BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-028C21
Chromosome13 (Build37)
Map Location 14,519,780 - 14,636,533
singlet/doubletdoublet
Overlap geneHecw1
Upstream geneLOC664960, Nid1, Lyst, LOC100039831, Gng4, EG665000, EG665008, LOC630894, LOC100040205, B3galnt2, Tbce, Ggps1, LOC100040243, Arid4b, LOC100039916
Downstream geneMrpl32, Psma2, AW209491, EG665099, LOC670994, EG625121, Gli3
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-028C21.bB6Ng01-028C21.g
ACCDH858726DH858727
length989985
definitionDH858726|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-028C21, 5' end.DH858727|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-028C21, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(14,635,666 - 14,636,533)(14,519,780 - 14,520,772)
sequence
gaattccaatgtcatacacttgcagaaactatctgtagctggcaaaatca
tgaccctgatagggtctgaagcaaatcacaggcttctgctgtgggcagtc
taaggtagcccatatcttacacttggggttaaaacaaaaacatattccca
taacatttctgtgtttaaaacaaaaatatcagttcagcaagtgatgatga
tatttctatgaggatttaaggaatttgatgaataatccacttttcagtgt
ttcagcaatgacccaaacaacctcttcattgtcttggaatgtccacatag
gctttcttgtgtgtgtgtgtgtacataaacttatatgtattgtaactagt
tttaggtaaatataaacaattgccctctctccttactctatatttacttc
tctcctcccttccctagggtggcccctccccatttccctcatttctctct
tcatattacatgtatcttgctccacccctctcaagtccatctcaacatca
aggtccctttgttatttcctgatttcttcagttattctgtctgtttctca
catatgaagatttggagcttgaaactgcaaatgagagagaacacttggta
tttgtctttctagggctatgttacttcactccacgcaatctatctagttc
cataaatttacttgaagatttcatttttcttagcagatgaatagtatccc
attgtgtatgtgtaccacattttcattatgtgttcatctgttgaagggaa
tttaggttgtttccatttcctgtctaacgcagcaatgaacattgctgagc
aaatgtctgtggtgtagtgttatgaccggatcatgagacccccaaagacc
accagaactcaactctgatataattcacaggagggtttattcagcatgag
gtcgagctcagaggcaaaccttcctgatgtagcagttaggagagtgtgtg
ccgagtccagtggcttggagtttttacaggaaaaatgca
gaattcatctttagatttttgggtcgatttttatttcaacattttaggag
taaaagctatttgaatttatcttggaccactttatagtaccagttaacaa
gagaatagttgttgggggtgatgcttttgttatgttaatgaaacaaagat
tcagaagctgggaatttagctcagtggtagagaactaacctaacatgcat
ggtcttgggttaggtccccagtcctgaaaagatagagagacaaacagaca
gacagacagacagatggtggtggggtttaagaattccctactgtaatgtc
tctgggagtgggaaatataattagttgccttctagggagaaattctacta
actagcccctttaaagtattaattctggaaaatgagactagaaagctctt
gctgctgatttacaaatgagattgcaagcaagactgattttttttaaggt
ttaaaataaaaacatatgatcttgttttattatgtcagaaatacatagtt
cagatctgtttaaaggcatgataaattgatactgccttttcttacaaact
tgtgtattcttaacttcttgaaatctattagattacatatctgggttaat
taaacatgtctcatgaaatagtaaaatggattaaatattacataccatta
gaagatacatgatctttcaaacatgtaatttagagtgatagtaagcatct
aaaaatagtttactaatgccggggcctagcaaacacagagctggatgctc
acggtcagctattggatggatcacagggcccccaatggaggagctagaga
aagtacccaaggagctgaagggatctgcaaccctataggtggaacaacaa
tatgaactaaccactacctcccggagctcgtgtctctagctgcatatgta
gcagaagatgcttagttggccatcattggaagagagcccattggtcttgc
aaacttttttccccagtacagggaacgcaggccaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr13_14635666_14636533
seq2: B6Ng01-028C21.b_45_912 (reverse)

seq1  TCAGAGTTGAGTTCTGGTGGTCTTTGGGGGTCTCATGATCCGGTCATAAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGAGTTGAGTTCTGGTGGTCTTTGGGGGTCTCATGATCCGGTCATAAC  50

