BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-063L21
Chromosome13 (Build37)
Map Location 44,178,705 - 44,357,385
singlet/doubletdoublet
Overlap geneA730030A06, EG637868
Upstream genePhactr1, Tbc1d7, Gfod1, Sirt5, Nol7, Ranbp9, LOC637627, Ccdc90a, Rnf182, LOC100039403, Cd83, LOC100039432
Downstream geneEG667157, Jarid2, Dtnbp1, Hsp25-ps1, LOC100039502, LOC667204, LOC100039533
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-063L21.bB6Ng01-063L21.g
ACCDH883742DH883743
length1,080934
definitionDH883742|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-063L21, 5' end.DH883743|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-063L21, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(44,178,705 - 44,179,789)(44,356,448 - 44,357,385)
sequence
gaattccctgtggtgtgatggatggtgcccggtgtagctgaattcccttc
cagaggctcaggacctcctcaagctcacctcggcagacttatgggcatct
gtaacacatgggacatgggaagtctagcacctcttctcaggggactgctg
gctcctgtgaatataactagagccccgaaggcttctcctgttgagaaggt
acaaagattgtcccatggctactacctggatcaggagaatcacctgccac
tatactgaggcttctttcgttctgaaaaatgaatattagataattttctc
tgtatgtgaaaaacaccagtgtcctatgcaagcctaaaatgcacctgtag
atcaccaaacatggccttttaacaccaacaaaacgtatggtaagccgtat
acatacatacatacatacatacatacatacatacatgtgtatgtacatag
gggacatgataaaagaatggttaaatacataaaccagaaacacagtcatt
cactatcatgatcattcacacattgaatgtgatagaatgggcagtgtaat
agatttgtttgcaacagtaccatcacaagcaagcaatacaaggtgttatg
acatcatatcatgacatgaaataatgtgaaatcgatatggattctaataa
actattatcctaagggatccgcactagatattcagttgcttacctacata
gtatgagttgagtactgtacattattttatagttgagacactcaaggcag
ggcgatggtaatgaactcagctacaatgacagacagattatggatttgaa
actagaagtctaatccctgagaccagctcttaacgaccatactgattttc
atgattcattgatgattccaatggaagaggcaaggtgctaaagtgggcac
agcaatcgagggacttatgagtagattactggatggaaggactgttcttg
aaagtgtgaatgaacagtgtttaaagtgacagaaaatataaacagaaatc
aaagactttagagagagtgtagaagagtcaatatcagattattagatgct
gaagaagaaaggtggagaaaagggagattt
gaattctggaaaccgccatttttctcagtacctgctacttctcaaatact
attacagttttctctaggaggggcgggtcacagttttgaagggtatttgc
tgaaaactcaagatagctttatattcagccagctttcttcttgtctaatc
ttacaagagtttgggcaacctagccccagttgacttgaggggcccagaca
ctctgtgttcttcttagcaacatgagacatgttgggttgaacatgaaagg
gggaggggagagatgaaaggtttaacaatatgtgaccctcattcgccaag
cctcaggagcagggcttcttggtgtgggaagctgaaccctgctattctgt
tttctcttggaaaaatatcacacggccaagcttcctatcatacagccaaa
ctttctaggccatttggacctattaaccaaagggagtggagggtaaggcc
ggtgtgtgcgccgtaaagctaaactcctgtgaactgctgtgtttctgcta
gactttgtacagtatcatctaagaggatctgttccttccatctcctcaat
cttcctttgttcctcatcccccacccctctggttagtgctgctcagatct
tcccactcatctcctaatggtgattaggacctaatttatgctggagtcct
tgtgagtctggtttctgcaaaggggactcacggcacatctggaaatggac
acattagatgttctttcatgaaggcctgcagttcagtgaatgccgggaag
ctgagagacaggaggctgccttgtgtatccccgggacttaaaaaaaaaaa
caaactctcctcaagccgggacttctggcagcagcaaaattaataaaatg
acccacctcttccctggccccaggcattaagaactggatctaggagccag
atactgaagggaagcgacaggatgtaatgaaggg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr13_44178705_44179789
seq2: B6Ng01-063L21.b_49_1128

seq1  GAATTCCCTGTGGTGTGATGGATGGTGCCCGGTGTAGCTGAATTCCCTTC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCCTGTGGTGTGATGGATGGTGCCCGGTGTAGCTGAATTCCCTTC  50

seq1  CAGAGGCTCAGGACCTCCTCAAGCTCACCTCGGCAGACTTATGGGCATCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGGCTCAGGACCTCCTCAAGCTCACCTCGGCAGACTTATGGGCATCT  100

