BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-400K13.T7 (MSMg01no400_k13.b1) | MSMg01-400K13.TJ (MSMg01no400_k13.g1) |
ACC | AG500229 | AG500230 |
length | 748 | 1,636 |
length of high quality (start - end) | 244 (80 - 323) | --- |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no400_k13.b1 PHD_FILE: MSMg01no400_k13.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 18:14:02 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no400_k13.g1 PHD_FILE: MSMg01no400_k13.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 18:14:02 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | NNNAAAATCTTTACTCGTGGCGCTANANGANTCACTATTTCGAGAGTATC
CGCGGAATTCATCTGGTTACACGCTAATGAAAGAGCTAGTGGACTGTGGT
TCTTCAACAAGTGTTGAGTCTCTAATGAATAGAGTTGAAGGAGGAGGGAT
GTTGATACAGGGCTGAGGATGAGACTGGAGAGACAGACATGGAGAATAAG
AATAGTGTGTCTTAACTGAGTCCCAACCAGGTGTGGCCACCATGAGTCCC
ACGTAGGGTGTGTTTTTAGATATAAGCTTCTGATACAAAGGAATAAGAAT
GGGCTAGAGGGGAAGAACAAGAGTATTCTTCTTTAGAGTCCTCAGCAAAG
AGCTAAACAGAATCCTCACCAAGAGGAGGATCTACTCTATAATAGCTACC
ATGGTCTTTACTCATTCCAACCTCTACTTACTCCTGGTACAGTGATTTTC
TTTTCCTATTTTATTCATTTACCATAGTGTTTAAATTTTATGCATATTTA
TTACTTTTACATTTAAAAGTTAAAGCTATTTCTTAGATACCTGGTTAAGC
TGATATAAATTCTTAGGAGCATTTGGCTTATCTCCCTAACCTAGCATTAC
ATTGGAATGCTATGACTTGAAAGTGTGTATTACCCAAAGTTCTAAGAGAA
CTGCTAGAATTGTTTTCTTCATTTTCGGGGCATTCCTACTTTTTCATTGG
AAAGTAATTATCTGTATCTAGAATGGCTTTCATTTTCGACGTAGGAAA
| ATCCTGTTCTGGGCAGTTGTGCGCGCGANGACNCCATGTACAACATACAC
GACTCTACNACATAGCATATTGATAGAGTGTACGATATTAGTTATTATTA
TCTATCTCATTATCATATAATATCAGTGAATGACATACATATCTACTAAT
GATATCAGTTACCACGTAGCGTAAGACAGACATCACTAANCACCATTGTG
TATACTATACTCTATTATCTACGTTAGCTCTAGGTACTGCATGCATGACA
TCATCACATACGCACCTTCATAGCGTCTGCAGACGTATATTCAATCATAC
TGCGCGTCTTATGTNGTAGCGCCGACCGCATGCATGACACTCNACTGTAT
AGAGACGATCATGACTATATGNTGAGCATATGTCGGAGCACGACATTATA
CATATCTGNCTGCTGAAAAGTGCTTGACACAATATCGTAAGATATAATGA
CATGTGATGTGTCTCATACAGATATGATAAATCATACAAGATGAGGTGCT
GTCATCTGGCGAAACGACAGAATCGAGACACATATAGCATCTATATCATA
GTCGGACACACACCAGTAGTATTGCGCCTCTCTCATCACATATAGTGCTN
GCACGGATAATATAAGTGTGATCCTGGACCATTGATCCCTACACATAAAG
ATACGTCATCAATCGTAGTGATAGCGGCTCGNGTGTGCGTGCCGTGTGCC
TTCGCCTTCGTGTCGCTGTGCTCTACGACTCAGCACACATCGCACTACGA
CACGTGTGCAGCGCATAAGATGCGATACGTGATCGGTTGGACACTATGCA
GCGTGAATCCGTGTATTATAACATCATTCTGTGTAGTATGCAACATNATT
CAACCACGTGCTGTGCATCGACAAGCGAGACATAGTAGACGTAGCAGGTC
GATAACAGCATCTGTTATGGCCAAATGAGCAGATGTGCAGAAAGCGTTGC
