BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-430D17.T7 (MSMg01no430_d17.b1) | MSMg01-430D17.TJ (MSMg01no430_d17.g1) |
ACC | AG522774 | AG522775 |
length | 815 | 1,488 |
length of high quality (start - end) | 359 (72 - 430) | --- |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no430_d17.b1 PHD_FILE: MSMg01no430_d17.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 18:52:59 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no430_d17.g1 PHD_FILE: MSMg01no430_d17.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 18:52:59 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | NGTCATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGC
GGAATTCAGGAGGATTGCGTTGGGGACTTCAGATTCACAAAAATTGTCAT
GTAACTTATTTTTTTTCCTTGTTCTTGTGAACTCTGTTCACTTCTGTTTC
ATGGAAGATCTTTGCAACGAAACTGCTCCTTGATTTCTGGTTTGTGTATA
TCCTTACCCCCGCCCCCCCACCCCTTCAAAGTTCTCATCTTGTCTCTGTA
ACATCAGAACCAAAAATAATTCAGTTGCTTTAAATGCCATATGGAATAAA
TAAATGTTTCTAAACAGATCAAATTAAATTTCCTGTAAAACTTCTCAGCA
TTGGTTGCTCTGATTAAATATGGAAGGGGAGCAAAAGCCACAGCATTGGC
GGGCTTATAAAAGAGAAATGAAAAGAATTCGGAAAGCAAAAGACTAAAGT
CAGTTGGTGAATTGTAATGTGATGTACCATTTGTTATTTTCATAACTTCC
ATATGCTCTGACTACTTTTTTATCTACCATTACACTCACTAATCCCTTCC
CTTTTAAACAACCTTATTTTCTCTTTCTCTCTTTTTCTCTTTAACCCTTT
CTTTACCTCACTTTTACCCTTCGATTTTTTTCCCTCTCTACTTTATTTTA
TTACTCCCCAATCACTCATCTTTCCTATTACTCCCTATTACCCTACCTTC
TTTATCACCCCCTTTATTCTTAAATACCTCTCATAACCCCTACACTTTCC
CATCCTATCCCAATAATTCCTTTTACCCCCAATTTACGTGACCAATCCTT
ACTTTATTCCAATTT
| AAACTCCTAATAGTTATAGTGTTGANNAGNGCACNNAGAAGTAGGTTGTC
GGCGAGAGACTGCTCGGCNCTGGTCTAGATCGACGANGGAGGAGAGCTGN
NTGCAGTGGTGANCNTCGCAGCCTGCGCGGAGCTAGCGCTANTCCACAGC
GGTGCACGGCGNGCAGCACGTGCATGCGNGCCACNCTCGCCGCNCGACTG
CGGTAGTATATACGATGGATGCTCGCTAATATAGGATAGATACAGCTGTA
TCTAGCTTCGTGCATAGTATCTAACTACTACAACACACCACGATATGCGT
GCACAACCCGCCCTATACAACCACACANACACACAATAACTATCACACCG
ATACAGCCGCCGACGAAGCTCGAATGCCAAGCATACTACATCTATTGTGT
TNACGCTACTACGTTATATCTGTATATCGTGCCTCGTTATCCTANTATCT
GCCANCNTATATCATCTATACGACGAGTATCCGCTATGCCCGCTCGAAGT
CGNTGCGTATATATAANATATAGACGAGCAGAACTNATAAGTACGCTATA
CACAAGGCATATCCATATACTCNACTGATTATACCACATGCATACTNCAA
TCTGTATACGTAGNCGCTAGTCAGCGTCATGAGCGCACATTCGACGGTAT
ATACGTCGACGATCATTACTCACGCGTATATAGCAGCTATGTTCGCCGTG
TGTTTGCTATACGATAGTGGATCACTATGCGCTACGTGCTACGACGTATA
CATATGTACCTACCAGCGCGTGATACGCGATATAGCTACTATCATTGCGT
GACNAGTATACCCTATAACCACGACCTATCAANCGATGAGTGTAGTGCGG
CGCCACGTATATGAGACGCATGATACTNAGCAGCTGGACGACTGTATGAT
GGTATGGAGTTATGACTAGGTGACGCTCAGAATCATCACANCGCGATACG
TCGTAATAGTAATGTAGACGCACGAGCGACCGCTGATATTAAATCAGCGC
AGACATAGGTATTCAGACGGCGCAGACTGCATGAGTCGCAGCAACCGGTG
ACGGAGCGCGAGCGATACGATCTATTNTCTATACAGCGCCGCATGTGTGC
GTAGTCAGCTTGTGTACTATAGTACTCGCCGCTATTGTCTCATATCGATG
TCGAGTAGAGTATCAGCTAGGTCGGGAGAATAGTCGTCGCTGCGCATAGA
TCTGTGGCGAGTGTCGATGCCGCAGTGAGTGATCGGGTGGCGCCGAGCAC
GATGATCAGTAGCACGATACGGCGCACAACCAGTTATGATCACCGATNGA
TAATAGTATAACGCGATGANTATGGCGCACATAATCGATATTACAACACG
GANGCGATCGATATCTCGACGTCGCACTATACACGGCATATATGATGTTG
TGAGGCGTGTGTATAGCGTCGACTACTGCGCNNAGTAGCTCTCTGCGCAT
GCGTTTTNCGGTCTGTCGTCGATGATATCGCGCGCATN
