| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-064O15.T7 (MSMg01no064_o15.b1) | MSMg01-064O15.TJ (MSMg01no064_o15.g1) |
|---|
| ACC | AG290251 | AG290252 |
|---|
| length | 1,261 | 1,190 |
|---|
length of high quality
(start - end) | 283 (126 - 408) | 413 (71 - 483) |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no064_o15.b1 PHD_FILE: MSMg01no064_o15.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 17:10:14 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no064_o15.g1 PHD_FILE: MSMg01no064_o15.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 17:10:14 2005 |
|---|
| singlet/doublet | --- | singlet |
|---|
| BLAST hit | no hit data | unique |
|---|
| sequence | NCCAATTCNNNNNNNAACATTGGGCGCTNXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXCGCGGAATTCTCTATTGTGTTTTCTGCCTTAAAAATGTATTCGTCTCA
TCATTGTTCAGGAGTATTTCCTCAATCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT
GCTTTTTTGAAACAGGGTTTCTCTGTATAGCTCTGCTGTCCTGTAACTCA
CTCTGTAAACCAGGTTGGCCTCAAACTCAAAAATCTACCTGCCTCTGCCT
TCCAAGTGCTGGGATTAAAGGCGTGCTCCACCACTGCCTGGCATATTTGC
TCATTCTTTATCACAGTCATAATGAAAGATTTGTTTGTTTTTTGACCACT
GTTGTTGAATGAGGGAAGGCTGAAAGAATCTGAGGAGGAAGGCAATGCTG
TAGGAGGACCAGTAGTCTCAATTAACCTGGACCCCTGAGATTTCTCAAAC
ATTGGACCACCAATCAGGCAGCATACACCAGCTGATATGAGGACCCTAAC
ACATACACAGTAGAGGACTGCTGGATCTGCCTTCAGTCAGAGAAGAGACA
TATGACTTTCAAGAAATTGGAGGCCCCAGAGAGTGGGGTGGTTTGAGGTA
GGGTGGAGGGTGNCTTTTTCATCCTCTTGTTATTTTTTCATTATATTTTT
TATGTAACAAATCTTATTTTGTTACATAATATTTCTTATTTTCTTGATTA
TTTTACATAATTATATTATCCTCTTTTATCTATTATTGATTATTTTATTC
TTTTTTTCCTCTTCTTCTTATTTACTATTTATTTATTTTCTTTTTTCCTC
CTTTTCTTCTTCTTCCATTAATTATTACATCTTTTTTCCTTTTCTACCCT
TTTTATAACTTATTCCTTTATTATCTCCTTTTCTTTATCCTTATTCCTTT
ATTTCTTCTACTATTTTTTTTCTTCATCCTACTTTTTCTATTTTTTTTCA
CATCTCATATTTAATTCATTTAATTTTTACTTTCTTATACATTTATTACA
TAACTTTTCTTTCTCTTCTTANTCTCTCTCATACACCTTCATTATCTATC
TTTATTTCTCTCTCATCTATCTTCTAATTTATTTTTCTTTTATCCTACTT
CCTCTATACTCTATTCTTCATTATTTCTTTTCTTATTTGTGATTCTACTA
TCCATAACTTCACTCATCTATAATTTATTATACATTAAGTCTTATTATCC
CTTACATCATACTCCTCTAATTAACTTTTCTCTTTCCTCCTTTACTTTTC
TTCCTAAATTC
| NNCCCATCAAGGTAGGCTGGGGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTGTCTGACACTGTGTCATACTTCCTTCCAG
TGCCAATACAGATTTATTGGGAGATGTTTAGTACATGCTTTGGAGAAGGA
GTTGAACTGGAATATGGAGAGATCTTGAGGGTATTAGATTGACAGAGGTA
CTGTTTGACATATTTCTGCTTGTTTCTCTTTTGAAGTCCTAATATCTAGC
GCATTAGGCTATGACTACACATAGAGATAAGTGTTAGGTCCCAGACCCAG
GACAAATGGCCAAAGTGCATATTTAACATGTCAAGGTATAGTGACCTCCA
GGTTTTCCCAGTATCCTCCAGTCCCTACCCATTAAAGGGTTTGATTGTCA
TACCCTGCAACCTGCTCTAAACTTCTTCAACCCAGGGGCTGAGCTGCCCT
TTTTTTTTTCCCCCCCCCATGTATAATAAAGCCCTGTTGAAAAGATGAAT