GTATCGTTGGAATGTAGTGCTCGATCACTGAGCATGATGATGCGTGCGAC
TGTTCTCAGGCACGATACGATGTGCGAAGTAGAATAGTCGNATCGTATAT
ACGTGCGGCATATATGACTCGCGGTACGCTCGCGCGCATATNCNATAGCC
TAGCTANCGNTTATACTNTTATGCGCGAGTCTNCTGCGTAGCGCGTGGTT
GTCAGANTATGATATGNANCGCGTCNGANCGATGNCTCTGACTGTGAGGA
TGTGATAGTGTGAGCGTGTAGCGTATCAGTGAGANCGTGTGTGCGTCACA
GGACGTGTCATGCAGTNATGCATTGACTCTTACACTCAACTGNGTGCATG
CGTCTAGTACGACAGTCATCGTATGACTGTGTTGAGTCTGTGTGTGGACG
CGTAGTGATGACACATTACACGGACGATACGNTATGTCACGTCGATACAG
CGCGATCTACGTGGACGANCGTANTGNGTGATATGACTACGACGTGTGAC
TCAACGACAGTTATACGTAGTNNAGCAGCATTTCGGTCGAGTATCGTCGC
ATGCCNAGTCGTCACAATGAGCGTCATACTGATATATACGCGTCANTACG
TTTGTCGAACGAGAATCTGACTGAGAGTGTAGTGATNTTNGAAGGCGTCA
CGACGTATGAATATGCGAGTCAGGNAGGACATTGAG
|
quality values | Open.Hide. 0 0 0 3 7 6 6 6 6 6 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 10 17 10 8 3 0 3 0 3 3 0 3 10 10 10 7 9 6 8 8 6 6 6 9 9 9 9 9 9 9
10 22 24 41 29 23 23 22 29 20 20 16 19 10 7 7 7 7 7 9 9 9 11 11 19 18 18 16 15 12 13 30 34 41 59 47 50 50 50 50 53 53 53 47 48 33 31 31 31 31
30 37 30 28 19 14 22 23 25 30 30 59 50 50 59 53 53 57 41 41 33 34 28 33 33 32 28 22 18 29 29 42 48 50 50 50 53 59 59 59 59 59 59 59 59 57 35 30 24 28
28 30 31 33 33 33 30 30 39 37 32 39 39 37 37 36 30 30 33 33 33 36 48 48 50 43 48 48 48 48 48 48 48 48 48 48 57 48 48 48 47 47 54 40 42 50 50 50 50 50
50 50 50 50 50 68 68 68 57 68 68 59 57 57 57 68 68 68 68 57 59 57 57 48 48 57 48 48 48 59 59 68 68 57 57 48 48 48 48 48 57 57 57 57 68 57 57 59 57 54
54 57 44 32 16 11 11 12 12 14 15 34 41 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 68 68 68 68 57 57 43 43 43 57 59 57 57 57 57 57 57 48 48 48 47
47 47 59 59 59 59 59 57 59 59 59 59 59 59 50 50 50 47 41 30 17 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 23 28 34 37 46 46 47 59 47 48 48 57 48 48 59 59
59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 47 42 39 28 28 18 18 17 22 25 40 44 48 54 47 47 47 50 50 53 54 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 59 59 48 48 47 59 59 59 57 68 68 68 68 57 57 57 57 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 54 57 54 54 54 59 59 59 59 43 43 43 59 59 59 54 54 54 48 48 48 48 48 43 43 48 48 43 57 47 47 40 47 43 57 48 48
48 48 40 40 40 37 37 27 27 15 15 17 30 28 31 28 32 37 59 59 43 37 37 28 23 32 28 39 39 47 43 43 24 25 12 21 21 27 30 39 37 25 16 13 15 15 22 31 42 41