|
quality values | Open.Hide. 0 3 6 8 6 6 6 8 7 12 30 17 13 13 23 14 19 27 34 32 31 32 37 37 37 47 41 28 28 26 22 22 21 21 10 10 11 12 12 21 23 30 20 21 24 28 29 31 59 59
57 36 36 36 36 36 36 31 31 29 25 16 9 10 16 15 9 11 11 23 23 23 23 23 28 34 37 47 53 50 50 50 53 53 53 50 50 50 53 53 50 50 47 47 47 47 43 43 47 51
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 50 50 68 68 42 40 17 35 35 48 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 51 51 51 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 57 57 52 52 57 59 38 38 13 13 13 38 38 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 59 68 59 59 59 59 59 59 59 59 52 52 52 59 59 57 57 57 57 52 54 57 57
57 68 57 59 54 54 54 59 57 57 57 57 54 54 57 54 54 54 59 59 59 48 32 34 28 17 17 16 12 10 8 8 15 21 42 48 48 57 57 57 57 68 68 59 59 59 48 48 59 59
59 59 59 54 54 54 59 59 57 57 57 57 57 59 48 48 43 43 43 39 42 42 42 57 48 48 48 43 47 43 43 43 43 47 43 43 43 37 37 43 43 43 43 36 26 28 22 13 13 23
23 25 25 24 28 24 26 19 26 22 33 33 39 33 31 24 22 22 32 29 29 28 28 28 20 33 23 19 10 10 10 12 18 21 19 10 10 10 12 13 18 30 23 28 28 28 14 13 14 14
15 11 10 10 11 12 11 11 11 15 16 15 11 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 7 8 9 10 10 14 17 16 11 10 10 10 8 8 8 10 10 9 10 12 8 8 8 8 11 11
8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 13 12 19 23 23 17 11 6 6 6 8 8 12 12 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 11 11 13 11
11 9 8 8 8 8 8 9 10 10 8 9 8 10 8 8 8 11 23 11 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 19 19 19 15 11 11 11 10 10 11 12 10 15 15 21 19 22 19
17 10 11 10 10 10 8 8 6 6 8 8 11 8 8 8 8 10 10 10 10 8 8 8 8 10 10 10 11 11 13 16 14 10 10 7 7 10 7 9 12 13 12 12 8 8 8 8 8 7
7 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 8 10 10 13 12 10 10 9 9 10 10 10 8 8 7 7 8 8 9 13 10 10 10 10 10 10 10 8 8 6 6 8 6 6 8 8
10 10 8 10 8 8 8 8 12 8 8 8 8 8 7 7 8 8 8 8 8 8 8 6 10 10 15 10 15 8 8 8 8 8 8 8 9 10 12 9 9 9 9 9 11 13 13 10 10 10
8 8 8 8 8 10 8 10 10 8 6 8 6 6 8 6 8 8 8 10 11 10 10 8 10 8 10 15 10 8 8 8 10 15 10 8 8 6 6 9 9 9 11 8 8 8 8 13 10 11
11 11 10 11 8 8 8 10 8 8 8 10 10 8 8 | Open.Hide. 6 6 6 6 6 8 9 9 9 7 6 6 6 6 6 6 6 6 6 10 6 6 6 6 3 0 0 3 3 0 3 6 6 3 0 0 3 9 9 9 9 7 6 10 6 6 6 6 6 6
6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 6 6 6 8 8 8 3 0 3 8 8 8 10 10 6 8 6 7 6 6 7 7 7 8 3 0 3 6 6 8 9 9 8 10 8 6 6 3 0
0 3 8 8 10 10 15 8 6 6 6 3 0 3 0 3 6 6 6 6 6 7 9 9 9 9 9 8 8 10 6 6 6 6 6 8 10 10 11 11 3 0 3 9 9 10 8 7 7 7
9 10 11 10 8 9 9 11 12 11 3 0 3 9 10 11 6 6 6 6 8 8 11 10 10 10 10 3 0 3 6 6 6 3 0 3 6 6 6 7 6 8 3 0 3 6 6 6 6 6
10 7 7 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 6 6 6 8 6 6 6 6 8 8 8 6 6 6 9 12 13 13 8 6 6 6 8 12 10 9 9 9 6 6 6 6 10 11 9
6 6 6 6 6 7 7 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 11 11 6 6 8 8 8 8 6 6 8 8 6 6 6 6 8 8 8 10 8 8 8 10 10 16 12 8 8 7 7 9
