BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-313B15.T7 (MSMg01no313_b15.b1) | MSMg01-313B15.TJ (MSMg01no313_b15.g1) |
ACC | AG435128 | AG435129 |
length | 1,292 | 1,290 |
length of high quality (start - end) | 368 (501 - 868) | 339 (478 - 816) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no313_b15.b1 PHD_FILE: MSMg01no313_b15.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:54:25 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no313_b15.g1 PHD_FILE: MSMg01no313_b15.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:54:25 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | NNGGGAGCACTGGGCGCTATAGACTCCTATAGGGAGAGGATCCGCGGAAT
TCAGGCCCATACCTAAACATGATAAAAGCAATCTACAGCAAACCAGTAGC
CAACATCAAAGTAAATGGAGAGAAGCCGGAAGCAATCCCACTAAAATCAG
GGACTAGACAAGGCTGCCCACTTTCTCCCTACCTTTTCAACATAGTACTT
GAAGTATTAGCCAGAGCAATTCGACAACAAAAGGAGATCAAGGGGATACA
AATTGGAAAAGAGGAAGTCAAAATATCACTTTTTGCAGATGATATGATAG
TATATATACGTGACCCTAAAAATTCTACCAGAGAACTCCTAAACCTGATA
AACAGCTTCGGTGAAGTAGATGGATATAAAATAAACTCAAACAAGTCAAT
GGTCTTTCTCTATACAAAGAATAAACAGGCTGAGAAAGAAATTAGAAAAA
CTTTTTTTTTCTCACCAGCCACAAATAATATAAAATATCTCAAAGAGACT
CTAACTAAGGAAGTGAAAGATCTGTATGATAAAAACTTCAAATCTCTGAA
GAAAGAAATTAAGGAAGATCTCAGAAGATGGAAAGATCTCCCATGCTCAT
GGATTGGCAGGATCAACATTGTAAAAATGGCTATCTTGCCAAAAGCAATC
TACAGATTCAATGCAATCCCCATCAAAATTCCAACTCAATTCTTTAACGA
ATTAGAAGGAGCAATTTGCAAATTTGTCTGGAATAACAAAAAAGCTAGGA
TAGCAAAAAGTCTTCTCAAGGATAAAAGAACTTCTGGTGGAATCACCATG
CCTGACCTAAAGCTTTACTACAGAGCATTTGTGATAAAAACTGCATGGTA
CTGGTATAGAAACAGACAAGTAGACCAATGGAATAGAATTGAAGACCCAG
AAATGAACCCACACACCTATGGTCACTTGATCTTCGACAAGGGAGCTAAA
ACCATCCCGTGAAAGAAAGACAGCATTTTCAACAATTGGTGCTGGCACAA
CTGGTTGTTATCGTGTAAAAAAAAGCCAAACCGAACCCAACTTATCTCCT
TGAACCAAGGGCAAATCTAAAGGGGATCAAGGAACTTCCCCTAAAAACCC
GAAACCTCTGAACTTATAAAGAAAAACGGGGTAAAACCCCTTAAAAATGG
GCCCCGGGAAAAAATTCTTGAAAAAAACACCAAGGGTTTGGGGTGTAATA
ACAAAAATATAACAAAGGGCCCTCAAGAACCTCCCACCTTCTCTTGGCGA
AAAAACCCCCTAATAAACAAAGAACCACCCCAATGTGGTAAA
| CATAAAANNNNNNAACAGACXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCTTTTAACCTGAGGAATACCGAA
TGGCAGAGAAGCACCTGACTTAAAGATCAACATCCCCAATCATCAGGGAA
ATGCAAATCAAAACAACACTGAGATTCCACTTCACTCCAGCCCGAATGGC
TAAGATCAAAAACTCAGGTGACAGCAGATGCTGGCGAGGATGTGGAGAAA
GGGGAACACCTTAGGAATTTTATGCATCTTATTTTGTTTAATCCTCACAA
AAATTCTGCTGGGATCATTCATCCATCCATCCTTTCAATCAATTCCATGT
AACTAACAGCTGGAGTATACCAGGGTCCATGTTAGGCAGACATTTGAAAT
GCATTATGCTTCAAAAACACGCACTGCACTTATTGCTTAGTGAAGGAGAC
AGACACTAAATATTATTTCAAATGAACACAGAATGTTGAGTGTTGCTGAA
AACAATATGATGTCACAAGAACATCTGAACAGGAATGGAGTAAAGGCAAA
GGAAGACGTACCTCAGAAATGAAAGTCTGGTCTGATACCCAAAGAAAGAC
