BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-071P10
Chromosome13 (Build37)
Map Location 101,138,995 - 101,256,414
singlet/doubletdoublet
Overlap geneEG667838, Naip1, Gtf2h2
Upstream geneMrps27, Mtap1b, Cartpt, Mccc2, Bdp1, Serf1, Smn1, Naip2, Birc1-rs1, Naip5, Birc1c-ps1, Birc1f
Downstream geneOcln, LOC667861, Marveld2, Rad17, Taf9, Ccdc125, Cdk7, Mrps36, Cenph, Ccnb1, Slc30a5, LOC619865, LOC619917, EG619937, 4933416M06Rik, LOC100039971, LOC100039983
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-071P10.bB6Ng01-071P10.g
ACCDH889515DH889516
length1,1731,135
definitionDH889515|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-071P10, 5' end.DH889516|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-071P10, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(101,255,217 - 101,256,414)(101,138,995 - 101,140,132)
sequence
gaattcagaactagattcctattttgctgtcaaatatagtttatttttct
tttaaaatgggacatatattctttgaagtattaagggaaccagattatgt
acctatttttggtatacttaatattgaagagcaaaataactctaaatgtt
aaacatgtagtatgtcttattaacgtatagacagtttatagctagatttt
tcaaaaacactatgagaaaagtttcatgtatgttcattattttgttttgc
agttactaattgatattccgtgtatttttatcaagaggaaataatttgtt
atattaaaataatcatttttgtttttactttgagattggaataattgtaa
ctaagagtaaaagagctgaaaaactgactgaactctcaggtatgcataaa
atgtctttacaagactcaaggactttgcttatctaactctgtaaaacctt
cctatgtgcattttaggtgaaacaacataatctcttcctattgaactctt
ggaatctactactaattgtttcaaattgaggtctgaagtagtagatgtac
tggaagtaaatatgcttatttaagtacacattcttcatcctgaaaatatt
aagctagcccaattggtaactaactacaaaatttaattttcaaattaaaa
agtgtctaatttaaaaagcagaaagtataaaagttgaattgggctattta
tgaatgagtcagagcatttgttcttgcagaagacatgagtttggttctca
gcactcacataggggctcctgactgttactccaggtccagggcatctaac
accattctgtgactgcatacatgcagggaaaacagtcagtaggcataaag
tcaatacataaagtaaacaacattaatctcagtttcttttgtctttgtta
tgtatgctgtttcaattgcatcacacttctttttgtaaatagtctattcc
ttaaatgaggttctcaatcttgttatacacataaagagatgactttgttc
actatagttcttgactctgccatagatcaaaataatttgccaaagtattg
ccaagaatagtaaagtagttgggtttctgctgtgaagagacatgttgaca
caataactcttcttaagaacacattatggtcctgcttagttctgtatctc
tatggtagaaatcctggcagctc
gaattcctcagagtccagctgtctctgtgaccctgtgattctgggatcct
gtgatcctgagatcccaggtgtatcagagctcctgggagtaaagctgctt
ccaggagcctgagatcctggtgtgaccaagctcctgggatcctgggatcc
tgtgaccctgtgatcctgggtgtgtttgatcgcctgggtgtcaagcttcc
tctgggtgttgtgggactggctgcagagttcacacccaaagtctgctcag
ggcacctactcatacctgaaggaactcatgcctctggtctgggaaggttc
ctgcatccctggatcctgctagtcccaattacttccagtgttgcgacaga
tgtattctcctcacctctgatcctatgatcctgggcatgttaaagcacct
gggagtggagaatactttgggtgttgtgggactggctgcagagttcatgc
ccaaggtctgtctgctcagggcactggcccagaccagaaggccaaaaaag
attttaacaatctggaaatctgtattttattttagattcatcctctatta
agccatgaggtgacatggaatagtttctacagttttccttagtgctcaca
gggtgttctctgtttagagcaggctggcacttcagtctttttttggcttt
cttcttgacctgatctcttcacctatatcaggaagctgtcagttctgtgt
gcattcatgcttatgaaggtacatgtacatgcacagactcatgcctgtga
aagtcacaggacacacttcactgtttctccctaggtgttaggacggatgt
ctcacttcccagaccaggttgtggaaccccaggatccatgtctctgcctc
cccaacctgagatcacaatagcacaacaatgacagctggtttttgtcaca
tggctcctggagacagaatgcatgctttgtgtttgcaaggaaagcacttt
gtactcattgcccctgccctggcccttagagtcctatatgctcaatgcac
tcagtaagtctctgcccaggaatctgcacttaatttatttgttttatcat
gacaggagcatctggggtaaactaatgacctctgccagctttgctgtggt
acaaatgaacatttgaacagtacacaatattcacc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr13_101255217_101256414
seq2: B6Ng01-071P10.b_43_1215 (reverse)

