BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-079H20.T7 (MSMg01no079_h20.b1) | MSMg01-079H20.TJ (MSMg01no079_h20.g1) |
ACC | AG300557 | AG300558 |
length | 717 | 719 |
length of high quality (start - end) | 600 (38 - 637) | 509 (67 - 575) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no079_h20.b1 PHD_FILE: MSMg01no079_h20.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 17:28:08 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no079_h20.g1 PHD_FILE: MSMg01no079_h20.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 17:28:08 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | ATTTGCGGCGCTATACGACTCCTATAGTTCGAGAATCCGCGGAATTCTCT
CTCACTACTTCACTTGGGTTCCAGGAATCAAGCTCAGGTCAGCAAGGTGG
TGTTAGGTAATTTTTGTGTGTGTTGTTTTAATTCTTTCATATATTGCATC
CCAACTGTAGTTTCCCCTCCATCCTCTCCTCCCAAACCCACCCCAACCCC
AGCCCAATCCACTCCTCCTCCATGTCCTTCAGGAAAGGGCAGGCCTTCCA
GGGATATCAACCAAACCTAATGAGCCACCTCACTGGCTCACTCAAACCAG
ATATTTAAATTACTTAAATTTAAATAATTATTATTTAAATTTAAAATTAT
ATAAATTTAAATAATTTAATAATTTAAAATTATTTAAAGAGAAAATTTCA
TAGCAATAAATCTCTACATTAAAAGGAGAAAGACAATATAAGTGTCCTTA
AATAATGCTCCAAGGATATAACAAAACCTGAGGTTTATATAAAGAATAAA
GAAGAGAACAAGTAAGTAAAATAGAAATTATAAAATTCACAAGGAAAAAA
ATCAATAAATCTAAGAGTTGGTTTTTTTTTCATTTTCTTTGAAAATTAAA
TAAGCCTTTTGCTAGACTGAGAAAAACATGAGGGAGAGTCACACCCTGAG
TGAAAAGTACAGGTGTTTATTTTAGCCGCACAGGCGAGAGCGAGCCATGA
AGAGCCCCTGACAGAGT
| TGTGAGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXATCCTTTGAACAAAGCTCTCATCACAGAAAAACA
AAGCCCACCCCCACCCCCTGCCCCCGCAGCTTTGCTGCCTCCCTAGAAAC
TCCTCTGCAGAAACAGATCTAGGGATGGAGGATTGGAGGTGAATTTGCAA
ACCAACTTGAGCCTCATGAGTTCTGTTGAGGGCTATGGAAACTGGCCCCC
TGCTCTCTGGCTGAGTATGGAGCTGAGGCACCACAAATAGGCACCATTAG
GAATCCTCCAGCTGAGAAGGAGGAAAAGAAGTCTATTGAGCCCTGGCTAG
GTGGAAATCTGAGCAATTAAGTTACAGATGCTTATTCTGACCTGACTCAT
ACAGTCAGTCCTCCTATCAGTATTCAAACCAAGACCAACCATTACTGCTG
CCTCCTTGAACTTGATCTCCAATGTCATGTTTCCTGTTTTTAGTGAAGTG
ATCTGTCACAATCTGTTTTTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATT
ATTATTATTATTATTATTATTATGCTTTCCCTTCCCCCTCCCCCCCCTGT
TCCCTCTTCCTTCGTTCTCCTCTTCCTTCCGATTCTCGTCTCCTTCACCA
CCACCCACCCCTCCCTTATCCTATCCCCTCTCCTCTCTCTCCTTCCGCCT
CCCCCCCTTCTACCTTTCC
|
quality values | Open.Hide.26 30 30 30 27 20 14 14 13 21 10 9 9 19 19 33 33 21 21 9 10 10 22 21 21 10 9 9 11 9 9 9 10 10 10 11 14 16 23 30 30 33 33 33 33 36 36 57 53 53
31 31 31 29 25 21 20 10 8 6 6 8 12 21 30 33 33 33 33 33 36 36 36 36 38 50 36 37 37 37 47 47 47 47 47 47 42 42 48 48 48 50 50 68 68 68 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 50 57 57 68 68 50 50 48 42 37 35 35 35 37 42 42 48 50 50 50 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 57 57 57 57 57 50 50 50 50 50 50
68 68 68 68 68 68 68 57 57 68 57 57 57 57 68 68 68 68 68 50 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 68 68 68 59 59 59 59 59 57 57
57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 59 59 59 59 57 57 68 57 57 57 57 59 68 68 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68