seq1  ACTACACCACAGACATTTGCTCAGCAATGTTCATTGCTGCCTTAGACAGG  100
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  ACTACACCACAGACATTTGCTCAGCAATGTTCATTGCTGCGTTAGACAGG  100

seq1  AAATGGAAACAACCTAAATTCCCTTCAACAGATGAACACATAATGAAAAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGGAAACAACCTAAATTCCCTTCAACAGATGAACACATAATGAAAAT  150

seq1  GTGGTACACATACACAATGGGATACTATTCATCTGCTAAGAAAAATGAAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGTACACATACACAATGGGATACTATTCATCTGCTAAGAAAAATGAAA  200

seq1  TCTTCAAGTAAATTTATGGAACTAGATAGATTGCGTGGAGTGAAGTAACA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTCAAGTAAATTTATGGAACTAGATAGATTGCGTGGAGTGAAGTAACA  250

seq1  TAGCCCTAGAAAGACAAATACCAAGTGTTCTCTCTCATTTGCAGTTTCAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCCCTAGAAAGACAAATACCAAGTGTTCTCTCTCATTTGCAGTTTCAA  300

seq1  GCTCCAAATCTTCATATGTGAGAAACAGACAGAATAACTGAAGAAATCAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCCAAATCTTCATATGTGAGAAACAGACAGAATAACTGAAGAAATCAG  350

seq1  GAAATAACAAAGGGACCTTGATGTTGAGATGGACTTGAGAGGGGTGGAGC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAATAACAAAGGGACCTTGATGTTGAGATGGACTTGAGAGGGGTGGAGC  400

seq1  AAGATACATGTAATATGAAGAGAGAAATGAGGGAAATGGGGAGGGGCCAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGATACATGTAATATGAAGAGAGAAATGAGGGAAATGGGGAGGGGCCAC  450

seq1  CCTAGGGAAGGGAGGAGAGAAGTAAATATAGAGTAAGGAGAGAGGGCAAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAGGGAAGGGAGGAGAGAAGTAAATATAGAGTAAGGAGAGAGGGCAAT  500

seq1  TGTTTATATTTACCTAAAACTAGTTACAATACATATAAGTTTATGTACAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTATATTTACCTAAAACTAGTTACAATACATATAAGTTTATGTACAC  550

seq1  ACACACACACAAGAAAGCCTATGTGGACATTCCAAGACAATGAAGAGGTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACACACAAGAAAGCCTATGTGGACATTCCAAGACAATGAAGAGGTT  600

seq1  GTTTGGGTCATTGCTGAAACACTGAAAAGTGGATTATTCATCAAATTCCT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTGGGTCATTGCTGAAACACTGAAAAGTGGATTATTCATCAAATTCCT  650

seq1  TAAATCCTCATAGAAATATCATCATCACTTGCTGAACTGATATTTTTGTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAATCCTCATAGAAATATCATCATCACTTGCTGAACTGATATTTTTGTT  700

seq1  TTAAACACAGAAATGTTATGGGAATATGTTTTTGTTTTAACCCCAAGTGT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAACACAGAAATGTTATGGGAATATGTTTTTGTTTTAACCCCAAGTGT  750

seq1  AAGATATGGGCTACCTTAGACTGCCCACAGCAGAAGCCTGTGATTTGCTT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGATATGGGCTACCTTAGACTGCCCACAGCAGAAGCCTGTGATTTGCTT  800

seq1  CAGACCCTATCAGGGTCATGATTTTGCCAGCTACAGATAGTTTCTGCAAG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGACCCTATCAGGGTCATGATTTTGCCAGCTACAGATAGTTTCTGCAAG  850

seq1  TGTATGACATTGGAATTC  868
      ||||||||||||||||||
seq2  TGTATGACATTGGAATTC  868

seq1: chr13_14519780_14520772
seq2: B6Ng01-028C21.g_65_1049

seq1  GAATTCATCTTTAGATTTTTGGGTCGATTTTTATTTCAACATTTTAGGAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATCTTTAGATTTTTGGGTCGATTTTTATTTCAACATTTTAGGAG  50

seq1  TAAAAGCTATTTGAATTTATCTTGGACCACTTTATAGTACCAGTTAACAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAAGCTATTTGAATTTATCTTGGACCACTTTATAGTACCAGTTAACAA  100

