BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-325D03.T7 (MSMg01no325_d03.b1) | MSMg01-325D03.TJ (MSMg01no325_d03.g1) |
ACC | AG443146 | AG443147 |
length | 669 | 730 |
length of high quality (start - end) | 265 (46 - 310) | 648 (81 - 728) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no325_d03.b1 PHD_FILE: MSMg01no325_d03.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:09:40 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no325_d03.g1 PHD_FILE: MSMg01no325_d03.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:09:40 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | TCATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGG
AATTCACATCAATTCCCTCTTTTCATAGCCTTCTTCACTGAACAATTTTA
AGTATTATGTAAAGCTATACTGCACAAGATAGCTTGGTACAGATGTATAT
TACAGATGTGGGATTGTCTAGAGTAACCGAAATTATAGAATGAATACATA
ATTGAATATATATTTACATGATTTATAATATAACCAGTTCAACAATGACT
GTTAACTAAAAGGCTAAATGTTTCATCTGGTCCTCAGTTATGCCATAATC
TCAAAGAAGAACTTGCTAGCCAGAGTGAGAGTAAGCAACCAAAGAGCAAG
CTTCCTTCTTCTGGGTCTTTTACATATGCAGCAGAAGTTGTANCCCAGAT
TAAAAATGGATCCTCGTACCTCATAATATCTGGATTAAAAATTTATTTTC
TAACCACACCAGACCAGGATTAGAAGTGGGTCTTCCCACTTTCAATAATT
TATTTAAGAAAAAAAAAATTCTTCACAGCTATATCAGAAGCCCTTGAGGT
AATTTAGGTTACTGCTCCGNAAAGAAAAAATAGAAAGNNCCCCCTTTATA
AATCTGTGGGGGNNNNNNNNATATTCTCACAGAAACCTCCCCCTCTTGGG
NNNNNNNNNNCCCTTTGAC
| NNNCCAATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTCTATCAATAAAGAAAAATG
AAAGGCTATATCTGCATCTGAATTGGTCAGGTCCTGGAAGAGCCTTTCAG
GGGACAGCTATACCAGGCTCCTGTAAGCAAGTACTTCTTGGTATCAGCAA
TAGTGTCTGGGTTTGGTGTCTTCAGGTGGCATGGATCCCTTGGTGGAGCA
GTCTCCGGATGACCTTTCTTTCAGTCTTTGCTCCATTTTTAGCTCTAAAT
TTCCTTTAGATAGGAACAATTCTGGGTTAAAATTTTGAGATGGGTGGAAG
GACCCATCCCTCAACTGAGGGCCATGGCTATCTAATAGACATGGATTCTA
AAGGTTCTATCTTGTAGCCTCCCCCAGCCTGAAGTGGGCTGATACAGACC
TTGTTGCCACTGAGGTGGGCCACCTGCCATGTAGCCTTCTGACTTAGATG
GCTATATTGTTTTGTCAACTACCACTGTTCTCCAAGATCCTGCTGCCGGC
TGAGATACCTTTGAGACAATCCCCATTTGTGTGGTGGGTGTCTTCCGGTG
GGTGTCTTCCGATGGGTGTCTTCGGGCTGGATCCAGGCGTCTGGATGGAC
TAGCAGGGGGATGGGCCTACCCCCTATATGAGCTTAGACTCTAAGTAAAC
TTTAAGGAGGCTTGAACAGAATACTTTTGG
|
quality values | Open.Hide. 8 8 8 8 8 9 13 18 37 37 29 27 24 22 22 27 30 25 24 24 30 32 30 41 37 24 20 19 19 16 19 17 8 8 8 8 10 28 31 46 30 29 22 24 24 28 32 47 39 36
42 34 34 34 34 34 34 37 34 33 29 36 28 40 40 48 48 48 48 48 57 42 41 34 26 36 42 44 25 31 37 42 48 36 36 35 35 26 36 57 48 38 38 41 48 48 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 48 48 54 59 59 48 44 43 43 37 37 43 32 46 46 46 48 48 52 52 52 57 57 50 50 35 37 37 57 57 68 68 68 68 68 68 57
57 52 52 52 57 57 68 68 68 68 57 57 57 57 39 57 43 42 43 44 44 68 68 57 57 43 35 39 39 42 42 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 43 43 32 32 44 44
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 50 50 37 37 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 42 39 37 37 44 44 42 42 35 42 42 44 57 57 57 48 48 48
59 59 59 59 48 44 44 48 48 68 59 59 47 54 54 59 59 68 68 68 44 44 39 35 36 36 43 37 43 43 30 23 37 34 30 28 43 43 57 57 43 43 43 37 37 44 37 41 30 32
32 20 20 32 33 33 33 16 15 12 12 12 13 15 18 18 23 25 19 12 18 18 41 41 59 59 59 59 50 50 50 50 41 41 36 17 17 10 10 10 10 17 12 12 12 24 24 35 39 39
