BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-098P14
Chromosome13 (Build37)
Map Location 11,663,510 - 11,784,350
singlet/doubletdoublet
Overlap geneRyr2
Upstream geneLOC100039648, Zp4
Downstream geneLOC100039678, Mtr, LOC100039826, Actn2, EG432725, Heatr1, LOC546246, Lgals8, LOC100039900, Edaradd, Ero1lb, LOC664862, EG238507
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-098P14.bB6Ng01-098P14.g
ACCDH908901DH908902
length1,037655
definitionDH908901|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-098P14, 5' end.DH908902|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-098P14, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(11,783,316 - 11,784,350)(11,663,510 - 11,664,165)
sequence
gaattcccacataatttgggaatccatttgatcaagtccccaacatcttc
tgttgttcctcatggtctgaaatgttaaatgaagatcttcagcagctgac
acttcccattctgagtcccatgatggaacttgtcaccctgctccattcca
ccccagacgtgaatttttcctgcattcactattttcctgtttgtattgag
ctccatttaatcatgtagtagatgtcagggtcatcggactggcagtcaga
ttagggaagtgcttgtgtttagttatctttattttactttatggtggtcc
tggactataagcttggtgacataaaagaggcctgagccatggaacataag
aggaaagatgggctttagtgtaacatggcagcactgagagcacatggagg
aagatgtgtacaatgtactaggatctagtactatctgacgttttgggcct
tcactgggggccctggtgaggaccactcaggatgaaagtggctactgttg
gactttttagaactgtttctttggggccatagagagggatcagtagttaa
gagcatttgtcctgtccttggaggaactgggttataccaagcagcgtcag
gagctcagtgtctctaagtccagctccagagaatgtgatgccctcttctg
gtcactgtgagtgccatcacacacacactctctctctctctctctctctc
tctctctctctctttctccctctctctctgtaggtgacccctaccttttt
gtgggtacccacagagacacacataaatataaaaatgcatgagaaagagt
taataaattaactgtgaataccaccttagttagtgaccaccttaattaat
gaccatcttaattgctcatgttaaagaatgcatattttagtttgttcatg
tatggaaattgatcacattccatttgtctcaatcttagccctgtgtgctc
tgtgtcactagggtatgttttgggaaaaatcatttgaatgaaagataaac
acttgttttcatagagcttacattaccaagtcaatgt
gaattccacagaaatggaaatatgaaggtcagattcaattggacaaaaga
ggatcatacaaggactgtggtatggagaaagaacccccactcccagcccc
cagtgtgccccagtcaggatgggcttaccgcctgagtgggagatggccca
ctgaagcaggagttggtgactcctactcactgagaagttttccaccagtc
gatgagaaagtattcgcaaggtgctattatactaacaatctatggctctg
aaaggtacttatgaaataagttcaaagatataaagagtaccttggatggt
tgggtaaaaggatggggatggagggaaaagagttggcttgctgtcacaga
cttaaagactgggaaaatgaaacgttcactataagagccaatgtgaaaat
taaacagtgaggtacatagacaacttttggtaatggttgactatattcaa
tcacattgaagtatagacctgggccatatgtttactgtctaaaggctttt
gatgaagataaatcaagaaaaagaacataatggtttaatgcacttaattt
gaaagaaaaagcaagcgcaactatttttaaaaatgtattagtttctacca
cattataaagacatatattctattatgacatttccagaaataccttgttt
ctgtt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr13_11783316_11784350
seq2: B6Ng01-098P14.b_47_1083 (reverse)

seq1  ACATTGACTTGGTAATGTAAGCTCTATGAAAACAAGTGTTTATCTTTCAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATTGACTTGGTAATGTAAGCTCTATGAAAACAAGTGTTTATCTTTCAT  50

seq1  TCAAATGATTTATCCCAAAACATACCCTAGTGACACAGAGCACACAGGGC  100
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAATGATTTTTCCCAAAACATACCCTAGTGACACAGAGCACACAGGGC  100

seq1  TATGAATGGGACAAATGGAATGTGATCAATTTCCATACATGAACAAACTA  150
      || || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGATTGAGACAAATGGAATGTGATCAATTTCCATACATGAACAAACTA  150

seq1  AAATATGCATTCTTTAACATGAGCAATTAAGATGGTCATTAATTAAGGTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATATGCATTCTTTAACATGAGCAATTAAGATGGTCATTAATTAAGGTG  200

seq1  GTCACTAACTAAGGTGGTATTCACAGTT-ATTTATTAACTCTTTCTCATG  249
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  GTCACTAACTAAGGTGGTATTCACAGTTAATTTATTAACTCTTTCTCATG  250

seq1  CATTTTTATATTTATGTGTGTCTCTGTGGGTACCCAC-AAAAGGTAGGGG  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  CATTTTTATATTTATGTGTGTCTCTGTGGGTACCCACAAAAAGGTAGGGG  300

seq1  TCACCTACAGAGAGAGAGGGAGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACCTACAGAGAGAGAGGGAGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG  350

seq1  AGAGAGAGAGTGTGTGTGTGATGGCACTCACAGTGACCAGAAGAGGGCAT  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAGAGAGTGTGTGTGTGATGGCACTCACAGTGACCAGAAGAGGGCAT  400

seq1  CACATTCTCTGGAGCTGGACTTAGAGACACTGAGCTCCTGACGCTGCTTG  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATTCTCTGGAGCTGGACTTAGAGACACTGAGCTCCTGACGCTGCTTG  450

seq1  GTATAACCCAGTTCCTCCAAGGACAGGACAAATGCTCTTAACTACTGATC  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATAACCCAGTTCCTCCAAGGACAGGACAAATGCTCTTAACTACTGATC  500

