BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-505N05.T7 (MSMg01no505_n05.b1) | MSMg01-505N05.TJ (MSMg01no505_n05.g1) |
ACC | AG580368 | AG580369 |
length | 759 | 763 |
length of high quality (start - end) | 710 (50 - 759) | 647 (79 - 725) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no505_n05.b1 PHD_FILE: MSMg01no505_n05.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:33:49 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no505_n05.g1 PHD_FILE: MSMg01no505_n05.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:33:49 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | NNAATCTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXC
GCGGAATTCTCTTTTATTGTTATTTTCCTTTTTATATCTTCCTAAAAGCA
TGAAAGATTTTTTTTTATTCTGGCTTCATCCAATTACTTTCCAGAGAGTT
GCTTATCCATGGGTTTCATGCGTTGTTTTCTAGGTTACCATGAATGATTT
GGCATAGCATATTTCCTATGTCATCCCTGTAGCCTGTGGTATTCATTTTT
TACCAACTCAGTGGTTGCCTTTTGAGGTATTGTCATCTAGCTCAGGTTTT
TGTTATTTCAGACTCTTAATTCCAGGTATTAAGTCTAAATTGTTATAGCA
AGATGTTCTATCAAGATATATGTTCATAAAAGAAGATTCACTCTCATAAA
CCTTTGTCGAGCGCGCCCCCAACTCGCCAGCAAGAACGACGCCACAGCAG
GATCCTTCTGCACACGTTTATTCAGTCCTGTTTCTTCTTGTTTATATCTC
CCCTGTTTATATCTCTCCCTTGTTTATATCTCCCCTGTTTGTATCTCTCC
CTCGTTTATATCTCCCAATAATAACAATCCTCTCTCGAATAATAATCCTC
CCTCTAACCCGGGCCTCTCACTCTTATATACTCTCAGTTCCCATCCACGC
ACAGCAGGCCACGCCACCTCACCAGGCACGCAGCTTCAGCTAATCAGGGC
AGCAGGGGCAAATCTCCACCAAATTGGATTCACCTGAATCCTGGTACACC
TGCGCAGCN
| CCCGATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXAAAAGACCACTGGGTGGCTGTT
GCATGCCACAGACGAACCTCACTTGGGTCCTTGATCCACAGGCGAAACTC
TGGTTCCGGTTACAGGTGGGCAAAGTGTTGGTGAGAAGAAGGGATGACAA
AAGTGACACAAGGGAGTGTAGATATGAATGTAATTTGTCAAATCAAGCAT
CAAACATTTTTTACAGAAGAAAATAGGGAAGTTAGGTGACCCACCGGCAA
GGTATGATGAGGTTACTGAATTCTTACACAAAACAGAGGAATGTAAACAT
GGAAGGACTGGCAGGAACCAACTAGGATAAAATTCAATGTTAATAACTGG
GATCAAAAGCAGCTTCACCTAAGGTCCACTTAAAAGCCAGGGGCAAGGGC
TTCCTGCCCTTGGCATAGTTCCTATTCTAGTCTATTGTATAGTCCACCTT
TCCCCTAGGCCATGTATATGAGTGTAACTCAGCTATCTATAGTTCTATCT
ACTCTGGTTCCTCCTTAGATTCCAAACTTCCTTCTTCCTAGATAATGGTA
AATTCCTGAGTAGAGCAGTGACTTAGCTATCCATGCCCAGGGTTGGCTCA
AGGACTGCCTAGAATCTAACTTAGCTATATGTCAAATAGAGCCACTTATA
ATAAAGCAATATTAAGGGAAAGCACACAGATCCATTTACCAACTAAAGCA
AGGACATTGGAGC
|
quality values | Open.Hide. 0 0 3 6 6 6 16 8 8 8 9 13 15 23 37 33 32 30 25 25 37 25 18 9 9 9 21 21 41 28 25 22 19 15 7 6 6 6 6 7 11 28 28 28 24 24 24 22 24 28
47 57 48 36 33 33 33 37 37 47 33 33 9 9 9 9 9 13 15 15 32 32 39 40 48 48 48 48 57 59 59 57 57 57 53 53 53 53 57 57 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 54 57 47 47 48 57 57 57 57 46 39 39 44 57 47 47 57 57 57 57 57 57 57 47 42 41 37 48 48 68 68 68 57 57
57 57 57 57 57 57 50 37 37 50 57 57 59 59 57 52 52 52 57 57 54 54 59 59 68 68 59 59 43 43 43 59 59 68 59 59 52 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68
68 68 68 59 59 59 57 57 59 59 68 59 59 57 57 57 57 59 59 59 52 52 52 52 57 57 57 57 47 59 44 44 35 43 43 57 44 59 68 68 44 44 43 52 52 62 62 68 68 62
62 62 43 43 39 43 43 43 43 31 43 43 62 62 62 62 62 43 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 45 43 43 44 43 43 43 43 31 44 44 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 43 43 35 43 43 44 43 52 52 62 62 59 44 43 43 31 31 43 43 62 62 62 68 68 62 62 45 52 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62
62 62 68 68 62 62 52 52 52 62 43 43 39 62 62 68 68 68 68 68 68 62 62 52 52 52 62 62 68 68 68 68 68 68 68 44 44 43 39 39 43 43 43 43 39 39 62 62 62 52