68 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 57 57 57 57 57
57 57 68 68 59 59 57 57 57 59 59 57 57 52 52 52 52 52 52 57 57 59 59 59 59 57 57 57 52 59 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57
57 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 59 57 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 54 54 54 59 57 57 57 57 57 48 48
43 43 43 44 43 44 42 44 43 43 43 43 44 44 48 48 48 48 48 48 46 46 43 39 39 42 42 54 54 54 59 57 54 48 48 50 50 48 57 48 48 48 57 48 48 48 57 57 57 57
43 43 43 40 40 47 59 59 59 59 41 32 32 32 32 28 27 23 26 29 32 28 31 39 43 59 47 41 40 40 40 43 43 48 46 46 46 47 47 37 37 32 29 32 37 37 37 37 39 35
26 24 17 19 20 27 34 39 39 39 40 34 37 24 24 25 30 27 27 16 10 8 8 8 8 6 6 6 17 23 35 35 24 24 24 22 22 21 17 18 9 9 9 16 13 23 20 21 11 11
8 9 10 11 12 15 15 28 28 26 23 21 15 15 23 24 25 25 15 15 15 11 11 10 11 11 20 23 30 30 30 17 12 9 9 9 9 10 11 21 22 25 12 12 12 18 25 37 25 21
12 10 10 17 12 10 9 10 10 15 14 21 12 8 8 8 8 | Open.Hide. 6 8 13 6 6 6 8 7 16 22 30 30 37 37 33 33 33 33 33 50 50 37 33 21 21 9 9 10 12 12 16 19 19 13 10 13 15 17 17 15 9 9 10 23 26 47 36 36 36 33
33 33 32 28 22 22 16 18 11 9 9 11 21 27 33 33 33 33 33 48 50 57 57 57 35 35 37 37 37 40 50 50 50 47 47 47 47 47 47 42 42 42 42 42 68 68 68 68 68 68
68 50 57 57 57 57 57 57 57 50 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 50 50 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 57 54 57 57 57 57 57 57 46 46 46 46 46 46 57 46 46 46 46 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
59 57 57 54 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 62 62 62 62 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 59 43 39 39 39 23 29 29 29 39 41 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 62 62 39 39 39 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 52 52 52 62 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 62
62 57 57 57 57 57 68 57 57 59 57 47 57 57 57 57 57 52 59 59 68 59 59 59 57 57 52 52 57 59 59 57 57 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 59
59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 52 52 52 44 43 43 50 57 44 50 43 37 37 43 50 50 57 54 54 44 44 43 48 48 44
44 37 37 37 44 44 57 57 46 44 39 41 42 42 30 30 30 44 44 54 54 48 57 48 48 48 43 43 43 43 32 32 28 36 36 37 33 43 43 43 39 39 35 35 35 42 39 39 39 43
43 47 43 43 43 43 34 34 37 37 33 33 28 28 28 33 33 37 39 36 36 19 17 6 6 8 8 10 8 8 6 6 8 10 15 10 7 7 8 8 8 8 8 8 8 13 13 6 6 8
8 14 11 14 14 15 15 15 11 8 8 8 6 6 10 10 10 10 17 10 13 12 10 8 10 8 8 8 10 8 8 8 8 8 10 10 8 10 9 8 8 8 8 8 9 10 10 8 8 10
10 8 9 10 12 10 9 14 15 16 10 9 10 8 8 10 8 10 10 12 12 11 12 15 21 18 12 8 8 8 8 15 19 10 8 8 8 8 10 13 12 9 8 8 8 11 11 11 9 8
8 8 8 15 12 17 10 11 10 8 8 8 8 10 8 8 8 8 6 |