40 41 37 47 47 39 39 48 48 32 32 28 21 21 28 26 36 39 37 41 41 31 36 27 11 9 10 10 22 22 28 28 24 31 16 15 11 13 13 15 21 25 19 17 17 17 21 21 21 13
22 17 18 25 25 22 22 22 31 31 26 29 19 24 19 28 28 31 18 17 14 18 21 22 22 16 14 10 9 12 12 17 12 10 10 10 12 12 10 10 8 10 6 6 6 8 11 13 11 22
20 22 11 11 11 9 11 11 13 9 9 9 12 16 12 10 8 8 8 8 8 10 14 18 19 14 10 9 9 10 11 14 16 23 14 14 16 17 17 21 15 12 10 10 10 10 12 11 11 10
10 12 14 9 9 9 8 8 6 6 13 8 8 8 8 6 6 6 6 6 8 10 10 10 10 12 10 12 12 13 10 10 12 12 21 12 12 10 13 8 8 8 8 8 8 9 9 9 | Open.Hide. 6 6 10 6 8 8 8 8 13 6 6 6 6 6 6 10 11 14 12 12 9 9 9 10 9 10 10 3 0 3 9 3 0 3 6 6 6 6 9 9 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8
7 7 8 7 8 7 8 3 0 3 10 10 12 11 9 9 9 9 9 8 8 8 6 8 6 6 6 6 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 10 6 6 6 6 6 6 8
9 9 11 8 8 8 6 8 6 9 9 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 7 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 7 6 6 6 6 8 8 10 6 6
6 6 10 8 9 8 6 6 6 10 8 10 10 12 10 8 8 9 9 9 9 11 8 8 6 6 6 6 6 6 8 6 6 6 6 9 10 9 3 0 3 7 6 6 8 8 8 8 8 8
10 13 8 8 8 8 10 10 9 6 8 6 6 6 6 6 8 10 10 10 13 13 8 6 6 6 8 10 10 10 8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 6 6 9 9 8 10 10 8 8
6 6 6 6 8 8 6 6 6 8 6 6 6 6 6 8 8 6 6 8 8 8 10 10 9 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 10 8 13 8 8 8 8 10 13 10 10 10
10 10 8 6 6 6 6 8 6 6 6 8 8 3 0 3 6 6 6 6 8 6 8 6 6 6 8 8 8 6 8 8 9 9 8 9 9 9 9 9 9 3 0 3 6 6 8 11 11 9
9 9 9 6 8 6 6 8 8 8 10 9 10 10 10 10 9 9 9 11 3 0 3 8 8 8 8 10 9 9 9 9 7 7 8 8 8 10 15 8 6 6 6 8 8 8 8 7 8 8
8 8 8 8 9 9 9 3 0 3 8 8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 9 9 9 9 12 6 7 7 6 8 6 8 8 8 10 10 10 8 7 7 7 8
9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 7 7 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 9 9 9 9 9 9 9 10 11 11 11 10 10 9 6 6 8 8 6 8 9 11 10
10 10 8 6 8 6 6 6 6 9 6 6 7 6 6 8 8 10 10 10 10 8 8 6 6 8 8 10 10 8 6 6 6 7 6 7 6 10 11 11 10 10 7 7 7 8 8 8 10 10
10 9 6 6 6 6 6 6 8 8 6 6 10 12 14 8 8 6 6 6 6 9 9 6 8 7 6 6 6 8 8 6 6 6 8 8 11 16 16 10 8 8 7 7 7 9 8 8 3 0
3 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 13 9 10 9 8 8 8 7 8 8 8 6 6 6 6 6 6 7 7 6 6 6 8 8 8 6 6 6 6 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8