CATTAAGTAGCTATAAAGGAGAGGATTTAGTCCAAATATTTCAAAAGATA
ATAACATGCATAGGTCCTGAGGCAGAACAAGGGATGGCATTTTTAAGTTT
ATGAAAGAATCATCATTTGGAAGCTACTAGAATAATACTTTCCAAAGAAT
GATCTTTGGTCAAATTAAGCAAGCTTTATTTTTTATCGAACAGGGCTATC
TCCCTAAATCAGGGTTTGAGAAAATAACATTAAACATGGGAAATAGTGGG
GCTTATATAGCAAAAACAAACAAGCATACACAAACGCGCACACACACATA
CACACACCACTACAAGGCTAGGCAGTTTGGTACCCAGGGGTTTTGGTTAC
ATGACAGAACATTTCAAAATTATTTGTCAGGATAAGTGTTCTGATTATCC
AGGCAGAGGTCCAGGTATATAGGGTATGGAATATGTCCAAATTCCAAAAT
AGTGGTCAAAGACCTGGGCCAACTGAAGTTTTTACGAAAAACTGGAAAAA
AGTTAATTTAACCTTAAACCAAAGACTTTTAATCCTTAAAAGGAAGCCCA
ACGGGGCCCCCCAAACCAGGGGGCTTTTAAAACCCCTGGGGGAGTTCCCA
AAATCTTGGCCCCAAGGAATAAGTATTAATGCAACTTCTTTTTCCTCGCN
NCCCCCTNCTCTCCCTCCCTGCTACTTTCTCCTCACCTCT
|
quality values | Open.Hide. 0 0 3 6 6 6 10 7 7 7 7 10 8 12 14 18 14 17 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 17 19 23 25 24 24 28 24 24 28 35 39 39 39 39 34 34 34 37 27 23
12 10 10 21 34 43 42 42 42 48 47 51 43 43 43 42 43 28 25 25 33 37 37 44 59 59 57 57 54 54 47 48 41 41 41 40 42 57 57 57 57 57 57 42 46 37 48 48 48 57
47 47 54 57 44 44 35 35 32 24 30 30 50 50 57 57 57 68 68 68 57 44 44 19 19 11 15 12 12 16 27 38 43 52 54 54 57 57 57 57 57 57 57 68 57 59 57 52 52 52
57 57 57 57 57 52 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 46 45 45 52 43 43 44 44 68 57 57 57 57 57 52 52 52 52 57 57 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 62 62 62 62
62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 59 59 68 68 68 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 59 59 59 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 57 57 59 59 68 59 59 37 37 27 24 18
16 12 12 12 28 34 59 68 68 68 68 68 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 59 59 59 59 59 59 50 50 48 48 50 53 57 59 57 57 53 53 50 50 50 47 41 27 16 10
9 8 8 8 15 18 19 22 19 27 15 15 11 11 11 15 11 11 11 15 27 34 59 59 59 59 59 59 59 34 28 20 15 15 14 24 24 28 21 13 12 11 6 6 6 6 8 8 10 15
22 22 22 31 34 41 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 54 54 59 59 57 57 57 59 59 57 57 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 46 43 44 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 59
59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 68 68 68 48 48 47 47 47 48 59 68 68 59 59 59 59
59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 47 59 59 59 59 59 59 48 47 47 47 41 37 37 37 31 31 37 43 47 47 59 59 47 48 48 59 59 59 59 59 57 57
57 57 48 48 48 48 48 48 50 48 48 48 48 57 57 57 57 57 48 48 48 59 59 59 59 59 43 39 39 37 32 37 37 44 37 37 41 41 41 59 59 59 59 48 48 48 42 42 42 41