seq1  CCTCTCTATGGCCCCAAAGAAACAGTTCTAAAAAGTCCAACAGTAGCCAC  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCTCTATGGCCCCAAAGAAACAGTTCTAAAAAGTCCAACAGTAGCCAC  550

seq1  TTTCATCCTGAGTGGTCCTCACCAGGGCCCCCAGTGAAGGCCCAAAACGT  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCATCCTGAGTGGTCCTCACCAGGGCCCCCAGTGAAGGCCCAAAACGT  600

seq1  CAGATAGTACTAGATCCTAGTACATTGTACACATCTTCCTCCATGTGCTC  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGATAGTACTAGATCCTAGTACATTGTACACATCTTCCTCCATGTGCTC  650

seq1  TCAGTGCTGCCATGTTACACTAAAGCCCATCTTTCCTCTTATGTTCCATG  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGTGCTGCCATGTTACACTAAAGCCCATCTTTCCTCTTATGTTCCATG  700

seq1  GCTCAGGCCTCTTTTATGTCACCAAGCTTATAGTCCAGGACCACCATAAA  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCAGGCCTCTTTTATGTCACCAAGCTTATAGTCCAGGACCACCATAAA  750

seq1  GTAAAATAAAGATAACTAAACACAAGCACTTCCCTAATCTGACTGCCAGT  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAAATAAAGATAACTAAACACAAGCACTTCCCTAATCTGACTGCCAGT  800

seq1  CCGATGACCCTGACATCTACTACATGATTAAATGGAGCTCAATACAAACA  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCGATGACCCTGACATCTACTACATGATTAAATGGAGCTCAATACAAACA  850

seq1  GGAAAATAGTGAATGCAGGAAAAATTCACGTCTGGGGTGGAATGGAGCAG  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAAATAGTGAATGCAGGAAAAATTCACGTCTGGGGTGGAATGGAGCAG  900

seq1  GGTGACAAGTTCCATCATGGGACTCAGAATGGGAAGTGTCAGCTGCTGAA  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGACAAGTTCCATCATGGGACTCAGAATGGGAAGTGTCAGCTGCTGAA  950

seq1  GATCTTCATTTAACATTTCAGACCATGAGGAACAACAGAAGATGTTGGGG  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCTTCATTTAACATTTCAGACCATGAGGAACAACAGAAGATGTTGGGG  1000

seq1  ACTTGATCAAATGGATTCCCAAATTATGTGGGAATTC  1035
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTGATCAAATGGATTCCCAAATTATGTGGGAATTC  1037

seq1: chr13_11663510_11664165
seq2: B6Ng01-098P14.g_70_724

seq1  GAATTCCACAGAAATGGAAATATGAAGGTCAGATTCAATTGGACAAAAGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCACAGAAATGGAAATATGAAGGTCAGATTCAATTGGACAAAAGA  50

seq1  GGATCATACAAGGACTGTGGTATGGAGAAAGAACCCCCACTCCCAGCCCC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATCATACAAGGACTGTGGTATGGAGAAAGAACCCCCACTCCCAGCCCC  100

seq1  CAGTGTGCCCCAGTCAGGATGGGCTTACCGCCTGAGTGGGAGATGGCCCA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGTGCCCCAGTCAGGATGGGCTTACCGCCTGAGTGGGAGATGGCCCA  150

seq1  CTGAAGCAGGAGTTGGTGACTCCTACTCACTGAGAAGTTTTCCACCAGTC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAAGCAGGAGTTGGTGACTCCTACTCACTGAGAAGTTTTCCACCAGTC  200

seq1  GATGAGAAAGTATTCGCAAGGTGCTATTATACTAACAATCTATGGCTCTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGAGAAAGTATTCGCAAGGTGCTATTATACTAACAATCTATGGCTCTG  250

seq1  AAAGGTACTTATGAAATAAGTTCAAAGATATAAAGAGTACCTTGGATGGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGGTACTTATGAAATAAGTTCAAAGATATAAAGAGTACCTTGGATGGT  300

seq1  TGGGTAAAAGGATGGGGATGGAGGGAAAAGAGTTGGCTTGCTGTCACAGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGTAAAAGGATGGGGATGGAGGGAAAAGAGTTGGCTTGCTGTCACAGA  350

seq1  CTTAAAGACTGGGAAAATGAAACGTTCACTATAAGAGCCAATGTGAAAAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAAAGACTGGGAAAATGAAACGTTCACTATAAGAGCCAATGTGAAAAT  400

seq1  TAAACAGTGAGGTACATAGACAACTTTTGGTAATGGTTGACTATATTCAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAACAGTGAGGTACATAGACAACTTTTGGTAATGGTTGACTATATTCAA  450

seq1  TCACATTGAAGTATAGACCTGGGCCATATGTTTACTGTCTAAAGGCTTTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACATTGAAGTATAGACCTGGGCCATATGTTTACTGTCTAAAGGCTTTT  500

seq1  GATGAAGATAAATCAAGAAAAAGAACATAATGGTTTAATGCACTTAATTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGAAGATAAATCAAGAAAAAGAACATAATGGTTTAATGCACTTAATTT  550

seq1  GAGAGAAAAAGCAAGCGCAACTATTTTTAAAAATGTATTAGTTTCTACCA  600
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAGAAAAAGCAAGCGCAACTATTTTTAAAAATGTATTAGTTTCTACCA  600

seq1  CATATATAAAGACATATATTCTATTATGACATTTCCAGAAATACCTTGTT  650
      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAT-TATAAAGACATATATTCTATTATGACATTTCCAGAAATACCTTGTT  649

seq1  TCTGTT  656
      ||||||
seq2  TCTGTT  655