10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 9 12 10 8 3 0 3 6 6 8 8 8 8 8 7 7 8 8 8 6 6 6 6 7
10 10 8 8 8 6 6 7 6 6 6 7 10 6 6 6 6 10 10 10 9 9 9 6 6 6 6 6 8 9 9 9 9 8 8 8 6 6 6 8 8 10 8 6 6 6 6 8 8 8
6 6 6 6 6 6 8 8 6 7 8 7 8 13 10 10 8 7 6 8 8 6 6 8 10 9 11 11 11 11 11 11 9 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 11 13 12 9 9
6 6 6 8 8 8 6 6 6 6 6 9 11 10 10 10 11 11 8 10 7 7 7 7 7 6 6 8 10 9 9 10 10 10 7 7 6 8 6 6 6 6 8 8 8 3 0 3 7 6
6 7 8 8 10 10 10 11 11 10 9 9 9 6 6 6 6 6 6 10 9 9 8 8 8 8 9 9 10 8 8 6 6 6 6 6 6 10 9 9 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6
6 9 10 10 6 6 6 6 6 10 10 14 8 6 8 6 6 8 8 6 6 6 6 6 6 8 6 6 6 6 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 7 10 6 6 8 8 8
8 8 8 6 6 6 6 8 8 6 6 8 8 7 9 14 11 13 9 9 9 9 10 10 14 11 11 9 9 9 9 10 10 8 8 8 8 8 13 8 6 6 8 8 8 8 8 9 9 9
9 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 10 15 10 9 7 8 8 8 13 9 8 8 8 8 8 8 8 7 8 6 6 8 8 8 6 6 6 8 3 0 3 6 6 6 8 8 11 12 10
8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 8 8 8 9 8 8 10 6 6 8 8 10 8 8 8 8 8 8 10 13 14 14 14 15 3 0 3 0 3 6 6 6 6 6
6 6 6 6 8 3 0 3 3 0 3 7 6 8 6 7 3 0 3 6 6 8 8 8 6 6 6 6 8 8 10 3 0 3 6 6 6 6 6 6 8 11 8 8 8 8 8 8 8 8
8 6 6 6 6 3 0 3 9 6 6 6 6 6 7 3 0 3 0 3 8 8 6 6 3 0 3 3 0 3 10 10 10 3 0 3 8 8 8 6 6 6 6 10 7 9 6 6 8 8
10 13 10 8 8 8 8 6 7 9 12 12 12 12 16 16 11 11 11 12 9 8 8 8 8 8 8 10 8 9 9 11 9 3 0 3 8 8 10 13 13 11 11 11 11 9 9 6 8 8
8 8 8 8 8 11 11 6 6 6 6 6 6 6 6 3 0 3 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 7 7 7 6 8 8 8 8 8 8 8 3 0 3 8 8 9 8 6 6
6 6 8 8 8 8 8 10 10 9 10 9 8 8 8 8 8 8 9 9 9 10 10 10 17 12 11 11 8 6 8 8 6 6 8 6 6 6 6 10 8 8 8 8 10 6 6 6 6 6
6 6 6 6 8 6 6 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 7 8 8 6 6 6 6 8 6 11 9 9 3 0 3 10 8 6 10 6 6 8 6 10 11 9 9 9 9 10 10 12
15 10 10 8 8 8 8 8 10 10 8 6 6 6 6 6 6 3 0 3 9 9 3 0 3 3 0 3 8 8 8 8 8 8 8 7 7 7 8 8 8 8 8 8 9 9 9 12 11 11
9 6 6 6 6 6 8 8 6 6 8 6 7 6 6 6 6 6 8 9 3 0 0 3 7 7 7 6 8 6 6 6 6 6 8 8 10 10 8 8 6 6 8 8 9 9 10 9 9 9
9 8 8 8 3 0 3 6 6 6 6 10 8 8 8 6 8 8 7 8 6 6 6 6 6 8 8 10 10 9 9 9 9 9 11 11 9 11 9 6 6 6 6 8 3 0 3 9 9 8
8 7 7 6 6 6 6 6 7 6 6 6 6 6 6 6 8 8 6 6 6 6 6 8 8 8 6 6 8 8 10 10 12 8 8 3 0 3 3 0 3 6 6 6 6 6 6 8 8 8
10 8 6 6 6 6 8 6 8 10 10 10 8 10 10 6 6 6 6 8 6 6 6 3 0 3 6 8 8 10 10 10 12 12 15 14 |