BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-547B10.T7 (MSMg01no547_b10.b1) | MSMg01-547B10.TJ (MSMg01no547_b10.g1) |
ACC | AG611759 | AG611760 |
length | 748 | 752 |
length of high quality (start - end) | 407 (38 - 444) | 459 (65 - 523) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no547_b10.b1 PHD_FILE: MSMg01no547_b10.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 21:28:37 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no547_b10.g1 PHD_FILE: MSMg01no547_b10.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 21:28:37 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGAATTCAAT
AGTTAACTTTTCTTTATAAAAGAGAAAATCTGTCAGGATCTAACTTTGGC
ACCAAAAACTCGGATTGTTCTCTGTGATAGCTGGGGTTAATCGTCAATTG
GAGAGGATACAATGCCACTAGGAAAATAGGCCTTGGGTTTTGGGGAATTT
GTGGGTTTTGTTGTTGTTTTGTTTTGTTGTTTTGTTTTGCTTTTGTTTTG
TTCTTACTTTATTTGAGATGGGAAGACTTACTCATTGTGGGTAGCACTGC
TGCCTGGCTGGGATCCTCAACAATATAAATGTGGAAACTGAGATGCATGT
ATTCCACTCTGCTTCCTGATGATTGATGTGATGTCATCAGTTGCTTTGAA
CTCTTTACACCTTGATTTCGTCACCTTGATGGGCTGTTCAGTACAACTGG
GAGGCAGGTTGCTTTTGTCAGTCTTGTATCCCAGCACCAGGTAAGGTAAA
AACACTATGACACTGCTCTTGCGTTATTAAGTGTGTTATACTTCCTTTAC
TAAGTGAGTATCTCATGTCTCATTATGGTATGTATTGTATCCATATATAT
ACATGTATGTATAAAATTCAACTTTATTTTCATTCATCCCTCTGCGCCAT
TCCTTTCCCTTACCCCCCATCTTTTCTATTCAGCTCTCCCCGCCAATTAC
TTCTCCTTTTACCCTCACTCATGCCCCCGCTTTCTCTTCACGTGTTAC
| GGGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXAGTCTGTGACTCATGGTATCTCTACTTGTTCAAGGC
TCATTTATTTCTTGTCTTTAGTTACATTATTTGGTCATTTCCCAATATTT
TTATGTATTTAAGTTTATCGCTGTTTTCTCCCAGTGAATTCACACACACA
CACACACCAAAACACACCTTTCATTTTTCTACCAAAGCAGATGTGTGAGT
TGCAGGTTGAATAGTACTGAGACCTTAGTCAAAAGAGACTGGCGTGAGCT
GGGTGTGGTGGCCACACCGTTAATCCCAGGATTTGGGAGGCAGAGGCAGG
CAGATTTCTGAGTTTGAGGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAGTTCCAGGAC
AGCCAAGGCTATACAGAGAAACCCTGTCTCGAAAAACCAGAGAGAGAGAG
AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG
AGAGAGAGAGACTGGGGTGAGATGTATTGGGGGGGGAGTANAANANNNNT
TANTCTTCTCNNTTTTTTGGGGAATTTCCTAAAACAGTTTTATTGATTCA
ATTAAGGTAAACAAAGTCTTCATTGTACAGTGGACTTATGCTGCTCGTAA
ACTTTGAAAGTACAAAATGAGCATTTTCTCTACTTTCGACGATTTTGCTT
AATTAAACATCTGAGGTAATCTTAGTATGTCCATATACACTTCTGTATAT
AT
|
quality values | Open.Hide.23 28 27 27 27 24 22 22 30 25 16 9 9 9 21 21 41 22 21 14 14 16 28 36 34 24 9 9 8 8 10 8 10 19 19 21 22 29 34 47 44 22 21 19 21 29 25 28 21 30
43 50 48 44 43 34 39 43 43 36 36 43 43 48 57 57 57 57 57 57 59 57 68 68 68 51 51 42 42 42 42 51 50 50 68 51 51 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
51 68 68 68 68 68 68 51 51 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 50 50 50 50 51 68 68 68 68 68 68 68 68 51 50 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 57 40 33 29 22 22 40 43 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 59 59 68 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57