ATTTTTGGTCTATACTTCACCTTCACAGCCTCTTGATCTAGCTGTTTCAT
CCCCTCTCACCTCTCTTCACGTGACTCAGAGTCATGTCTAATCTATATGT
TCTCACATGCCTCTGCCTCTGACCTTGCTCTCCTATTTGTCTAAAACAAA
CTATCTCCTTCAACAGACATAGGTACTGTCATGTCCTCCTTTTTTTTTTT
ATTTATTTCTGTTTTCATACAGTAGGTTCTTCAAAAATGCTTTTTAGTTA
AAACAAGTTTCTCTGACCCACTGGTTGCTTTAATATGGCTGATATGCTGG
TTAAAAGAGTCTGACCCTGACTTGACCCCCCAAGGAAAGTTTATGTTAAG
AGATGACAGGTGACTCATAAAGAAGCCAAGGCTGCCACCCCTTTCCTCTT
GGATAGCTTGCTTTTAAAATTCAGAGGATACCAAAAAAGAATTGAGGGGA
TCCCTTTTCTGTTAAAAAAATTCTCTTGAAATTTCCTAAAATGCCCCCGA
CATATTGCCAACTTTTCCTTTTGCCTCCAATTACCCCCTCCCCTTTACCC
ATAAAAATCTCTTATTTTCAGCTTTTCTTTTCTTTTCCCCTGCTCCACCA
CAACCTCGCTTTATATGCTTTTAATTCTCCTCTCCCCTTACTTTCCTTCT
CTTTTAATTCTTTGTCGTTTCCATCTCTTTCCCCTTCCTT
|
|---|
| quality values | Open.Hide. 0 3 8 8 7 8 8 3 0 0 0 0 0 0 0 3 6 6 8 8 8 8 8 8 10 10 9 3 0 3 10 10 10 15 8 8 8 8 8 10 17 19 30 24 20 24 23 23 23 37
43 43 43 43 40 47 47 47 42 42 43 42 38 38 36 36 35 35 31 31 31 30 31 21 23 15 9 9 9 9 9 9 10 10 12 17 13 19 15 18 19 30 32 44 53 36 36 36 38 36
42 57 42 35 35 35 35 35 36 44 41 33 28 22 19 10 8 9 9 9 10 12 17 10 10 10 17 21 33 48 48 57 48 59 59 48 48 48 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 47 43
43 43 43 46 47 59 59 41 41 20 20 20 20 20 36 36 48 46 36 36 32 37 32 30 20 21 21 30 22 25 25 25 33 33 35 32 32 28 22 21 24 24 15 19 19 36 36 44 43 43
43 37 43 43 18 18 14 15 15 32 32 32 32 32 43 43 52 43 43 33 43 33 42 42 52 52 52 52 52 52 59 59 52 52 52 52 52 52 43 50 37 36 36 43 43 43 32 32 32 43
43 57 52 36 38 15 15 15 24 24 44 43 43 33 43 43 57 57 43 43 35 35 33 39 33 39 39 57 43 57 57 52 52 43 43 32 32 32 38 38 42 42 38 38 32 43 43 50 43 52
52 52 52 52 52 52 52 52 57 42 42 35 43 38 43 43 43 35 43 43 57 43 43 35 43 43 33 33 27 33 28 34 32 35 35 47 42 43 43 59 59 59 57 46 37 37 35 37 36 44
30 30 30 42 39 48 57 57 47 44 39 30 30 32 37 39 43 39 39 39 35 39 39 42 32 35 32 40 37 43 28 28 14 14 14 24 24 30 43 40 43 43 41 41 34 34 35 28 32 24
24 28 28 28 28 22 22 22 15 15 11 11 11 11 12 15 25 32 35 39 43 43 43 43 37 43 37 43 39 39 35 36 36 43 43 28 26 13 13 13 26 26 43 43 41 31 15 15 14 15
15 34 32 37 37 37 42 32 37 37 47 47 47 41 41 27 41 31 39 30 32 28 36 36 43 39 39 42 44 42 35 32 29 32 28 30 30 32 32 35 32 37 42 42 46 41 43 43 43 43
48 47 47 43 43 37 37 32 39 25 28 12 12 11 18 18 37 37 39 35 35 35 39 39 43 43 43 43 39 39 32 34 26 18 13 19 23 32 18 18 11 11 11 12 12 11 11 11 21 21
39 39 39 41 43 43 43 47 43 35 35 35 37 36 43 37 37 33 23 23 28 28 30 39 34 30 24 12 12 9 9 9 16 16 29 25 37 59 39 43 43 47 59 34 34 25 25 18 25 14
