| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-344M02.T7 (MSMg01no344_m02.b1) | MSMg01-344M02.TJ (MSMg01no344_m02.g1) |
|---|
| ACC | AG457743 | AG457744 |
|---|
| length | 714 | 711 |
|---|
length of high quality
(start - end) | 249 (76 - 324) | 400 (79 - 478) |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no344_m02.b1 PHD_FILE: MSMg01no344_m02.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:35:02 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no344_m02.g1 PHD_FILE: MSMg01no344_m02.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:35:02 2005 |
|---|
| singlet/doublet | doublet | doublet |
|---|
| BLAST hit | unique | unique |
|---|
| Map location. | (104,497,231 - 104,497,479) | (104,719,816 - 104,720,182) |
|---|
| sequence | GAGGGTCTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XCGCGGAATTCATGATTTCCAAGGGACACTAGGACCACAGTCTTTTCCTC
TTCCTCTCTTACATCCCAACATGAGTGGAATGACTTTGCTACACATCCTG
CCATACTGTGCTTCTGAGTCATAGGAACAGTCACTCAGTTTTGGAAACTC
TAAGCCCCAAAGAAGCTCCCCTCCTTATATGTCGCACGTGCTAACACAAA
TCTCGCCAGCAAGAACACACGCGGGCAACCGGATCCTTCTGCAGCAATGC
TTTATTATGCTAACTTCAGCATGATTATTATGACCCCGAGCCCCAAAAAG
GCGCTGCTTATATACACCTCAGTGCAGCGTGTCCACAACTGATTGGCTGC
TGCCAGTACCTCATTAATATGCGTCGGACCAGGCAGTGACTCGGCAAAAA
AAAACTCTTATGCACATGCGCACATTGGTTGTTTACCCATATTCATGGGC
TGTGGCCAGTGGTAGCCAGCGCCACCCTGCAATGGCACATGTGGCATCCC
ACACTTATAAAATGGCTGTCTCAGGTAGTTGGTGAGGTTAATAAGAGCTC
TGGAGTAAACTTTTTTTTTGAGCCTTGGATACCAATCGTGTACTGATAGT
GAACACCTGATCTCACTGCCAATATTCATGTCCTCTATGGTCAATACTTG
CCATTAATAGGACG
| CTCCTCGATGCAGGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCTTTGTGGTGCCCCTAAGCCTT
CAAAAGCAAAAAGGGCTAAAGGCTTGGCATGACTATCACGGCTCACAAGA
AGTTGTGAAACTAGGGATAGAGGTCACTGGCTGGGCTTTGAGGGTGAGGG
CTGACCCATGGTCAGAGTAGGAGCTGGAGAGCAAGTTTCACCTCTACTCT
GATAACTTCACTCCTTCCAACACACACAACCCTCTCCTCTTCAACACAGA
CTTACCAGTAAGGATCCAGGGGCCTTCAGGAACAGCCCGGGATTTGAGGT
AGAAGCCACTCAAGAGAGTGCCTTGAGTCCACAGATAAGTGCTTAGTGTT
GAAAAGGACAGGATAGGACCCTAACAGGATGGGGAGGGCAGGGGACCTTC
TATGGGATGCGAGGGCGGGGGAGCCTATTGGCTCCATGGGCAGGGGCATG
GGACATATCGTCGACTTAGAATTACTGACCCAACAGCTTCATGCAGGCCC
TTGTTTCACAGTGCTCATGTATTGCTACACGAATGGAAGGAGCCCTATTG
TCAATGCGGAGGTGTATTATCCTCCTTCCTCGGGCTTTGGCCATACCCAT
CTGTCTTTTTTCCTTTGTGCTTGTTTACCTCTATGTTTGCCATATATGTC
CGCTCTCCTAG
|
|---|
| quality values | Open.Hide. 6 8 8 10 8 10 10 10 9 9 9 16 21 30 34 23 12 12 12 10 13 28 24 25 22 24 32 41 41 41 41 28 25 20 19 13 6 7 7 8 7 8 8 9 10 10 12 12 12 12
16 23 30 47 47 36 31 31 31 33 33 33 33 21 21 12 15 8 8 7 9 9 9 12 12 12 26 26 32 32 30 37 37 47 53 42 53 53 53 53 53 59 59 59 59 59 59 59 59 59
68 68 68 68 68 68 68 68 68 47 50 43 43 43 43 53 68 68 68 54 53 48 48 44 43 37 43 37 37 48 48 50 50 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 68 68 57 57 57 57 57 57 59 59 57 68 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 52 52 59 59 59 59 59 68 68 57 57 57 57 57 57
59 59 59 59 52 57 57 52 52 59 59 68 68 68 57 57 57 57 68 59 59 59 59 59 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 54 54 57 57 57 57 57
57 59 57 47 43 35 35 35 28 28 31 42 44 57 57 57 57 48 48 48 44 41 41 39 32 39 43 59 54 54 54 57 57 48 48 54 59 59 59 59 59 59 54 59 59 68 59 59 59 59
