BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-305E16.T7 (MSMg01no305_e16.b1) | MSMg01-305E16.TJ (MSMg01no305_e16.g1) |
ACC | AG430311 | AG430312 |
length | 1,270 | 1,291 |
length of high quality (start - end) | 404 (43 - 446) | 413 (73 - 485) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no305_e16.b1 PHD_FILE: MSMg01no305_e16.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:45:02 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no305_e16.g1 PHD_FILE: MSMg01no305_e16.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:45:02 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | NNCCCCGCATTGGGCCTATAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGAAT
TCCTGATCTTTCCAAACTTTTATCATGAATGGGTGTTGGATCTTGTCAAA
TGCTTTTTCTGCATCTAACGAGATGATCATGTGGTTTTTGTCTTTGAGTT
TGTTTATATAATGGATTACATTGATGGATTTTCGTATATTAAACCATCCC
TGCATCCCTGGAATAAAACCTACTTGGTCAGGATGGATGATTTCTTTAAT
GTGTTCTTGGATTCGGTTAGCGAGAATTTTATTAAGGATTTTTGCATCGA
TATTCATAAGAGAAATTGGTCTGAATTTCTCTATCTTTGTTGGATCTTTC
TGTGGTTTAGGTATCAGAGTAATAGTGGCTTCATAAAATGAGTTGGTTAT
TGTACCTTCTACTTCTATCTTGTGAAATAGTTTGTGCAGAACTGGAATTT
TTTTTTCTCCCCCCCCCNGANAGAACTCTCCACTAAAAAAAAAAAGGGGG
GGGCTTTTTTTGGTTGGGAGACTATTAATAACTGCTTCTATTTCTTTAGG
GGATATGGGACTGTTTAGAAGGTCAACTTGATCCTGATTCAACTTTGGTA
CCTGGTATCTGTCCAGAAATTTGTCCATTTCGTCCAGGTTTTCCAGTTTT
GTTGAGTATAAGCTTTTGTAGAAGGATCTGATGGTGTTTTGGATTTCTTC
AGGATCTGTTGTTATGTCTCCCTTTTCATTTCTGATTTTGTTGATTAGGA
TTTTGTCCCTTTGCCCTCTATTGAGTCTAGCTAAGGNTTTATCTATCTTG
TTGATTTTCTCAAAGAACCAACTCCTCGTTTGGTTAATTCTTTGAATAGT
TCTTCTTGTTTCCACTTGGTAATTTCACCCCCTGAGTTTGATAATTTCTT
GCCGTCTACTCCTCTTGGGGAAATTGCTTCCTTTTTTTTTAAAGCTTTTA
AAGGGGTTGTCAGTTGCTAAAAAGAGTTCTCCTCCCGTTCCTTCTGGAGG
AATCAAAACTATAATTTTCCCTCTTAAAAAGGCTTCCTTGGTGCCCCAAG
TTTGAGTACGTTGAGGTTTCTTTTTTTTTAACCCTTAAAAATCCTTAAAT
CCTTCCTTTTACCCATCCTGCACAAAGGATTATTGAAAAGAGGTGGGTAC
ATTCCTCCGGATGAGAGATATCCTCTATATTCTGTATACTAGAACAACCT
TTTACACGGCTTCACCTAATTACTTCACAACTTATATTTTTTTACTTACC
AACAATTTTTTATACATATA
| NNNGGTGTGCAGTGTAGCTGGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXATAAGATTAATAAATGCATGCTCTGTTT
CTTTAATGCCTCTTATCTACATTAGTAAGGGGCTGATAATTTGCAGTTTG
GATTGCTTTTATATAAATATGACTGTGAAATATAAGATGTACGTTGACAC
TAGAATCAAAGTAATAATTAAACCTCTATAATTATTTTATATTTTAAGGG
ACCAGATTTGTTCAATGGAAAATTTTATTCTTTTGTTTACTTTTAACATA
TTACTAGAATATTAAAAAATCATAATAATAAAAATAAAGTTTAAAAGGGC
TATAAATATTTTTCTTTAATGCTTTTATAGTCAGTATATTAGTAATAAAG
TTTTTTCAAAGTGACAATTAAGTAGCATTACTACCTTGTCTCAGGAAAGA
AAGTTTTTTTTCCCCCCCCCCCCAAGGAAACAATCCCCCTCCTAAAAAAA
GGGGGGCTAACAATCACAGTGGATTAGTGTAATCATGGTGAGCTGCTGCA
CACATTATGAATTAGGAAGGCATAGATTCTCATTTACTCTGAAATTCATG
CCTAAAACTTCATAAAATTAGTTGAGAAGATGGAAGCCTGGAAGACACTC
CCTGCTTCTGAATGCTGTGCTTGGCAAATCAGCCCTTAGATGGAGACTTT
GAGTCTCTGTGTCGTATGCTTGCCAAGAATCCCTCTCACTTTCCGTAACT
CCCCACAACGTCTTCATTTGTGCTCATTATCTCTGCTTTTTATAACAGTG
GGATTCCCTATTTTTGAAAACACTGCAACCGAGGCCGACAGACCACACTG
TGAGATACTCCAAATCAGGCCTCGGAGCTTATCCGCTGCATTACTGGCTC
CTCTTAACTTATGATCTGGCCTTTGTGCCAACTTTCCAGGCAGGCTTGGG
TTGAGAGAGGATACCCAGAGGTTCTAACACTGGGGAGGTGCAGCAGAGCT
GCCACTAACCTGAGGCACCCAATTGCCTTTGCAAAGAAAGGGGCATCCGT
CTCCATTCTCCCTCCCCAACTCCAATTAATCCCAAACCCTTAACAAGGGG
