BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-037K04
Chromosome13 (Build37)
Map Location 117,782,489 - 117,953,756
singlet/doubletdoublet
Overlap geneParp8, LOC668288, LOC623312
Upstream geneEG623174, Isl1, EG668276, Gm280, LOC100041169
Downstream geneEmb, EG623365, LOC382807, Hcn1, LOC100041695, LOC674926
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-037K04.bB6Ng01-037K04.g
ACCDH865434DH865435
length1,0611,095
definitionDH865434|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-037K04, 5' end.DH865435|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-037K04, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(117,952,688 - 117,953,756)(117,782,489 - 117,783,588)
sequence
gaattcctatcccaattaaaaacatttaaaagtaaccagtttcgtgttca
aggtattaaaaccttgctacaaaaaaaatatatggtttaagagaacaaga
gcatacacaagctatgaaaagcgttcattcatgaccagtgaagtagggca
ttgtggtgcttgcctgtaactccagcactcaggaggcagaaactgggaaa
gtactctgagttttcagtcttcatggactgcatagtaagttctgggcttg
cctgagcattgtgtgtgtgtgtgtacacatatttatatcgatatacacat
atctatctatctatctatctatctatctacctatccatatccatatatat
atatattacgttaaactaagcatggtggaaatgcctacaatccagaggca
ggggaggggatcttgaacgccacaccagctatgcagaatagagagaaaac
atcccacagacttacctacaagagaatcagatggaggcagttcccaaatt
gagattccctctttagcctgttgtcaagatgaccaaaacctaaccagccc
acccagtcttgaaaatgattaatttaaacaaaactcttatttgaatcata
tacattttgcaaataaataagaaaaactatcttaagccatgggtgagtaa
ttgagttatcagagagctttgcgtcttctattcataaggcagcaagtgga
gctgaagaactgccctatgtaataaactacaagtgttcaaagtttgatct
tgaaccgtttaattcactcatacatagttctgtccttgatcaggacggga
ccataaatataagtgaaaggggagacccctcggccttcagcccatgtggt
ttgacggataacactttcttcatgctccctaaacttcctctaagcagttc
ttcttggagcttgggctggaaagacacttaccataaataagttttattgc
cttcttttctgggttagtgaaatagacctgttgtgctgtattgggagtct
atggtggagatggaaattagtcccttgagatagaaggaaaggctgacgaa
gaggagcctga
gaattcagcagatattagaaataaaaggtaggaaccctgctggaaattaa
tatttgaacacgtaagacttggatatcaattcctttttaatataaattct
aatgtaagaagaaattctccgtggcatcatctggggaatttccactgact
cagagatttaaaaaaaaaaaaaaattcacaaactccagaaacagcaaaaa
gtgttccagtgcgtgctgctaggtctcaggtgctctgcctcaggtttgag
agtgaggattatagatgtaatgattatccagaggagatttttgcaagatt
aataagaacagctagaaaagcataagacaggagcctaaataagcattatc
acattaattgaacatggttcccattggcaggaagcagaatgtttcagaaa
tgatgacaaacctcatcttattcaatataagaaacggcccacagattcca
aacagtgaagagaagaagagagttgagcttgagctctaattattactcat
ttaaataattgcctgaaagctttatttgggaaattcagaacacagttgtt
tacttccttatagtggatccaattaagtatacaaactttctgcgctacag
gaagacaaagagccaaacaagaattgaggctgggaaaccatagagcactc
aaggaacacaatattttttgtgtaaattcctggtgtatgaaacttagagc
tgtgatcatcacgcactgtaccatcagagaccagatgaaacttatctaag
tttgaagagtccagctctctttgtagctcaaaggtttaatgatggctttt
ctgtcacctctgactcacagtttctccttgaaagaagtctatgctggtgc
ctctggcctctcctacagtacagggagtgacttgaaccactaaccatatc
tgaaagcctcatttctctcacataatgcctgctgttgaactttgaacatg
gatacacatttagttttgtttgtttcctcagttcttcaaagcttgaagat
agctatgatacaccgccaacaaatttatcaatgggtggccttaccatcaa
ggaaaccagaaggatgcggagggagccggagggctgctgaagtct
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr13_117952688_117953756
seq2: B6Ng01-037K04.b_50_1110 (reverse)

seq1  TCAGGCTTCCTCTTTCGTCAGCCTTTCCCTCTTACTCAAAGGCACTAA-T  49
      |||||| ||||| ||||||||||||||| |||  ||| |||| ||||| |
seq2  TCAGGC-TCCTC-TTCGTCAGCCTTTCCTTCTATCTC-AAGGGACTAATT  47

seq1  TCCATCTTCCACCATAGACTCCCAATACCAGCACAACAGGTCTTATTTCA  99
      |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||
seq2  TCCATC-TCCACCATAGACTCCCAATA-CAGCACAACAGGTC-TATTTCA  94

seq1  CTAACCCAGAAAAGAAGGCAATAAAACCTTATTTATGGTAAGTGTCTTTC  149
      |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  CTAACCCAGAAAAGAAGGCAATAAAA-CTTATTTATGGTAAGTGTCTTTC  143

