BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-192P13.T7 (MSMg01no192_p13.b1) | MSMg01-192P13.TJ (MSMg01no192_p13.g1) |
ACC | AG382468 | AG382469 |
length | 1,203 | 1,236 |
length of high quality (start - end) | 276 (120 - 395) | 377 (71 - 447) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no192_p13.b1 PHD_FILE: MSMg01no192_p13.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:11:06 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no192_p13.g1 PHD_FILE: MSMg01no192_p13.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:11:06 2005 |
singlet/doublet | doublet | doublet |
---|
BLAST hit | unique | plural |
---|
Map location. | (25,464,020 - 25,464,292) | (25,394,085 - 25,394,461) |
---|
sequence | NNCCGGCATTGGGGCTATAGACTACTAAGGGAGAGGATCCGCGGAATTAG
AACCCATCACTAGCCCTTTAAATTGCAATTAGAGATATATCTGTGGGGAG
ATACCCTTTAAACCACCGCTGTCAGGAGGGAGCCACTTCTCAGCAACCAC
GCCTTCAAATTCATCTGCATTAACTTACCCACTCTCCACTTCTCTGGAAT
GTGGACCTTCTGGCAGGAGGGACTTGAACTCAGCCCTGTGTTTCTTATTC
TGCAGTTTGGTGCAGATGGACATGATGACTCAGCCAATGTGAACCCTAGC
CACTGTGCCCCGGGGCTTCCCATTGGCACCCCACATACCTACCTGTCTGA
AGCCTGGATTGGGGACAACACTGAGATCAGGGACTTAAATAATTTTTTTT
AAANNACNCCAAGGNCNCNAAGGGCAACCCAGAACGGAAACATTTTTTTT
TTTCCCCCCCCCCCGAAAAGNGCCCCCCCCCCAAAGAGAAAGGGGGGGGN
NNGNNCNNGNNNGNCNNNNNNGNNNGCNGGCGNNNGNNGCGNNNNNNCGG
CNGGNCNGCGCCGCCNCNNGCCGGCCCGGGCCCCNNGGNNGGCCCCNNGG
GGGNGGGCCCGGCNCCCCCGCCCGGGCCCCCNCGCCGGCCGGCNGCGGCC
GCGCGCGCGCCGGCCCCCCCCCCCCGCCCCCCCGCCGGCGCGCCCGCGCC
CCCCCCCCGGGGCCCCCCCGCCCCGCCCGCCGCCCCCCCGCCCGGCCCCC
CCGCCCCCCCGCCGCCCGGGCCCCGCCCCGGCCGCCCCCCCGGCCCCCCC
CGCCCCGCGCGGCCCCCCCCGCCCGCCCCCCCGCGCGCGCGGCCCCCCGC
CCCCGCCCCCGCGCCCCCCGCCCCCCCGCCCGGGGCGGCCCCCGCCCCGG
CCCCGNCCGCCCCCCCCCGCCCCCGCCGCCCGCGGGCCCCCGCCGCCCCN
CCCCCCCCGCGCCCCCGCCCGCGCGCCCGCCGCCGCGGCCGCCCGGCCCG
CCGGGCGCCCCCCGGCCCGCCCGCCCGCCCCCCCGCCGCCCGCCCGCGGC
GCCCCGCCGCCCCCGCCGCCCCGCCGCCGCCCGCCCCCCCCCCCGCGGCC
GCGCCCGCCGCCCGCGCGCCCCCCGGCGCCGCGCCCCCCCCCCCCGCGCC
CCCCCCCGGNCCCCGCGCGCCCCGCCGCCCCCCGCGCCGCCCCGCCCGCC
CCG
| NNGGGCTGATGGAGCCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXGTAATGAGATGGTTTGGGGGACTTCAGTTT
TAAAGTGTGTGTGTATGAGAGAGAGAAAGAGAGAGAGACCTACAGACCTG
CTAATCGTGAACTTCTAAACTTCAGGTGGACCTTTCCAAGGATATTCAGC
ACTGGGAAGCTCTGAAACCCGATGAGAGACATTTTATATCTCACGTTCTG
GCTTTCTTTGCAGCGAGTGATGGCATAGTCAATGAGAACTTGGTGAGTTG
GCATGAAATACCCATAATTCACTTAGATCCAGAACTGGTTCCTGGCTCTC
TATCTTTTGCCCTGAAGCGGGGCTGGAGGGATAGATGACTGACTCCTGTC
TCCGCTCTGGTTAACACACTTCCTGCTTGGGCGGAAGACCCAGGTTCTTT
TTTTCCCCCCCCCTGTTGGACTGCTTCCCATCTGAAAAAAGAGGGGTCTC
