BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-480B15.T7 (MSMg01no480_b15.b1) | MSMg01-480B15.TJ (MSMg01no480_b15.g1) |
ACC | AG560823 | AG560824 |
length | 1,009 | 723 |
length of high quality (start - end) | --- | 282 (329 - 610) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no480_b15.b1 PHD_FILE: MSMg01no480_b15.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:00:18 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no480_b15.g1 PHD_FILE: MSMg01no480_b15.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:00:18 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | TACCTTGGTTGNGTGGGGCNNNTATGCCTAGGAACCTTCACTCCTCAGAA
GGCGGGGAACACNGGAGTTCTCTCCCCCCGCGGAGGGGGGGTGGGCGGCT
GTATCACGCGTTGTTGTTGTGGTGTGATCCCGCTCCCCACCGCCTATTCC
GTACCCCGCGCGTAGAGACCGCTATTAACGCCGGTACGAGTCGCAGATGG
CGGGCGAAACTGAACAATGTATGTAATAATATAGGCTTACATCTACACCG
CCTCTATGTTCCCCCACCACCCCTTAACTCCCCCTCCCACCATGAATATA
TTTCAAGACATAAATGATAAAACACAAATACCCCCAGAAGTCTGAGAGTC
GAGTATGCTCTGTACCGCTATCTATAACGCCGAACATTACCCCACCCATA
TATACACACTGCCATATCGAGTCTCNACAAACTTATTACCAATTCTAATA
TCTCCTGCTACCTATAACAGGATGATGCAGTGCTTCACAGCAAAGCTGAC
CTGTTAAGCTAGTACCAATTCTATACCATACTCTCCCGCATATATATTAT
TATATTCTTCTAGCGAACCCAGCTCTTAGTCTGACCGGTGATGTCTCGTA
ATTATCTCTCCTCCGCATAAGGACACTTATACAGCTAGTAGTTCGTCGCA
CTGAGCACACGTTTTTACACGTAGCCGGGGCAGTATGTGCGCGTCGCTAC
TATAAGGCAGGAGTACCACACATGTATATATGTATCACATATTAATATAT
TAAGATACGTAACCACTCCTTATCGCCACAATATTTTTATATATCCTCCC
GCCGCTCCGACGACAGAGATGTATCACCTATATAGTGTCATCGCCACGTC
ACGCGGAGACATACTCGTGACCGCTTTCTCGCTNGCAGCGCACATTTTTC
TGTGAGCCTGTGGCAGATGTGTGCTTGTGACGATTACACCATAGATCTCT
TATAGTGTGGTGTGGAGGGGCAGTACGCTAGCGTACGTTCAGCGATTTGC
GGCGAAGAN
| TTTCGATGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTTCAAAATAGGAGG
TGAACTATAGAAGGTTACANAAAATTCGCCTCCTGTTGAGTGGGCCTTAA
GTCCAATTAGAAAGATGTTGGTTACCAACAAGACCTGTATGCCACCATTA
TACCATTGCGGATATCTTGCTGGTCCATTGTGGTTCACACACTTTTCTGC
TGGGTACAAATACAATTGTTCCTCTTCCTTGGCAAGTTGATACCACATTC
CCATAAGTGAGCCAGTTTGAAGAGTAGAATGTTTTATGTCAGATATACTT
TTATTTCTCCAAATCCTATGNCTAATATGTATGGTATCCTCAGCAATAAG
GAAATTACTTTAATATTCTTGGAGGCAACCAAGGGAAATAGCAATAGCCT
GTTTTTGGAGTCACTTCTACTTCCCTGACCAACAATGTGAGCAGATAAAT
ATTCATGCTACTGCAATTTTTGTTAGGCTATGGTTCTTGGGGGGGGGGTT
ATTGTCCATGGATTTTTCAAAGGTTCTTAGTGTTATTCATCCCTCTTTCC
CACCATCTCTTCAGTTACAGTTCCTCTTTGTAGCTCCTGTGTTCTGCTAG
GGCACTGTCAAGAGCCAGCTCCTTTTCTTACTTTCCTGATATTTTGCATT
TACTCTGCGTTAATATACTCAAATCCTAAAGATTCCGAGGTTGGGAACCT
CCAATTAAGAGAGTATCTTTTTG
|
quality values | Open.Hide. 8 8 11 17 10 8 8 8 8 8 3 0 3 6 6 6 6 6 3 0 0 0 3 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 6 6 6 6 6 7 8 8 8 10 8 8 8
8 6 6 8 12 13 11 6 6 6 6 3 0 3 9 9 9 9 9 8 8 9 8 8 8 10 9 9 8 8 8 9 10 8 8 8 8 8 12 12 11 13 14 8 10 8 8 8 8 9
9 10 14 14 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 11 10 10 11 8 8 9 8 8 9 9 10 10 8 8 8 8 11 8 8 8 8 8 8 10 11 16 10 10 10 8 8 8
8 8 9 9 10 10 8 8 8 8 8 8 9 9 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 10 10 12 8 8 6 6 8 6 6 8 6 6 6 6 9 10 10 9 9
9 8 8 6 6 6 6 8 8 11 11 10 11 12 9 10 10 10 9 9 10 10 11 8 6 7 6 8 8 10 9 10 8 8 6 6 8 8 9 9 9 9 9 8 8 8 8 8 6 6
6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 10 8 6 8 6 6 10 10 10 10 10 6 8 6 7 11 12 14 14 13 10 10 10 10 7 6 8 8 8 10 10 8 9 8 9 9
9 9 9 13 11 8 8 6 7 10 8 9 8 8 6 6 6 7 8 8 11 11 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 10 8 7 8 9 9 10 8 8 8 6 8 6 7 8 6 6 8
8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 6 6 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 14 12 8 6 6 6 8 8 10 11 7
6 8 8 10 13 9 8 8 8 8 8 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 3 0 3 10 8 8 6 6 8 8 10 8 8 8 6 6 6 8 6 6 8 8 8 8 8 6