44 41 19 11 11 11 13 19 32 59 39 35 39 39 43 43 39 36 36 39 39 39 39 39 41 36 32 35 32 35 39 41 41 39 39 31 28 35 31 27 27 26 32 37 32 31 36 39 44 44
37 31 37 37 32 29 11 11 11 11 12 19 28 37 37 37 36 36 26 30 24 30 30 30 15 13 8 8 8 11 19 37 37 30 30 15 21 21 17 20 20 39 37 39 30 22 17 21 21 24
28 27 24 31 39 39 43 41 44 43 34 28 27 28 28 28 27 25 15 19 22 20 14 15 23 17 25 25 33 29 36 31 24 23 17 18 14 20 20 28 29 26 20 22 15 12 9 9 8 7
7 9 7 10 12 16 16 15 24 13 10 8 8 8 8 9 20 19 24 21 21 19 22 11 12 11 18 16 23 22 15 21 12 12 11 12 12 19 15 19 19 18 24 24 23 23 28 30 31 31
25 25 18 23 16 12 11 10 10 10 8 8 8 8 10 10 16 10 8 8 7 6 10 10 11 8 16 11 11 10 9 9 10 13 17 25 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 9
9 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 12 10 10 11 13 13 17 9 9 9 9 9 8 8 9 9 9 12 12 15 11 10 9 9 9 9 9 9 10 10 10 10 13 15 12 12 12 10 9
9 6 6 6 6 6 6 15 7 6 6 6 6 7 10 10 10 10 11 9 9 12 10 10 10 8 8 6 6 6 6 11 8 8 9 8 8 8 8 8 8 12 13 14 22 14 12 8 8 8
8 8 17 8 8 8 8 8 8 10 8 9 9 9 9 10 10 8 8 8 8 8 8 21 9 8 8 8 8 8 9 19 11 15 14 14 11 8 8 8 8 8 8 13 8 10 6 6 6 6
9 12 10 10 11 9 12 10 11 11 17 23 21 13 11 11 8 8 8 8 9 9 11 17 8 8 6 6 6 8 9 10 11 9 11 8 7 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 6 6 6
8 8 8 10 10 8 8 6 6 6 8 7 7 10 8 11 11 12 9 9 8 6 6 6 8 6 8 8 8 6 6 6 6 7 11 9 6 8 8 10 6 8 8 6 6 6 6 6 6 6
8 13 8 11 10 9 12 10 13 10 10 10 11 18 10 8 9 9 8 15 6 6 6 8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 7 8 9 9 9 9 9 9 | Open.Hide. 6 6 6 8 8 9 3 0 0 0 0 0 0 3 6 6 6 6 6 6 6 3 0 3 6 6 8 6 6 8 10 19 9 10 6 8 6 6 8 7 8 15 15 13 8 8 10 21 15 19
10 10 19 24 28 35 35 37 36 37 37 37 33 35 36 36 36 36 36 44 44 50 47 23 21 10 10 13 11 10 10 10 10 8 12 12 12 12 9 9 14 27 36 38 53 42 42 53 43 43
43 42 42 42 50 50 36 36 33 33 33 50 33 23 21 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 13 11 15 19 30 25 27 12 11 11 11 21 25 37 37 37 50 50 50 50 50 57 57
57 59 59 59 57 57 44 44 43 43 43 48 48 48 48 48 42 42 42 37 37 43 43 47 57 57 59 57 57 50 50 50 50 50 50 42 41 37 37 23 11 8 8 10 15 22 41 46 40 37
30 28 13 13 13 26 21 37 37 47 57 57 57 57 57 57 57 57 57 48 48 57 54 48 48 48 54 54 59 57 68 68 57 57 57 59 59 54 54 54 59 59 57 57 57 57 57 57 68 68
59 59 57 57 57 57 46 47 57 57 43 57 57 48 48 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 57 57 57 68 57 59 57 57 57 57 57 57 57
68 59 59 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 57 59
59 59 59 68 68 68 68 59 59 59 57 57 57 57 68 68 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 68 68 68 68 68