seq1  GAGCTGCCATGCTTCCTACCATGAAGATACAGAAACTAAGCCAGCACCAA  50
      ||||||||| | || |||||||  |||||||| ||||||| ||| |||| 
seq2  GAGCTGCCAGGATTTCTACCATAGAGATACAG-AACTAAG-CAGGACCA-  47

seq1  TAAATGTTGTTCTTTAGAAGAGTTATTGTGGTCACAATGTCTCTTCACAG  100
        |||| ||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||
seq2  -TAATG-TGTTCTTAAGAAGAGTTATTGT-GTCAACATGTCTCTTCACAG  94

seq1  CAAGAAAACCCCAACTACTGTTAACTAATTTCTTGGC-ATACTTTTGGCA  149
      | |||||  |||||||||  || ||||  |||||||| |||| |||||||
seq2  C-AGAAA--CCCAACTAC--TTTACTA--TTCTTGGCAATAC-TTTGGCA  136

seq1  AATTTATATTTGATTCCTTATGGCCAGAGTCAAGAACTATTAGTGAACAA  199
      || |||| ||||||    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||
seq2  AA-TTAT-TTTGAT---CTATGG-CAGAGTCAAGAACTA-TAGTGAACAA  179

seq1  AGTCATCTCCCTTATGTGTATTAACAAGATTGAGAACCTCATTTAAGGAA  249
      |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCATCT-CTTTATGTGTA-TAACAAGATTGAGAACCTCATTTAAGGAA  227

seq1  TAGACTATTTTACAAAAAGAAAGTGTGATGCAATTTGAAACAGCATACAT  299
      ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  TAGACTA-TTTACAAAAAG-AAGTGTGATGCAA-TTGAAACAGCATACAT  274

seq1  AACAAAGACAAAAGAAACTGAGATTAATGTTGTTTACTTTATGTATTGAC  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAAAGACAAAAGAAACTGAGATTAATGTTGTTTACTTTATGTATTGAC  324

seq1  TTTATGCCTACTGACTGTTTTCCCTGCATGTATGCAGTCACAGAATGGTG  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATGCCTACTGACTGTTTTCCCTGCATGTATGCAGTCACAGAATGGTG  374

seq1  TTAGATGCCCTGGACCTGGAGTAACAGTCAGGAGCCCCTATGTGAGTGCT  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGATGCCCTGGACCTGGAGTAACAGTCAGGAGCCCCTATGTGAGTGCT  424

seq1  GAGAACCAAACTCATGTCTTCTGCAAGAACAAATGCTCTGACTCATTCAT  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAACCAAACTCATGTCTTCTGCAAGAACAAATGCTCTGACTCATTCAT  474

seq1  AAATAGCCCAATTCAACTTTTATACTTTCTGCTTTTTAAATTAGACACTT  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATAGCCCAATTCAACTTTTATACTTTCTGCTTTTTAAATTAGACACTT  524

seq1  TTTAATTTGAAAATTAAATTTTGTAGTTAGTTACCAATTGGGCTAGCTTA  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAATTTGAAAATTAAATTTTGTAGTTAGTTACCAATTGGGCTAGCTTA  574

seq1  ATATTTTCAGGATGAAGAATGTGTACTTAAATAAGCATATTTACTTCCAG  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATTTTCAGGATGAAGAATGTGTACTTAAATAAGCATATTTACTTCCAG  624

