BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-504K14.T7 (MSMg01no504_k14.b1) | MSMg01-504K14.TJ (MSMg01no504_k14.g1) |
ACC | AG579487 | AG579488 |
length | 1,327 | 777 |
length of high quality (start - end) | --- | 585 (76 - 660) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no504_k14.b1 PHD_FILE: MSMg01no504_k14.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:32:19 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no504_k14.g1 PHD_FILE: MSMg01no504_k14.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:32:19 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | CCTCCTCTCCCCCTTCCNGTGTGNTTCNCTTACTCGACCGCTCTCTTCTT
CTCCCGACGAGAGCTCAGAGGTAATAACGCTTGGGGCGTGTGCCGCGCTA
TTAACGGCGAATTTGGCGCTCTGTCTAATTGGTGTTCTTATATCTCTCGC
CCCTTCCCATCGCACTGTGTTCATTACACACACCACTCACTCTCACGCTC
CCCTCCGCCCCGCGCTGTGTCTCGCTGTTGGCCCTTATATGTATCCGAGT
GATGTGACCGACCCTGTTATACCAACCCCCTCGATTATAAAACCTATCAT
TCCTTATGTCGCACATTCTCATTTGTCTGTCCTCGTTCCCGTGCTGTCGT
GACGCGCGCTGGTCAGTTCCTATTTAGATTGTCGGTCGTGCTCCCCAGAG
AATAGGAGCCATCGCGAAGTCGGCCAGACATATCATTAAGTATAGATCGA
CGCGAGCACGCCCTCTTTATCATACTTTCTTGTCACTTCGCCCGCCTCTC
TTGCTGTCCTACGCTCCTCATTATATATTTCTTGCCGCGTTCGCACGGTG
CTACATAATATCTCGACTGCGTGATGAGACTACGCGCCGATTCTTATACT
ATTTTATGCATTATCACAACCTCGTGCATGACCTGGGGCGCAGTAGTGGT
AGTTATCAAGACGGAGTCGATAGGTCCGTCCGCGTGCCGGTTCTTGTCGT
CTGCTCGCCGCACACTCCTGTACCACGCAATCACTCATGTAGTTGCGTGG
TGTACCGCCGTTACAAGAACTTCATTATCGGTCCGTTCAGGCGCGCGATT
TCCACTTGATATAGTGCGGGGTGGAACCGCTCCAAGGCGTGGCGTGGCCT
AGAGTGGTTATGGGATGCTGGTCTTATTCCGCCTGGCNGCATAGTGCGCG
CGAGTGTCCCGCTGTCTGTCGAGTTCGGTGATCTCTCCTCATACCTACCG
CCGTCCGTGGTTCTCAGTGCTCCGATGGCGGCTAGCATCTCGATTACCAT
GGTCAGCATGTGCGCCGACGCGCCGACTATAGCCTGGTACCTTACGACGT
CGACTTTAATACGTCTGGTTTATATACCGCTACGACGCCGTCATTGTGCG
CATATTACTACGCTCTCTCCTTGCGCTCATCGTTTACCTCNTAGCTAAAT
GGGATCCGTACNGTCGTGTGTGCGCCGATTATCTCTTCTCTCCTCTACCT
CCCCNTGCTGTTTTGGCGCCCGCGGATAGCGATAATGTAAGTATATCTTG
TTTTCTGCTTACGCCGGCGCGTGACTTTGATTGCTCACGCGACGTCGTTA
TTATCTGAACTGTAATGTCTCGTGCCG
| NNCCGATGCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXATCACTTTGTCCGGGCTCAGCTCAG
AACCGACCCAGAGCTGCCCTTTGGATACAAATGAAGCCAGGGACCCCAAA
ACAGGCCCAGCTGCGAAAGGAAAACCCTTAACAAAGGAGCTCACTGAGCC
CAGCCTCAGCACTGCTGTGGACACAACCCGTCACCAGACAAAGCCTTTGC
TTTCCTTTGTATCTGGTGCGGCTCCCGAAGCCAGGGCTGGAAGCTGGAAG
CTGAGCGTCATGTTCCGTCTTCTTCTAAGACCACATCTCCACTGATCCAC
CTCCCCTGCGGCCTAAGGCTGCTGCCTGCGGATCTCAGCCTCCGTCTGTT
CCCCTTGGGAAAGAGAGAAGGGCAGAAATAAGCCTAGTGTCTGGGGGTGC
TTTCCTGGGTAGAGGCGTGGGCTCATGCCTGCTCAGTCTTCGAAGCTGAA
AAAGCTACACAGGGGATAGGAAAGAGCTCTAGCTCTTTTCACTGTGTCTA
GAGGTGAGGTATCTGCACCCCTCTCCTGACCTGGACAGGCCCTGAGACTA
GTAACCTCACTGGCACTGAGCTGTGTACAAAATGGGGAGGAGCTTCCATC
ATTCTCAACCTGGGTTTACAGCGTGGCCCCGCCCCGGGAGGGTTTACAGC
