| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-323A10.T7 (MSMg01no323_a10.b1) | MSMg01-323A10.TJ (MSMg01no323_a10.g1) |
|---|
| ACC | AG441564 | AG441565 |
|---|
| length | 1,164 | 1,268 |
|---|
length of high quality
(start - end) | 611 (137 - 747) | 649 (135 - 783) |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no323_a10.b1 PHD_FILE: MSMg01no323_a10.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:06:07 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no323_a10.g1 PHD_FILE: MSMg01no323_a10.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:06:08 2005 |
|---|
| singlet/doublet | singlet | --- |
|---|
| BLAST hit | unique | no hit data |
|---|
| sequence | CCATCCTNNNNNNNACCCACTGCGCGCTATAGACTCCTATANGGAGAGGA
TCCGCGGAATTCTATGGTTTTGGTGGTCTTTTAAAGTCCCCAAATGTGNG
AAATATGCCTATGTTGACCCTAAACAGCTCTCGGNTCATGATGTCATAAA
GAGATTGCACATCAATGTTGTTTCCAGAATGACTGTTCTGGACTCTATCT
CCATTATCAAAATGCAAACATTTATTTTCTTCTATTGTTAACATTTTTTT
TTCTCTTTGGGAGGCATAAACAGTGTCTACCCCCTCCCCCTGTGGTCCCC
ATAGTAGACAAAGGTGTAAGTCTACAAAAGTTCACTCTGGAAAAAAAATG
AACTTATCAAAGATACAGAGCTTTAGGTTAGGGGCTCTGGTCAGGAGCAT
GATTTTTTCAAAGCAGGCTCACTGAAAGGACTATACACTACATGGATGGC
TCCCATAGCTGTGTAGATGGAGATTCATCTCCTCATCCTACCCTACCTGT
ATCATTTAGCCTTTACAAAGACCAAAAAACACCTACAGTAAGGAAAAACT
TGGATACTCAGGCAAGGTAGCAGGTCCTTTCTCTAACCCTCTTCCCAAGA
AGAAATCTCAACAAAGACTAATCTCATTGATCTTTGGTTAGGAAGCCCAG
CCTGGCTCTTGAAGATTACTGTGGTTTGGCTCTGTAGATATTTCTGAAGG
CCAGTTTCACATTCTCAATAATATTATCATGTAATTTTTCCTATGANAAA
CCAGAACACGGGAAGCATAGATTATATGTTATTACGTTTTAAATTTTTCA
TTAGTGATGAAATTAAGCATTATCTATTTTCTAGGCATTTTCTCAATTCT
GGTTCCCTCCTCTCAGATGACTCTAACTTGTGTCACATTGACATAAAACT
AGCGAACACAATTATTTTATGGTTTTACCATTATTTTATTAAAATTACAT
CTGTGGGGTGCTGAAACCCCCTGGGTAAGGGCCTAGGTGAATGAGGGAAG
GTTCCCATACCACTCCTAAAAAAAAAAGTACCCCCAAAATGCTTGGCATT
ACCCTGTGGACCCCAAAACCAAAGGAATCCTTAATTAACTTATCGCGGAA
ACCCTCCAAAATGTGGTCTCCGAAAAGCGGAAAAAAAGGGGGCTTTCCCC
TGGCCCTTTATAGA
| NCCATACTTNNNNNNGATGCATGGAGGCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCTCTAAAGGGCCCAATACCGA
ATGGCAGAGAAGCACCTGACCCTTTGATCACCATCCTTAATCATCAGGGA
AATGCAAATCAAAACAACCCTGAGATTCCACCTCACACCAGTCAGAATGG
CTAAGATGAAAAATTCAGGTGACAGCAGATGCTGGCGTGGATGTGGAGAA
AGAGGAACACTCCTCCATTGTTGGTGGGATTGCAGGCTTGTACAACCACT
CTGGAGATCAGTCTGGCGGTTCCTCAGAAAACTGGATATAGTACTACCGG
AGGATCCAGCAATACCTCTCCTGGGCATATATCCAGAAGATGCCCCAACT
GGTAAGAAGGACACATGCTCCACTATGTTCATAGCAGCCTTATTTATAAT
AGCCAGAAGCTGGAAGGAACCCAGATGCCCCTCAACAGAGGAATGGATAC
AGAAGATGTGGTACATCTACACAATGGAGTACTACTCAGCTATTAAAAAG
AATGAATTTATGAAATTCCTGGCCAAATGGATGGACCTGGAGGGCATCAT
CCTGAGTGAGGTAACACATTCACAAAGGAACTCACACAATATGTACTCAC
TGATAAGTGGATATTAGCCCAAAACCTAAGATACCCAAGATATAAGATAC
AATTTCCTAAACACATGAAACTCAAGAAAAATGAAGACTGAAGTGTGAAC
ACTATGCCCCTCCTTAGAAGTGGGAGCAAAACACCCTTGGAAGGAGTTAC
AGAGACAAAGTTTGGAGTTGAGATAAAAGGATGGACCATGTAGACACTAC
CATATCCGGGGATCCATTCCATAATCCGCTTCCAAATGCTGACACCATTT
GCTACCCTAGCAGAATTATGCTGAAAGGACCCTGATAATACTGTCTCTTG
TCAAAGATGCCTGGGCCCACCAAACATANAAGTGGAGGCCCCCCGCCCGC
AATTGAAGGGATCCATGCCCCCCATGGAGGGAGCTAAAAAAGTACCAAAA
AAACTAAAGGGATCTGCAACCCTTTTGGGGGAAACACCTTTATGAACTAA
CCCGTACCCCCGGAAGCTCTTGAACCTAAGCTGATAAGGCCCTAAAAAAA
GGCCCTAACCGCCTCCCTGGGAAAAAAAACCCCTTTGGAACCCCCAAATT
TTTTTCCCCCATAACGGGGAAACCCCGGCCCCTAAAAGAGAATGTGTTGG