ACCAAGGCAACTCTGACCTTGGGCACTTGCCTATACATGCACGGACCCAT
TCCCAGGCAAGCACAAGCAAAACAAACTTTTTAAGAGCTATGAATGTTAT
GTTAACGTTCATCATGTTAGTCTTTCCCTCTGCTAAGGAGCAGTAGTGAG
TTTTTCTCTTTGTACCTACATGCTTAACTTTTTGTGGATTTCCATAAGAC
TTTGGCTGTATACTTCCTTAACTCCAAGTGGTTCCTTGTAATGAACTTGA
ACCAGAATTAGGGATTAACTGTGTTTAAAGAAACCCCTGTGGGGCCCGGG
GTGGTCCTCCAAGGTTTTTAACTCTTGTATTTTTTTGTTAAATACTTGGC
ATATTACTATTAATTGGTTTCCAATTGGTTCATTTTCACGTTATAACCTT
CATAATTATCCTTGTTTGTCTTTCCTGTTTATCCTCCTTTATTTTCGTCT
TCTTCGCTCTTTAATACTATCCTTTTTTTTTTTCTTTTTCCATTTTTTAT
TTTTATAAACTTTTTTTTTTATTCTTTCTTATCCTTCTTTTTTTTATATT
TTTACTATCTCTCTACTTTCTCTTTCTTCTTTTTTATTTCTTTCTCACTT
CTGTTTTCTTCTCATCTACTCTCTTTCTTTATCTTTTTACTTCTCTTCTT
TGTATCCTATCTATTTTCTCACTTTATCCTATACTTTCTATTTCTTTATC
TCTCCTTCCTCTTTTTCTTTCCCTCTTTTCCGTTCT
|
quality values | Open.Hide. 0 0 3 6 6 6 9 9 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 13 10 10 8 12 8 8 8 19 21 28 19 19 17 22 20 28 37 37 37 37 39 39 37 21 19 10 10 9 21
21 59 33 31 31 31 28 28 31 33 21 21 9 9 8 9 11 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 11 21 26 36 36 53 53 53 53 53 42 47 38 38 33 36 33 33 37 37 41 37
21 21 9 9 9 10 12 17 21 17 16 11 11 11 12 12 13 13 11 19 18 30 31 33 50 50 50 53 43 43 35 35 35 39 39 44 47 53 50 50 50 50 57 57 59 59 68 68 59 59
57 57 57 53 53 50 50 50 53 48 53 47 47 47 50 50 47 53 33 33 33 33 37 23 21 11 9 9 10 10 12 12 27 27 47 47 41 41 25 28 32 30 30 24 32 32 57 59 47 47
43 59 44 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 57 57 54 54 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57
57 68 68 68 68 57 57 57 59 59 59 59 59 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 46 46 46 43 43 43 43 48 48 57 59 59 59 59 59 57 57
57 57 53 50 50 50 53 53 57 59 59 59 50 50 50 50 41 27 22 12 11 11 11 11 11 9 16 20 34 41 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57
57 57 57 68 68 68 68 57 57 57 57 59 54 50 50 53 53 57 59 59 57 50 53 47 43 39 39 39 48 57 47 47 41 44 39 50 59 31 27 15 9 9 9 13 13 20 20 12 9 9
9 9 3 0 0 3 3 0 3 27 27 27 27 3 0 3 0 3 0 3 7 7 15 14 14 17 28 29 35 39 27 25 11 11 11 12 11 11 27 23 16 12 9 10 12 23 26 35 32 19
14 12 10 10 10 12 19 26 37 35 29 11 9 9 8 7 6 6 6 3 0 3 7 8 8 10 10 17 15 21 14 14 12 17 9 11 9 9 9 12 12 11 10 10 12 11 12 17 3 0
0 0 3 0 0 3 0 0 3 0 0 0 3 0 3 0 0 0 0 0 0 3 0 0 0 3 3 0 3 11 11 3 0 0 0 3 0 0 3 6 3 0 0 0 0 0 0 3 7 7
3 0 3 3 0 3 0 3 9 9 9 9 9 11 3 0 3 0 0 3 9 9 10 23 17 11 9 7 7 6 6 6 17 3 0 0 3 3 0 0 3 17 8 6 6 3 0 0 3 16
23 18 3 0 3 9 7 8 6 6 8 9 3 0 3 10 11 8 6 6 6 6 6 7 7 6 6 6 6 6 3 0 3 6 6 6 8 8 8 6 6 6 3 0 3 6 6 7 6 8