17 17 19 20 28 28 12 12 11 18 18 3 0 3 17 12 12 12 9 9 10 21 18 13 13 10 10 10 15 10 10 8 8 8 8 8 10 10 10 9 9 6 8 6 6 8 8 10 8 8
8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 8 8 6 6 8 8 9 9 10 10 11 10 8 8 9 9 9 9 9 9 10 10 16 17 13 10 10 11 11 11 10 9 9 9 11 9 9
9 13 10 8 8 8 8 6 6 8 8 10 12 17 11 10 10 8 8 8 6 6 8 8 8 8 6 6 8 8 9 10 9 8 8 8 8 8 8 12 10 9 12 9 8 8 10 10 8 8
12 8 9 9 9 10 13 10 8 8 8 8 8 8 8 6 7 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 10 10 8 10 10 14 12 8 8 9 8 8 9 8 8 8 8 6 6 8
8 10 8 8 8 8 12 8 10 11 11 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 10 10 9 9 9 11 8 8 8 8 8 8 8 6 6 7 10 8 10 10 10 9 9 9 10
10 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 13 11 10 8 6 6 6 7 8 8 6 6 6 6 8 8 8 10 8 9 8 8 6 6 8 6 6 8 8 10 10 10 8
8 8 8 8 8 8 11 8 8 8 6 6 8 8 8 10 15 11 12 10 10 10 8 8 7 6 8 8 6 6 8 8 10 9 8 8 8 10 10 10 13 10 15 14 13 10 10 7 7 8
11 10 10 9 10 10 10 8 8 8 8 8 8 9 10 9 9 9 10 10 10 10 10 8 8 8 10 10 9 6 8 8 10 10 9 10 9 9 9 10 9 10 10 8 6 6 10 8 8 8
8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 9 10 10 10 8 6 6 8 8 3 0 3 10 10 11 13 7 7 8 8 11 11 11 11 11 8 8 6 6 6 10 10 8 8 8 10 8 8 8
8 10 10 13 10 12 9 13 9 9 8 8 13 10 10 10 10 10 10 9 9 10 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 10 6 6 6 8 8 9 9 10 10 12 8 8 8 15 16
12 10 8 6 6 8 8 8 8 8 8 13 10 10 8 6 6 8 8 8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 10 10 10 9 9 9 10 8 8 7 9 9 9 9 9 9 9 10 10 10
10 9 8 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 6 6 10 8 6 6 8 7 6 8 8 22 16 12 9 9 9 8 8 8 8 11 8 8 9 9 9 9 9 9 13 10 8 6 6 6 8
8 10 8 8 6 6 6 8 6 6 8 8 16 12 12 11 8 6 6 8 8 8 8 8 6 6 6 8 10 8 8 6 6 8 8 8 6 6 6 6 7 9 13 10 10 9 8 8 6 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 | Open.Hide. 0 0 3 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 7 8 6 6 6 6 8 8 13 8 8 8 6 8 10 10 19 19 19 9 9 10 15 19 28 24 28 24 25 19 17 17 22 26 22
37 37 37 42 48 43 48 48 43 57 46 37 37 40 43 42 42 39 46 46 48 43 48 43 46 42 39 42 42 28 36 25 37 37 42 42 41 41 38 38 41 54 54 48 48 42 42 36 36 29
29 29 48 48 47 47 50 48 42 37 43 44 50 50 57 57 37 32 28 44 44 43 38 38 35 35 35 30 32 36 36 50 42 37 32 35 43 43 47 50 50 37 52 52 52 52 59 52 54 54
52 52 52 52 52 43 42 43 35 44 57 57 52 57 57 52 59 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 39 39 39 47 47 43 57 43 45 45 52 57 57 43 43
43 43 45 62 52 52 43 62 62 52 52 62 44 62 62 52 52 52 62 52 52 52 62 52 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52
62 62 62 62 62 43 43 39 43 43 62 62 62 62 62 44 44 31 31 31 35 35 43 43 62 62 62 62 62 52 45 45 52 57 57 57 57 52 52 52 57 57 39 39 39 57 57 43 57 39