68 68 59 59 47 34 28 19 13 13 12 18 12 18 30 44 59 59 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 59 59 59 59 59 44 43 48 48 57 57 59 57 53 53 53 53 50
50 50 50 50 50 59 41 37 20 18 10 11 8 8 8 8 9 9 12 12 15 14 14 13 13 13 12 23 20 34 34 57 57 57 59 57 48 43 39 37 32 32 31 31 29 30 30 22 22 15
15 10 11 11 12 12 13 23 23 28 32 28 59 59 59 59 53 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57
57 68 68 54 54 54 57 57 57 57 59 57 44 44 42 46 48 57 57 68 68 68 59 59 59 54 54 57 59 57 48 48 57 59 57 57 57 57 57 50 48 57 57 68 68 68 57 59 54 57
57 57 57 57 57 68 57 44 44 35 35 47 59 59 68 68 68 59 57 54 54 54 57 57 57 54 54 54 59 59 48 48 57 57 57 68 68 59 59 59 59 54 54 54 59 54 54 48 57 57
57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 57 57 44 43 43 43 48 43 41 41 41 41 39 39 39 37 37 39 44 39 41 42 42 42 48 48 50 59 59 59 59 59 59 50 48 48 47 47 47 47
44 44 44 37 41 44 28 24 26 27 30 33 47 47 47 47 59 59 48 59 59 59 43 43 57 59 43 43 35 35 35 43 43 59 59 48 46 46 46 47 43 43 41 37 37 41 41 41 41 46
47 59 47 47 47 39 39 34 25 30 28 24 25 34 37 44 47 41 41 41 43 43 48 48 57 57 57 48 50 50 53 48 48 48 39 39 35 35 43 59 59 43 41 37 34 37 34 34 37 41
41 31 35 37 38 34 37 37 37 39 32 19 19 19 19 16 16 30 28 24 22 19 21 22 19 28 28 41 41 37 22 18 15 18 18 21 20 17 23 20 20 20 21 25 22 19 12 11 17 13
14 17 31 30 37 36 32 32 30 30 37 30 28 28 26 26 22 20 20 24 24 22 24 25 22 22 19 25 22 35 32 19 17 18 19 22 30 30 30 17 17 17 12 27 27 47 48 48 48 59
47 47 47 39 30 27 21 26 29 37 37 37 32 29 20 20 22 25 37 32 25 19 17 16 10 10 10 11 10 9 9 9 10 10 11 9 12 11 19 10 10 11 19 20 24 25 19 14 21 11
11 10 28 14 14 9 8 8 8 10 11 12 30 34 25 23 14 10 10 10 10 11 9 9 10 9 9 10 10 10 10 10 11 8 10 10 8 8 12 13 13 10 10 10 13 11 11 16 8 8
8 11 8 8 6 6 6 8 10 11 8 10 12 9 9 8 9 10 10 10 10 10 10 10 11 11 21 17 13 11 9 9 9 10 8 9 13 17 18 21 10 8 8 8 9 9 16 17 10 6
6 6 6 6 6 8 8 9 9 8 8 8 8 9 9 9 9 10 9 10 15 16 19 23 14 10 9 10 10 12 15 19 10 12 9 9 10 18 28 9 9 9 9 9 9 19 25 25 28 23
14 12 10 9 9 10 9 8 8 8 8 8 11 21 15 12 12 12 12 10 10 10 9 9 8 8 8 14 23 11 11 11 8 8 8 6 8 8 9 11 10 15 10 11 11 10 12 10 8 7
6 6 6 6 12 12 12 16 13 9 8 6 6 6 6 8 8 8 8 9 12 10 11 15 11 12 13 31 31 10 15 7 7 7 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 8 10 11 11 18
12 9 8 8 7 8 8 7 7 7 9 11 14 16 10 8 7 8 9 9 6 8 6 6 8 8 10 8 8 8 8 10 10 8 9 8 8 8 8 8 11 15 8 8 8 8 8 8 3 0
0 3 14 15 10 7 3 0 3 10 8 8 9 9 12 15 21 14 13 9 9 9 8 8 8 13 8 11 11 10 8 11 12 11 8 8 10 13 10 8 |