BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-075D23.T7 (MSMg01no075_d23.b1) | MSMg01-075D23.TJ (MSMg01no075_d23.g1) |
ACC | AG298111 | AG298112 |
length | 663 | 729 |
length of high quality (start - end) | 567 (42 - 608) | 192 (79 - 270) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no075_d23.b1 PHD_FILE: MSMg01no075_d23.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 17:23:52 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no075_d23.g1 PHD_FILE: MSMg01no075_d23.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 17:23:52 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | AXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGAATT
CTGCCAACTGCTCATATATCTATTCCAATTATGTATTATCAGACTGGGGA
AATAACCCAGGATGAGTCTGGGAACCCACTGGAACTACTGGAATCAGACT
TCAGCCAAAATATCATTGTTCAACTGAGCTTTATAAGCCCATACTTTAAG
TTGAAAGTAAATATGTTTTTTTGGGATATCCTAGATTCAGTGTGAATACA
GAATCAGTATCCAAAAAAAAAAAATCTGATTGTTTTCTTTCGCCCAGTGT
TCAGTTACCCTTGTCCCTCTGGAGAAGGAATGGATAAAATCTACCAGTAA
AACTATGAGATATTTTATCAAAACCTTTCCTCAGAGGAAGCAGGCCATCC
CTCCATTCAAGGGGTTTTGGGTAGTCAAACTGGCTCAAGCCTGGAAAATT
GAGTCACAGACCAAGATTCTCTTTAACCACAATTCAATGTACCTTTCTTT
CATTTCTTTGTTTGAAATGTTTTCTGCTTATACAGACCAAACAAAAATTC
AGTAGCCTTTTTAATCTATATCTTACTTGAAAACACCATGATTGGTTAGC
CAATGCCTAATGCACATTACAAGTCATGCCACCATAAGAATAAATTTGCC
TGTGCTGATAATT
| AAAACGATGCAGTGTXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTATGCTCAGCTGGGAATAGTG
TGAGCCAGACCTCAGAAGGGAATAGGAGAATCAAGAGAAAACAACCAAAT
AGTCCCAGATTTCAGCTTATCCAGACTAAAACAGTTCCTGAGCTTATGTT
AAATATGCGATTTTAATTTGTTTATTTTATAAATGTGAGTGAGTGAGTGT
GTGTGTGTGTGTGTGTGNGCCNCNCTCCTCTCCTCCCCTCTTTCCCCTTT
CACCACATTTATTACCCAAACCAAAATATTTTTTCTTTCTCCAAACCACA
CCCCACCCCCATATCTTCTCCCCTTCCTCCTCCCCTTTCCTCTCTACTCC
CCTCTCCCCATCTCTTCATCCCCCCCCTCCTTCCTCCCCCTTTTTTTATC
TTTTCCTATTATATTTTATTTTCTACTCCCTCACTTCTCCCCCGCTAATC
TCACCCATATTTATACCTCTATTTTTCCTCGCTCTTCCCTTTCTCTTTCT
TCTCCCCTCAACACCCCTTGTTATCTTTCTCCCTTTTTTATCTCTATATC
CTTCATTACCCTCCCACATACTTATTCTACAACAATATCTCTCCCATATA
CCCCACAATATATATTTATCACTACTTTTTCGTTCCTTATTTATCTTTCA
CATTTCTCTTCTTGTTCCTCTCACTTTCG
|
quality values | Open.Hide. 8 8 8 8 15 11 22 17 15 14 17 28 23 19 27 25 25 24 32 33 33 25 22 10 10 10 21 21 9 9 9 9 9 11 11 12 10 12 13 19 17 21 28 32 32 36 36 36 50 36
36 33 29 28 26 31 19 22 18 15 7 6 6 8 8 10 22 28 37 39 44 44 53 35 35 28 28 36 36 47 42 42 40 40 40 47 48 40 40 42 42 36 36 40 48 54 68 68 68 68
68 50 53 50 50 50 50 50 50 50 50 68 57 57 57 68 50 50 50 57 57 57 57 57 57 68 68 68 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 46 46 50 50 50 50 54 54 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 50 50 50 68 57 57 57 57 50 50 50 50 50 50 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
57 57 57 57 57 57 57 57 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 52 52 62 62 62 62 62 62 62 52 45 43 43 52 43 43 43 43 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68