10 10 10 8 8 8 6 6 6 7 6 8 11 10 10 11 11 8 8 6 6 6 6 7 9 9 3 0 3 6 6 8 8 6 6 6 6 7 6 6 8 6 7 7 9 7 7 8 8 8
7 9 8 8 8 8 7 6 6 6 6 8 8 8 8 8 6 6 6 8 6 9 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 10 10 11 9 10 10 12 24 15 10 6 6 6 6 6 8 8 8
3 0 3 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 10 10 10 10 10 10 13 14 12 11 9 9 10 8 10 7 7 7 9 10 9 6 6 6 6 6 7 8 8 3 0 3 8 8 8 10
10 12 11 3 0 3 0 3 11 13 8 6 6 6 6 11 8 7 7 7 7 7 6 6 6 6 6 6 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 6 10 6 6 6 8 8 8 6 6 6 6
6 3 0 3 8 8 8 11 11 8 8 8 6 6 6 3 0 3 6 6 8 6 6 6 6 6 6 9 9 10 9 9 9 9 3 0 3 6 8 8 8 6 6 6 6 9 8 6 6 6
6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 6 8 8 3 0 3 8 8 8 9 10 11 10 10 12 10 6 6 6 8 8 8 8 6 8 6 6 3 0 3 6 6
6 10 6 6 6 8 8 10 8 8 8 8 3 0 3 9 6 6 6 6 6 8 6 6 8 8 8 6 6 6 6 8 8 10 9 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 9 13
10 10 10 9 10 10 11 11 11 6 6 7 6 8 6 6 6 6 6 6 8 9 9 9 9 9 13 12 12 11 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8
11 10 10 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 7 6 6 8 10 13 9 9 9 15 12 11 11 8 8 8 6 8 8 8 8 8 6 6 6 6 11 6 6 8 10 10 8 9
9 10 10 10 6 6 6 6 8 6 9 8 8 8 8 8 9 15 11 11 6 6 6 6 8 8 6 6 6 6 8 10 8 8 8 8 9 11 11 11 13 8 8 6 6 6 6 8 8 6
6 6 3 0 3 9 9 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 3 0 3 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 6 8 7
7 9 10 8 8 8 8 10 12 18 7 7 7 7 8 8 8 8 8 8 8 8 8 7 9 9 3 0 3 8 7 6 8 7 9 9 9 10 10 7 10 7 7 7 8 8 8 6 6 6
6 6 8 8 8 6 8 6 7 10 6 6 10 8 13 8 7 6 6 8 8 10 9 9 9 9 9 9 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 3 0 3 8 8 8 8 10 8 8 6
6 10 10 10 10 8 9 9 9 9 9 9 10 10 12 12 12 8 6 6 6 6 7 10 10 8 8 6 6 10 6 6 6 7 9 10 17 11 9 9 9 11 7 7 8 8 9 9 6 6
6 6 6 6 6 10 8 6 7 7 8 8 8 10 6 6 6 6 6 10 10 9 9 9 9 11 6 6 6 6 6 8 8 9 8 8 8 8 6 8 6 6 6 8 8 6 6 6 6 8
8 8 8 10 8 9 11 9 9 8 8 8 8 14 15 9 9 9 12 12 12 12 12 11 11 3 0 3 6 6 6 8 6 9 9 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 12 11 11 11 11
10 10 10 10 8 6 7 9 10 10 10 10 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 7 8 10 12 9 9 12 13 15 8 8 8 9 9 9 10 9 9 9 9 10 14 13 10 10 10 8 10
8 8 6 6 6 6 8 10 7 9 9 7 7 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 11 10 11 11 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 8 6
6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 8 6 6 8 8 13 10 9 7 9 11 10 8 8 6 6 6 6 8 10 8
6 6 6 6 6 8 6 8 6 6 6 6 10 10 10 11 17 18 14 13 8 8 8 6 6 6 7 10 6 6 6 6 6 6 6 7 6 6 8 6 8 6 6 6 6 8 3 0 3 8
9 9 9 9 10 10 7 7 6 6 6 6 8 6 9 9 11 11 3 0 3 8 8 8 8 9 9 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 13 10 11 12 11 10 10 10 10
10 3 0 3 6 8 10 13 8 8 8 6 6 6 6 6 10 11 13 17 15 8 8 6 6 6 6 8 6 9 9 11 10 8 10 8 8 8 8 17 9 10 6 8 6 6 6 6 8 8
8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 6 9 8 8 15 10 3 0 0 3 8 8 8 10 9 9 9 9 7 8 8 8 8 8 9 9
6 8 6 6 6 7 3 0 3 7 8 10 10 10 9 6 8 6 6 6 6 8 8 8 6 6 6 6 8 6 6 6 6 10 6 6 3 0 |