57 57 57 57 57 53 57 57 57 57 57 59 59 59 53 48 48 41 41 28 27 21 21 15 12 11 12 12 15 11 10 10 17 23 36 37 41 41 48 48 48 48 47 47 43 59 59 59 59 59
59 59 59 59 59 59 57 57 57 68 68 57 59 47 43 43 43 48 42 42 35 37 37 43 47 47 57 59 59 48 54 54 48 57 48 48 48 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59
59 57 57 57 54 59 59 59 59 59 59 57 57 59 59 59 57 57 59 59 59 50 46 43 43 35 35 29 32 32 19 20 28 41 42 43 50 43 43 43 43 36 29 44 44 57 57 50 50 54
59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 48 48 48 48 57 57 42 44 35 47 44 57 59 68 68 59 59 57 48 48 48 48 44 44 37 30 30 32 32 47 47 41
43 43 43 35 35 35 35 42 42 32 30 28 29 28 28 25 30 30 37 39 32 32 35 39 35 37 37 41 33 37 36 27 18 15 14 16 17 30 37 59 39 47 28 28 12 18 15 26 28 32
31 43 43 48 57 57 57 43 43 43 43 43 42 25 22 22 20 22 30 43 32 43 18 18 12 12 12 18 18 31 20 20 24 24 40 28 22 22 15 21 14 15 15 13 12 9 12 12 15 27
32 23 23 20 23 23 15 13 8 8 8 8 19 28 31 33 33 33 33 33 18 18 11 16 16 19 10 10 10 10 10 12 12 10 10 10 11 10 11 8 10 6 6 8 12 8 8 8 8 10
15 13 11 11 10 10 10 12 12 11 12 9 8 8 8 8 8 15 16 10 6 6 6 6 10 10 8 8 8 12 11 15 8 8 8 10 11 18 14 9 10 8 8 8 8 10 15 16 16 10
13 12 14 12 19 11 11 9 9 9 8 8 6 6 | Open.Hide. 6 8 8 6 6 6 6 8 10 8 8 9 11 11 12 15 13 9 9 9 19 9 19 12 23 21 31 31 25 33 34 34 34 31 22 9 9 9 9 9 9 10 10 10 10 11 10 10 11 15
15 15 27 27 33 28 33 36 28 27 12 9 11 11 9 9 7 7 7 7 11 8 14 14 22 22 33 33 43 48 48 57 59 50 50 47 47 42 43 43 57 48 47 44 40 40 25 34 23 29
21 28 42 42 57 48 54 54 54 54 59 59 59 57 44 44 32 32 30 30 30 36 44 32 37 28 37 37 46 47 57 57 57 57 57 57 48 48 47 47 48 57 57 47 47 44 41 42 41 47
47 50 57 50 50 57 47 57 50 54 50 57 57 50 46 46 46 50 50 50 57 57 57 52 52 52 52 57 52 52 52 43 43 41 31 31 43 44 57 57 57 57 54 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 43 43 39 43 43 57 52 43 43 43 43 52 44 43 39 35 35 43 43 45 52 43 57 57 52 52 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 52 62 43 62 43 45 43 43 43 52 52 52 52
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 44 62 52 52 43 43 26 15 12 12 13 27 28 13 13 20 18 35 43 43 62 62 52 52 47 43 43 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57
39 39 39 44 44 52 52 52 44 44 39 29 29 35 39 35 35 43 43 52 52 52 52 44 44 44 44 23 28 23 38 36 52 52 52 43 43 28 36 36 32 43 36 38 16 14 14 16 30 27
38 35 33 43 43 50 43 43 35 24 27 18 16 16 32 16 22 28 44 44 27 30 14 15 18 32 24 32 36 36 32 32 32 32 24 26 14 14 14 26 26 17 17 17 24 26 32 43 44 46
54 44 40 40 23 23 20 32 32 37 37 26 30 17 17 14 23 14 14 14 24 24 37 30 24 24 16 19 22 24 28 28 21 21 10 12 12 16 11 11 11 13 13 12 10 10 10 15 19 16
10 10 10 15 13 16 16 11 9 9 11 12 11 11 15 27 18 11 10 10 10 10 11 19 23 28 34 25 19 20 12 11 11 11 11 11 11 17 15 10 10 11 12 15 10 8 8 8 8 12
18 30 24 21 21 16 10 12 10 10 12 9 9 9 9 9 9 9 9 9 12 9 9 10 13 15 19 19 12 12 12 14 18 19 12 12 12 12 18 15 22 19 19 10 13 8 8 8 10 8
11 8 8 6 6 8 6 9 11 12 11 11 12 11 9 9 9 9 9 9 10 10 10 10 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 12 6 6 8 8 7 7 8 10 8 8 8 8 8
10 8 8 11 11 11 20 20 9 9 9 9 9 9 15 13 13 11 10 9 9 9 11 8 8 8 10 10 10 8 6 6 8 8 8 8 13 10 12 12 9 8 8 10 8 8 9 9 9 9
9 9 9 9 9 9 9 8 8 7 7 |
|---|