seq1  GTAACACATGGGACATGGGAAGTCTAGCACCTCTTCTCAGGGGACTGCTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAACACATGGGACATGGGAAGTCTAGCACCTCTTCTCAGGGGACTGCTG  150

seq1  GCTCCTGTGAATATAACTAGAGCCCCGAAGGCTTCTCCTGTTGAGAAGGT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCCTGTGAATATAACTAGAGCCCCGAAGGCTTCTCCTGTTGAGAAGGT  200

seq1  ACAAAGATTGTCCCATGGCTACTACCTGGATCAGGAGAATCACCTGCCAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAAGATTGTCCCATGGCTACTACCTGGATCAGGAGAATCACCTGCCAC  250

seq1  TATACTGAGGCTTCTTTCGTTCTGAAAAATGAATATTAGATAATTTTCTC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATACTGAGGCTTCTTTCGTTCTGAAAAATGAATATTAGATAATTTTCTC  300

seq1  TGTATGTGAAAAACACCAGTGTCCTATGCAAGCCTAAAATGCACCTGTAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTATGTGAAAAACACCAGTGTCCTATGCAAGCCTAAAATGCACCTGTAG  350

seq1  ATCACCAAACATGGCCTTTTAACACCAACAAAACGTATGGTAAGCCGTAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCACCAAACATGGCCTTTTAACACCAACAAAACGTATGGTAAGCCGTAT  400

seq1  ACATACATACATACATACATACATACATACATACATGTGTATGTACATAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATACATACATACATACATACATACATACATACATGTGTATGTACATAG  450

seq1  GGGACATGATAAAAGAATGGTTAAATACATAAACCAGAAACACAGTCATT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGACATGATAAAAGAATGGTTAAATACATAAACCAGAAACACAGTCATT  500

seq1  CACTATCATGATCATTCACACATTGAATGTGATAGAATGGGCAGTGTAAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTATCATGATCATTCACACATTGAATGTGATAGAATGGGCAGTGTAAT  550

seq1  AGATTTGTTTGCAACAGTACCATCACAAGCAAGCAATACAAGGTGTTATG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATTTGTTTGCAACAGTACCATCACAAGCAAGCAATACAAGGTGTTATG  600

seq1  ACATCATATCATGACATGAAATAATGTGAAATCGATATGGATTCTAATAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATCATATCATGACATGAAATAATGTGAAATCGATATGGATTCTAATAA  650

seq1  ACTATTATCCTAAGGGATCCGCACTAGATATTCAGTTGCTTACCTACATA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTATTATCCTAAGGGATCCGCACTAGATATTCAGTTGCTTACCTACATA  700

seq1  GTATGAGTTGAGTACTGTACATTATTTTATAGTTGAGACACTCAAGGCAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATGAGTTGAGTACTGTACATTATTTTATAGTTGAGACACTCAAGGCAG  750

seq1  GGCGATGGTAATGAACTCAGCTACAATGACAGACAGATTATGGATTTGAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCGATGGTAATGAACTCAGCTACAATGACAGACAGATTATGGATTTGAA  800

seq1  ACTAGAAGTCTAATCCCTGAGACCAGCTCTTAACGACCATACTGATTTTC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTAGAAGTCTAATCCCTGAGACCAGCTCTTAACGACCATACTGATTTTC  850

seq1  ATGATTCATTGATGATTCCAATGGAAGAGGCAAGGTGCTAAAGTGGGCAC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGATTCATTGATGATTCCAATGGAAGAGGCAAGGTGCTAAAGTGGGCAC  900

seq1  AGCAATCGAGGGACTTATGAGGTAGATTACTGGATGGAAGGACTGTTCTT  950
      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAATCGAGGGACTTATGA-GTAGATTACTGGATGGAAGGACTGTTCTT  949

seq1  GAAAGTGTGAATGAACAGTGTTTAAAGTGACAGAAAATATAAACAGAAAT  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAGTGTGAATGAACAGTGTTTAAAGTGACAGAAAATATAAACAGAAAT  999

seq1  CAAAGAACTTTAGAGAAGAGTGTAGAAGAGTCAATATTCAGATTATTAGA  1050
      ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  CAAAG-ACTTTAGAG-AGAGTGTAGAAGAGTCAATA-TCAGATTATTAGA  1046

seq1  TGCTGGAAAGAGAGAGGTGGAGAAAAGGGAGATTT  1085
      |||| |||  ||| |||||||||||||||||||||
seq2  TGCT-GAAGAAGAAAGGTGGAGAAAAGGGAGATTT  1080

seq1: chr13_44356448_44357385
seq2: B6Ng01-063L21.g_68_1001 (reverse)