CAATGTTTCCTCCTGGTTGGATTTGGAAATTATTTCTAAACCCATGCCCC
AGAAATCCAACTTGGGTTGGGTTTCTCTAGAAGCCATATTTGTCCAAAAG
GGTTCCCCATTTTCCGGGTGAGACAAAAACACAATGTAAATAAATCCCTT
GCCCCCCCTTTTCTTTTGTAAAAAAACGACACTTCTCCCTC
|
quality values | Open.Hide. 0 0 3 6 6 6 6 6 7 9 7 6 8 8 8 8 10 10 8 8 8 11 15 15 20 20 20 23 19 21 26 29 36 28 28 28 28 30 33 33 39 37 37 37 37 37 32 28 28 32
37 37 41 42 50 50 50 50 53 37 32 21 18 18 34 34 59 59 50 53 53 53 53 50 50 50 50 54 54 48 68 68 68 68 68 68 51 43 44 27 32 27 31 31 36 36 41 37 40 44
57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 50 50 48 48 48 48 48 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 51 51 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 59 59 59 57 62 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 44 25 21 10 10 10 22 34 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 33 33 10 8 8 6 6 6 6
6 6 10 15 25 41 41 59 50 50 50 50 53 53 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 47 37 33 21 12 11 11 11 12
18 19 26 21 21 11 9 9 9 9 13 19 32 26 16 17 3 0 3 3 0 3 29 18 25 12 18 13 13 10 9 9 9 12 12 15 15 17 20 20 22 18 12 9 9 10 10 10 11 11
11 33 33 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 53 53 53 53 53 53 57 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 54 59 59 68 68
68 68 54 54 48 48 48 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 37 37 37 37 37 37 37 37 37 59 43 41 32 37 41 44 44 59 59 44 30 30 32 31 31 37 40 39 34 32
30 28 33 33 30 30 37 43 37 37 41 32 32 40 43 44 47 47 50 59 59 59 59 50 48 48 48 48 48 57 59 57 28 28 13 13 13 27 27 50 50 41 41 39 23 21 11 11 11 11
13 13 21 21 33 41 42 33 33 33 33 30 27 16 15 15 16 19 15 11 11 11 11 11 12 12 15 26 27 20 19 14 10 8 8 3 0 3 12 17 37 41 32 32 15 21 14 20 20 19
18 14 15 9 9 9 16 14 10 13 9 9 9 9 19 11 17 17 18 25 21 20 25 25 22 19 10 11 11 12 15 12 19 25 37 23 23 30 25 24 22 20 10 10 8 7 8 8 10 10
10 13 14 25 24 14 14 15 15 15 13 11 11 11 12 11 10 9 10 10 10 15 11 12 23 8 8 8 8 8 8 11 8 8 6 8 8 8 10 10 8 8 8 8 13 8 8 8 8 8
8 15 12 11 10 9 6 10 8 8 8 10 22 24 12 10 8 7 6 8 7 8 8 10 13 8 10 10 13 9 9 14 28 37 33 31 22 13 8 8 15 13 8 8 9 12 26 27 20 13
10 10 10 10 10 10 13 15 11 17 18 11 11 11 11 9 9 8 11 8 8 8 8 8 6 9 8 7 8 6 6 8 8 6 6 6 6 8 8 10 8 8 6 6 6 6 6 10 9 8
10 8 8 6 6 11 10 13 12 10 13 10 10 8 13 10 12 17 19 15 10 8 8 6 6 10 13 14 19 14 15 16 16 16 11 11 10 12 9 9 8 8 8 9 15 8 8 8 8 8
9 6 6 6 6 7 10 12 8 10 10 8 8 8 8 17 12 11 12 12 24 28 23 14 10 10 10 13 10 9 9 9 9 9 9 9 11 15 13 11 10 10 9 9 9 13 11 10 10 10
8 8 8 8 8 10 10 10 8 10 11 10 13 11 11 11 12 11 9 8 8 10 8 8 8 15 8 8 8 12 10 10 15 10 10 11 14 15 11 9 8 8 7 8 8 9 9 9 9 10
8 8 8 8 8 8 10 8 11 10 8 8 6 6 8 8 8 13 6 6 8 10 9 8 8 9 10 9 13 8 10 10 8 10 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 12 15 15 9 9
9 11 11 11 10 13 8 8 6 6 8 8 9 11 11 11 8 8 8 8 8 7 9 9 11 10 8 8 7 8 8 8 8 10 9 9 11 15 15 25 12 13 8 9 9 9 12 13 12 8
8 8 8 8 6 6 10 6 6 8 8 8 8 8 11 8 8 8 8 8 | Open.Hide. 0 0 0 3 6 6 6 6 6 6 6 7 7 7 7 6 8 8 6 6 6 7 14 14 15 15 8 8 9 9 16 19 22 21 21 9 10 10 21 19 28 24 30 28 36 36 36 36 37 37
