BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-134J21.T7 (MSMg01no134_j21.b1) | MSMg01-134J21.TJ (MSMg01no134_j21.g1) |
ACC | AG341288 | AG341289 |
length | 1,160 | 1,197 |
length of high quality (start - end) | 329 (468 - 796) | 340 (470 - 809) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no134_j21.b1 PHD_FILE: MSMg01no134_j21.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:50:11 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no134_j21.g1 PHD_FILE: MSMg01no134_j21.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:50:11 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | GATTTTANNNNGGTCAATGGGCGCTATAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
CGCGGAATTCTCTGGTTAGAATTTTTGAGGCTTCCTTATGGAAACTATCA
TATCATCTACAGATACTGATACTTTGACTTCTTCCTTTCTAATTTGTATC
CCTTTGAGACCCTTTTGTTGTGTGCTTGCTCTCGCTAGCACTTTGAGCGC
TATATTGAATAGGTAGGGTGAGAATGGGCAGCCTTGTCTTATCACTTATT
TTAGTGGGAGAGTTTCAAATTTTTTCTATTAAATTGTATGTCGGCTGTTG
ATTTGCGGTATATTACTTTTATTTTGTTTAGGTATGTTCCATAAATTCCT
GATTCTCCAAGACTTTTAACATGAAGGGATGTTGGATTTTCAGCATCTAA
TGATATGATCATGTGATTTTTTTTCTTTGAGTTTGTTTATATATTGTAAC
TATGTTTATGCACCCCCATATATTGAATGATCCCTGCATCCATGGAATGA
AGCCTACTTGATCATGGTGAATGATGGTTTTGATATGTTTTTGGATTCAG
TTTGCAAGAATTTTTTGAGTACTTTTGCATTGATATTCATAACCTAAACT
GGCCTGAAATTCTCTTTCTTTGTTGGGTCTTTTTGTAGTTTAGGTATCAG
AGTAACTGTGGCTTCATAGTATGAATTATGTAACATTCCTTCTGTTTCTA
TTTTGTGGAATAGCTTGAGGAATATTGGTATTAGGTCTTTTTTGAAGGTT
TGGTAGAATTCAGTACTAAAACCATCTGGCCCTGGACATTTTTGGATGGG
AAGTTTTTAATGACTGCTTCTATTTCCTTAGGTGTTATAGGACTGTTTAA
ACAGTTTACCTGATCTTTATTTAACTTTGGTAAGTGGTCTAGAAAATCCC
CATTTCCCCTAAATTTCCAGTTTATTTGAAGGGTAGCTTTTTTTCTAAAA
AATGAATTATTTTTTTTTCCTATTTTTCGTTGTTTTTTCTCCCCCTCCAT
TTCTTATTTTTTCCAATTCTTATCCTCTCCCTCTTGGTTTTTTTTATCTT
ACTCTAGAATTTTTTTCTTTCTTCCTATTTTTTCTACTAACCCACATTTG
ATCTTTTGTATTCTTTTCTTTATTAACTTCTTCCCCTTCTTTTTTTTTTC
TTTTTTTTTT
| NCCCATTATTNNNNNATTCAAGGNAGGCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCTTTTATACTCTCACCTACCCTT
CTGCAGTATGACCTCCTCCCTTTAATACGGAGAGGTAGAGCTTATTTTCT
TCTTGAATCTGGACTAATGCCACTGACTAACATACAACCCTCCGATGTGT
CAGCAGCACTGCATGACCTCAAAGTGTAAGTAAGAAGGCTTCACATTCTG
TCTTCTGCTATCTGGGTGTTTCCACTGGAATAAATCTTGTAAGAATTCTA
CAGTCATGATCTGAAAAGCCCATGTCATCCAAGAAGACCATAGGTGCTTC
AGTCTTAGATGAAATCAAATTTGACCACACACAACCCCAAGTGCGAGGCT
TTTGAGTTAAAGAGACTCCAGATGGTCCCACCATCCAGCATGCCAGTCAG
TTCTGGTCTTTACAGCCTTCTTTGCTGAGCCTCAGATGCCATGAGAAAAA
AAGACACCATCTGCATGGAGGTTGGCTCGCATGAACATAATAAATAAGGA
GTTTTGGTTTATGTCACTCAACTTGGACTTTTTTTTAAATGTAGCAATAT
ACTGACCAAGGATCTTGAACAACCTATGATGCTACCATGCTTTAGTTCTT
TCTGTTAAATGGAGTCTCATTCAAACCCTAAAGTGTTGACATGAAAATTA
AATGAGCACATAGAGGTGTGGCAATTCAAACAGGGCATTAGACTTAGTCA
ACTGGGAGAGTCAAAATAGAAGTAACAGAAACTCGTGGCTCTGAAGGAAG
CCCTCATGGCGTAGATGACTACTGCTGTTCCAAATTCTCTTTGCAGAGTC
CATATAGGAAGGTAGTAGAAGAAAAAGGTGAGATTTCTGCCTAGGTGGTT
ATACTAAACCTGCTGAAATAATTGGTTTCCCCCTTCTTTCCCCAAAAAAA
ATTTCAAAAAAATTGCTCCTTGCTCGGTTAAAACTGTTAAAAAAAATTTT
TATATTTTTCCCAAGTTGGGGCAATTATTTTTCTTATTTCTTATAAAGGA
TAAAAAAGTGTTCTCTTACAAAAAATTTTTTATTTTTTCTTCCAGCTTTC