6 6 8 6 6 8 6 6 9 9 7 9 9 7 7 8 9 10 9 9 7 8 8 8 8 8 8 8 9 10 11 9 12 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 13 15
21 9 7 7 7 8 10 10 10 8 6 8 10 10 8 8 8 8 6 6 6 6 9 10 14 12 11 8 6 6 6 6 8 8 9 9 15 12 9 9 7 17 15 10 10 7 9 10 11 15
19 8 8 8 8 8 11 6 6 6 6 8 17 11 6 6 6 6 6 6 9 9 7 6 6 6 8 8 9 9 9 7 7 8 9 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 12 11 11 11 18
18 13 9 9 9 8 8 8 8 8 8 10 11 11 17 15 16 15 8 6 6 7 8 8 8 8 10 12 14 15 15 14 12 10 10 7 7 7 8 8 9 9 8 9 12 6 6 6 6 6
6 13 10 6 6 6 6 10 10 8 8 8 9 9 9 9 8 6 8 6 6 10 11 20 10 10 9 8 8 8 8 11 8 6 6 6 6 10 8 8 6 8 6 6 8 15 14 10 10 10
10 10 8 6 3 0 3 8 8 10 10 9 9 9 17 11 8 8 6 6 8 10 10 12 10 10 6 6 8 8 8 9 8 8 10 10 15 10 10 10 10 12 9 9 9 9 13 10 3 0
3 7 6 6 6 10 11 11 11 9 9 9 11 11 8 7 7 7 13 8 10 11 10 9 9 8 8 8 8 9 9 9 6 8 6 6 8 8 13 9 9 9 12 9 6 6 6 6 6 6
8 8 8 7 9 9 8 8 11 11 11 10 9 9 9 9 9 10 8 6 7 6 6 8 10 10 12 8 8 8 8 8 8 10 10 10 9 9 8 8 8 8 15 10 6 6 8 6 9 9
11 10 11 13 8 7 7 6 6 6 6 6 6 8 8 6 6 6 6 6 8 9 9 9 12 16 9 9 10 10 10 10 10 11 9 10 10 10 10 10 10 9 12 10 9 9 9 9 8 8
12 10 10 8 8 6 6 8 6 8 6 8 6 6 6 7 8 8 9 14 15 16 15 9 8 6 6 6 8 8 10 6 6 8 8 10 9 9 9 8 6 6 6 6 8 10 11 12 12 11
11 9 14 12 10 10 6 6 3 0 3 10 7 7 7 6 8 6 6 6 8 13 10 8 10 9 9 10 8 11 11 11 8 8 8 6 6 8 8 8 13 13 9 7 7 10 8 9 8 6
6 6 6 | Open.Hide. 0 0 3 6 6 6 6 6 6 6 7 6 10 10 8 8 6 6 6 6 8 8 15 9 8 9 9 16 15 22 21 19 10 10 10 21 19 28 20 28 17 28 28 36 36 37 37 37 43 43
43 43 37 42 42 48 48 59 59 54 43 43 43 48 48 48 46 48 42 42 32 32 32 39 39 39 32 39 39 46 44 57 57 39 44 39 57 42 37 35 30 42 37 37 37 42 42 47 41 41
48 47 38 38 35 35 32 32 30 37 37 50 50 50 50 50 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 59 59 59 57 54 54 57 57 57 57 57 57 52 52 43 43 43 52 43 38 38 43 43 35
42 42 47 57 57 57 37 37 42 57 43 52 52 57 57 57 57 57 47 52 57 57 52 57 57 35 35 35 43 43 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 52 52 52 52 57 57 52 57 57 43
43 43 43 43 35 35 35 44 43 52 52 62 43 43 43 62 62 62 62 52 52 52 43 43 35 43 43 57 57 54 54 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 43 43 39
43 43 52 57 57 57 57 57 57 43 43 57 57 52 57 57 37 37 37 43 43 43 59 43 52 43 42 35 35 37 44 43 43 43 33 33 33 44 44 43 43 29 43 33 35 43 59 59 59 57
57 50 48 48 57 57 54 54 54 57 57 57 54 54 54 57 57 48 57 48 48 48 44 44 28 31 31 44 41 47 35 35 35 42 32 32 32 44 42 42 40 41 41 25 36 32 39 43 47 48