seq1  TACATCTACTACTTCAGACCTCAATTTGAAACAATTAGTAGTAGATTCCA  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACATCTACTACTTCAGACCTCAATTTGAAACAATTAGTAGTAGATTCCA  674

seq1  AGAGTTCAATAGGAAGAGATTATGTTGTTTCACCTAAAATGCACATAGGA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGTTCAATAGGAAGAGATTATGTTGTTTCACCTAAAATGCACATAGGA  724

seq1  AGGTTTTACAGAGTTAGATAAGCAAAGTCCTTGAGTCTTGTAAAGACATT  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTTTTACAGAGTTAGATAAGCAAAGTCCTTGAGTCTTGTAAAGACATT  774

seq1  TTATGCATACCTGAGAGTTCAGTCAGTTTTTCAGCTCTTTTACTCTTAGT  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATGCATACCTGAGAGTTCAGTCAGTTTTTCAGCTCTTTTACTCTTAGT  824

seq1  TACAATTATTCCAATCTCAAAGTAAAAACAAAAATGATTATTTTAATATA  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAATTATTCCAATCTCAAAGTAAAAACAAAAATGATTATTTTAATATA  874

seq1  ACAAATTATTTCCTCTTGATAAAAATACACGGAATATCAATTAGTAACTG  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAATTATTTCCTCTTGATAAAAATACACGGAATATCAATTAGTAACTG  924

seq1  CAAAACAAAATAATGAACATACATGAAACTTTTCTCATAGTGTTTTTGAA  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAACAAAATAATGAACATACATGAAACTTTTCTCATAGTGTTTTTGAA  974

seq1  AAATCTAGCTATAAACTGTCTATACGTTAATAAGACATACTACATGTTTA  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATCTAGCTATAAACTGTCTATACGTTAATAAGACATACTACATGTTTA  1024

seq1  ACATTTAGAGTTATTTTGCTCTTCAATATTAAGTATACCAAAAATAGGTA  1099
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATTTAGAGTTATTTTGCTCTTCAATATTAAGTATACCAAAAATAGGTA  1074

seq1  CATAATCTGGTTCCCTTAATACTTCAAAGAATATATGTCCCATTTTAAAA  1149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAATCTGGTTCCCTTAATACTTCAAAGAATATATGTCCCATTTTAAAA  1124

seq1  GAAAAATAAACTATATTTGACAGCAAAATAGGAATCTAGTTCTGAATTC  1198
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAAATAAACTATATTTGACAGCAAAATAGGAATCTAGTTCTGAATTC  1173

seq1: chr13_101138995_101140132
seq2: B6Ng01-071P10.g_71_1205

seq1  GAATTCCTCAGAGTCCAGCTGTCTCTGTGACCCTGTGATTCTGGGATCCT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTCAGAGTCCAGCTGTCTCTGTGACCCTGTGATTCTGGGATCCT  50

seq1  GTGATCCTGAGATCCCAGGTGTATCAGAGCTCCTGGGAGTAAAGCTGCTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGATCCTGAGATCCCAGGTGTATCAGAGCTCCTGGGAGTAAAGCTGCTT  100

seq1  CCAGGAGCCTGAGATCCTGGTGTGACCAAGCTCCTGGGATCCTGGGATCC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGAGCCTGAGATCCTGGTGTGACCAAGCTCCTGGGATCCTGGGATCC  150

seq1  TGTGACCCTGTGATCCTGGGTGTGTTTGATCGCCTGGGTGTCAAGCTTCC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGACCCTGTGATCCTGGGTGTGTTTGATCGCCTGGGTGTCAAGCTTCC  200

seq1  TCTGGGTGTTGTGGGACTGGCTGCAGAGTTCACACCCAAAGTCTGCTCAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGGGTGTTGTGGGACTGGCTGCAGAGTTCACACCCAAAGTCTGCTCAG  250

seq1  GGCACCTACTCATACCTGAAGGAACTCATGCCTCTGGTCTGGGAAGGTTC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCACCTACTCATACCTGAAGGAACTCATGCCTCTGGTCTGGGAAGGTTC  300