ATTTTTTTGGATTTCTTATTTTTTATCTTTATTATTATCATAATATATCA
TTTCTTGCCTATCCCATTTTTGTTTATACATTTAGCTCTCCTTAATT
|
quality values | Open.Hide. 6 6 6 8 8 9 3 0 0 0 0 3 7 8 9 9 7 8 8 9 11 15 13 8 8 8 8 8 8 19 19 24 24 20 22 20 21 18 26 26 35 36 33 36 33 36 33 33 33 33
33 41 39 39 39 39 39 39 44 37 33 33 33 33 31 33 36 36 36 36 50 59 41 41 30 28 28 12 10 9 9 10 12 13 28 24 34 30 41 41 50 53 53 53 53 53 53 53 53 53
53 53 53 53 57 53 53 53 53 68 68 68 68 29 26 19 14 14 19 18 19 24 36 36 41 46 48 54 50 68 68 68 68 68 68 68 57 42 37 37 37 42 42 59 54 68 68 68 68 51
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 53 53 53 53 53 44 44 39 37 33 22 19 8 8 6 6 6 9 22 23 34 30 37 37 33 33
33 33 33 39 48 57 59 57 57 53 53 53 53 53 53 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 44
32 26 13 13 13 24 32 32 46 57 57 59 57 54 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59
30 30 15 21 18 18 14 11 9 8 8 8 8 8 8 10 12 18 18 32 34 59 59 59 59 59 53 57 57 53 53 48 59 46 46 32 30 15 15 10 10 10 10 10 11 12 24 24 28 32
28 35 59 59 59 59 59 57 53 53 53 53 53 57 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 59 59 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 59 59 59 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 59
59 59 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 68 68 68 68 59 59 57 57 57 68 57 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 59 59 59 57 48 48
48 48 48 57 57 57 57 50 57 57 57 57 59 59 48 48 59 59 59 59 59 44 30 26 26 30 30 33 59 59 50 50 50 50 50 50 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57
57 57 59 59 59 59 59 57 57 57 57 48 48 48 59 59 59 48 48 37 37 37 37 37 37 39 37 37 39 39 39 47 47 41 39 30 25 24 24 30 30 32 32 37 37 37 32 32 31 31
37 39 34 28 28 28 37 37 37 37 37 43 43 43 39 34 43 43 37 37 39 39 41 41 47 39 39 36 31 39 37 39 39 25 25 24 28 24 22 22 28 34 30 18 18 22 22 25 15 22
17 14 19 14 21 23 22 22 22 22 25 37 37 37 37 37 40 43 30 28 14 14 23 30 34 30 30 18 20 11 12 12 16 14 12 16 17 16 16 13 13 10 10 10 13 14 18 15 13 11
22 23 37 24 23 19 25 24 23 28 30 34 24 13 10 8 8 8 12 8 10 10 12 16 32 29 29 32 29 20 25 18 14 18 15 16 12 13 10 10 9 10 13 17 17 10 10 9 10 15
12 22 13 15 14 14 10 8 8 8 8 8 8 13 15 10 10 10 10 8 9 8 15 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 12 8 8 8 8 12 19 10 10 9 9 9 9 11 10 14 9
8 8 8 8 8 6 8 6 6 8 6 8 8 15 15 12 8 6 6 8 8 9 9 9 11 9 9 9 9 9 8 10 17 19 8 8 10 8 8 8 8 13 10 8 8 8 8 8 10 10
10 10 12 10 10 10 9 15 12 9 9 8 8 6 6 8 8 8 10 8 8 6 6 10 6 8 8 8 9 8 8 9 9 8 8 8 8 13 19 19 14 11 10 12 11 11 11 8 8 13
10 10 8 7 9 9 9 10 10 12 12 10 12 10 16 13 13 10 8 8 8 8 8 9 9 9 9 10 14 12 16 15 8 8 8 10 8 8 6 6 6 6 6 8 9 9 10 15 10 9
9 9 10 10 11 12 8 8 8 8 10 6 6 8 8 12 19 18 12 13 12 8 8 8 8 8 8 10 9 9 13 13 10 8 8 8 10 8 8 9 13 11 12 15 17 18 21 15 15 9
9 14 12 21 15 15 18 21 14 14 | Open.Hide. 0 3 7 7 8 8 10 11 9 3 0 0 0 0 0 3 6 6 6 6 6 6 3 0 3 6 6 8 6 6 6 7 8 12 11 8 7 9 9 12 16 19 19 19 9 9 10 23 22 29
