BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-109D08.T7 (MSMg01no109_d08.b1) | MSMg01-109D08.TJ (MSMg01no109_d08.g1) |
ACC | AG322451 | AG322452 |
length | 790 | 708 |
length of high quality (start - end) | --- | 541 (88 - 628) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no109_d08.b1 PHD_FILE: MSMg01no109_d08.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:12:20 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no109_d08.g1 PHD_FILE: MSMg01no109_d08.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:12:20 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | ATAAAAAATATTAATAATTGCGGTGTTAATCGACTCACTATATTCAGAGG
ATCCGCGGAATTCAGTACCATTTTCCGTTAAAGGAGAAGAGGCAATCGGT
TCACATAGACTTCCCCACAAAAGGATACCAATGGAGCATGATGGAAAGAT
TCTGAACGTCTATAATGACTACTTAATATGTTATATAATATGCCTCATCT
CTGTAATAATGAATATTCGAGACTCTGACAGACCTCATAATTTCCCGCAG
AGTCTCGGCGATAAAATATCCACCTTGTTATTCCGCCTTTCGCACACTTG
TTTTTTATTACCTTCTTCGCCTATTTCCATACACCTCAATTCCCCACGTT
TTACATAAAAATATTTATATTTCCCACTTTTACACGAATTGTATTCTGCC
CGTCGCTTCCGTATATTGTTTTGTCCCATTATCGCCTCTCAAACCCCTTT
GTTTTTAAATAATACAAAAACCCACCCTCTACGTCGTTTCCCCCTTTTCC
TTTTTCCCCGTTTTCCCCCATCTATTCCTCTTTAGCCCTTCCTTTCCACA
TATCTTTTTTTTTTAAAAAAACAACCTCTCCCCTTTCCCTTCCTTTTCCT
TTACCTCTTCCCCCTTTTTATACCTTTCCCCTCCCTCCCCCCATTACCCT
TTACTTCCCCCTTTTCCCCCTTCATTATCCCTTCTCCCTTCGCCCCCTTT
CCTTTCCACACTTTCTTTTTTCTTCTTCTCTTTCCCATATTCCCAAACAC
CCCCTTTCCCCATTTTCCGCCCCCCCCTTTACATTACCCG
| CCACATACTNNNNCTCGATGAAGTXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTGTTATTTCTGTG
TAGTAAGTTCTCTATGAAGCCTTTCAGCTCTCTCTCAATTATTATTATTT
TAAACAGAATGCTATTAAATTAGGAAATGCTGCTAGTTTGTTGTGAAAAC
CTTAACGACAAGTTGAGGCAAAACTCACAAAAATTTATGAGCTAACTCAG
GGAGCCGGAATAAAAATGAACATTACCAACTCAGCATTTATTAATTCTAA
ATGAACTTTTAGATTCTTCCTCAGGGTTTTCAGAGGACACCAAGTTTCAC
TGGAACCCTGTTCTCTGCTCTTCCCCTCCCCCAACTGTATAAACCAATGA
AGCAATGGCTTCACTCCTTTTTCTCACCTGCGCATCTCAGCTAACTATCA
CAATCTGGAGTGTCAGTTTTCTAAAGAGTTGAACCACTTTAGAGAGCCTT
GTTAAAACTAACCCTATGCCCAAACAACCCCCTCCCACTGGAATCAAAAT
TAACACCTATAAATAGCCTTTGTCCTCTTTTGTGAAGGAAATCAGATAAG
TTTGAAAATATCTTAAAAACAGACAATAGGGCTGGTTTTAGGGCTGAAAA
CAGCGGCTTATTTCACTGTATGTTAATTAGGAACAATCCATCTACTGTAG
CTCTTTGA
|
quality values | Open.Hide. 6 6 6 8 6 6 6 6 6 6 8 12 12 9 9 9 13 9 10 11 10 10 10 10 10 10 17 10 9 9 10 15 15 10 10 13 12 16 19 21 10 8 9 10 9 9 9 11 10 10
10 13 13 13 16 12 12 15 15 29 32 21 19 22 16 16 9 9 8 8 8 8 8 8 11 11 8 8 8 8 10 15 21 24 20 18 15 9 9 9 17 17 15 15 15 26 19 17 13 16
11 12 11 11 11 20 22 28 30 33 30 37 30 19 21 21 21 24 24 19 28 32 28 25 21 18 11 10 11 12 16 19 15 15 12 14 12 8 11 6 6 8 8 11 11 16 13 10 10 10
10 10 18 10 8 6 6 8 10 8 8 9 10 10 9 10 10 9 9 10 10 9 9 9 9 8 8 8 15 11 8 10 13 15 16 10 10 10 12 12 8 8 9 16 16 24 14 10 8 8
10 8 13 12 10 10 10 15 15 10 9 9 8 10 11 9 9 13 10 10 8 8 8 8 8 8 12 21 19 15 16 16 11 10 6 6 6 8 8 6 6 11 6 11 11 9 9 8 8 8
8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 12 12 16 19 8 8 8 8 8 6 6 8 6 6 8 10 10 8 8 8 8 10 8 8 8 12 12 15 10 8 8 6 6 6 8 8 8 8 11
12 21 10 9 9 8 8 8 8 8 8 8 9 9 11 11 11 11 11 8 8 8 8 8 8 8 10 10 6 6 6 8 8 10 8 10 10 12 13 15 10 10 11 12 12 11 11 9 9 9
8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 11 15 15 14 11 9 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 9 11 16 10 11