54 54 57 57 59 59 48 48 48 59 59 48 43 42 39 42 43 48 48 59 39 35 35 37 37 47 40 43 39 39 39 39 39 39 43 43 43 43 43 40 40 37 34 25 19 13 12 12 12 24
28 34 34 47 43 43 39 39 35 59 39 48 48 48 48 48 48 48 48 48 47 48 43 43 39 43 39 37 32 34 32 39 43 32 37 30 30 30 37 36 37 37 30 20 20 9 9 11 17 17
28 11 9 9 9 9 10 14 15 17 22 33 16 15 9 11 23 23 34 37 34 34 34 34 30 31 25 30 14 12 12 9 9 11 10 10 11 7 8 8 8 8 6 12 10 10 10 13 13 25
30 47 59 48 39 47 39 37 37 23 25 30 39 39 46 46 48 48 47 47 39 39 39 39 41 39 43 47 48 48 48 43 47 42 42 41 30 30 37 37 37 39 39 39 48 47 57 48 48 48
59 59 57 47 47 44 47 47 43 43 43 43 43 43 43 43 43 43 43 59 43 43 48 42 42 30 32 32 59 43 57 37 37 23 23 23 34 32 43 43 37 30 21 15 15 19 25 28 35 39
59 59 47 41 37 37 39 31 31 35 37 37 39 39 39 35 37 30 27 15 15 15 27 30 39 29 29 25 30 28 31 28 34 34 41 43 43 40 40 37 37 32 28 15 13 13 11 22 18 22
22 30 29 28 28 21 21 11 12 12 23 18 21 17 10 10 10 21 17 24 20 29 19 19 21 17 18 25 39 39 39 25 25 12 12 12 19 24 28 24 30 18 12 14 14 14 10 11 15 22
14 11 14 9 13 13 15 11 11 11 10 10 16 19 21 15 19 25 30 21 22 11 11 11 10 11 10 12 12 11 10 10 10 11 8 8 8 8 8 8 16 10 14 12 8 8 8 8 11 13
10 11 14 15 8 6 6 6 6 8 9 12 10 8 8 8 8 8 10 13 13 10 13 13 11 10 10 12 10 10 10 16 13 13 14 16 20 18 23 15 11 10 10 12 9 9 9 9 9 9
9 10 9 8 8 8 6 6 6 7 10 8 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 9 14 10 8 6 6 8 8 10 13 14 19 15 12 10 12 8 10 8 8 8 7 7 9 9 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 10 13 13 9 7 8 8 8 8 8 10 8 9 9 10 8 13 8 8 8 8 9 8 8 6 6 8 8 9 9 9 11
11 13 11 10 10 10 10 9 10 9 18 16 11 10 10 13 13 10 10 10 10 17 11 10 10 10 10 10 11 9 9 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 7 9 8 8 8
10 7 6 10 8 6 6 6 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 7 9 9 8 8 8 8 6 6 8 8 11 12 9 12 11 12 12 10 11 10 12 10 10 10 10 10 10 11 11 11 14
19 13 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 13 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 9 9 8 8 8 10 10 10 10 10 15 17 17 8 8 8 8 8 8 8 12
12 12 11 16 10 12 10 8 8 13 8 8 8 8 8 8 9 8 8 7 9 11 11 11 10 8 8 7 7 10 10 11 12 10 6 6 8 8 8 7 6 8 8 8 10 10 10 10 10 10
10 9 9 9 8 6 7 6 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 6 6 8 8 9 9 10 11 12 10 10 10 10 10 9 6 8 6 6 8 8 8 10 7 7 10 10 11 11
8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 7 6 8 8 6 6 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 12 15 13 8 8 6 6 8 8 7 6 8 6
8 8 8 10 8 9 9 8 8 7 6 8 13 12 8 8 6 6 8 8 9 9 8 8 10 10 10 10 8 6 6 6 8 8 8 6 |