BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-190L18.T7 (MSMg01no190_l18.b1) | MSMg01-190L18.TJ (MSMg01no190_l18.g1) |
ACC | AG380973 | AG380974 |
length | 831 | 983 |
length of high quality (start - end) | 278 (96 - 373) | --- |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no190_l18.b1 PHD_FILE: MSMg01no190_l18.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:07:06 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no190_l18.g1 PHD_FILE: MSMg01no190_l18.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:07:06 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | CGAGGCGCCGCGACAAATTAAAAAAAAAAATTAAAACCCTTNNNNNTCTT
CTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGG
AATTCTTTGCAATCTGTTAATAACTGAGCTTGCTGCCCTTGAAAACTGAG
CAAAGACTTCCCTCATTCAGAATCATAGAATAATTAATCAATAAATCCTA
ATATTATACCCACAGAGAGAGAGGGAGAGGGAAAGGGAGAGAGCAAAAAC
TACCCTTGCTAACTCATCTGCCCATTATCTTGAAGAGGAATCTATTTTTG
CACACTAGGTGATTTATGAAGCATACATTGTCATTTCAGACCACAAATGT
CAAAAAGTTAAAGGAGGGTAGCCAATTAAAAGCATTATGAATAATCCCGC
CTCACTTTCAAACCTTTTTTTGTTTCCCCCCCCCCCGCCAATTCCTACAT
TTTTATCCCTTTTGTTAATTCCTCATGACGATGAACAAACAGACACTTAT
TAGGAGTGATGTCATTTAATCAGTTTGGGTAGAATCTACATAGATCAGTT
CAGAGTTGAATGACATTTGTTCATCTCTGCTAGCTAAATTATAAAGTCTT
TTTCTTTTTCTGACTTTATCCAAATCTGAATAATTAACTAATGTTCTTAA
GCCCTATTTCCCCCTATTCTTTCTACTCACACTTAATTATCGCCGCCAAA
ATAACAAATTAACTCGCTGCAATGATTCGTTCTAATGTGCCCTCCTGGTC
CTATTCAAATAAATCCGTCGCCGCTTTTGCCGATTCCTCCCCCGCCGATT
AATTCCTCGATAAAAAGCATCCACTCACCAT
| ATACCCCCCTTATAAATACCGCAAACCCACCCCCCATCCCCCCCACTNTT
TTACTATGATATTGTXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTCGATGATCGTCCTACT
CTTGCGACGCGCTCGACTCGACCAGCGAGCAACGACGTCTGTCTACAGGA
TCCTTCTGCACACGATTTATCTGGGAGAGCTTCGATACGCAGAGGACGAA
AAGACTTTTATGGCCAGGAGCTCGCAGCTGCCTTTTATAGGCCTTAGGTA
GAGGCGTGTCTCACACCCTGCACGGGTTATGCTCTAGAGCCTCATTTTGC
ATGCATCCTCATACAGATTGGTATATTCTCTACTCAGAACCTTACAGATG
AGTCATTATCAGTACCTCAGTGTGCCTCGCCTCATAATCCGATTTGCATT
ACTCTTTGATAATTTCCCCCCCCCCCCCCCCACTTATTAGTGTCATCTAT
TTGGAACGATCTTACAATCTTGATTGCTTTAAAAAAAAAAAAAAACCACC
ACTTGATTCGGTTGGGGCCAATGCAACGGACGCCACTTCATTGTATTTCC
GAACAAACAACATTTACTTGCATTATGATATAACTTGCCGGTTTGTCTTT
GTCCTACCACCCATATCGCCCTGTATTGTTTCAGTCCTAATTTTCCCAGG
GTACGGCACCCTTTTTATCGCCCATATATGAAGCTTCTTTATTCTATTTG
TTTACTTACTCGTTTCGTTCTTCACCTTTATAATTTGTTTGCCCTGTGCA
TCTCCCGATTTCCGTTATCATAATCATTTTTCCCCCTTCCTTGATTTGTT
CCCACTTTTAATGGTTTCACGATTGTTTGCACCACCTCTCACCCAATTTG
TTTTATTGTGTTATTCTTATTTCGACCCGCCTTTATTATTCGTATATATT
ACTAAACACTCATCGCCTTCTACATCACTTCTC
|
