BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-466A10.T7 (MSMg01no466_a10.b1) | MSMg01-466A10.TJ (MSMg01no466_a10.g1) |
ACC | AG550068 | AG550069 |
length | 747 | 1,858 |
length of high quality (start - end) | 530 (54 - 583) | --- |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no466_a10.b1 PHD_FILE: MSMg01no466_a10.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:41:21 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no466_a10.g1 PHD_FILE: MSMg01no466_a10.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:41:21 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | TTTCCTACATCTXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTCGAGAG
AATCCGCGGAATTCATTATGTTGCCTGTCATATTTGCATGCAAGCACTTC
ACCAACTGAACCATTCCCAAGCCCCCATGAACTCAATTCCCTCTATTAAA
AAAAAAACAATTGTCTTACATTCCCAATATCACAAATCGGAGGTGAACAG
AAGCCATTCTGTATGATGAAAATGATCGTTTGGAATGGCATTAACATACT
GGGCTTAGCAATAAGAAATTACAGGTTTGTGGCTGATATTGATGCTGTAT
GCCATTTTTCAAAACTCCTTTGGTAATCCCTCTGAACTGTTCAGAATCCA
CATGTGTATACAGTTCCATTAAACACAACCCTCCCAATCACGCTACGGTA
TACAGAAAATCCTGTAAGGAAGACTATTAATATTCTTGGGCACGTTTTTC
AATTATAGAACATATAGCCAACCAAAGCAAGGCCCTCAGCAGCCACAAGT
CTCTGGGTCTCCATTGAGGCTTCCTGGTATCTAGAACAGCCTGGGACAAA
ACTCCAACATCACGGCATGTATATATATATTACATACNCCCATATATATG
AACAGAAGAAATCCAGGAAATAGCTCATCCCCCTTTAGAAGAAGTTACCA
GGAAAAGGAGGGGAAAAAGGTGCCCCTTGGGGGAAAAGCTGGGAGCCCTT
GTTACCTCCAAAAAAAAAAACTTAAAACATGGTTAATTCTCTTTGTG
| AGTTTATGTAGAGCGAGNTAGTGATGGTNCAAANCANAAAACCAAAGTAA
TCTGTCTTTTNGTTNATTGTNNCNGNGTNCANCTTCGTCTCATCCTCATC
CATTACACAGANCGTCAGTAGTNTGAGTATATACCTATNAGCACACATAT
TCATGATCTATCGTATCNACANACGANCAATANCACTAGAGTATTAGAGC
AGATGATTGTATNNTCTCGAGAGTAGCATACACAACACCAGATGCTGTGA
CGCGCTNCNTCTAGTAGNTGATNCCTCGTACCTACTCGCATCGTACTGCA
AGTCTCAGCGTCTGATACGTAAGTCCGATCTCGATGCCTCCAGATGCTGT
NCTATANTACANCTACACCATGATATATTTGTATACNCAGCTACTCTGCC
TTNTTCTCTATCCTTTGTGTATCACTCCTNACACCACATATACTACTAGT
GAATGATATATGCTACGAAGATTCTGACGCATCGGACGTCCTGTTATATA
TAGTGTAGTATGATCGNATCTCGTATCGATATTCCTGCGAGTNCCTAGTG
ACTGCATCTGGCATCCTGTACTGATCTACAAGTAGTGATCTGACGCGAAC
TGCTATNTNTCNTGACGGCGACATCAATCNGCCGTGATACTCTGAGTACT
GGTTCTCNCNGCATATATTTGATGCATTCTCATAGTATATCATAGCAACG
AAATGACGCGATACGCACNACAGTAAGCACGANACGATGATTGAGGCTAG
ACACTAACAAGCGACGACTCTGTATATCACGCCTACTACTCNTCTCACAT
TATACTATATATCTNACTCCTCACACATGTACTCTATCCCAACACGNATA
TCTCATTCTGATGTTAGCTCTAGTATCANTAGTACATCAAATTATCATGA
GCACGCTGCTATCGTATATGTACGATCAGTGACTGCGAATAGTCTGTCGC
ATCGACTTCACNTGCTACTTCTANTGCGATGCCGAGCTGACAGGCGTCAC
TCGCTGGATGCAGTTGTCTCGNCTGCTGCNGTCGTCGTGTCATGTCGCGT
CGTGCTGTNCTCAGTAACAGTGTATGTGCCTGCTATCTACACGCGCNCGC
TATTAGCGTGAGCTCGNTGATCGCACTGCATACGCGTACTACTNCATANT
ATATATATATATATCAGATTACTAGTATATGACTATATGTCATACTATCG
ACGCACGAAANGGTACTTGNATCAGATTATACGTCGCAGTACACGAACAG
