BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-051N10
Chromosome13 (Build37)
Map Location 20,896,549 - 20,946,906
singlet/doubletdoublet
Overlap geneAoah
Upstream geneGpr141, LOC432730, Elmo1, LOC100040226, LOC665381, LOC665386
Downstream geneOlfr1370, Olfr1369-ps1, Olfr42, Olfr1368, Trim27, Gpx5, LOC625752, Gpx6, Olfr1367, Zfp96, LOC665454, Zkscan3, Pgbd1, 4930470G03Rik, Zfp187, 4921504I05Rik, OTTMUSG00000000421, AK157302, LOC100040340, Zfp192, Olfr1366, Olfr1365, Olfr1364, Olfr1362, Olfr1363-ps1, Olfr11, Olfr1361, Olfr1360, Olfr1359, Hist1h2bl, Hist1h2ai, Hist1h3h, Hist1h2aj, Hist1h2bm, Hist1h4j, Hist1h4k, Hist1h2ak, Hist1h2bn, LOC100041150, Hist1h1b, Hist1h3i, Hist1h2an, Hist1h2bp, LOC665596, Rp23-480b19.10, LOC100041230, Hist1h4m, Hist1h2ao, LOC665622
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-051N10.bB6Ng01-051N10.g
ACCDH875364DH875365
length1,096933
definitionDH875364|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-051N10, 5' end.DH875365|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-051N10, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(20,945,790 - 20,946,906)(20,896,549 - 20,897,406)
sequence
gaattcaaaaggtgcctgtagcacgtttatagaggttataattgagactg
gtctgggagtttctggactgaggatcccagagggtgcagttggggaagga
agagctacagttgaatgttagtttgtaagctgtggcatgagtggcaggtt
ttgtacacacaaacatacacacaagtgccagttgttaggtgttttgagtg
caaagagaaagggtgatgaaatacacccctaaagactatctctgtggtct
ttgcaattcggaccagcacattttacttctcccttctctcattcccccgc
caccaatcacttacacccaaaccagtccccatgtacttacatcctaataa
ggaaatccatataattactatcatagtctataaaatgtggacaataccta
cttcctatgattaactgaattgatgcataggaaacacttggatcagtcat
tagtacactgtaaggaccagaagttagtttatgatggtgcttaagaggat
agtcaacattttaaggtgttttatagagaaggtggtagttgggatgagct
tgtaatgcgagtagacctaataccctaccctactcagcattctaacttag
tttcatcactttaagcatctcaaggcactgttatgtacctacagtgggca
aagatgtctaaaccaaaacctgatttataattcagggctgagtgtcctgt
gtacataaagatgggtgcttcgtagacataaggagatatgaaaacaccag
gtactcatctgctataaacaaagtacagtagtgcataggttgtttccttt
catgattgcatagctgactgggagatacagtcacagaaataaatgaaaat
tcatgatctagaattcaattatgctgacttcattttctttcttcttcttc
gttcttctttctttcttccttcttcttctttcttcctttgaccatgatga
gtagaaaattagggctctaccattgtaagttggagggtcatctactgttc
ttgaatattcctcccacatgaaattcagattacagttttaattaaagacc
ggatttatggttgcattccaagtattgctattttggggtcactgac
gaattccaggtacttgctgggcagattcttatctggaaagaggaatgggg
atgaagcattcaggtctgtttgacttctcaatgctctatgactcaagttt
gcagtgtcttcagtaacagtaatagaagttctgttaaggactatgtgacc
tgcctcaggtagcgggtgtggaggttctgtcctcaggtaaggccaggcag
agaagaaagaaccctccaggaaaaaggggttctccatttgtgctgagctc
agaggaactatctggatgtagtagactgtgaccacaaatagcagggtttg
tcaatactggccaattgtggatctccatgccatatgctgcaaacaaaaga
ttctatgatgagcattcaggtctgtaatagtttgacttctccatgttata
tgactcagtatgcagtgtcttcagtaacagggtcttaccattacattgta
gaggataatcaagtacattggtaatagcttctgcagttttgggggcttct
ataggacctcattggccaacagctctatcaatagaagcagcccattctca
gcactggggtttgtagtgattagtctctagtgtctagtagcagcattgtt
gccaagttataaggtaactttaccttaaaatatacatatacataaacata
tacacatatatatacacatacatatacacatacatatacacatatacata
tacacatatacatgtgtgtgtatttatgtgtttgtgtatgtgtatccatg
cgtacgtggggaagcgtctacaacagtatattttcatatgactttttgaa
ggtctttagtattatttatccctctctatatctcctccttcaccttgtcc
tcctctcaacccaaaattaacccattctattccacgattcctttttaacc
tttatcacagtgtgctttgcatcctctccttga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr13_20945790_20946906
seq2: B6Ng01-051N10.b_47_1142 (reverse)