quality values | Open.Hide. 6 8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 6 6 6 11 10 12 10 12 9 9 9 10 11 15 13 14 14 14 12 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 3 0 0 0 0 0 3 6 8 8
8 13 9 10 10 15 13 14 27 30 37 39 25 19 19 25 30 30 30 33 36 30 30 33 36 36 38 47 47 47 43 43 37 30 28 18 23 18 26 26 24 19 12 14 14 26 25 36 26 26
32 28 28 41 41 54 54 48 47 47 47 47 42 32 29 20 20 29 29 50 50 48 47 47 42 32 27 17 17 28 34 42 47 57 48 54 57 59 57 42 42 35 37 36 43 43 43 43 22 27
32 43 43 44 50 57 57 38 43 25 31 28 44 44 57 44 43 32 23 22 22 32 43 37 32 38 38 24 24 32 32 35 37 43 57 50 50 47 57 41 57 57 57 52 52 52 57 57 43 43
39 43 43 52 57 57 57 57 42 39 35 38 43 35 29 27 27 35 43 42 52 43 43 42 34 34 20 20 35 41 38 35 43 43 43 35 43 62 62 62 43 43 41 57 57 59 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 54 54 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 45 45 45 57 52 52 52 57 57 57 57 52 43 43 43 43 43 43 43 52 52 52 52 52 52 52 52 52 52 50 50
37 37 37 50 43 50 35 35 43 37 36 43 43 43 43 43 43 43 44 43 29 29 35 43 43 43 43 32 32 20 20 32 43 42 42 42 37 32 32 32 42 43 39 37 43 57 44 42 36 31
22 18 17 18 19 19 12 12 12 24 23 30 30 36 24 28 28 28 36 25 19 19 15 14 15 22 21 12 12 16 18 21 18 23 23 30 30 30 30 30 32 30 30 32 39 39 43 47 47 48
48 43 43 43 43 30 30 16 19 19 23 15 11 11 12 10 11 19 20 27 13 15 12 12 11 11 14 16 19 15 16 14 10 8 8 8 8 13 10 13 13 19 30 41 59 59 48 48 48 47
43 43 43 39 39 35 24 27 14 15 15 28 21 18 18 23 23 22 22 28 37 30 33 28 30 30 30 26 16 16 10 10 9 16 11 12 12 15 12 12 10 13 11 13 13 25 25 24 22 18
18 21 18 18 11 11 11 23 18 14 14 14 26 26 36 39 37 37 24 16 16 12 12 16 23 21 12 10 10 10 10 13 16 19 19 28 34 30 35 23 23 16 18 15 22 21 24 16 15 14
21 14 14 16 22 19 17 18 18 13 13 15 16 10 10 10 9 8 8 8 10 13 13 12 12 11 8 8 6 6 7 6 8 8 9 9 10 12 15 18 25 18 20 16 13 13 8 8 8 11
14 13 15 6 6 8 8 12 21 23 26 15 12 9 9 9 10 10 8 8 8 8 10 10 10 10 10 15 15 8 8 8 13 15 8 10 9 9 10 10 13 9 8 6 8 6 11 8 10 10
10 9 9 9 10 9 12 13 17 14 14 12 12 16 10 10 10 9 9 8 10 6 6 6 8 8 12 9 9 8 9 10 9 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 10 10 16 11
11 11 12 11 11 9 8 6 6 6 6 8 6 10 10 10 10 9 9 9 9 10 10 8 8 8 8 8 6 8 6 6 8 8 8 6 6 8 10 10 8 9 10 9 9 9 11 11 11 10
17 15 13 9 9 9 9 9 9 9 12 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 11 8 8 8 11 11 11 11 7 7 6 8 8 6 6 8
8 6 6 8 8 11 12 11 6 6 7 7 8 8 8 10 9 9 9 9 9 9 9 8 8 8 6 6 8 6 6 | Open.Hide. 8 8 8 8 8 8 10 10 9 9 9 9 9 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 8 8 8 8 11 16 10 11 6 6 6 8 6 9 15 21 10 6 6 3 0 3 10
