| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-152C23.T7 (MSMg01no152_c23.b1) | MSMg01-152C23.TJ (MSMg01no152_c23.g1) |
|---|
| ACC | AG354139 | AG354140 |
|---|
| length | 719 | 855 |
|---|
length of high quality
(start - end) | 169 (159 - 327) | --- |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no152_c23.b1 PHD_FILE: MSMg01no152_c23.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:16:13 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no152_c23.g1 PHD_FILE: MSMg01no152_c23.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:16:13 2005 |
|---|
| singlet/doublet | singlet | --- |
|---|
| BLAST hit | unique | no hit data |
|---|
| sequence | CATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCTGACACGATCCGCGGA
ATTCAAATCATCATTGACCAGAACAAGAATCTAGCAGAGATTACATTGTC
ACAGGAATGCCATCCTCATATTAGCAGAATAAAGAGAATAGCTAACTCAT
AGATTGCATAAAACTGTTTTTTAAATAATACTTCTAGATTTTAAAGTCAG
TTATGGACAAAATGCATTAGAATAATTAATTATCACAATTATGGGTGTGC
TTTTCAAGCAACAGTTTGTGTGCAAACACGTTCTTAGTCTCTTATGTGCC
TAAGTGTCTACTTTGGACTATGAATGAAGCAGTGCAGCAAGCTATGGAAT
GATGGCAGTATGCGCTTCGATCTTTTCTTAATTTCCTTCTCCAGGTAACG
TTCTTATTTCCTTTCTAGATTCCATCTTGATCTTTAATTATGCTCTATAA
TTGTCTCTGTGGGAAAACATCTGCTATTGCCTACCCATTCGTTCCTGCGT
TATGTCAGATTCCCTGCGGACTATACCATAACTAGTTGATATTGAACTTT
CTAGTTGCCTTCTGATCATTTTCCCCCCTGACGGTATGGCTAGGACTAGA
AAAATTACCCCTACCCTTTTAATACACCTTAACACACGTTTCTTATCAAT
ACCATATTACGAAACTCCTAACATTACCTCCGCGGCCTAGAGCTATTATT
TCACGTTAACAGTTTGCGG
| CCGATGCTACCGCGACGGCCGGCGCGCGGCCGGGCTTCGACCTTTAGGCG
GCGGGATGGGGCGGATTCGCGGCATTCCGCGGTGACGCGCGTGGCCGCCG
GTGGGCGTCTCTCGTCGGGGCGGCGATTCGGCGCGGCCGCACGCTTTNNN
TTTCTCGCCCTCTTANGTCTTCTCGCTCGCAATACCCCATCCCGTGGCAC
CATGAACTGAGTCCCCGATGGCCAAGGTTCGCGCTTCTCCCCTCTATCCC
TCCTGCGCCGGCCCCGGCGATCCTCGGGTCTATACGTCGACTCACACCCG
GGCGCCATACGAGCTTTCCTTACCGCGCCCCTCGCCTGCGACCGCAACGG
CGCGTCGGCTCCTTTTATCATTTGCCAGCCCCGTTCGCCCGCCGAGACGG
AGACGTCTTTCTCTGCCTCCGCGGCCGGACGACCCTCCCCCGGTCCCCCG
CCTTTCCCCCGGCCGGCTGTGTTTCCTACCCCCCTTTTCGTCCCCTTACT
CTCCCTCGTTCGGCGCCCTCACGCACGGCCCGTCCGGGCGCGCGGCCCGC
GGTTCCGCCGGGCCACCCCCGTTCTGGCGCCCGCCAGTGCCCCGGTTTGT
GTACTGCCGCGCTCCCCTGGCGTGGCTGTTGGGGTCGTGTCGTCGCGGGC
TGTTTTGTCCCCTTGCGCGCGGGGTGTCTGACGGGGCGGGGCCGTTTCCC
CCGGCCGCGCCCGGCCCTATTTCCCCTTCCCCCTCCGGTGACACGCGCCC
CCGCCGCCAGTGCCGGGACCGGCGCTGTCTGTTCTGTTCCGCCCGCGCCT
GTGTTTTCCCCAGTCTCCGCCGGGGGGCCTTCCCCTGCCCGTGTCCCCCC
GGGGA
|
|---|
| quality values | Open.Hide. 6 6 6 7 7 9 14 30 28 24 25 12 13 10 17 17 25 25 30 33 33 33 30 30 12 12 10 10 10 14 16 21 10 8 6 6 6 6 8 6 8 9 9 18 10 12 12 12 9 22
22 22 23 10 11 11 25 25 24 21 21 12 12 12 12 14 14 11 13 11 12 11 18 18 22 19 15 15 10 10 10 23 14 19 14 14 14 19 26 23 33 26 22 19 19 19 29 23 21 12
12 20 23 24 29 20 20 11 12 12 15 15 15 15 14 16 19 19 23 34 25 34 16 16 11 11 11 11 11 16 16 19 17 17 20 20 19 18 18 11 13 13 14 11 8 8 8 10 10 16
17 11 11 19 19 11 13 14 21 30 32 21 21 15 18 14 26 14 22 22 28 28 28 37 37 43 43 43 43 43 43 34 32 20 20 19 19 19 33 33 39 43 30 30 17 18 18 25 13 13
13 28 28 36 37 37 39 39 43 30 30 14 15 15 30 32 18 16 11 11 24 24 57 57 57 43 43 37 37 32 43 24 24 12 12 12 26 26 43 43 35 35 32 32 20 20 20 27 27 37
41 43 37 33 32 32 32 35 35 35 35 36 36 18 18 11 12 12 32 24 14 14 14 18 27 36 39 44 36 36 23 27 27 30 32 23 23 11 11 11 20 23 37 24 24 20 20 20 41 31
31 28 21 13 13 13 13 17 30 21 28 28 30 28 28 37 39 39 43 43 34 34 19 19 12 15 11 12 12 10 10 10 11 18 18 20 18 21 14 12 12 19 19 18 21 15 25 25 12 12