52 52 52 62 62 62 43 39 39 62 62 62 52 62 62 52 52 43 43 31 31 43 44 41 31 31 35 35 35 47 43 54 62 62 62 52 52 52 52 43 43 35 31 31 35 35 44 44 57 57
44 38 38 52 52 52 52 52 43 57 57 52 52 52 52 52 59 59 68 59 57 57 43 35 44 43 52 57 57 52 59 59 59 59 59 57 57 57 57 52 52 57 57 68 68 68 68 68 68 68
59 59 50 50 35 50 59 59 59 68 68 59 59 68 68 68 59 59 59 44 44 33 43 44 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 44 44 37 42 59 47 43 43 57 59 59 68 59 59 59 59
59 42 42 35 42 44 57 57 57 57 59 59 59 54 54 54 54 54 54 57 54 54 54 54 54 42 43 37 33 39 37 43 43 34 34 30 30 43 42 48 48 48 48 40 43 32 36 39 39 39
39 39 39 39 39 39 39 41 41 41 43 59 41 31 31 36 37 37 39 40 46 46 46 46 46 46 48 48 48 48 41 41 41 39 37 37 37 34 24 34 34 37 39 35 37 35 37 39 43 41
41 40 39 39 39 41 30 30 22 22 32 34 39 31 24 30 23 28 28 23 23 18 18 20 28 24 41 41 47 47 47 46 46 28 28 26 18 17 27 27 32 22 23 21 18 14 17 24 29 37
37 37 39 35 31 31 39 39 41 34 28 28 28 31 25 22 17 14 14 17 17 24 34 32 37 30 29 30 28 23 18 18 16 20 24 39 31 31 30 26 28 28 21 17 28 22 26 24 25 25
27 37 30 28 21 18 11 3 0 | Open.Hide. 6 6 6 8 8 13 8 8 8 8 8 21 25 39 36 39 41 37 37 43 41 41 41 46 46 50 50 42 41 39 23 21 9 9 9 9 9 9 9 13 13 12 15 15 22 20 21 12 22 30
39 53 47 41 37 37 37 41 35 25 18 9 6 6 6 6 7 11 16 23 32 34 33 33 33 33 36 33 33 38 42 57 37 43 43 43 43 43 43 57 57 57 57 59 59 54 54 54 59 54
54 54 47 46 46 42 39 39 42 42 48 47 48 47 44 42 36 39 39 35 35 39 42 57 57 59 59 44 44 46 47 50 50 50 42 42 39 39 44 41 57 57 57 57 57 57 42 57 44 50
50 57 57 57 47 50 44 44 57 57 57 50 52 52 57 57 68 59 59 54 54 54 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 52 52 57
59 68 68 57 57 57 52 52 52 45 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 52 52 52 62 62 62 52 45 62 62 62 62 43
43 39 62 41 43 43 62 62 62 68 62 62 62 52 52 44 44 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 52 52 52 52 45 43 43 44 44 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 44 44 39 43 43 39 39 19 19 27 27 44 44 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 62 62 52 45 45 62
62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 44 44 52 52 52 62 44 62 62 62 68 68 68 68 68 68 62 62 62 52 52 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62
62 57 43 43 45 57 57 59 52 52 52 52 43 44 43 26 26 35 43 43 44 44 57 44 43 39 43 43 57 57 57 57 68 57 57 57 43 43 39 59 59 59 57 57 57 59 59 59 57 57
57 52 52 52 57 57 54 54 57 57 57 52 59 59 68 68 68 59 59 43 50 57 57 59 59 57 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 48 48 57 59 59 59 57 48 57 57 54 54 57 57
54 54 54 54 42 42 44 47 57 44 44 48 59 59 59 59 59 57 57 57 57 59 57 57 57 57 59 59 47 47 37 43 44 46 46 57 54 54 59 59 59 59 59 54 59 59 59 59 59 59
59 59 59 48 48 57 48 48 48 43 43 48 48 48 59 59 39 39 35 47 37 37 32 29 29 37 43 59 41 46 39 47 39 39 39 39 39 28 28 28 31 28 37 37 43 40 48 57 57 57
59 41 43 43 43 43 37 37 40 39 39 43 43 43 43 43 43 43 57 43 57 43 32 32 20 20 32 25 25 28 32 23 23 28 34 37 39 37 35 35 32 28 31 31 43 28 34 19 19 18
26 22 31 39 39 39 32 28 19 28 18 23 17 24 26 36 35 32 34 41 34 34 25 23 28 32 32 41 37 37 31 31 28 28 24 29 34 36 36 26 23 16 12 11 12 21 17 28 24 29
29 35 36 36 39 37 35 31 32 35 37 37 33 33 28 26 26 25 25 31 34 31 22 22 14 15 14 23 23 23 21 17 13 12 12 19 19 21 16 18 18 20 28 28 28 24 31 30 22 20
20 24 22 27 30 30 25 27 15 15 11 11 11 |