seq1  GTCAGTGACCCCAAAATAGCCATTACTCTGAAATGCCACCATAAATCCGC  50
      ||||||||||||||||||| || |||| || ||||| |||||||||||| 
seq2  GTCAGTGACCCCAAAATAG-CAATACT-TGGAATGCAACCATAAATCCGG  48

seq1  TCTTTTATATAAAACTGTATTCTTGAATTTCATGTTGGTAGAATTATTC-  99
      ||||| || |||||||||| || ||||||||||| ||| || | ||||| 
seq2  TCTTTAAT-TAAAACTGTAATC-TGAATTTCATG-TGGGAGGAATATTCA  95

seq1  AGAACAGATAGATGACCCT-CAACTTACAATGGTTAGAGCCCTAAATTTT  148
      ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||
seq2  AGAACAG-TAGATGACCCTCCAACTTACAATGG-TAGAGCCCT-AATTTT  142

seq1  CTACTTCATCATGGTACAAAAGAAAGAAAAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGA  198
      |||| ||||||||||   |||| |||||| |||||       ||| ||||
seq2  CTAC-TCATCATGGT--CAAAGGAAGAAAGAAGAA------GAAGGAAGA  183

seq1  AAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAAATGAAGTCAGCATAA  248
      ||||||| ||||| | |||||   ||||||| |||||||||||||||| |
seq2  AAGAAAG-AAGAACG-AAGAA--GAAGAAAG-AAAATGAAGTCAGCAT-A  227

seq1  ATTGAATTCTAGATCATGAATTTTCATTTATTTCTGTGACTGTATCTCCC  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGAATTCTAGATCATGAATTTTCATTTATTTCTGTGACTGTATCTCCC  277

seq1  AGTCAGCTATGCAATCATGAAAGGAAACAACCTATGCACTACTGTACTTT  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCAGCTATGCAATCATGAAAGGAAACAACCTATGCACTACTGTACTTT  327

seq1  GTTTATAGCAGATGAGTACCTGGTGTTTTCATATCTCCTTATGTCTACGA  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTATAGCAGATGAGTACCTGGTGTTTTCATATCTCCTTATGTCTACGA  377

seq1  AGCACCCATCTTTATGTACACAGGACACTCAGCCCTGAATTATAAATCAG  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCACCCATCTTTATGTACACAGGACACTCAGCCCTGAATTATAAATCAG  427

seq1  GTTTTGGTTTAGACATCTTTGCCCACTGTAGGTACATAACAGTGCCTTGA  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTTGGTTTAGACATCTTTGCCCACTGTAGGTACATAACAGTGCCTTGA  477

seq1  GATGCTTAAAGTGATGAAACTAAGTTAGAATGCTGAGTAGGGTAGGGTAT  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGCTTAAAGTGATGAAACTAAGTTAGAATGCTGAGTAGGGTAGGGTAT  527

seq1  TAGGTCTACTCGCATTACAAGCTCATCCCAACTACCACCTTCTCTATAAA  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGTCTACTCGCATTACAAGCTCATCCCAACTACCACCTTCTCTATAAA  577

seq1  ACACCTTAAAATGTTGACTATCCTCTTAAGCACCATCATAAACTAACTTC  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACCTTAAAATGTTGACTATCCTCTTAAGCACCATCATAAACTAACTTC  627

seq1  TGGTCCTTACAGTGTACTAATGACTGATCCAAGTGTTTCCTATGCATCAA  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTCCTTACAGTGTACTAATGACTGATCCAAGTGTTTCCTATGCATCAA  677

seq1  TTCAGTTAATCATAGGAAGTAGGTATTGTCCACATTTTATAGACTATGAT  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAGTTAATCATAGGAAGTAGGTATTGTCCACATTTTATAGACTATGAT  727

seq1  AGTAATTATATGGATTTCCTTATTAGGATGTAAGTACATGGGGACTGGTT  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTAATTATATGGATTTCCTTATTAGGATGTAAGTACATGGGGACTGGTT  777

seq1  TGGGTGTAAGTGATTGGTGGCGGGGGAATGAGAGAAGGGAGAAGTAAAAT  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGTGTAAGTGATTGGTGGCGGGGGAATGAGAGAAGGGAGAAGTAAAAT  827

seq1  GTGCTGGTCCGAATTGCAAAGACCACAGAGATAGTCTTTAGGGGTGTATT  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCTGGTCCGAATTGCAAAGACCACAGAGATAGTCTTTAGGGGTGTATT  877

seq1  TCATCACCCTTTCTCTTTGCACTCAAAACACCTAACAACTGGCACTTGTG  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATCACCCTTTCTCTTTGCACTCAAAACACCTAACAACTGGCACTTGTG  927