seq1  GAGAATAGTTGTTGGGGGTGATGCTTTTGTTATGTTAATGAAACAAAGAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAATAGTTGTTGGGGGTGATGCTTTTGTTATGTTAATGAAACAAAGAT  150

seq1  TCAGAAGCTGGGAATTTAGCTCAGTGGTAGAGAACTAACCTAACATGCAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGAAGCTGGGAATTTAGCTCAGTGGTAGAGAACTAACCTAACATGCAT  200

seq1  GGTCTTGGGTTAGGTCCCCAGTCCTGAAAAGATAGAGAGACAAACAGACA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCTTGGGTTAGGTCCCCAGTCCTGAAAAGATAGAGAGACAAACAGACA  250

seq1  GACAGACAGACAGATGGTGGTGGGGTTTAAGAATTCCCTACTGTAATGTC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAGACAGACAGATGGTGGTGGGGTTTAAGAATTCCCTACTGTAATGTC  300

seq1  TCTGGGAGTGGGAAATATAATTAGTTGCCTTCTAGGGAGAAATTCTACTA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGGGAGTGGGAAATATAATTAGTTGCCTTCTAGGGAGAAATTCTACTA  350

seq1  ACTAGCCCCTTTAAAGTATTAATTCTGGAAAATGAGACTAGAAAGCTCTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTAGCCCCTTTAAAGTATTAATTCTGGAAAATGAGACTAGAAAGCTCTT  400

seq1  GCTGCTGATTTACAAATGAGATTGCAAGCAAGACTGATTTTTTTTAAGGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGCTGATTTACAAATGAGATTGCAAGCAAGACTGATTTTTTTTAAGGT  450

seq1  TTAAAATAAAAACATATGATCTTGTTTTATTATGTCAGAAATACATAGTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAAATAAAAACATATGATCTTGTTTTATTATGTCAGAAATACATAGTT  500

seq1  CAGATCTGTTTAAAGGCATGATAAATTGATACTGCCTTTTCTTACAAACT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGATCTGTTTAAAGGCATGATAAATTGATACTGCCTTTTCTTACAAACT  550

seq1  TGTGTATTCTTAACTTCTTGAAATCTATTAGATTACATATCTGGGTTAAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTATTCTTAACTTCTTGAAATCTATTAGATTACATATCTGGGTTAAT  600

seq1  TAAACATGTCTCATGAAATAGTAAAATGGATTAAATATTACATACCATTA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAACATGTCTCATGAAATAGTAAAATGGATTAAATATTACATACCATTA  650

seq1  GAAGATACATGATCTTTCAAACATGTAATTTAGAGTGATAGTAAGCATCT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGATACATGATCTTTCAAACATGTAATTTAGAGTGATAGTAAGCATCT  700

seq1  AAAAATAGTTTACTAATGCCGGGGCCTAGCAAACACAGAGCTGGATGCTC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAATAGTTTACTAATGCCGGGGCCTAGCAAACACAGAGCTGGATGCTC  750

seq1  ACGGTCAGCTATTGGATGGATCACAGGGCCCCCAATGGAGGAGCTAGAGA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGGTCAGCTATTGGATGGATCACAGGGCCCCCAATGGAGGAGCTAGAGA  800

seq1  AAGTACCCAAGGAGCTGAAGGGATCTGCAACCCTATAGGTGGAACAACAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTACCCAAGGAGCTGAAGGGATCTGCAACCCTATAGGTGGAACAACAA  850

seq1  TATGAACTAACCACTACCCCCCGGAGCTCGTGTCTCTAGCTGCATATGTA  900
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGAACTAACCACTACCTCCCGGAGCTCGTGTCTCTAGCTGCATATGTA  900

seq1  GCAGAAGATGGCTTAGTTGGCCATCATTGGAAAGAGAGGCCCATTGGTCT  950
      ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||
seq2  GCAGAAGAT-GCTTAGTTGGCCATCATTGG-AAGAGA-GCCCATTGGTCT  947

seq1  TGCAAACTTTATATTCCCCAGTACAGGGGAACGCCAGGGCCAA  993
      |||||||||  | |||||||||||| ||||||||   ||||||
seq2  TGCAAACTT--TTTTCCCCAGTACA-GGGAACGC--AGGCCAA  985