39 39 57 44 57 43 43 39 44 44 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 43 43 43 37 39 43 50 57 57 57 57 52 52 43 43 35 43 43 44 43 52
52 57 59 59 52 52 50 59 57 57 48 48 48 57 57 57 57 57 57 57 57 44 44 43 43 48 57 57 57 54 54 47 57 47 48 48 48 59 59 59 43 44 44 57 42 39 32 36 18 19
11 18 18 27 21 21 23 26 40 44 32 37 37 43 43 43 47 47 47 59 43 41 42 42 48 42 59 42 43 43 36 43 37 47 47 39 39 30 30 37 37 28 39 39 37 30 32 28 24 22
16 11 13 13 13 19 16 16 17 16 17 22 34 36 37 19 23 11 9 9 20 27 37 59 37 59 25 21 11 11 11 8 8 8 8 8 10 18 18 17 12 9 8 8 6 8 6 9 11 13
24 32 59 59 59 59 59 43 43 43 47 47 59 48 48 37 43 28 28 28 40 40 43 42 57 48 48 48 59 59 59 59 48 48 48 48 57 47 57 39 44 35 37 37 47 44 57 57 57 57
57 59 57 57 57 48 48 48 48 48 48 57 57 57 57 59 59 57 44 44 37 37 37 46 46 44 37 29 29 29 44 44 35 35 35 42 42 44 44 47 43 43 43 47 59 59 54 54 47 47
43 37 37 30 30 25 36 36 43 43 48 48 48 54 54 54 54 57 54 54 54 54 57 57 47 46 43 40 40 33 33 37 39 39 43 59 37 32 22 32 32 47 47 48 48 48 48 43 44 40
40 41 47 59 37 29 25 25 21 23 25 37 37 37 33 28 31 20 20 20 28 30 43 37 37 33 36 25 40 40 28 30 25 23 23 15 15 19 32 32 57 57 59 57 57 57 57 57 39 39
35 28 28 33 22 26 12 12 11 16 15 21 21 14 14 14 15 15 24 12 12 15 18 20 23 22 8 8 8 8 8 8 10 9 19 10 10 12 16 17 13 10 10 11 23 17 15 15 11 11
9 14 21 24 22 23 19 11 8 8 8 8 12 16 21 17 9 9 8 8 15 13 14 14 16 23 15 13 10 9 14 10 11 11 12 13 9 10 13 10 10 10 21 21 12 15 11 11 11 14
17 32 23 21 10 11 11 11 11 10 11 16 12 14 13 9 9 12 12 12 12 12 11 12 17 8 8 8 15 10 11 11 11 11 13 16 17 13 10 9 9 9 17 19 28 28 19 30 18 18
13 12 9 12 14 9 9 9 10 8 8 8 8 8 9 9 10 9 9 16 13 12 12 11 11 11 19 16 15 10 10 10 10 10 10 10 8 8 8 8 10 8 21 11 8 8 8 8 8 8
9 9 10 10 8 10 10 8 13 10 9 9 15 13 9 9 9 8 10 8 7 7 8 11 11 12 11 11 9 8 8 8 8 8 10 10 11 10 10 10 8 10 11 8 8 8 16 9 9 9
9 12 12 18 23 20 14 13 9 9 9 10 10 13 19 24 27 37 22 17 13 10 10 10 9 10 8 8 8 8 10 13 12 10 8 8 6 6 6 8 8 8 10 10 10 15 9 10 8 10
8 8 6 6 8 8 10 11 10 10 8 8 8 10 12 10 12 9 9 10 10 9 9 14 13 11 11 11 11 9 12 9 9 9 12 16 16 13 13 15 14 15 10 8 10 8 9 8 8 8
8 8 8 10 13 18 11 11 10 11 11 15 12 10 10 8 8 10 8 8 8 8 10 8 9 10 10 13 19 17 8 8 8 8 8 10 12 8 8 8 8 8 6 7 8 8 6 6 8 6
8 10 9 10 12 12 10 10 9 8 10 8 8 6 6 8 8 11 10 13 16 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 12 11 14 14 10 10 8 8 9 8 8 11 11 10 10 9 9 9
8 8 8 13 9 9 9 11 12 12 10 8 8 8 6 7 8 8 11 11 9 8 8 8 8 8 8 10 9 11 11 11 11 11 12 10 8 11 10 8 |
|---|