TAATACAACAAAAAACTT
|
|---|
| quality values | Open.Hide. 6 6 6 6 6 6 3 0 0 0 0 0 0 0 3 9 9 9 9 9 7 7 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 15 19 9 8 8 13 15 11 3 0 3 17 13 20 19 21 30 33
37 37 37 41 39 39 35 32 28 31 30 30 30 31 31 31 33 33 32 19 9 9 7 7 8 6 7 7 8 6 7 6 6 6 6 8 8 8 8 11 9 12 12 25 26 21 21 3 0 3
23 23 37 47 47 50 33 31 31 31 31 31 30 21 21 9 9 10 8 8 7 8 8 10 11 10 8 8 6 6 6 6 9 3 0 3 21 21 37 41 37 37 39 44 33 36 53 53 53 53
59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 54 54 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 68 57 59 59 59 68
59 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 57 57 57 68 68 57 59 59 59 57 57 57 57 57 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 68 59 59 59 59 59 59 59 68 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 57 57 57 57 44 27 24
24 19 18 18 18 15 24 24 23 27 36 44 59 59 59 59 59 59 57 57 57 54 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 57 50 53 53 53 43 57 48
48 48 59 59 59 59 43 39 39 39 43 43 28 24 13 13 13 28 28 33 34 37 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 59 59 43 57 59 59 59 59 68 68 57 57 57 57 57 57 59 68 68 59 59 59 59 59 54 57 57 46 43 43 57 59 59 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57
57 57 57 44 44 43 50 43 44 43 57 59 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 59 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 68 57 57 68 68 68
68 68 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 59 59 57 59 59 59 59 68 68 59 59 54 54 54 57 48 48 68 54 54 57 57 57 59 59 48 48 47 47 59 59
35 39 42 43 43 48 48 59 59 59 59 59 39 39 35 39 39 48 59 59 59 46 47 47 44 39 37 31 26 30 28 34 37 30 30 23 18 15 22 17 29 29 30 37 37 30 30 29 31 31
31 37 44 44 37 36 43 41 41 41 46 46 47 48 48 48 59 57 47 47 47 47 47 47 57 57 57 48 43 43 43 43 40 41 41 41 39 59 39 37 34 41 32 21 21 3 0 3 18 19
28 24 18 18 14 21 25 33 24 22 21 30 32 37 37 39 25 17 10 9 9 12 21 32 41 41 59 48 48 42 37 37 26 26 14 28 21 26 19 11 12 12 13 19 24 30 26 26 24 25
22 21 10 9 9 9 15 8 6 6 6 6 7 12 21 22 22 10 12 12 26 22 28 28 28 29 30 23 25 15 9 9 14 15 15 18 27 16 18 19 30 19 18 14 13 13 13 12 12 10
16 21 12 10 12 14 9 9 9 11 14 24 17 16 9 9 9 13 13 16 9 12 10 12 10 12 13 14 18 14 14 14 16 16 20 23 27 16 17 18 17 8 6 6 8 8 9 9 13 13
10 9 9 9 10 11 11 11 11 11 11 10 9 9 9 9 15 15 25 23 18 18 18 12 21 15 16 13 8 8 8 8 11 15 14 17 12 12 10 9 10 9 8 8 9 9 10 9 9 9
10 13 10 10 11 11 9 9 9 9 12 13 13 9 9 9 15 12 17 12 9 9 9 9 9 11 10 10 8 8 8 8 8 8 8 10 9 9 9 9 8 8 9 9 9 9 10 8 8 8
8 8 10 10 10 9 12 12 10 12 11 11 10 10 10 10 10 13 9 9 9 9 9 11 15 11 10 11 10 11 12 20 10 10 6 6 6 6 8 8 8 9 9 11 11 10 10 10 9 10
10 11 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 22 18 18 12 10 8 8 8 8 10 10 10 8 10 6 8 6 6 7 8 8 8 8 8 8 8 7 7 9 9 9 9 9 10 12
15 11 7 6 6 8 8 15 13 20 12 11 11 8 8 7 8 6 6 6 6 12 14 20 14 9 10 10 9 9 9 11 17 15 10 9 8 8 10 8 8 8 6 8 8 8 12 10 8 6
6 6 7 7 11 12 12 19 19 12 12 12 12 12 | Open.Hide. 0 3 8 8 8 8 6 6 3 0 0 0 0 0 0 3 6 6 6 6 6 7 7 6 6 6 6 10 6 6 6 10 19 15 13 8 8 9 8 11 8 12 13 20 20 17 20 21 24 19
