BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-093A12
Chromosome13 (Build37)
Map Location 110,007,792 - 110,114,150
singlet/doubletdoublet
Overlap genePde4d, LOC100040968
Upstream geneLOC668123, LOC621498, Elovl7, LOC668129, LOC100040524, Depdc1b, EG668144, LOC621663
Downstream geneLOC100040577, Rab3c, EG432803
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-093A12.bB6Ng01-093A12.g
ACCDH904632DH904633
length1,181846
definitionDH904632|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-093A12, 5' end.DH904633|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-093A12, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(110,112,958 - 110,114,150)(110,007,792 - 110,008,636)
sequence
gaattcaataaaactaactggtgggtacttttctgtttttcaagaacctg
attccctaccccgagccccagctttaccatataaaaatattagtacattt
aactctgtatgttcttgaatggcatgcagtacctctgcagcctggacttc
aggtcaaccatgatataggcataaaaaagtcctacctcaactttcatggg
aggtgggggaaaaaatgaaacttggccacttgaacatattatgttggaca
tatgcatgtctgttttgacgagaattagtagagttttctaaggtgccaca
gggctgactacttcactcatttacctatagatattagtgaaagctgttta
aacccaggcttcccttatttacaaatggcagcattcacaccacagctatc
gagagtcaacatataaagagctgggaaagttttcccacttgccagtgtaa
actggctgcactttgagcacagctgtttctgcatgagatttttctcttgg
tgggattttgtattgactgtgctcctgtggcatgaatacagtcaatgaaa
gattgtttgggggcttgataagaaaagaggccagaaacaattgctcccac
gggccctacccttccttaataaccaactgctgtctggagtcctgcaaaaa
cccatcatccatcatatcagttgcatacaaagggtctaggactttcttgc
cctgctctttagcctgagaaagacacagacccatctggaaggcatttttt
aagataaaactgacagtaaggagctaggtctcagctgtaaacattagaca
tattgcccacacttctcgatttccactcaccattgagagttggttttcct
gaactgagttctctaaaaagagaacacaagatattttgtctcctgggcta
gctatatatatgtttgcacagtttgccttctgtcttataacactgctaat
aaattagatgcttttttttccattttttataggtatttagctcattacat
ttccaatgctaataccaaaagtccccatacccactaccccaactccccta
cccacccacttcccccttttgtcctggcgttcctttactggggcattaaa
ggttggtgtcaatggcctcctctttcacaggagggcgaatagcaatcttt
tgagatctaatgcactagagtcaagagctcc
gaattccttagcttaaaatgggcagtaatccccaattttaagattagtgc
tctactagtgagtcgcttggggctaatgagcagaagtgagctcccagggg
attctgaatgctagtcttgtgtctcagttgggtcttggagatctctgtgt
gtttaactttgcaaatcaaatttattgatttttttattcataatttatac
acctgtgtttggacttaggatccatttgtaagcaacaatatgatctatcc
tatgttagaatcattgaagccaagacatccataccctcctttgtcatgta
aaggcgtgcctgattctgggaagtgttctcagtgaatgttgaagagaatc
taaggcatgtcatctcttgcagggtgcaaagtcacagagggatagtggtg
tttggttccctaggactctataaacccaaggtgtggggggggcatgggat
cagtcagcagtcagaggctctgtgcaaggagttctgatctcagtgaggcc
taaacaagaacaaggctaaactcaggacataagatcatggatcacccctt
aatatctctgggtgatctgggtatgcaatcatgttccccctcccctcccc
caggtctgtgaaagtcacactcctattgaatctctgtcattatttccagc
cttattgaaacctgactaatgaatcctcaccttcttcttccccctccccc
tcctcctttctcctctctcattcctatcaaggccactggccttctggact
ccctgaagatcttcttctgcctctcagagtaggtcccactcttccctgaa
ctgacgtgtatctctctctctctctctctctctctctctctctctc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr13_110112958_110114150
seq2: B6Ng01-093A12.b_40_1220 (reverse)

seq1  GGAGCTCTTGACTCTAGCTGCA-TATGTATCAAAAGATGGCCTAGTCGGC  49
      ||||||||||||||||| |||| ||  | ||||||||| | ||| ||| |
seq2  GGAGCTCTTGACTCTAG-TGCATTAGATCTCAAAAGATTG-CTATTCGCC  48

seq1  CATCACTGAAAAGAGAGGCCCATTGGACACGCAAACTTTATATGCCCCAG  99
      |  |  || ||||||  | ||||| ||||| ||| ||||| |||||||||
seq2  CTCCTGTG-AAAGAGGAGGCCATT-GACAC-CAACCTTTA-ATGCCCCAG  94