9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 6 6 8 8 10 7 7 8 8 8 8 11 16 13 10 10 10 10 12 16 17 15 10
10 11 12 9 9 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 10 13 10 10 10 10 11 11 11 12 9 9 9 9 9 10 10 11 13 19 12 12 12 16 16 18 19 19 16 19 14
13 10 15 15 9 9 9 10 10 9 9 13 17 14 13 11 12 12 13 12 8 8 8 8 8 8 10 8 10 10 10 12 12 8 9 8 11 8 9 9 9 10 10 16 12 12 12 12 10 10
8 8 8 8 9 10 15 19 15 14 11 10 12 10 10 10 10 13 9 8 8 8 8 8 9 10 8 8 8 8 8 10 11 11 12 12 10 10 11 13 10 10 11 11 23 15 11 11 11 11
16 15 15 9 8 10 10 8 8 8 8 10 13 10 8 8 9 8 10 13 13 9 8 10 8 9 9 9 8 9 9 10 10 10 12 14 14 22 22 24 16 14 14 14 9 9 9 11 9 11
10 10 12 11 13 14 9 9 9 9 9 10 11 9 10 10 11 16 18 20 19 17 8 9 9 8 8 8 13 13 9 8 8 8 8 8 8 12 9 9 9 9 9 10 12 9 8 8 8 8
10 10 15 21 15 9 8 9 7 8 10 10 8 10 9 8 12 8 10 8 12 10 8 6 6 6 6 6 8 9 9 19 12 9 9 9 9 9 8 8 8 8 8 6 6 8 8 6 6 6
10 10 12 12 12 19 14 10 10 10 8 8 8 12 15 14 13 9 9 9 14 14 14 13 14 11 17 19 25 11 8 8 8 10 10 8 10 10 10 10 | Open.Hide. 9 9 9 9 11 11 11 9 3 0 0 0 0 3 6 8 8 8 8 11 10 9 9 13 12 10 10 13 19 32 59 37 37 37 36 36 36 39 41 41 47 27 27 11 9 9 8 7 7 7
8 8 13 14 9 9 9 16 18 23 21 11 11 11 25 25 39 39 27 27 11 15 11 11 11 11 12 12 15 15 12 10 13 23 27 25 28 33 33 33 33 47 48 57 47 39 39 39 39 39
43 43 48 57 47 50 50 50 48 48 54 54 57 57 57 57 57 48 59 43 46 48 50 42 47 47 37 37 39 47 48 57 57 57 57 57 57 47 47 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68
57 57 57 48 48 50 42 42 37 37 47 48 57 68 57 57 57 57 57 43 43 35 35 35 36 36 46 46 46 46 57 57 57 57 59 59 52 50 43 37 37 43 37 43 42 50 43 52 52 52
57 57 57 43 43 43 57 57 52 52 52 50 50 52 52 52 52 57 57 52 52 52 57 57 57 57 54 54 52 52 52 52 52 57 36 21 10 10 10 15 27 50 57 57 54 50 50 44 43 44
46 47 44 46 39 44 43 39 39 46 46 44 43 37 37 37 37 42 41 57 57 57 57 57 44 44 43 57 57 57 59 59 57 48 48 48 57 59 59 54 57 57 57 54 54 57 59 59 59 43
43 43 47 59 59 59 59 59 59 59 47 47 59 59 59 59 59 59 59 57 50 50 48 48 42 59 59 27 27 19 18 12 12 12 12 13 18 30 41 59 59 50 50 50 48 57 57 48 48 57
57 59 48 48 48 48 48 48 57 48 57 57 57 48 54 57 43 46 43 46 42 47 43 43 43 46 47 59 59 59 59 35 35 35 36 36 30 36 39 46 59 59 43 43 43 43 43 48 47 48
48 48 43 43 43 43 43 43 43 43 43 43 43 46 57 57 48 48 59 59 59 59 47 47 25 25 11 10 9 9 9 9 12 26 34 46 39 39 30 30 39 39 39 47 50 57 59 59 57 50
43 43 31 32 32 42 42 57 57 43 43 43 43 43 46 43 48 48 59 59 59 59 57 48 48 47 47 47 47 47 57 57 57 44 44 43 43 43 32 32 17 17 19 32 36 47 57 57 46 46
43 44 57 57 57 48 48 48 57 57 50 48 43 44 42 43 43 41 37 37 43 43 50 39 37 37 37 42 47 48 54 54 54 57 32 32 17 17 14 27 27 47 42 42 42 42 35 37 39 47
47 48 48 47 47 48 50 50 48 43 43 39 37 31 29 20 20 20 32 30 41 23 20 18 24 24 36 36 43 43 40 28 28 28 40 28 35 35 34 29 29 25 20 20 23 32 34 34 28 25
18 24 23 28 20 23 30 37 37 39 37 30 28 22 12 10 10 14 19 28 24 24 24 25 22 22 21 12 12 12 12 15 19 18 12 14 15 27 28 23 15 13 11 11 11 16 14 14 15 16
12 13 8 8 8 8 10 22 22 25 29 21 24 11 11 11 19 17 13 11 18 11 16 19 14 17 24 30 28 28 28 26 24 22 22 11 11 11 19 11 11 11 12 12 19 14 10 10 10 10
10 11 19 25 30 17 17 17 |