20 20 28 28 35 35 36 37 42 37 36 36 36 38 38 53 53 50 50 50 50 47 30 27 9 9 9 9 10 10 17 6 6 6 6 8 15 21 30 33 30 31 31 31 36 36 38 53 53 53
53 53 53 50 38 38 36 36 36 47 33 33 33 26 26 15 13 10 8 6 6 7 8 8 8 8 10 17 19 39 36 39 43 37 37 35 35 19 13 9 9 9 19 21 37 37 50 50 50 50
53 53 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 47 47 47 47 47 47 47 47 42 42 42 38 50 50 53 53 53 53 50 50 50 50 42 30 21 10 8 6 6 6 8 8 6 8 10 11 30 34
37 32 35 35 39 39 43 44 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 59 57 57 57 54 54 54 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 68 59 57 57
57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 53 53 50 50 50 59
59 36 30 28 12 12 10 11 11 15 15 28 30 41 48 50 50 50 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 48 48 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59
39 39 34 34 24 21 8 8 8 11 8 11 11 12 15 15 12 13 13 17 28 24 36 36 39 57 57 57 57 57 57 59 44 43 37 37 41 43 59 34 31 16 18 10 10 10 12 14 18 31
43 34 43 41 47 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 57 57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 68 68 59 59 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 59 57
57 57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 54 54 54 59 59 68 68 59 59 59 59 59 68 68 68 68 57 57 57 54 54 54 54 68 68 59 59 59 57 57 57 57 48 48 47 48 57 59
57 57 57 48 59 59 59 59 59 57 48 48 48 48 48 57 59 59 59 43 43 43 41 41 41 59 44 44 44 39 39 44 41 41 41 40 40 41 43 46 46 46 47 46 59 59 47 59 44 41
41 43 59 59 41 41 41 41 48 47 37 48 40 39 41 37 47 41 35 31 27 27 12 18 18 28 14 17 30 30 23 23 21 24 24 34 28 29 32 20 20 20 32 32 34 30 33 36 30 26
31 41 35 32 29 30 30 30 30 37 30 27 18 21 11 16 16 19 19 33 37 32 28 33 28 32 37 32 29 29 32 37 24 17 12 11 11 16 23 25 32 31 25 19 19 19 22 24 29 32
27 27 30 34 36 32 17 11 9 12 11 13 9 9 9 18 18 24 24 28 34 32 24 19 19 32 29 30 30 18 17 11 11 11 14 18 31 20 24 21 20 19 15 19 19 17 17 15 15 10
10 10 10 10 11 15 9 9 8 8 8 8 19 18 19 16 11 8 10 8 8 7 9 10 10 10 12 18 19 19 10 9 9 8 8 8 8 10 10 9 10 12 9 9 9 12 11 8 9 13
9 9 9 9 14 10 8 8 10 9 10 11 12 9 11 10 9 9 8 8 8 8 10 10 13 13 11 11 11 21 21 28 10 12 8 8 8 8 10 10 8 13 8 8 8 10 11 9 9 12
10 12 10 10 10 10 18 11 11 6 6 6 6 10 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 12 11 11 8 10 9 11 19 19 26 17 13 12 10 10 8 8 10 13
9 8 8 8 8 8 9 10 10 10 10 8 8 8 6 6 6 8 6 8 8 10 10 8 8 11 13 24 23 15 11 8 8 8 11 6 7 8 8 10 12 11 11 11 12 11 10 9 9 9
9 9 10 12 12 13 9 9 9 9 8 8 10 8 8 8 7 7 7 11 12 12 10 10 10 10 11 13 9 9 9 11 11 12 10 15 10 8 6 6 8 8 8 8 10 8 8 10 10 7
9 10 11 9 10 9 9 7 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 14 15 8 8 6 8 6 6 10 8 11 11 12 16 10 10 10 8 6 6 7 7 9 6 8 8 10 10 9 9
11 8 8 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 6 6 8 10 16 23 11 11 8 13 7 6 6 6 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 8 8 |