seq1  TACAGGGGAACGCCAGGGCCAAAAAGGGGGAGTGGGTGGGTAGGGGAGTG  149
      || |  ||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||| 
seq2  TAAA--GGAACGCCA-GGACAAAAGGGGGAAGTGGGTGGGTAGGGGAGTT  141

seq1  GGGGTAGGTGGGTATGGGGGACTTTTGGTA-TAGCATTGGAAATGTAAAT  198
      |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||
seq2  GGGGTA-GTGGGTAT-GGGGACTTTTGGTATTAGCATTGGAAATGT-AAT  188

seq1  GAGCTAAATACCTAATAAAAAATGGAAAAAAAAGCATCTAATTTTATTAG  248
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  GAGCTAAATACCT-ATAAAAAATGGAAAAAAAAGCATCTAA-TTTATTAG  236

seq1  CAGTGTTATAAGACAGAAGGCAAACTGTGCAAACATATATATAGCTAGCC  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGTTATAAGACAGAAGGCAAACTGTGCAAACATATATATAGCTAGCC  286

seq1  CAGGAGACAAAATATCTTGTGTTCTCTTTTTAGAGAACTCAGTTCAGGAA  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGAGACAAAATATCTTGTGTTCTCTTTTTAGAGAACTCAGTTCAGGAA  336

seq1  AACCAACTCTCAATGGTGAGTGGAAATCGAGAAGTGTGGGCAATATGTCT  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCAACTCTCAATGGTGAGTGGAAATCGAGAAGTGTGGGCAATATGTCT  386

seq1  AATGTTTACAGCTGAGACCTAGCTCCTTACTGTCAGTTTTATCTTAAAAA  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGTTTACAGCTGAGACCTAGCTCCTTACTGTCAGTTTTATCTTAAAAA  436

seq1  ATGCCTTCCAGATGGGTCTGTGTCTTTCTCAGGCTAAAGAGCAGGGCAAG  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCCTTCCAGATGGGTCTGTGTCTTTCTCAGGCTAAAGAGCAGGGCAAG  486

seq1  AAAGTCCTAGACCCTTTGTATGCAACTGATATGATGGATGATGGGTTTTT  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTCCTAGACCCTTTGTATGCAACTGATATGATGGATGATGGGTTTTT  536

seq1  GCAGGACTCCAGACAGCAGTTGGTTATTAAGGAAGGGTAGGGCCCGTGGG  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGGACTCCAGACAGCAGTTGGTTATTAAGGAAGGGTAGGGCCCGTGGG  586

seq1  AGCAATTGTTTCTGGCCTCTTTTCTTATCAAGCCCCCAAACAATCTTTCA  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAATTGTTTCTGGCCTCTTTTCTTATCAAGCCCCCAAACAATCTTTCA  636

seq1  TTGACTGTATTCATGCCACAGGAGCACAGTCAATACAAAATCCCACCAAG  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGACTGTATTCATGCCACAGGAGCACAGTCAATACAAAATCCCACCAAG  686

seq1  AGAAAAATCTCATGCAGAAACAGCTGTGCTCAAAGTGCAGCCAGTTTACA  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAAAATCTCATGCAGAAACAGCTGTGCTCAAAGTGCAGCCAGTTTACA  736

seq1  CTGGCAAGTGGGAAAACTTTCCCAGCTCTTTATATGTTGACTCTCGATAG  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGCAAGTGGGAAAACTTTCCCAGCTCTTTATATGTTGACTCTCGATAG  786

seq1  CTGTGGTGTGAATGCTGCCATTTGTAAATAAGGGAAGCCTGGGTTTAAAC  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGGTGTGAATGCTGCCATTTGTAAATAAGGGAAGCCTGGGTTTAAAC  836

seq1  AGCTTTCACTAATATCTATAGGTAAATGAGTGAAGTAGTCAGCCCTGTGG  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTTTCACTAATATCTATAGGTAAATGAGTGAAGTAGTCAGCCCTGTGG  886

seq1  CACCTTAGAAAACTCTACTAATTCTCGTCAAAACAGACATGCATATGTCC  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCTTAGAAAACTCTACTAATTCTCGTCAAAACAGACATGCATATGTCC  936

seq1  AACATAATATGTTCAAGTGGCCAAGTTTCATTTTTTCCCCCACCTCCCAT  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACATAATATGTTCAAGTGGCCAAGTTTCATTTTTTCCCCCACCTCCCAT  986

seq1  GAAAGTTGAGGTAGGACTTTTTTATGCCTATATCATGGTTGACCTGAAGT  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAGTTGAGGTAGGACTTTTTTATGCCTATATCATGGTTGACCTGAAGT  1036

