BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-346N04.T7 (MSMg01no346_n04.b1) | MSMg01-346N04.TJ (MSMg01no346_n04.g1) |
ACC | AG459317 | AG459318 |
length | 725 | 736 |
length of high quality (start - end) | 506 (41 - 546) | 427 (72 - 498) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no346_n04.b1 PHD_FILE: MSMg01no346_n04.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:37:36 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no346_n04.g1 PHD_FILE: MSMg01no346_n04.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:37:36 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGAATTC
AGCGCATTTCCCAGTAGGGCTATGACAATGGCCTCCTCCTAAAGGTAGTC
AGAGAACATCCTCAAACAATGAAGATGTCACTGCCGCTCCAGCCTTAAAC
CAAGGAAGCCTTTCAACTTCTCCATCACAGCACACCATTTCACCTCCTCC
AGAGCAAACAGCTAGCTAAAGATCTCTGGCATCCTGCGCTGTCTTCTTCT
TCACACTAATGCCACAGCTTGTCCCTGGTCAGTGTGGTTACCAATCCCTA
GCACATATGCATACACATTAGAAAGAGTAAATCTAGATGAACTGTGCTGA
TGAAAAAGTATGGACAGGAGGTGCTCCCTGAGAGATGCTCCCTGAGAGGA
GATGTTCCCTGAGAGGAGGTGCTCCCTGAGAGGTGCTCCCTGAGAGGAGA
TGCTCCCTGAGAGGTGCTCCTTGAGAGGAGGTGCTCCCTGAGAGGAGATG
CTCCCTGAGAGGTGCTCCCTGAGAGGAGATGCTCCCTGAGAGGTGCTCCT
TGAGAGGAGGTGCTCCTTGAGAGGAGATGCTCCCTGAAAGGTGCTCCCTG
GACTCTATTGAATTTTTTTTTCTAACAATGAAGCTGATAATCACACAGGC
ATAAGTTGGTCGAACTGACACATTACAGCCCCGTTTGGAAAATTCCACAC
ATTTACAGGAGCCCAAACCCACTCN
| ACXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTCACCTGAGGAATACCGAATGGCAGAGAA
GCACCTGAAAAAATGTTCAACATCCTTAATCATCAGGGAAATGCAAATCA
AAACAACCCTAAGATTCCACCTCACACCAGTCAGAATGTCTAAGATCAAA
AATTCAGGTGACAGCAGATGCTGGCGAGGATGTGGAGAAAGAGGAACACT
CCTCCATTGTTGGTGGGATTGCAGGCTTGTACAACCACTCTGGAAATCCG
TCTGGCGGTTCCTCAGAAAATTGGACATAGTACTACCGGAGGATCCAGCA
ATACCTCTCCTGGGCATATATCCAGAAGATGTCCCAACTGGTAAGAAGGA
CACATGCTCCACTATGTTCATAGCAGCATTATTTATAATAGCCAGAAGCT
GGAAAGAACCCAGATGCCCCTCAACAGAGGAATGGATACAGAAAATGTGG
TACATCTACACAATGGAGTACTACTCAGCTATTNAAAAGAATGAATTTAT
GAAATTCCTAACCTAAATGGATGGACCCTGGAGGGGTTTCATTCGGAGTG
GGGGAAAACCATTTTCCAAAGGGAAACTTTCCCAAAATTGGTTACCCTCC
GGTTAAAGGGGGAAAATTAACCCCAAAATCCTTATGGAAATCCTCTAGAA
AATAAAAATACCCTTTTTTTTTTAAACACCTTTGGA
|
quality values | Open.Hide.37 37 37 37 41 39 39 39 39 37 15 17 9 9 9 14 20 32 32 41 30 30 30 19 19 10 12 8 7 7 6 6 8 10 13 23 23 28 21 22 24 32 39 39 36 36 32 30 29 29
22 21 21 11 11 11 11 10 11 13 12 17 15 19 22 37 46 48 48 48 57 57 57 39 39 39 39 43 43 43 40 32 32 37 37 46 46 43 43 43 44 57 68 68 68 68 43 44 30 30
36 44 44 59 48 47 42 42 42 41 44 39 37 37 48 42 47 47 57 57 68 68 48 48 35 36 36 35 39 44 46 48 57 48 48 46 57 47 47 44 43 50 37 37 43 59 59 59 46 44
44 47 57 57 68 57 50 50 37 37 43 50 52 52 52 52 57 57 52 52 52 52 52 52 52 52 52 52 52 57 57 52 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 52 52 52 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 59 59 68 57 57 57 57 57 52 43 59 59 59 59 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 45 43 43 43 52 52 52 52 52
62 62 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 62 62 62 39 39 43 62 62 68 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 62 54 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 43 39 31 31 35 32 38 35 35 35 59 59 62 62 68 68 68 62 62 52 52 57 59 59 68 68 59 59 57 57 57 59 59 57 59 57 57 57