ACGACATCTAGCTGNGCATACTAGAAACGACTCGTCGCGGCGAATGATGA
TGTAACCTGATAGCTCTATATACCATGAAGTATAGAGTATNACTGTATCA
GTGTCATAGTGNCGTGACTGATAAGTGTNTATCACGCATACANCTCGATA
ACTCATGATCACGAANGCGACATCAGTACAGTGCAGTTAGTTANCGATAT
CNGCGNCATNATCGCATCTATNGTACTGTAGTATAGTGATGCACTNCTNA
TATTGATGCAGACAGCGACATATCNANCTACGTAGTACACTGCGCCCATC
GCTCTGATAGTTGCTGCATCGGAAAGCCATCGTCACGATGAATGTGAGTG
GATCAGTGACTCGCATAGTACGCGCTGCCGACTGNACTGAGTCACTCGAT
NGACATAGAACCTTGCACTGCTCATGTACAGATATGCTGACCGTATGCAC
GTCTATAGCTACTAGTATTGCGCTGTACACTCATGACTCGTCTAATGCNA
GTAGTGAATCGATATANTATAGTGCANACATATGGCCTTCCCATCGCATC
GTCTAGATATCCACTCGGACACGCCACGAGATGACNAGNATATACAGCAG
ATCACTGN
|
quality values | Open.Hide. 9 9 9 9 9 8 8 9 9 9 9 9 10 11 10 10 10 10 25 23 30 30 25 24 24 28 25 21 10 10 10 13 13 34 27 28 19 19 18 15 21 12 12 14 9 9 9 8 6 6
6 9 9 13 16 29 32 37 30 30 28 28 28 28 37 37 23 27 12 12 9 9 9 9 9 10 11 12 15 27 30 33 42 48 48 48 48 48 48 48 48 48 53 57 59 57 57 53 50 50
50 48 48 48 48 36 42 48 54 42 41 54 50 48 53 50 48 48 54 54 48 48 47 48 47 54 47 47 48 50 50 50 47 47 47 50 50 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68
59 59 68 68 68 68 68 68 57 50 50 50 47 57 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 59 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 57 57 57 68 68 57
57 57 57 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 57 57 52 52 52 57 57 57 52 57 59 68 68 50 50 43 43 37 50 50 68 68 57 57 59 59 59 59 59 57 57
47 59 57 57 57 59 43 43 47 57 59 59 59 59 59 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 47 57 46 59 59 68 57 57 54 54 54 57 47 43 43 46 57
47 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 53 59 59 59 59 59 59 47 30 24 12 11 11 21 22 35 33 39 47 59 59 48 48 48 43 43 39 47 43 57 57 57 57 59 57 57 57 59
59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 47 57 48 54 59 59 59 68 68 68 68 68 57 57 43 43 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 59 59 68
59 59 68 68 68 68 68 57 57 47 47 46 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 59 59 59 59 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 48 48
48 48 59 48 48 48 59 59 50 50 50 50 47 47 59 41 41 31 31 37 39 37 37 37 47 59 48 48 48 47 43 39 36 36 43 39 41 40 39 39 39 39 34 34 39 39 37 37 39 41
41 41 46 40 47 43 47 47 43 34 34 36 36 36 37 37 37 31 31 32 37 37 37 37 27 28 24 28 20 32 28 34 28 25 25 28 28 32 33 28 31 39 37 30 34 23 23 20 27 24
27 30 27 30 24 24 24 28 28 28 23 23 18 18 15 25 24 27 18 18 19 32 32 39 39 39 39 41 31 34 21 21 13 13 12 25 3 0 3 9 7 7 9 17 12 21 15 19 19 21
17 19 27 28 23 21 10 10 10 13 15 16 16 10 10 10 18 14 17 12 15 10 10 10 10 10 10 14 10 11 10 9 10 11 12 15 7 7 9 8 8 8 8 8 10 8 10 11 14 9