seq1  CAGCCCAAGCTCCAAGAAGAACTGCTTAGAGGAAGTTTTAGGGAGCATGA  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  CAGCCCAAGCTCCAAGAAGAACTGCTTAGAGGAAG-TTTAGGGAGCATGA  192

seq1  AGAAAGTGTTATCCGTCAAACCACATGGGCCTGAAGGCCGAGGGGTCTCC  249
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  AGAAAGTGTTATCCGTCAAACCACATGGG-CTGAAGGCCGAGGGGTCTCC  241

seq1  CCTTTCACTTATATTTATGGTCCCGTCCTGATCAAGGACAGAACTATGTA  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTTCACTTATATTTATGGTCCCGTCCTGATCAAGGACAGAACTATGTA  291

seq1  TGAGTGAATTAAACGGTTCAAGATCAAACTTTGAACACTTGTAGTTTATT  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGTGAATTAAACGGTTCAAGATCAAACTTTGAACACTTGTAGTTTATT  341

seq1  ACATAGGGCAGTTCTTCAGCTCCACTTGCTGCCTTATGAATAGAAGACGC  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATAGGGCAGTTCTTCAGCTCCACTTGCTGCCTTATGAATAGAAGACGC  391

seq1  AAAGCTCTCTGATAACTCAATTACTCACCCATGGCTTAAGATAGTTTTTC  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGCTCTCTGATAACTCAATTACTCACCCATGGCTTAAGATAGTTTTTC  441

seq1  TTATTTATTTGCAAAATGTATATGATTCAAATAAGAGTTTTGTTTAAATT  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTTATTTGCAAAATGTATATGATTCAAATAAGAGTTTTGTTTAAATT  491

seq1  AATCATTTTCAAGACTGGGTGGGCTGGTTAGGTTTTGGTCATCTTGACAA  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCATTTTCAAGACTGGGTGGGCTGGTTAGGTTTTGGTCATCTTGACAA  541

seq1  CAGGCTAAAGAGGGAATCTCAATTTGGGAACTGCCTCCATCTGATTCTCT  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGCTAAAGAGGGAATCTCAATTTGGGAACTGCCTCCATCTGATTCTCT  591

seq1  TGTAGGTAAGTCTGTGGGATGTTTTCTCTCTATTCTGCATAGCTGGTGTG  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAGGTAAGTCTGTGGGATGTTTTCTCTCTATTCTGCATAGCTGGTGTG  641

seq1  GCGTTCAAGATCCCCTCCCCTGCCTCTGGATTGTAGGCATTTCCACCATG  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCGTTCAAGATCCCCTCCCCTGCCTCTGGATTGTAGGCATTTCCACCATG  691

seq1  CTTAGTTTAACGTAATATATATATATATGGATATGGATAGGTAGATAGAT  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAGTTTAACGTAATATATATATATATGGATATGGATAGGTAGATAGAT  741

seq1  AGATAGATAGATAGATAGATATGTGTATATCGATATAAATATGTGTACAC  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATAGATAGATAGATAGATATGTGTATATCGATATAAATATGTGTACAC  791

seq1  ACACACACACAATGCTCAGGCAAGCCCAGAACTTACTATGCAGTCCATGA  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACACACAATGCTCAGGCAAGCCCAGAACTTACTATGCAGTCCATGA  841

seq1  AGACTGAAAACTCAGAGTACTTTCCCAGTTTCTGCCTCCTGAGTGCTGGA  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACTGAAAACTCAGAGTACTTTCCCAGTTTCTGCCTCCTGAGTGCTGGA  891

seq1  GTTACAGGCAAGCACCACAATGCCCTACTTCACTGGTCATGAATGAACGC  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTACAGGCAAGCACCACAATGCCCTACTTCACTGGTCATGAATGAACGC  941

seq1  TTTTCATAGCTTGTGTATGCTCTTGTTCTCTTAAACCATATATTTTTTTT  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCATAGCTTGTGTATGCTCTTGTTCTCTTAAACCATATATTTTTTTT  991

seq1  GTAGCAAGGTTTTAATACCTTGAACACGAAACTGGTTACTTTTAAATGTT  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGCAAGGTTTTAATACCTTGAACACGAAACTGGTTACTTTTAAATGTT  1041

seq1  TTTAATTGGGATAGGAATTC  1069
      ||||||||||||||||||||
seq2  TTTAATTGGGATAGGAATTC  1061

seq1: chr13_117782489_117783588
seq2: B6Ng01-037K04.g_69_1163

seq1  GAATTCAGCAGATATTAGAAATAAAAGGTAGGAACCCTGCTGGAAATTAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGCAGATATTAGAAATAAAAGGTAGGAACCCTGCTGGAAATTAA  50

seq1  TATTTGAACACGTAAGACTTGGATATCAATTCCTTTTTAATATAAATTCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTGAACACGTAAGACTTGGATATCAATTCCTTTTTAATATAAATTCT  100