seq1  CTGCATCCCTGGATCCTGCTAGTCCCAATTACTTCCAGTGTTGCGACAGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCATCCCTGGATCCTGCTAGTCCCAATTACTTCCAGTGTTGCGACAGA  350

seq1  TGTATTCTCCTCACCTCTGATCCTATGATCCTGGGCATGTTAAAGCACCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTATTCTCCTCACCTCTGATCCTATGATCCTGGGCATGTTAAAGCACCT  400

seq1  GGGAGTGGAGAATACTTTGGGTGTTGTGGGACTGGCTGCAGAGTTCATGC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAGTGGAGAATACTTTGGGTGTTGTGGGACTGGCTGCAGAGTTCATGC  450

seq1  CCAAGGTCTGTCTGCTCAGGGCACTGGCCCAGACCAGAAGGCCAAAAAAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAGGTCTGTCTGCTCAGGGCACTGGCCCAGACCAGAAGGCCAAAAAAG  500

seq1  ATTTTAACAATCTGGAAATCTGTATTTTATTTTAGATTCATCCTCTATTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTAACAATCTGGAAATCTGTATTTTATTTTAGATTCATCCTCTATTA  550

seq1  AGCCATGAGGTGACATGGAATAGTTTCTACAGTTTTCCTTAGTGCTCACA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCATGAGGTGACATGGAATAGTTTCTACAGTTTTCCTTAGTGCTCACA  600

seq1  GGGTGTTCTCTGTTTAGAGCAGGCTGGCACTTCAGTCTTTTTTTGGCTTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTGTTCTCTGTTTAGAGCAGGCTGGCACTTCAGTCTTTTTTTGGCTTT  650

seq1  CTTCTTGACCTGATCTCTTCACCTATATCAGGAAGCTGTCAGTTCTGTGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTTGACCTGATCTCTTCACCTATATCAGGAAGCTGTCAGTTCTGTGT  700

seq1  GCATTCATGCTTATGAAGGTACATGTACATGCACAGACTCATGCCTGTGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATTCATGCTTATGAAGGTACATGTACATGCACAGACTCATGCCTGTGA  750

seq1  AAGTCACAGGACACACTTCACTGTTTCTCCCTAGGTGTTAGGACGGATGT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTCACAGGACACACTTCACTGTTTCTCCCTAGGTGTTAGGACGGATGT  800

seq1  CTCACTTCCCAGACCAGGTTGTGGAACCCCAGGATCCATGTCTCTGCCTC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCACTTCCCAGACCAGGTTGTGGAACCCCAGGATCCATGTCTCTGCCTC  850

seq1  CCCAACCTGAGATCACAATAGCACAACAATGACAGCTGGTTTTTGTCACA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAACCTGAGATCACAATAGCACAACAATGACAGCTGGTTTTTGTCACA  900

seq1  TGGCTCCTGGAGACAGAATGCAATGCTTTGTGTTTGCAAGGAAAGCACTT  950
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCTCCTGGAGACAGAATGC-ATGCTTTGTGTTTGCAAGGAAAGCACTT  949

seq1  TGTACTCATTGCCCCTGCCCTGGCCCTTAGAGTTCCTAATATGCTCAATG  1000
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||
seq2  TGTACTCATTGCCCCTGCCCTGGCCCTTAGAG-TCCT-ATATGCTCAATG  997

seq1  CACTCAGTAAGTCTCTGCCCAGGAATCCTGCACTTAATTTATTTG-TTTA  1049
      |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||
seq2  CACTCAGTAAGTCTCTGCCCAGGAAT-CTGCACTTAATTTATTTGTTTTA  1046

seq1  TCAATGACAGGAGCATCCTGGGTAACACT-ATGGACTCTGCCAGCTTTGC  1098
      || ||||||||||||||  |||||| ||| |||  |||||||||||||||
seq2  TC-ATGACAGGAGCATCTGGGGTAA-ACTAATGACCTCTGCCAGCTTTGC  1094

seq1  TGTGGTAACAATGAACA-TTGAACAGGTCAACAATA-TCACC  1138
      |||||||  |||||||| ||||||| ||  |||||| |||||
seq2  TGTGGTACAAATGAACATTTGAACA-GTACACAATATTCACC  1135