CTAACCCCGCCCCAGGAGGAAATGTTGGCCTTGAGTGGGTACTAAGGCAC
AANTCAGCCACAGCCCCCAGTTACAGG
|
quality values | Open.Hide. 6 6 6 11 12 10 9 8 8 12 8 7 7 7 8 7 3 0 3 8 8 11 3 0 3 17 3 0 3 17 8 8 8 8 8 6 6 8 6 8 8 8 8 11 11 8 8 8 8 8
8 8 8 8 10 10 10 6 6 6 6 6 6 8 6 6 6 6 8 8 8 8 9 9 9 9 9 8 8 8 6 6 8 12 8 8 6 6 8 8 9 9 11 12 10 10 10 9 8 8
8 8 8 8 10 10 11 11 8 8 8 8 6 7 7 10 12 14 12 10 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 6 8 6 6 6 6 11 10 10 9 9 9 11 11 8 8 8 8 10
10 7 7 7 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 7 10 8 8 6 6 8 6 6 8 8 6 6 8 8 9 9 6 6 6 6 6 6 10 8 10 10 13 8 8 7 7
7 10 12 13 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 11 11 12 8 8 6 6 6 6 10 10 12 9 9 9 7 12 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 6 6 6 6 8
6 7 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 8 8 6 6 6 6 6 7 7 6 8 8 10 9 8 8 6 6 6 6 8 6 8 10 8 8 8 8 12 10 10 9 9 10
10 8 8 8 8 8 8 6 7 11 8 8 8 8 8 8 9 8 8 6 6 10 7 6 6 8 8 8 8 8 10 8 6 8 6 6 6 6 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 9 10 10 8 8 8 10 10 11 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 8 6 6 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 10 10 9 9 6 6 6 6 8
8 6 6 6 8 9 8 8 8 8 8 8 7 7 7 6 8 8 9 9 9 9 12 10 9 8 8 8 8 8 9 10 13 12 13 10 13 10 10 10 10 12 9 8 8 8 6 8 7 6
6 6 8 6 6 6 6 8 6 10 10 12 9 8 8 8 10 8 10 9 8 8 6 6 6 6 10 11 20 13 9 9 9 8 8 8 8 10 10 12 10 6 6 7 6 8 8 8 8 8
8 8 6 8 6 7 8 6 8 10 10 10 10 10 8 8 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 12 15 16 14 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 10 8 8
8 10 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 10 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 6 6 8 8 8 10 15 13 13 11 11 6 7
7 9 10 10 15 13 10 11 10 10 10 6 6 6 8 8 10 10 10 13 10 10 10 10 10 10 6 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 6 7 7 8 6 6 6 6 6 6 7 7 11 12 10 10 10 10 10 9 9 8 10 8 6 6 8 8 9 9 9 6 7 6 6 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9
8 8 8 8 8 10 10 11 13 10 8 8 8 8 8 8 8 12 12 10 8 8 8 9 8 8 9 8 8 8 8 8 6 6 12 10 11 6 6 8 6 6 10 8 6 6 6 6 6 6
6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 11 10 10 10 10 10 8 8 6 6 6 6 10 10 8 6 7 8 10 10 10 8 8 6 8 6 6 8 8 12 10 12 9 9 10 10 8
9 10 9 10 10 10 10 9 9 10 10 12 9 8 8 6 6 8 6 8 8 8 10 9 9 8 8 8 8 8 6 6 6 6 7 8 8 6 6 6 7 8 8 8 8 8 15 11 11 11
9 9 6 6 6 8 8 6 8 6 6 8 8 8 6 8 8 6 6 6 6 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 10 3 0 3 8 8 8 8 12 10 10 9 9 9 9
10 10 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 12 13 10 9 10 9 7 6 6 6 7 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 7 7 6 8 8 8 6 6 8 12 8 8 8 8 8 8 10 7 7 8 8 9 15 16 10 8 13 10 10 10 8 6 8 6