seq1  TGTATGTTTGTGTGTACAAAACCTGCCACTCATGCCACAGCTTACAAACT  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTATGTTTGTGTGTACAAAACCTGCCACTCATGCCACAGCTTACAAACT  977

seq1  AACATTCAACTGTAGCTCTTCCTTCCCCAACTGCACCCTCTGGGATCCTC  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACATTCAACTGTAGCTCTTCCTTCCCCAACTGCACCCTCTGGGATCCTC  1027

seq1  AGTCCAGAAACTCCCAGACCAGTCTCAATTATAACCTCTATAAACGTGCT  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCCAGAAACTCCCAGACCAGTCTCAATTATAACCTCTATAAACGTGCT  1077

seq1  ACAGGCACCTTTTGAATTC  1117
      |||||||||||||||||||
seq2  ACAGGCACCTTTTGAATTC  1096

seq1: chr13_20896549_20897406
seq2: B6Ng01-051N10.g_67_923

seq1  GAATTCCAGGTACTTGCTGGGCAGATTCTTATCTGGAAAGAGGAATGGGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAGGTACTTGCTGGGCAGATTCTTATCTGGAAAGAGGAATGGGG  50

seq1  ATGAAGCATTCAGGTCTGTTTGACTTCTCAATGCTCTATGACTCAAGTTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAAGCATTCAGGTCTGTTTGACTTCTCAATGCTCTATGACTCAAGTTT  100

seq1  GCAGTGTCTTCAGTAACAGTAATAGAAGTTCTGTTAAGGACTATGTGACC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGTGTCTTCAGTAACAGTAATAGAAGTTCTGTTAAGGACTATGTGACC  150

seq1  TGCCTCAGGTAGCGGGTGTGGAGGTTCTGTCCTCAGGTAAGGCCAGGCAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCTCAGGTAGCGGGTGTGGAGGTTCTGTCCTCAGGTAAGGCCAGGCAG  200

seq1  AGAAGAAAGAACCCTCCAGGAAAAAGGGGTTCTCCATTTGTGCTGAGCTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAGAAAGAACCCTCCAGGAAAAAGGGGTTCTCCATTTGTGCTGAGCTC  250

seq1  AGAGGAACTATCTGGATGTAGTAGACTGTGACCACAAATAGCAGGGTTTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGGAACTATCTGGATGTAGTAGACTGTGACCACAAATAGCAGGGTTTG  300

seq1  TCAATACTGGCCAATTGTGGATCTCCATGCCATATGCTGCAAACAAAAGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAATACTGGCCAATTGTGGATCTCCATGCCATATGCTGCAAACAAAAGA  350

seq1  TTCTATGATGAGCATTCAGGTCTGTAATAGTTTGACTTCTCCATGTTATA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTATGATGAGCATTCAGGTCTGTAATAGTTTGACTTCTCCATGTTATA  400

seq1  TGACTCAGTATGCAGTGTCTTCAGTAACAGGGTCTTACCATTACATTGTA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACTCAGTATGCAGTGTCTTCAGTAACAGGGTCTTACCATTACATTGTA  450

seq1  GAGGATAATCAAGTACATTGGTAATAGCTTCTGCAGTTTTGGGGGCTTCT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGATAATCAAGTACATTGGTAATAGCTTCTGCAGTTTTGGGGGCTTCT  500

seq1  ATAGGACCTCATTGGCCAACAGCTCTATCAATAGAAGCAGCCCATTCTCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGGACCTCATTGGCCAACAGCTCTATCAATAGAAGCAGCCCATTCTCA  550

seq1  GCACTGGGGTTTGTAGTGATTAGTCTCTAGTGTCTAGTAGCAGCATTGTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACTGGGGTTTGTAGTGATTAGTCTCTAGTGTCTAGTAGCAGCATTGTT  600

seq1  GCCAAGTTATAAGGTAACTTTACCTTAAAATATACATATACATAAACATA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAAGTTATAAGGTAACTTTACCTTAAAATATACATATACATAAACATA  650

seq1  TACACATATATATACACATACATATACACATACATATACACATATACATA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACACATATATATACACATACATATACACATACATATACACATATACATA  700

seq1  TACACATATACATGTGTGTGTATTTATGTGTTTGTGTATGTGTATCCATG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACACATATACATGTGTGTGTATTTATGTGTTTGTGTATGTGTATCCATG  750

seq1  CATACGTGGGGAAGCTTCTACAACAGTATATTTTCATATGACTTTTTGAA  800
      | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  CGTACGTGGGGAAGCGTCTACAACAGTATATTTTCATATGACTTTTTG-A  799

seq1  AGGTCTTTAGTATTATTTATCCCTCTCTATATCTCCTCCTTCACCTTGTC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTCTTTAGTATTATTTATCCCTCTCTATATCTCCTCCTTCACCTTGTC  849

seq1  CTCCTCTC  858
      ||||||||
seq2  CTCCTCTC  857