seq1  AATGTAAGAAGAAATTCTCCGTGGCATCATCTGGGGAATTTCCACTGACT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGTAAGAAGAAATTCTCCGTGGCATCATCTGGGGAATTTCCACTGACT  150

seq1  CAGAGATTTAAAAAAAAAAAAAAATTCACAAACTCCAGAAACAGCAAAAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGATTTAAAAAAAAAAAAAAATTCACAAACTCCAGAAACAGCAAAAA  200

seq1  GTGTTCCAGTGCGTGCTGCTAGGTCTCAGGTGCTCTGCCTCAGGTTTGAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTTCCAGTGCGTGCTGCTAGGTCTCAGGTGCTCTGCCTCAGGTTTGAG  250

seq1  AGTGAGGATTATAGATGTAATGATTATCCAGAGGAGATTTTTGCAAGATT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGAGGATTATAGATGTAATGATTATCCAGAGGAGATTTTTGCAAGATT  300

seq1  AATAAGAACAGCTAGAAAAGCATAAGACAGGAGCCTAAATAAGCATTATC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAAGAACAGCTAGAAAAGCATAAGACAGGAGCCTAAATAAGCATTATC  350

seq1  ACATTAATTGAACATGGTTCCCATTGGCAGGAAGCAGAATGTTTCAGAAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATTAATTGAACATGGTTCCCATTGGCAGGAAGCAGAATGTTTCAGAAA  400

seq1  TGATGACAAACCTCATCTTATTCAATATAAGAAACGGCCCACAGATTCCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATGACAAACCTCATCTTATTCAATATAAGAAACGGCCCACAGATTCCA  450

seq1  AACAGTGAAGAGAAGAAGAGAGTTGAGCTTGAGCTCTAATTATTACTCAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAGTGAAGAGAAGAAGAGAGTTGAGCTTGAGCTCTAATTATTACTCAT  500

seq1  TTAAATAATTGCCTGAAAGCTTTATTTGGGAAATTCAGAACACAGTTGTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAATAATTGCCTGAAAGCTTTATTTGGGAAATTCAGAACACAGTTGTT  550

seq1  TACTTCCTTATAGTGGATCCAATTAAGTATACAAACTTTCTGCGCTACAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTTCCTTATAGTGGATCCAATTAAGTATACAAACTTTCTGCGCTACAG  600

seq1  GAAGACAAAGAGCCAAACAAGAATTGAGGCTGGGAAACCATAGAGCACTC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGACAAAGAGCCAAACAAGAATTGAGGCTGGGAAACCATAGAGCACTC  650

seq1  AAGGAACACAATA-TTTTTGTGTAAATTCCTGGTGTATGAAACTTAGAGC  699
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGAACACAATATTTTTTGTGTAAATTCCTGGTGTATGAAACTTAGAGC  700

seq1  TGTGATCATCACGCACTGTACCATCAGAGACCAGATGAAACTTATCTAAG  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGATCATCACGCACTGTACCATCAGAGACCAGATGAAACTTATCTAAG  750

seq1  TTTGAAGAGTCCAGCTCTCTTTGTAGCTCAAAGGTTTAATGATGGCTTTT  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGAAGAGTCCAGCTCTCTTTGTAGCTCAAAGGTTTAATGATGGCTTTT  800

seq1  CTGTCACCTCTGACTCACAGTTTCTCCTTG-AAGAAGTCTATGCTGGTGC  848
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  CTGTCACCTCTGACTCACAGTTTCTCCTTGAAAGAAGTCTATGCTGGTGC  850

seq1  CTCTGGCCTCTCCTACAGTACAGGGAGTGGACTTGAACCACTAACCATAT  898
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGGCCTCTCCTACAGTACAGGGAGT-GACTTGAACCACTAACCATAT  899

seq1  CTGAAAGCCTCATTTCTCTCACCATAATGCCTGCTG-TGGACTTTGAACA  947
      ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| 
seq2  CTGAAAGCCTCATTTCTCTCA-CATAATGCCTGCTGTTGAACTTTGAAC-  947

seq1  ATGGATACACATTTAGTTTTGTTTGTTTCCTCAGTTC-TCAAAGCTGACA  996
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |
seq2  ATGGATACACATTTAGTTTTGTTTGTTTCCTCAGTTCTTCAAAGCTTGAA  997

seq1  GAT-GCTATGATACACGGTCAACAAAATTTATCCAATGGTGGCCTTATCC  1045
      ||| |||||||||||| | |||| ||||||||| |  ||||||||||  |
seq2  GATAGCTATGATACACCGCCAAC-AAATTTATCAATGGGTGGCCTTA--C  1044

seq1  TATCAAGGAAACCAGATGAATGCTGAGTGAAAGGCCTGAGGGGCTGCTGA  1095
       ||||||||||||||| | |||| ||| ||   ||| || ||||||||||
seq2  CATCAAGGAAACCAGAAGGATGCGGAGGGA---GCCGGA-GGGCTGCTGA  1090

seq1  AGTCT  1100
      |||||
seq2  AGTCT  1095