6 6 6 10 10 8 10 8 8 8 10 8 10 8 8 8 8 8 8 12 8 9 8 8 12 10 10 6 6 6 6 8 8 7 7 8 8 8 6 8 6 6 6 7 10 10 6 6 8 10
8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 9 10 8 8 6 6 6 6 7 6 14 14 10 8 8 8 10 8 8 8 6 6 8 8 8 8 10 10 10 8 6 6 6 6 6 8 6 9 10
13 8 8 8 8 8 8 8 7 7 8 15 13 15 15 8 8 8 8 8 8 9 10 8 8 6 10 7 6 6 8 8 10 10 10 8 8 9 8 3 0 3 10 10 12 13 11 11 11 11
11 8 8 7 7 10 8 8 8 7 3 0 3 9 12 11 9 8 10 8 8 8 12 10 9 9 7 8 8 6 6 6 6 9 9 10 13 13 10 10 10 13 10 11 10 9 8 11 10 8
8 8 8 3 0 3 8 8 6 6 8 7 7 7 7 8 8 10 8 8 8 11 8 8 8 10 8 8 8 8 6 6 6 6 8 7 7 8 8 9 9 8 8 6 6 8 8 8 8 8
8 8 10 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 10 7 7 7 9 9 10 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 11 11 11 11 11 11 11 11 11 11
11 12 12 11 8 8 8 8 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 9 10 10 8 8 8 8 | Open.Hide. 0 0 3 7 7 12 15 12 11 11 11 27 21 21 13 18 14 20 34 44 44 59 59 50 50 44 39 37 37 37 23 25 9 6 6 6 6 6 6 9 9 10 16 15 28 23 23 25 25 11
12 11 26 26 50 42 41 25 25 8 7 7 8 8 13 18 18 18 19 13 16 24 24 36 30 36 36 36 53 53 53 53 53 57 59 59 59 59 59 59 53 53 54 54 54 51 48 48 43 48
51 59 57 68 68 68 50 50 50 47 50 51 68 57 59 59 57 57 59 59 59 59 50 50 50 50 50 50 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 50 51 51 50 50 50 57 57 57 57 57
68 68 68 59 59 59 57 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57
59 59 59 59 59 57 57 52 59 59 59 59 68 68 59 59 57 57 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 62 35 28 38 28 35 35 43 43 43 44 44 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 68 59 59 54 59
59 59 54 54 54 59 59 59 59 59 47 59 43 48 46 59 59 57 57 57 57 57 48 48 48 57 57 57 57 57 48 48 48 47 43 40 59 40 47 47 46 46 46 59 59 59 59 44 41 41
44 41 41 41 42 41 41 43 43 40 43 43 57 38 38 34 34 34 43 47 59 59 59 59 43 43 43 47 47 48 48 57 57 48 48 48 48 57 57 43 43 37 37 30 32 30 39 39 47 47
47 43 47 36 34 32 28 24 20 32 28 37 37 47 40 40 40 43 43 48 48 48 46 46 46 47 37 37 32 29 26 32 31 36 35 37 37 39 35 31 31 39 34 34 23 23 23 28 26 26
21 28 34 30 25 28 35 30 30 30 34 30 28 32 35 37 34 32 23 23 20 32 20 23 23 28 28 35 28 31 39 30 30 25 34 32 35 31 26 25 23 23 23 34 30 32 25 30 30 37
33 27 24 28 28 25 28 24 28 10 9 7 8 7 7 9 18 19 23 23 20 20 11 11 11 12 12 17 27 28 31 28 28 26 26 19 19 19 23 16 12 10 8 8 8 8 16 14 12 10
10 10 9 11 12 10 14 10 8 9 9 9 12 9 11 11 9 9 9 9 9 8 8 8 10 10 11 8 10 8 8 10 15 15 11 11 10 11 13 15 10 10 9 10 10 10 9 13 8 9
6 3 0 3 8 8 10 13 9 9 9 12 12 17 21 24 19 11 11 11 16 9 8 8 8 8 8 |