seq1  CCCTTCATTACATCCTGTCTGCTTCCCTTCAGTCTCTGGCTCCTTGGATC  50
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||
seq2  CCCTTCATTACATCCTGTC-GCTTCCCTTCAGTATCTGGCTCC-TAGATC  48

seq1  CAGTTCTCATGGCCTGGGGCCAGGGAAGAGGTGGGTCATTTTATTAATTT  100
      ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTTCTTAATGCCTGGGGCCAGGGAAGAGGTGGGTCATTTTATTAATTT  98

seq1  TGCTGCTGCCAGAAGTCCCGGCTTTGAGGAGAGTTTTGTTTTTTTTTTTA  150
      |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||
seq2  TGCTGCTGCCAGAAGTCCCGGC-TTGAGGAGAG-TTTGTTTTTTTTTTTA  146

seq1  AGTCCCGGGGATACACAAGGCAGCCTCCTGTCTCTCAGCTTCCCGGCATT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCCCGGGGATACACAAGGCAGCCTCCTGTCTCTCAGCTTCCCGGCATT  196

seq1  CACTGAACTGCAGGCCTTCATGAAAGAACATCTAATGTGTCCATTTCCAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTGAACTGCAGGCCTTCATGAAAGAACATCTAATGTGTCCATTTCCAG  246

seq1  ATGTGCCGTGAGTCCCCTTTGCAGAAACCAGACTCACAAGGACTCCAGCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTGCCGTGAGTCCCCTTTGCAGAAACCAGACTCACAAGGACTCCAGCA  296

seq1  TAAATTAGGTCCTAATCACCATTAGGAGATGAGTGGGAAGATCTGAGCAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAATTAGGTCCTAATCACCATTAGGAGATGAGTGGGAAGATCTGAGCAG  346

seq1  CACTAACCAGAGGGGTGGGGGATGAGGAACAAAGGAAGATTGAGGAGATG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTAACCAGAGGGGTGGGGGATGAGGAACAAAGGAAGATTGAGGAGATG  396

seq1  GAAGGAACAGATCCTCTTAGATGATACTGTACAAAGTCTAGCAGAAACAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGGAACAGATCCTCTTAGATGATACTGTACAAAGTCTAGCAGAAACAC  446

seq1  AGCAGTTCACAGGAGTTTAGCTTTACGGCGCACACACCGGCCTTACCCTC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAGTTCACAGGAGTTTAGCTTTACGGCGCACACACCGGCCTTACCCTC  496

seq1  CACTCCCTTTGGTTAATAGGTCCAAATGGCCTAGAAAGTTTGGCTGTATG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTCCCTTTGGTTAATAGGTCCAAATGGCCTAGAAAGTTTGGCTGTATG  546

seq1  ATAGGAAGCTTGGCCGTGTGATATTTTTCCAAGAGAAAACAGAATAGCAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGGAAGCTTGGCCGTGTGATATTTTTCCAAGAGAAAACAGAATAGCAG  596

seq1  GGTTCAGCTTCCCACACCAAGAAGCCCTGCTCCTGAGGCTTGGCGAATGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTCAGCTTCCCACACCAAGAAGCCCTGCTCCTGAGGCTTGGCGAATGA  646

seq1  GGGTCACATATTGTTAAACCTTTCATCTCTCCCCTCCCCCTTTCATGTTC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTCACATATTGTTAAACCTTTCATCTCTCCCCTCCCCCTTTCATGTTC  696

seq1  AACCCAACATGTCTCATGTTGCTAAGAAGAACACAGAGTGTCTGGGCCCC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCCAACATGTCTCATGTTGCTAAGAAGAACACAGAGTGTCTGGGCCCC  746

seq1  TCAAGTCAACTGGGGCTAGGTTGCCCAAACTCTTGTAAGATTAGACAAGA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAGTCAACTGGGGCTAGGTTGCCCAAACTCTTGTAAGATTAGACAAGA  796

seq1  AGAAAGCTGGCTGAATATAAAGCTATCTTGAGTTTTCAGCAAATACCCTT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAAGCTGGCTGAATATAAAGCTATCTTGAGTTTTCAGCAAATACCCTT  846

seq1  CAAAACTGTGACCCGCCCCTCCTAGAGAAAACTGTAATAGTATTTGAGAA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAACTGTGACCCGCCCCTCCTAGAGAAAACTGTAATAGTATTTGAGAA  896

seq1  GTAGCAGGTACTGAGAAAAATGGCGGTTTCCAGAATTC  938
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGCAGGTACTGAGAAAAATGGCGGTTTCCAGAATTC  934