32 30 34 34 33 28 23 22 18 22 11 11 11 14 12 11 12 12 23 14 22 28 28 21 21 12 12 12 18 15 9 9 9 9 9 12 15 12 16 9 11 3 0 3 14 22 31 37 39 47
47 59 59 59 59 50 57 57 43 43 43 39 43 34 29 25 33 36 37 39 39 35 35 39 43 46 40 39 37 41 41 36 35 39 39 39 37 37 39 39 38 31 34 39 41 37 34 36 22 18
15 19 17 16 11 11 10 11 9 7 7 8 8 8 10 11 11 12 21 21 21 13 13 14 21 18 25 20 36 26 26 14 15 11 13 14 10 10 10 15 8 8 8 8 8 24 19 26 26 24
17 13 10 10 13 18 15 15 10 14 17 17 21 21 19 12 8 6 6 7 6 10 10 9 9 10 11 12 15 11 10 10 10 10 10 9 9 6 6 6 8 8 10 9 8 10 10 10 11 8
8 8 8 6 6 6 6 6 6 11 9 10 8 8 8 6 6 6 3 0 3 11 8 8 8 9 11 8 9 8 8 6 6 6 8 7 3 0 0 3 12 16 11 10 8 8 8 8 8 9
9 9 9 9 11 11 10 10 11 13 15 3 0 0 0 0 0 0 0 0 3 9 9 10 10 6 6 6 7 6 6 7 7 8 10 8 7 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 3
0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3 7 8 6 8 8 8 8 8 | Open.Hide. 0 0 0 3 8 8 8 14 9 9 9 9 8 7 9 9 9 16 16 31 31 32 36 37 37 37 37 39 43 40 37 39 37 22 23 9 9 9 11 9 9 10 12 12 22 24 33 33 37 37
39 39 39 36 36 34 28 32 34 43 43 57 57 43 40 19 19 16 16 20 29 28 40 37 42 42 30 30 34 36 43 43 43 43 32 39 32 43 44 68 68 68 68 68 68 68 51 50 50 50
51 68 59 59 48 48 48 59 44 57 43 43 37 42 37 37 35 37 42 48 48 50 50 50 42 44 35 35 43 44 44 37 35 43 43 44 44 57 57 50 44 43 28 32 43 44 43 37 37 50
50 50 50 47 50 50 52 52 52 57 57 52 43 43 39 59 43 43 35 43 43 43 59 44 59 59 57 57 57 59 59 59 35 43 43 52 52 43 44 44 57 44 44 43 43 35 43 43 57 59
59 68 68 59 59 39 39 43 44 44 59 68 68 68 68 68 44 44 35 35 43 43 43 43 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 43 43 52 52 43 44 44 68 68 68 62 62 52 52 43
44 35 35 43 43 52 52 62 62 62 62 62 52 52 62 62 52 52 52 62 43 43 39 43 31 31 43 44 62 62 62 52 52 52 52 62 62 68 68 62 62 62 62 43 43 43 62 62 68 62
62 43 52 52 52 39 39 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 52 52 43 44 44 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62
62 62 52 52 52 52 52 62 43 43 43 39 31 43 43 52 62 62 62 62 62 39 43 43 62 62 54 54 43 44 43 52 52 62 44 68 62 62 39 43 43 62 62 68 44 44 43 43 43 59
59 68 68 59 59 39 43 43 62 62 52 43 44 43 62 39 39 14 39 39 52 52 62 43 43 39 43 35 35 43 44 44 68 68 68 62 62 52 52 62 62 62 62 52 52 52 62 43 43 43
43 44 44 62 62 62 43 45 45 52 43 62 62 68 68 68 62 62 62 39 43 43 43 43 43 57 43 52 43 59 44 59 41 38 17 32 38 43 52 52 59 57 57 44 44 44 59 68 59 59
68 59 59 59 59 68 59 59 59 59 59 68 59 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 54 57 57 50 50 35 43 43 43 35 43 43 57 59 52 52 52 52 52 52 52 52 43 42 43 43 43
43 50 43 44 43 44 44 48 48 50 59 44 57 57 57 48 48 44 44 42 42 44 47 47 54 59 59 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 44 44 30 30 41 41 43 41 36 44 44 68
68 68 44 44 23 28 34 34 43 43 43 47 47 48 59 59 43 43 32 28 37 37 28 28 43 37 48 48 57 43 43 43 39 39 37 39 39 34 34 30 30 32 34 39 39 39 37 37 38 34
34 32 34 37 39 36 37 32 30 32 33 33 33 37 39 28 28 37 37 39 39 40 40 41 43 43 43 48 39 39 43 41 41 37 43 28 28 19 29 21 32 25 30 30 50 50 47 47 39 41
41 40 29 27 22 24 24 25 31 32 41 41 41 39 31 29 32 37 32 27 28 35 36 37 37 39 19 11 11 11 |