19 10 14 17 28 28 32 37 37 37 37 35 30 35 35 36 36 36 44 44 39 37 42 37 27 27 11 9 9 9 12 11 11 11 11 9 9 9 9 10 10 10 15 15 25 30 33 33 50 44
44 53 53 48 48 48 48 48 53 53 50 50 59 37 28 25 22 22 10 10 11 11 11 11 13 11 11 11 17 11 12 12 12 12 19 23 23 29 34 36 43 53 53 53 57 57 57 57 57 57
57 57 59 54 59 57 57 57 57 48 48 48 48 48 50 50 50 50 48 48 48 48 47 48 57 57 44 57 48 47 47 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 47 48 48 57 57 48 57
57 57 57 37 43 43 59 59 68 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 59 59 54 54 52 57 57 57 57 59 59 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 59 59
59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 68 59 59 59 59 59 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 57 57 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 52 62 62 62 62 68 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 44 44 39 39 20 14 14 14 20 20 23 43 43 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 43 43 43 43 35 43 43 62 62 62 62 62 43 43 62 62 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57
57 57 57 52 52 52 57 57 57 59 59 59 57 59 59 57 59 59 59 57 57 57 59 57 57 52 57 57 57 59 57 59 59 59 59 59 57 57 54 54 57 57 59 68 68 68 68 68 59 57
57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 57
57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 48 54 54 54 50 54 54 54 54 57 59 57 68 57 57 54 48 57 48 48 48 59 57 59 59 59 59 59 59 59 57 59 59 40 40 40
43 41 42 42 41 41 43 41 34 36 41 43 43 37 36 34 28 24 29 34 39 41 41 39 39 39 30 30 30 37 28 37 37 39 47 47 43 48 48 48 48 48 43 44 48 42 46 43 39 41
37 32 27 25 28 28 24 28 22 29 35 37 37 39 37 37 43 37 37 41 39 39 37 32 30 39 31 37 39 44 37 37 32 27 14 18 11 13 13 21 21 32 30 22 22 28 32 37 32 37
28 28 32 37 37 31 31 30 29 25 32 31 31 23 25 11 11 11 20 21 27 23 27 27 32 36 27 26 22 20 20 16 13 11 10 10 10 22 12 9 13 11 15 15 17 32 29 23 25 12
11 10 10 10 10 12 13 19 30 29 27 15 15 14 17 18 11 11 11 23 12 14 14 22 17 20 22 22 18 18 19 22 13 13 10 10 10 13 17 17 17 11 11 11 23 12 10 13 13 21
13 17 17 15 13 9 9 9 8 8 8 9 10 9 14 19 22 21 23 24 28 24 22 16 13 8 8 8 8 10 12 14 12 10 10 10 10 10 15 10 13 15 12 10 11 15 15 9 9 8
8 8 8 8 10 9 8 10 8 9 9 10 10 8 10 11 14 18 25 31 26 14 14 10 11 14 15 17 16 17 21 10 10 8 8 8 8 8 8 8 11 21 16 9 9 9 9 8 8 8
8 8 10 8 11 11 9 11 11 19 19 24 14 14 11 11 9 10 8 8 8 8 8 8 10 10 10 3 0 3 8 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 10
11 10 8 10 10 10 10 10 10 9 9 8 8 8 8 8 7 7 7 7 8 8 8 8 10 9 9 8 9 9 9 10 10 10 12 10 12 14 15 15 15 19 24 18 12 22 12 12 15 10
9 10 8 8 8 11 11 19 10 9 8 8 8 8 10 15 12 17 17 13 19 12 12 12 9 9 9 11 13 9 8 8 8 8 9 9 13 13 7 8 7 7 8 8 8 8 8 8 8 8
8 11 11 11 14 10 11 11 21 15 15 16 11 11 9 9 9 11 10 10 10 8 8 8 10 10 10 11 10 10 9 10 8 8 8 8 8 8 16 16 12 10 10 10 10 12 15 27 14 9
9 7 6 8 6 6 8 10 10 10 8 8 8 8 8 10 11 15 12 18 18 19 24 30 31 26 17 11 10 10 10 15 14 11 10 9 9 9 9 8 10 10 9 8 8 9 9 9 11 9
9 9 10 8 10 10 10 11 11 8 8 8 8 6 6 6 6 11 15 20 17 12 14 19 21 10 10 8 8 8 8 8 8 13 8 10 8 8 8 8 13 11 6 6 6 6 6 6 8 10
8 10 10 8 8 11 11 9 9 10 13 12 12 11 11 11 17 12 |
|---|