seq1  CCAGGCTGCAGAGGTACTGCATGCCATTCAAGAACATACAGAGTTAAATG  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGCTGCAGAGGTACTGCATGCCATTCAAGAACATACAGAGTTAAATG  1086

seq1  TACTAATATTTTTATATGGTAAAGCTGGGGCTCGGGGTAGGGAATCAGGT  1148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTAATATTTTTATATGGTAAAGCTGGGGCTCGGGGTAGGGAATCAGGT  1136

seq1  TCTTGAAAAACAGAAAAGTACCCACCAGTTAGTTTTATTGAATTC  1193
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTGAAAAACAGAAAAGTACCCACCAGTTAGTTTTATTGAATTC  1181

seq1: chr13_110007792_110008636
seq2: B6Ng01-093A12.g_70_915

seq1  GAATTCCTTAGCTTAAAATGGGCAGTAATCCCCAATTTTAAGATTAGTGC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTTAGCTTAAAATGGGCAGTAATCCCCAATTTTAAGATTAGTGC  50

seq1  TCTACTAGTGAGTCGCTTGGGGCTAATGAGCAGAAGTGAGCTCCCAGGGG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTACTAGTGAGTCGCTTGGGGCTAATGAGCAGAAGTGAGCTCCCAGGGG  100

seq1  ATTCTGAATGCTAGTCTTGTGTCTCAGTTGGGTCTTGGAGATCTCTGTGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCTGAATGCTAGTCTTGTGTCTCAGTTGGGTCTTGGAGATCTCTGTGT  150

seq1  GTTTAACTTTGCAAATCAAATTTATTGATTTTTTTATTCATAATTTATAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTAACTTTGCAAATCAAATTTATTGATTTTTTTATTCATAATTTATAC  200

seq1  ACCTGTGTTTGGACTTAGGATCCATTTGTAAGCAACAATATGATCTATCC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTGTGTTTGGACTTAGGATCCATTTGTAAGCAACAATATGATCTATCC  250

seq1  TATGTTAGAATCATTGAAGCCAAGACATCCATACCCTCCTTTGTCATGTA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTTAGAATCATTGAAGCCAAGACATCCATACCCTCCTTTGTCATGTA  300

seq1  AAGGCGTGCCTGATTCTGGGAAGTGTTCTCAGTGAATGTTGAAGAGAATC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGCGTGCCTGATTCTGGGAAGTGTTCTCAGTGAATGTTGAAGAGAATC  350

seq1  TAAGGCATGTCATCTCTTGCAGGGTGCAAAGTCACAGAGGGATAGTGGTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGGCATGTCATCTCTTGCAGGGTGCAAAGTCACAGAGGGATAGTGGTG  400

seq1  TTTGGTTCCCTAGGACTCTATAAACCCAAGGTGTGGGGGGGGCATGGGAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGGTTCCCTAGGACTCTATAAACCCAAGGTGTGGGGGGGGCATGGGAT  450

seq1  CAGTCAGCAGTCAGAGGCTCTGTGCAAGGAGTTCTGATCTCAGTGAGGCC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTCAGCAGTCAGAGGCTCTGTGCAAGGAGTTCTGATCTCAGTGAGGCC  500

seq1  TAAACAAGAACAAGGCTAAACTCAGGACATAAGATCATGGATCACCCCTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAACAAGAACAAGGCTAAACTCAGGACATAAGATCATGGATCACCCCTT  550

seq1  AATATCTCTGGGTGATCTGGGTATGCAATCATGTTCCCCCTCCCCTCCCC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATATCTCTGGGTGATCTGGGTATGCAATCATGTTCCCCCTCCCCTCCCC  600

seq1  CAGGTCTGTGAAAGTCACACTCCTATTGAATCTCTGTCATTATTTCCAGC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGTCTGTGAAAGTCACACTCCTATTGAATCTCTGTCATTATTTCCAGC  650

seq1  CTTATTGAAACCTGACTAATGAATCCTCACCTTCTTCTTCCCCCTCCCCC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTATTGAAACCTGACTAATGAATCCTCACCTTCTTCTTCCCCCTCCCCC  700

seq1  TCCTCCTTTCTCCTCTCTCATTCCTATCAAGGCCACTGGCCTTCTGGACT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTCCTTTCTCCTCTCTCATTCCTATCAAGGCCACTGGCCTTCTGGACT  750

seq1  CCCTGAAGATCTTCTTCTGCCTCTCAGAGTAGGTCCCACTC-TACCTGAA  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||
seq2  CCCTGAAGATCTTCTTCTGCCTCTCAGAGTAGGTCCCACTCTTCCCTGAA  800

seq1  CTGACGTGTATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGACGTGTATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC  846