68 68 68 68 62 62 62 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 62 62 62 52 52 57 59 57 57 57 57 57 39 39 39 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 52 43 43 39 39 38 34 28 23 18 16 14 16 18 38 36 43 35 43 43 57 57 59 57 52 52 52 57 57 57 57 59 59 59 57 54 52 57 52 54 57 57
57 57 57 59 54 54 54 57 57 57 50 50 50 35 35 46 38 44 37 43 43 57 50 57 57 57 57 48 48 48 57 48 48 48 48 48 48 57 57 59 54 57 57 59 57 57 54 54 48 57
57 57 57 57 48 48 48 41 47 41 47 47 47 59 48 48 39 42 30 30 30 32 32 30 32 35 42 43 57 57 42 42 40 47 40 40 57 57 34 33 33 28 30 33 37 43 48 48 39 37
39 39 30 30 31 25 31 39 39 39 39 32 28 24 34 24 25 24 30 28 35 35 43 37 37 32 29 29 30 32 27 19 15 14 14 26 26 39 33 33 33 33 33 33 39 39 39 33 32 30
30 30 33 39 26 19 8 8 8 8 13 19 33 28 22 16 15 14 19 14 14 13 14 11 11 13 16 18 22 28 28 22 22 22 16 24 10 10 10 8 8 8 10 10 13 28 27 25 25 22
17 14 10 10 11 16 22 22 25 28 30 24 20 | Open.Hide. 7 7 6 6 6 8 8 10 12 11 11 9 18 9 9 9 10 13 24 32 28 29 37 37 29 28 28 24 24 32 44 41 41 27 21 11 10 11 11 10 9 9 13 13 21 14 24 30 30 33
33 36 36 38 38 36 36 50 50 50 53 53 47 42 37 36 21 23 10 15 15 18 13 29 26 41 41 42 57 68 68 68 68 40 40 37 37 37 40 48 68 68 50 50 50 50 50 50 68 68
68 68 68 50 51 50 50 48 48 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 50 50 50 50 54 54 50 50 50 50 50 50 50 47 50 50 54 54 57 57 54 54 54 57 57 57 57 50 50
50 50 50 50 51 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 48 50 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68
68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 54 54 54 54 54 50 57 57 57 48 48 48 57 48 48 48 48
48 48 48 57 48 48 48 48 48 41 41 41 31 31 15 20 3 0 3 9 3 0 3 0 3 8 8 6 6 8 6 6 8 8 8 10 10 9 9 8 8 8 10 9 9 11 11 10 8 10
8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 8 10 8 8 9 9 9 9 11 11 12 12 21 22 11 10 8 8 8 8 8 8 8 8 12 10 8 8 8 8 9 12 12
14 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 13 17 11 11 10 8 8 6 6 8 10 16 13 15 11 12 11 10 10 10 14 12 12 11 21 10 8 8 6 6 8 8 10
10 11 11 16 15 13 8 8 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 13 12 9 9 9 9 10 12 8 8 8 8 8 8 8 13 15 17 20 15 15 10 10 8 8 15 10 8 8
9 8 8 7 6 8 8 8 8 6 6 6 8 8 12 12 12 13 12 15 11 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 9 9 10 9 9 9 9 12 10 8 8 8 8 8 8 8 10
10 9 9 8 8 8 8 8 8 13 10 10 10 8 6 6 8 8 8 11 11 11 12 15 19 15 15 11 10 9 9 8 8 6 6 8 8 8 8 11 14 8 8 9 9 10 10 9 7 11
6 8 8 8 8 8 11 8 8 8 8 8 6 7 12 10 10 12 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 12 12 8 8 8 10 10 9 11 11 11 12 10 11 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 10 11 11 11 12 10 8 11 6 6 8 8 6 7 8 8 13 8 10 11 8 8 8 8 8 8 9 11 17 18 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8
11 11 10 8 8 8 8 10 10 8 8 8 10 15 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6
6 6 6 10 7 9 9 8 13 10 10 10 9 9 9 10 10 9 10 10 10 9 7 10 8 8 8 8 8 |