13 19 13 12 12 20 20 23 28 15 12 8 8 8 15 19 37 30 30 28 32 24 28 32 32 32 23 21 21 32 32 35 37 39 39 39 37 37 39 39 37 26 19 12 12 10 17 10 9 9
10 11 31 26 31 23 23 28 28 32 23 23 18 24 28 30 39 39 47 43 43 43 36 36 29 32 19 20 23 24 14 14 15 18 21 28 20 23 28 28 32 28 32 24 15 15 14 12 12 22
22 33 24 24 12 18 18 19 11 12 12 12 15 15 29 25 28 24 15 15 12 12 15 26 28 24 17 17 18 24 22 35 35 36 34 37 37 37 34 34 34 35 32 31 21 15 8 8 8 15
17 37 39 25 22 11 11 11 11 15 21 23 30 23 21 17 13 10 10 22 25 37 41 28 28 13 17 19 28 26 39 34 31 18 14 14 18 28 32 28 28 18 18 23 28 30 15 14 13 22
12 12 11 12 12 11 12 13 17 22 15 13 13 13 12 19 11 13 13 16 18 17 13 9 9 9 13 14 12 10 10 10 13 13 10 11 12 12 19 16 12 11 11 11 11 10 10 10 10 10
15 16 17 17 18 18 17 17 14 15 9 8 8 7 6 7 8 8 8 17 18 12 12 8 6 6 6 8 8 11 12 12 11 9 7 8 8 8 8 8 13 12 12 12 11 11 11 13 16 13
12 10 11 11 15 9 14 12 13 11 11 11 11 11 11 11 11 12 11 11 11 12 18 9 11 11 16 15 10 13 8 10 12 9 9 10 8 8 11 11 11 18 18 21 22 19 17 9 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 12 9 9 9 10 12 18 12 12 12 12 | Open.Hide. 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 8 9 9 10 8 8 6 6 6 6 6 9 12 11 11 8 8 8 8 8 8 11 9 9 8 8
8 8 8 8 6 8 8 11 15 9 12 11 12 11 11 9 11 11 11 13 11 10 10 10 10 10 10 11 11 12 12 11 11 10 9 11 8 8 8 8 8 8 11 13 15 10 10 10 9 8
8 6 6 8 8 8 8 6 6 8 8 11 11 12 11 11 11 11 11 11 11 11 12 12 10 8 8 8 8 8 8 11 12 11 11 12 6 6 6 6 6 6 10 7 7 9 3 0 0 0
3 9 9 6 6 6 6 8 8 8 8 7 8 9 3 0 3 9 8 8 6 7 10 8 8 8 10 10 10 11 8 8 6 6 8 8 9 8 8 6 6 8 8 6 6 6 8 7 7 11
8 8 9 11 8 8 8 8 8 6 6 6 8 11 8 7 7 8 8 6 6 8 8 8 9 9 10 8 8 8 6 8 8 11 8 8 8 8 8 8 9 9 16 8 8 8 10 11 8 9
11 8 6 6 6 8 9 9 9 9 9 9 9 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 10 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 9 9 6 8 6 6 8 8 10 10 10 10
9 6 8 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 9 9 8 6 8 6 6 10 6 6 8 8 9 9 10 12 10 8 8 6 6 8 6 6 6 6 8 6 6 8 8 8 8 6 6 8 8
9 9 8 8 8 8 6 8 10 8 8 8 11 10 10 10 8 8 6 6 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 9 10 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 7 6 8 6 6 6 6
7 9 9 9 9 9 9 8 8 8 8 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 11 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 8 6 10 8 8 8 8 8 6 6 6 6 10 10 12 10 9
10 10 9 9 9 9 14 14 18 11 11 11 11 13 6 6 6 6 6 7 10 8 18 11 9 9 9 9 9 10 12 10 9 9 13 13 23 12 10 9 9 9 9 17 10 10 10 10 8 10
8 8 8 8 9 9 9 9 9 13 10 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 11 11 11 8 8 8 8 6 7 6 7 8 8 13 10 10 11 12 14 10 10 12 7 6 8 8 9 9
10 8 8 10 8 8 8 11 10 6 6 6 6 6 6 8 10 15 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 10 8 10 10 10 6 6 6 8 8 10 23 19 8 8 6 6 8 6 6 8
8 7 7 7 8 9 9 9 8 8 8 9 9 9 16 16 11 10 9 9 10 9 10 11 17 6 6 6 6 8 8 11 8 8 6 9 8 8 9 10 10 10 10 6 6 7 7 10 8 12
10 12 12 19 15 8 8 8 8 8 8 9 9 9 10 9 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 6 6 8 6 9 10 11 6 6 6 7 6 10 10 9 9 9 9 9 10 12 15 16
16 16 11 8 8 6 6 9 8 11 8 9 9 9 10 10 13 9 9 10 11 9 9 10 10 12 18 9 9 11 10 8 8 8 10 10 8 8 6 6 6 6 8 8 10 10 10 11 11 23
18 15 12 12 9 9 9 9 8 8 8 8 10 10 13 9 9 6 6 6 6 6 6 17 8 9 8 10 10 8 8 8 13 6 6 6 6 8 8 6 9 12 7 9 8 8 8 8 8 8
8 8 11 12 12 10 10 9 8 10 6 6 8 8 8 6 8 7 7 10 8 10 13 11 8 8 8 8 11 11 24 23 15 8 8 8 6 8 8 8 8 8 9 11 11 11 15 8 8 8
8 8 8 6 6 |
|---|