57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 68 68 68 62 62 68 68 68 68 68 68 62 62 68 68 68 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 52
52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 39 43 43 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 62 44 43 35 35 43 43 52 52 43 62 43 43 43 47 44 62 62 62 62 62 62 62 62 44 43 35 35 43 44 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 43 43 43 43 45 62 62 52 52 43 43 35 35 35 44 44 62 43 43 39 35 43 43 62 62 62 62 52 52 45 62
62 62 62 62 62 43 43 35 33 33 43 43 32 32 17 17 14 38 27 35 35 43 57 57 57 44 43 39 31 31 35 43 43 43 47 43 43 38 36 19 22 15 36 15 14 17 32 38 21 15
12 11 11 11 26 24 27 24 27 27 32 35 35 35 35 35 32 30 19 12 12 12 12 18 36 32 37 38 28 24 18 15 11 12 11 15 15 21 18 17 20 24 28 10 10 9 9 9 9 14
19 30 19 16 13 13 13 14 27 28 17 15 10 13 9 9 10 13 17 18 11 11 11 15 15 26 26 24 23 11 11 11 11 15 15 12 12 12 19 19 23 27 27 24 15 15 24 15 15 20
19 25 15 12 12 12 12 12 12 12 15 15 18 15 17 17 16 15 13 16 10 10 10 10 10 10 10 10 10 8 8 10 10 9 9 9 9 9 9 11 11 11 10 11 10 9 10 10 10 8
8 8 6 8 6 6 8 8 8 8 8 8 10 8 16 12 10 8 8 8 8 9 10 8 8 8 8 8 8 13 10 8 8 10 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 12 10 8 8 10 10
14 11 9 12 12 13 15 9 9 9 10 10 11 19 22 13 6 6 6 6 8 8 8 12 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 10 8 9 9 10 10 10 10 9 8 8 8 8 13 10 12
16 16 16 15 11 11 12 13 10 8 8 8 8 8 9 8 10 8 10 8 10 10 8 17 19 19 8 8 8 8 11 7 9 10 10 12 10 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 | Open.Hide.11 11 11 11 13 21 30 32 37 44 44 41 42 50 50 50 50 59 50 50 50 41 41 18 23 9 9 9 9 9 17 21 34 44 39 37 34 37 37 37 37 37 39 50 50 53 53 57 57 36
42 36 37 36 36 43 43 43 37 42 36 36 33 42 43 68 47 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 51 51 50 50 50 50 57 50
50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 50 50 50 51 51 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 59 59 57 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 59 57 59 59 57 57 59 59 68 57 57 57 57 50 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59
59 59 59 59 59 59 59 59 48 48 48 57 48 48 48 48 50 50 25 23 11 8 10 8 8 8 8 9 9 12 19 21 21 39 33 30 19 15 15 3 0 3 3 0 3 0 0 0 0 3
25 3 0 3 17 13 19 17 18 3 0 0 3 9 18 27 39 36 36 36 36 37 28 28 28 37 41 44 37 33 31 30 30 29 24 17 13 11 10 10 10 13 15 30 30 36 28 26 17 10
9 10 22 22 19 16 15 19 19 33 33 47 47 37 28 28 24 28 30 30 28 22 12 18 10 10 10 10 13 10 11 14 29 19 30 30 37 37 39 39 32 22 12 10 10 12 10 10 26 26
23 15 9 9 8 15 9 11 15 11 12 8 8 8 8 19 10 10 10 10 7 7 8 8 8 17 23 27 22 14 13 11 11 11 13 10 8 8 8 9 11 13 18 10 9 9 9 9 11 12
12 13 11 14 18 14 12 12 13 19 20 18 27 21 13 11 11 8 8 8 9 11 6 6 6 6 6 8 8 11 8 8 8 8 6 6 8 10 10 8 8 8 8 8 6 6 10 6 6 8
8 6 |