9 9 9 9 9 9 10 10 10 10 10 16 16 9 9 9 15 15 17 22 24 15 11 11 11 11 16 23 23 11 12 12 23 15 9 9 9 9 15 30 37 30 24 19 12 11 11 23 26 23
12 12 10 13 19 22 24 24 25 25 19 13 8 8 8 11 15 24 29 28 28 30 29 19 15 9 8 8 13 15 17 17 10 7 7 10 17 17 20 15 12 8 6 6 13 15 10 8 8 13
13 28 28 18 10 8 6 6 10 15 15 23 30 32 32 28 28 28 28 28 30 37 25 10 11 6 6 8 10 10 8 9 13 15 17 11 8 8 8 12 9 9 12 12 20 22 21 17 20 15
17 12 14 23 28 25 23 18 14 14 14 13 11 6 6 7 8 12 8 15 15 15 10 8 12 12 11 11 12 15 11 6 6 8 15 8 8 7 8 8 8 11 8 10 8 8 8 10 12 12
14 12 16 12 19 19 13 11 8 8 10 10 10 10 15 13 15 14 19 15 10 12 8 8 8 6 6 12 12 15 10 8 8 10 10 19 28 19 18 14 8 8 8 8 12 10 13 15 10 10
13 16 18 15 15 12 12 14 19 19 10 8 8 10 10 10 12 11 12 10 12 8 8 8 8 10 10 11 16 16 19 15 15 15 15 8 6 6 8 8 16 24 21 10 10 9 10 9 9 14
11 11 9 9 9 9 10 10 29 25 8 8 6 6 8 8 10 19 13 8 6 6 6 8 12 21 12 12 8 8 6 6 8 6 10 8 8 6 6 9 11 15 15 15 11 11 8 8 6 6
6 6 9 12 9 10 12 21 12 6 6 8 8 10 8 12 8 8 6 6 6 6 8 10 12 10 10 9 9 14 14 18 13 11 10 9 9 11 12 10 8 8 8 8 10 8 8 8 6 7
8 8 8 11 7 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 12 15 16 18 28 21 19 19 24 28 30 18 9 9 9 6 7 8 11 11 10 11 10 15 7 6 7 6 8 8 8 8 10 10 12
15 15 8 8 8 8 8 10 10 13 12 10 8 10 6 7 7 8 8 11 7 9 14 10 12 11 11 11 11 11 12 13 16 19 19 22 20 19 32 37 30 24 22 13 11 11 9 8 8 8
8 6 6 6 6 8 8 8 8 9 9 9 11 11 10 10 10 10 10 10 9 11 11 10 10 10 10 10 13 11 11 8 6 8 10 8 8 9 10 11 10 12 8 8 8 8 9 9 8 8
8 8 8 11 15 10 10 10 10 8 8 6 7 10 9 8 10 8 10 8 8 8 8 8 8 9 9 9 10 9 9 9 8 8 8 8 8 6 6 6 8 6 11 10 14 14 15 16 27 16
12 10 10 10 9 10 8 8 8 9 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 11 11 15 13 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 10 6 6
6 6 8 8 10 10 10 12 17 12 21 16 19 16 14 10 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 10 8 9 10 9 10 8 8 8 8 9 11 10 10 10 10 10 10 8 8
8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 11 12 10 8 6 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 15 16 8 8 8 8 8 8 8 8 8
6 6 6 6 6 6 6 8 6 8 10 8 8 8 8 8 9 9 10 11 10 10 13 10 8 8 8 10 8 13 18 24 17 20 21 10 10 10 13 10 10 8 8 8 8 12 8 8 8 8
8 8 8 8 8 10 13 12 8 8 8 8 8 8 9 11 12 7 9 9 10 10 8 6 6 6 6 8 8 9 9 9 11 11 11 10 12 14 15 11 12 6 8 6 6 6 6 10 8 9
9 13 9 8 8 8 8 11 10 10 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 6 6 6 6 6 8 11 12 9 10 13 12 12 18 15 18 10 10 12 6 6 6 6 10 6 9 10 13 16 17
6 6 6 6 8 6 8 8 8 8 8 9 9 8 10 8 10 10 12 6 6 6 6 8 6 9 8 8 10 13 13 13 13 |