68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 43 59 43 57 57 52 43 44 44 54 52 57 43 57 52 52 52 52 52 52 43 44 44 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 52 52 52 47 44 44 50 50 43 57 57 57 57 43 43 35 43 36 43 43 48 42 44 44 54 54 59 57 57 42 42 42 44 44 48 42 44 43 43 43 47 47 48 57 57
57 39 39 37 39 39 46 37 44 42 54 48 59 48 47 34 40 33 43 43 43 43 43 57 57 57 57 57 32 30 18 18 18 30 32 43 48 48 39 39 32 36 30 39 47 39 39 35 39 39
40 37 41 36 36 34 34 28 28 19 26 17 22 22 30 30 43 43 41 34 34 30 28 28 37 37 33 33 33 33 30 30 28 32 24 25 25 28 23 28 28 34 37 28 19 23 17 22 22 25
23 28 15 25 26 29 29 23 18 16 18 21 16 16 19 16 16 18 17 19 23 23 24 28 26 19 17 18 18 12 12 15 24 23 28 23 18 18 16 16 12 13 12 13 18 23 21 8 8 8
9 6 6 8 8 8 9 12 13 16 14 15 21 28 39 30 19 12 9 10 8 7 7 7 9 12 12 12 12 12 14 12 12 10 10 10 12 10 9 13 13 9 9 11 11 10 10 8 8 8
8 8 8 13 13 13 13 13 10 8 8 8 13 8 8 8 10 9 8 8 8 8 8 8 10 9 9 9 11 9 9 9 9 9 11 13 15 14 10 10 10 10 10 10 9 9 8 8 8 10
10 10 13 14 12 11 11 11 10 9 9 9 10 10 10 12 13 14 9 9 12 10 10 3 0 | Open.Hide. 6 6 6 8 7 7 9 6 9 9 19 18 30 30 37 37 37 37 37 39 32 26 32 28 18 23 9 9 9 9 9 9 12 15 14 18 18 29 26 33 33 33 36 38 38 33 33 33 33 33
39 39 41 25 23 12 9 9 9 10 15 15 28 32 34 31 31 29 29 33 33 34 33 33 33 30 37 43 43 57 47 50 42 48 37 37 40 43 48 44 48 48 43 43 43 48 48 68 59 48
43 39 39 39 41 39 48 48 68 68 68 68 68 68 57 57 39 39 37 57 44 44 39 39 48 43 48 48 57 37 39 39 39 39 37 46 48 57 48 48 48 50 47 47 48 50 50 43 43 32
44 44 50 52 52 52 52 52 52 43 44 42 51 38 42 36 41 43 43 37 43 43 37 37 52 52 52 43 43 59 43 52 52 57 57 68 57 57 52 52 43 57 57 57 57 57 57 52 57 57
68 57 57 52 45 45 57 57 57 57 47 47 47 57 57 57 57 57 57 52 52 43 57 43 52 52 57 57 57 57 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 43 62 43
52 52 62 52 52 52 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 57 57 57 57 59 52 52 52 59 59 57 52 52 43 57 45 45 43 43 52 52 52 59 59 68 57 57 52 43 43 41
43 43 57 59 57 57 57 59 59 39 43 43 43 43 31 44 43 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 52 57 57 54 54 54 52 57 57 68 57 57 54 54 52 50 57 57 57
59 59 50 43 44 43 43 43 44 43 44 44 44 48 48 48 59 59 59 59 57 48 48 48 59 59 57 57 57 57 57 44 44 44 44 43 47 47 57 59 59 68 68 68 68 68 68 57 57 57
57 57 57 59 59 59 59 43 43 43 43 57 57 59 59 59 48 43 43 43 43 43 59 59 59 59 59 59 59 59 59 53 50 50 50 50 47 47 39 39 39 28 28 35 39 34 32 41 39 39
35 41 44 44 44 41 31 27 25 22 28 33 34 37 34 34 24 24 33 34 34 32 25 27 30 33 37 30 26 21 24 20 24 20 20 30 24 28 32 32 37 36 36 43 28 28 14 12 12 15
19 28 23 23 17 18 16 22 8 8 8 8 8 13 17 19 17 9 9 9 15 17 25 18 10 10 10 10 15 16 23 7 3 0 3 10 6 10 8 10 10 12 13 13 14 21 21 22 23 28
19 27 13 9 9 8 8 9 12 17 6 6 6 6 6 7 8 15 9 10 18 18 14 18 10 8 6 6 8 6 6 15 12 21 16 11 11 11 8 8 8 8 8 8 9 9 11 10 8 8
8 10 9 8 11 9 10 11 11 11 11 12 18 11 11 9 9 9 11 13 13 18 19 7 6 6 6 8 8 10 9 10 10 9 6 8 6 6 8 6 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10
10 6 6 6 6 6 8 8 9 10 10 9 8 8 11 8 8 6 6 6 8 10 14 11 10 10 10 10 10 10 10 6 8 8 10 7 6 9 10 8 8 10 6 6 6 10 8 8 8 13
9 12 8 8 9 11 8 7 7 7 8 8 9 9 13 16 25 24 22 22 22 28 28 15 13 12 6 6 6 8 8 10 11 11 11 11 |