11 12 14 12 11 11 10 10 11 11 11 8 10 8 8 13 9 10 8 8 8 8 8 8 13 14 28 27 15 14 14 18 14 14 14 10 10 11 12 13 11 9 9 8 8 8 10 16 11 12
11 11 11 8 8 8 8 8 8 10 13 8 9 8 8 8 8 15 8 9 9 9 10 11 12 9 9 9 9 9 7 9 9 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 9 9 9 9 | Open.Hide. 7 7 7 8 8 8 10 6 8 6 6 10 8 8 8 8 3 0 3 10 10 10 10 10 6 6 6 3 0 3 6 6 3 0 3 3 0 3 11 11 7 6 6 6 6 6 6 6 6 6
6 6 6 8 8 6 7 8 11 3 0 3 8 3 0 3 6 6 6 3 0 0 3 0 3 0 3 3 0 3 3 0 3 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 11 8 8 8 8
8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 3 0 3 9 9 9 10 6 6 6 6 3 0 3 9 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 9 9 3 0 3 6 6 6 8 8 8 10 10 10 10
7 7 7 7 6 6 10 6 6 6 6 8 8 8 8 8 3 0 3 6 3 0 3 6 6 3 0 3 7 8 10 3 0 3 11 12 11 12 12 11 9 9 6 6 6 6 8 6 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 3 0 0 3 8 8 8 8 9 10 13 6 6 6 7 8 6 6 6 6 15 10 10 9 9 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6
6 6 6 11 11 3 0 3 0 3 6 6 6 6 6 8 3 0 3 6 8 3 0 3 9 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 8 6 6 6 6 6 8 6
6 6 6 7 6 8 8 8 9 9 9 10 10 11 6 6 6 6 6 8 6 6 6 6 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 11 9 9 7 6 6 8 8 8 8 8 8 9 11 3
0 3 8 8 8 3 0 3 9 10 3 0 3 9 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 6 9 9 9 9 12 10 11 3 0 3 6 8 6 8 9 16 10 10 8 8 8 8
8 3 0 3 8 10 10 10 9 10 8 6 6 6 7 6 6 6 6 6 6 6 8 7 6 7 7 8 3 0 3 8 8 8 7 7 7 6 6 6 8 6 6 6 6 6 6 8 6 9
8 8 8 8 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 6 8 9 9 9 10 12 7 7 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 12 12 12 15 15 12
6 6 6 7 6 6 8 8 8 9 6 6 6 6 6 3 0 3 6 8 8 7 7 10 7 9 9 9 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 9 8 6 3 0 3 6 6 8 8 8 6
6 6 6 6 10 7 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 6 6 6 8 8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 9 9 7 7
9 9 9 9 9 3 0 3 0 3 3 0 3 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 3 0 3 6 6 6 6 6 9 17 13 17 8 6 6 6 6 6 9 9 9 9
9 9 9 10 10 9 3 0 3 0 3 6 6 6 6 8 8 7 7 6 6 6 8 8 8 8 8 9 8 6 6 6 8 8 8 8 6 6 6 6 8 6 6 6 6 6 6 6 8 6
6 6 6 8 6 6 6 6 8 6 6 6 11 9 10 9 9 3 0 3 6 6 6 6 7 8 8 8 8 10 10 3 0 3 17 10 10 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6
6 7 7 8 10 10 7 7 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 9 7 7 6 6 8 3 0 3 10 10 10 10 8 8 9
8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 10 8 3 0 3 6 6 6 6 6 10 9 9 9 9 9 8 6 6 6 6 6 9 9 10 8 8 8 8 8 7 6 6 6 3 0 3 6 8
6 6 6 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 8 6 6 6 6 6 10 6 8 8 3 0 3 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 7 9 9 9 11 8