6 8 8 9 9 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 12 12 10 9 10 9 9 9 9 9 10 10 9 10 10 11 10 8 8 6 6 6 6 8 8
8 8 8 8 8 9 9 10 10 11 11 11 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 10 10 10 8 8 9 9 8 10 12 7 7 7 6 6 8 6 8 6 6
8 8 10 9 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 10 8 8 6 6 8 8 13 10 12 9 10 10 10 12 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 9 8 8 9
10 10 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 11 13 12 11 11 10 11 12 12 10 8 8 6 6 8 8 8 8 10 10 9 9 10 8 8 6 6 10 8 10 8
8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 9 9 9 9 10 10 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 11 11 11 8 8 8 8 8 8 10 10 10 8 8 8 11 9 9 9 8 8 10 8 8
7 7 7 8 8 10 10 10 9 6 6 6 6 8 8 10 10 8 8 8 8 8 10 8 7 7 10 7 8 10 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8
10 8 7 7 8 8 8 8 8 8 8 6 7 8 8 10 8 8 6 6 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 6 6 6 8 10 10 8 8 8 10 8 8 8 8 10 9 7 10 8
10 10 10 8 9 9 10 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 11 11 11 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 11 10 10 8
8 8 7 6 6 8 8 10 8 10 8 8 10 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 10 14 9 8 8 8 8 8 8 3 0 3 8 6 6 7 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6
6 6 6 8 8 8 8 8 8 6 8 8 6 6 6 6 6 6 6 8 8 6 6 6 6 6 8 10 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 9 9 8 8 8 6 8 8 6 6 6 6
11 11 10 12 12 8 8 6 6 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 17 12 9 9 10 8 8 8 8 8 8 8 8 6 8 6 6 8 8 9 9 8 8 8 8 8 8 11 8 10 10
8 8 8 8 8 8 8 3 0 | Open.Hide. 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 13 13 3 0 3 9 10 11 30 30 30 41 41 39 39 44 39 39 44 37 23 23 9 9 7 11 10 6 6 6 8 8 8 8 8 8 10 10 21
23 22 22 18 32 32 42 41 25 25 11 7 6 6 6 6 6 6 3 0 3 8 9 12 6 8 6 6 8 12 25 34 43 50 59 59 59 53 53 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59
59 48 48 48 48 48 42 44 54 54 68 68 57 68 68 68 34 34 15 14 14 14 32 32 48 43 41 41 42 48 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 50 50 50 50 50 50 50 50 43 43 50 50 48 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 54 54 57 68 68 68 68 59 59 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 53 53 50 50 50 53 59 59 59 44 43 37 28
26 13 13 12 12 11 11 12 27 30 59 59 59 47 48 48 59 48 57 59 47 43 43 43 59 39 43 33 43 40 48 48 57 57 59 68 68 68 59 59 48 48 59 59 59 59 57 57 59 59
57 57 59 59 59 59 59 53 53 50 50 50 50 59 29 29 12 15 9 3 0 3 9 9 9 9 9 9 18 18 36 30 59 59 59 59 50 53 53 57 57 48 48 48 59 59 59 57 57 57
57 48 48 57 57 57 54 57 43 41 23 23 27 23 37 40 57 57 68 57 48 43 43 43 48 48 57 57 57 54 44 44 43 43 43 57 57 57 57 48 48 48 57 57 48 48 43 44 43 44
47 47 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 68 68 68 57 57 57 59 59 59 54 48 48 44 46 37 39 42 46 47 57 57 57 57 43 43 43 59 59 59 57 57 47 50 50 53 53 48
54 48 48 48 48 48 57 59 54 54 48 57 57 48 48 48 48 57 57 48 48 48 43 43 39 33 33 33 33 33 33 33 33 33 33 33 39 41 32 32 37 37 37 39 41 37 27 24 22 22
28 31 39 35 35 39 37 30 34 18 18 19 23 17 24 27 37 37 32 32 31 31 28 28 28 37 28 26 13 13 13 25 25 41 59 37 37 37 37 37 23 31 37 32 32 32 14 24 17 17
15 15 25 32 34 41 41 47 46 41 34 31 18 15 12 13 19 15 21 12 25 29 32 32 37 32 29 27 32 22 24 13 13 13 28 27 31 37 30 30 32 28 28 28 24 16 16 16 14 14
12 16 28 28 28 27 28 10 10 10 10 13 19 28 16 21 13 10 10 10 9 8 15 9 9 8 13 8 9 10 10 11 20 14 10 11 10 12 8 10 10 15 8 8 9 9 9 10 12 10
9 9 9 10 9 9 12 11 11 11 16 16 10 13 10 10 10 10 10 9 10 9 9 10 9 9 9 8 8 8 9 9 9 8 8 8 8 8 8 9 9 9 8 8 11 9 10 9 10 6
6 6 6 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 11 14 18 17 13 |