BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-423E11.T7 (MSMg01no423_e11.b1) | MSMg01-423E11.TJ (MSMg01no423_e11.g1) |
ACC | AG517472 | AG517473 |
length | 735 | 739 |
length of high quality (start - end) | 241 (60 - 300) | 243 (57 - 299) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no423_e11.b1 PHD_FILE: MSMg01no423_e11.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 18:43:55 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no423_e11.g1 PHD_FILE: MSMg01no423_e11.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 18:43:55 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | CGGCCGCTATACGACTCACAATCAAAAGAGGATCCGCGGAATTCTCAAAT
GCTGAAACTCAAATGGCTGAGAAGTACTTAAAGAAATGTCAACATCCTTA
GCCAACAGTGAAATGCAAATCAAGGCTACTTTGAGATTTTATCTTAACAC
CTATCAGAATGGCTGCAATCAATAACAAAGTGATGTCTCATTCTGGTGAG
GATTTTCATCCATTGCTGATGGGAATGCAAACTTGTGTATTCACTGTGGA
AATCAATGTGGTGATTCCTCAGGAAGATGAGAATGACTTTACCTCAAGAT
CTTAGCTGATTTCTCTTGGGCATATACCCAAAGGTCACTCCATCCTACTA
CAATGATACTTGCTCAACTGTGTTCAGTGATGCCTGATTAATTGTAGCCA
GAAATTTGAAACTACCTAGATGTCTCCCAGTGGAACAATGGATGAAGAAA
ATGACCTACATTTACACTATGAAGTATTGCCCAGCTCTTTAAAAAATAAC
ATTATAAAATTTGTAGGCTCTCCTGGGCATATATCCAGAAGATGCCCCAC
CTGGTAATAAGGACACATGCTTTCTCTATCGGCTTAGTTACCTTATTTAT
TTTGTTTTAATCTGGTTCTTATTCCGATGCCCCTCTTTTTTTTTATGGTC
TCCTACACCGTGGCTCTTCTACCCTCGCATTACCTATCCACCTTTTAATA
TGACTACTCTATATCTTCCCATGTATACGGCCGCG
| AGGCCTGGGGGNCGGCCTTTCAAAGAAGTTAGGNGACCTATAGATTACAC
AAAGGAATTCCTAACCCTGAGCTGAACCAAGTCCTCTGGGAGTAGGGATG
CCCCCTCACTTCTCCTCCTGGCTAGCTGAGAAACTCTGACTTACAAGGAG
GGCATGCAGGCCTTGCCTATACTAAGTATGAGGTTCAAGCTACTAAGGAG
AACTTGCATAGTTCTAGAGTATAAAATCACACTTATTTAAGCCATCTCTC
TTGGGTCTTTGATACATGAATTTATTTCAAACAAACATTAAGACTGTATT
TGTGATTTTGGGCCCATTCAGTTTTAATGAATCTACAATTTTACGGCGCA
CCTCCTTCTAATATTTTTAAAAATAACCGAAGTTTATAATTGACAACATT
AAAAACCAGCCTCTGAACAATTTGCCGTTGTCACTGCCTTAATCAATTTA
TTATGCCTACCTTTGTGTGAATGCTACTCTAACATCTATTCTAATCTAAA
CTTGCAGTATATAGAAAATAACCCACAGTTTAGCTTGCACTTTTATAATT
CTTTTAATGGTTTACAGCACAAGGGGGCGCATCTTAATCCCAGACGACCC
CGTACATTTACTAGGCTCTTCACCACTGAGTTTTCTTTCTTTGACCGAAT
ATTCCCGTTCCCCCTTTCATATGCCCTTTCCCCCTTATACCGTTCACCAA
AAACATGCCTTTTACTTCCCATTGTCCCCTTTTCTTTCN
|
quality values | Open.Hide.22 28 28 18 14 18 11 10 10 13 13 26 26 59 22 17 15 8 6 6 6 6 8 10 11 20 19 20 24 23 23 27 28 30 30 37 59 59 33 33 33 33 33 31 19 11 6 6 6 6
6 6 9 12 14 28 21 19 17 18 16 23 29 43 48 47 57 57 57 57 57 57 57 34 43 30 40 40 43 43 57 57 57 42 47 42 42 42 36 36 36 43 39 43 43 48 57 59 59 41
32 15 21 21 37 38 38 23 22 23 28 32 42 42 48 50 50 57 57 57 47 43 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 59 57 57 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 50 50 50 50 50
50 57 57 57 57 47 47 47 47 47 47 38 46 42 42 35 39 42 44 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 57 54 54 54 54 68 54 57 59 57 48 48 48 48 48 42
42 42 48 48 48 57 68 57 57 48 48 48 59 59 59 59 57 57 57 43 43 36 33 36 33 33 33 33 46 46 43 37 37 25 28 12 9 8 8 6 8 8 13 28 36 41 41 41 48 48
48 48 57 57 57 57 57 57 43 37 31 22 22 28 34 42 48 48 43 43 43 43 43 43 42 42 42 42 40 39 33 29 36 36 39 39 43 57 57 59 48 48 43 44 39 40 41 23 23 12
8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 10 22 36 59 47 47 48 37 37 32 33 39 35 28 28 32 32 48 48 59 48 48 48 59 59 59 43 35 35 35 28 28 16 8 8 8 8