8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 11 11 11 12 12 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 6 6 6 6 6 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 10 10 9
6 6 8 8 8 8 8 8 8 6 3 0 3 6 8 6 6 6 8 8 6 8 3 0 3 6 6 8 10 10 10 9 9 9 8 7 7 7 8 8 6 6 6 10 10 13 11 11 8 6
6 6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 6 6 6 8 8 8 6 6 6 3 0 3 6 6 6 10 10 3 0 3 8 8 8 7 6 6 6 6 8 11 9 11 9 11 11 8 6 6 6
8 6 8 8 8 10 10 3 0 3 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 10 10 10 8 8 8 8 6 6 6 6 8 6 6 8 8 8 11 10 9 11 11 12 3 0 3 8 8
8 8 8 6 6 6 8 8 11 9 9 9 9 9 9 3 0 3 10 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 8 8 8 6 8 3 0 3 8 8 3 0 3
10 10 8 8 9 17 11 12 9 9 9 8 10 8 8 9 11 10 8 8 8 8 8 8 11 9 13 9 9 9 9 9 10 9 9 9 9 8 8 7 8 8 6 6 6 6 10 10 8 6
6 6 6 7 8 8 8 7 8 3 0 3 8 8 8 8 8 8 3 0 3 10 8 11 9 6 11 7 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 6 6 6 6 6 6 8 8 11
12 10 9 9 9 9 9 11 14 12 12 11 9 3 0 3 8 6 6 10 8 6 6 6 6 6 6 6 10 6 8 11 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 10 12 10
10 8 6 6 6 6 6 6 6 6 7 6 6 6 8 8 8 8 8 10 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 9 9 8 6 6 6 6 6 6 3 0 3 9 9 9 10 13 10 8 8
6 6 6 6 8 8 8 8 6 6 3 0 3 8 8 8 8 9 9 9 8 8 8 6 6 6 10 3 0 3 6 6 6 9 6 6 6 6 7 7 11 3 0 3 6 6 6 6 6 6
8 8 8 6 6 6 6 6 6 10 6 6 6 6 3 0 3 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 11 12 12 11 9 9 10 8 6 6 6 3 0 3 10 10 12 12 15
3 0 3 9 3 0 3 8 3 0 3 6 6 6 10 8 8 8 8 8 3 0 3 8 8 8 8 6 6 6 8 8 8 6 6 8 6 6 8 8 8 8 8 8 3 0 3 3 0 3
8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 6 9 9 8 8 8 3 0 3 0 3 9 9 9 6 6 6 6 8 6 7 9 9 8 6 6 6 6 6 6 6 8 6
8 8 6 6 6 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 7 6 6 6 6 7 8 10 10 9 7 6 6 6 6 6 8 8 9 9 10 10 12 10 10 8 6
6 6 6 6 6 7 9 9 9 11 10 9 9 9 8 8 8 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 13 8 8 8 8 3 0 3 6 6 6 6 6 6 8 8 8 6 6 6 6 3
0 3 9 9 9 9 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 10 6 6 6 7 8 8 8 8 6 6 6 8 9 12 11 10 10 12 13 10 8 6 6 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8
8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 11 6 6 6 6 8 10 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 10 10 6 8 6 6 8 6 6 6 6 6 8 3 0 3
9 9 9 9 11 11 11 11 11 11 12 7 8 6 8 3 0 3 9 8 8 8 8 8 8 3 0 3 6 6 6 6 8 8 8 8 6 7 6 6 6 6 6 6 8 8 8 7 6 6
6 6 8 8 8 8 8 6 6 6 6 7 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 10 10 10 8 6 6 6 6 6 6 8 6 3 0 3 3 0 3 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6
6 8 6 6 7 6 3 0 |