37 40 40 40 40 42 50 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 57 50 48 57 54 54 46 46 39 39 39 46 48 54 68 68 57 57 57 59 57 57 57 32 32 24 35 30 36 32 42 37 47
48 47 46 57 57 57 57 57 57 48 48 46 46 46 46 48 48 48 48 46 50 57 50 50 50 50 50 50 57 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 57 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 57 57 57 59 59 57 57 68 68 57 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 68 57 57 48 48 48 48 48 54 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 68 68 68 68 68 59 59 59 54 54 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 36 30 21 12
12 12 14 21 20 22 12 17 30 41 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 48 57 57 53 59 50 50 50 50 43 43 30 22
15 11 10 11 15 17 26 27 25 31 27 27 29 24 24 19 16 10 10 9 14 13 11 27 27 47 47 50 43 41 26 16 12 12 12 12 11 16 12 12 11 12 12 11 13 12 15 14 10 10
12 16 23 28 30 37 41 41 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 48 48 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 59 59 59 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 68 68 68 68 57 57 59 57 57
57 57 57 57 59 59 57 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 57 54 54 54 54 57 57 57 68 68 68 68 68 57 57 57 43 43 39 39 40 43 43 48 59 59
59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 50 59 59 59 59 50 42 41 39 39 39 37 41 41 43 47 39 39 35 39 39 37 41 33 39 37 43 34 43 36 36 36 43 43 50 48
48 48 48 43 43 46 48 57 48 48 48 48 48 48 48 48 59 59 59 59 59 37 37 32 25 25 32 32 37 41 41 43 41 47 46 47 47 47 41 30 22 12 8 8 8 19 18 37 41 44
59 59 37 37 37 37 37 30 33 28 28 27 26 31 39 39 44 39 39 35 35 35 59 59 48 59 59 39 39 43 43 43 48 48 48 59 59 37 33 33 33 28 27 29 34 37 32 14 11 11
10 10 12 15 17 17 24 24 25 37 41 43 39 37 19 11 11 11 12 17 18 24 24 24 18 17 17 17 30 22 25 10 8 8 13 10 15 20 22 22 24 24 25 17 26 12 12 11 13 10
15 15 10 10 10 12 10 14 12 9 9 10 17 19 22 37 32 31 21 21 14 18 11 17 17 10 10 10 20 17 24 24 21 19 28 22 18 20 19 19 14 20 18 25 19 17 24 13 13 17
15 24 16 16 15 25 24 19 12 12 10 13 15 14 14 18 13 14 16 11 9 8 9 9 9 10 10 10 9 9 11 22 19 27 18 13 10 10 10 15 15 25 21 12 13 10 11 10 10 10
14 15 18 11 11 10 11 10 10 10 12 10 8 8 8 8 8 9 10 10 10 15 13 13 23 15 16 12 12 11 10 8 8 8 10 8 8 8 10 11 18 12 12 16 9 9 9 10 8 8
10 8 8 6 8 6 7 7 9 11 10 11 6 6 6 6 9 9 11 9 10 10 9 9 9 9 9 9 14 15 20 26 19 10 8 8 9 8 9 9 10 10 11 13 10 10 12 14 17 11
10 8 6 6 8 6 6 9 10 10 16 10 14 10 15 10 11 11 10 12 12 14 17 23 11 8 8 8 8 8 11 9 9 9 9 9 8 8 8 8 8 13 16 12 9 9 7 9 6 8
7 8 6 8 6 6 8 8 9 12 13 11 10 10 9 8 10 10 8 8 9 8 8 8 9 10 9 10 9 11 11 12 11 10 10 10 10 8 10 10 10 10 8 10 8 8 8 8 11 11
8 8 8 8 8 8 8 15 8 8 8 8 9 8 11 11 11 11 11 12 15 11 11 10 10 10 9 9 9 12 13 9 9 9 8 7 7 8 8 8 8 6 9 10 10 16 18 12 12 13
12 8 6 6 6 8 8 10 10 11 9 9 10 9 9 9 11 11 8 8 6 6 8 8 13 11 8 8 8 8 8 8 9 6 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8
8 8 8 8 15 10 17 18 18 17 13 6 6 6 11 11 7 6 8 6 15 25 29 10 9 8 8 8 8 9 9 9 8 10 6 6 6 8 10 9 9 |