8 10 11 12 15 12 11 16 22 30 33 39 36 35 36 36 39 30 25 14 12 12 10 10 17 20 11 18 11 16 16 24 30 30 30 30 29 32 28 23 23 32 24 13 13 10 10 11 12 24
24 21 19 22 22 22 28 24 20 16 15 14 14 14 16 23 18 11 11 12 23 21 37 28 30 18 24 18 22 11 18 18 26 22 30 25 25 25 28 31 37 30 37 26 24 18 24 15 19 13
17 16 26 22 22 18 17 15 11 11 9 21 13 10 8 10 8 8 11 21 19 19 9 9 9 13 10 11 20 19 20 15 14 14 8 8 8 10 17 20 19 19 12 11 16 25 27 25 19 11
11 11 11 14 13 15 15 15 15 17 12 13 10 9 12 13 19 18 18 23 28 24 28 34 30 22 14 12 14 11 12 10 10 10 12 10 10 15 15 12 12 11 16 16 25 18 18 12 12 12
24 20 12 14 14 14 14 17 21 12 10 10 10 10 10 9 10 9 10 12 10 10 9 9 14 12 10 8 6 6 6 8 8 11 10 8 8 8 8 8 10 13 18 13 12 11 14 11 11 10
10 10 8 8 8 8 10 14 11 16 10 11 11 11 11 13 11 10 9 9 9 9 9 18 9 9 9 8 10 10 10 8 8 6 6 6 6 13 20 24 24 15 16 11 11 8 11 7 7 8
10 18 16 15 10 10 10 9 9 9 8 8 10 8 8 8 10 8 8 8 8 8 13 10 8 8 8 10 10 12 12 8 8 8 8 8 11 7 9 7 12 8 13 13 13 8 8 8 8 8
6 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 9 12 8 8 6 6 8 8 13 8 8 8 8 8 | Open.Hide. 8 8 8 8 13 23 18 9 7 7 3 0 3 8 7 6 6 6 7 8 9 7 6 7 7 9 9 9 9 11 11 18 3 0 3 13 13 22 25 21 23 11 9 9 7 7 7 6 6 6
6 6 6 9 11 11 17 19 27 30 34 41 59 59 48 48 48 57 59 57 57 57 57 30 23 8 8 8 14 22 42 59 59 59 59 59 59 59 57 68 68 68 68 68 44 36 24 24 31 28
31 43 59 59 33 33 24 43 43 68 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 44 44 42 47 35 37 37 43 44 57 47 57 57 57 57 68 57 43 36 26 26 35 40 50 50 42
35 35 35 37 43 43 32 43 44 59 43 43 50 50 48 50 50 57 57 57 57 57 57 54 57 57 39 43 46 57 57 57 57 59 43 44 43 47 59 59 59 68 59 59 48 48 48 48 48 48
54 44 44 48 42 39 39 39 43 47 47 36 36 28 28 35 35 32 48 48 57 57 43 48 39 39 42 39 29 26 12 12 11 11 11 11 23 23 48 43 43 37 43 43 43 41 41 47 41 41
37 34 24 29 36 35 35 43 47 39 41 48 37 39 39 39 39 39 47 59 57 57 57 57 57 43 43 32 30 30 34 32 23 23 25 22 23 20 21 18 12 28 22 32 32 32 11 9 9 9
9 9 9 9 9 9 16 13 14 22 16 11 11 11 11 11 11 21 12 17 20 24 34 37 47 43 43 37 36 36 39 39 47 24 23 12 12 12 24 27 34 23 23 16 11 8 8 7 8 9
17 16 35 35 35 31 32 28 28 35 37 39 43 48 48 48 57 43 43 43 43 43 43 28 28 11 12 12 12 22 22 35 36 35 34 36 23 23 23 23 19 28 13 13 13 30 19 23 21 18
14 14 28 23 26 15 14 13 13 13 19 21 20 18 18 12 18 15 15 20 24 25 18 9 9 8 8 8 8 10 14 13 11 11 18 19 31 28 22 26 12 10 10 9 9 9 11 22 25 33
33 37 34 25 19 12 12 12 20 12 15 14 15 15 12 15 15 22 16 15 20 12 12 13 14 23 22 32 29 21 19 13 13 13 15 15 23 21 20 17 15 14 14 14 19 20 12 9 8 10
11 12 10 13 11 12 12 21 23 15 11 11 11 11 13 16 15 19 19 13 11 8 6 8 8 8 12 8 8 8 12 10 10 11 19 21 22 11 11 10 10 10 10 10 9 15 10 13 10 16
16 14 14 18 24 24 28 28 24 18 16 14 12 12 8 8 8 10 12 11 11 11 12 10 8 8 8 8 8 8 10 9 10 12 9 8 8 8 12 8 8 8 10 10 9 9 10 9 10 10
10 10 10 10 10 10 8 10 7 6 8 8 10 9 10 8 8 10 8 8 8 8 8 8 10 10 10 8 10 10 10 10 13 10 10 10 11 13 13 10 12 11 10 10 13 10 9 9 9 10
9 12 10 10 10 10 10 10 10 10 10 12 19 19 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 10 11 10 9 9 9 9 8 9 13 13 9 9 11 8 8 8 8 10 10 8 8 8 12 13 14
10 12 10 11 10 9 9 14 22 23 23 23 11 11 11 12 11 11 12 11 6 6 7 6 8 6 10 15 24 33 33 29 25 31 17 11 8 3 0 |