BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-134B05
Chromosome13 (Build37)
Map Location 67,721,449 - 67,884,561
singlet/doubletdoublet
Overlap geneA530054K11Rik, LOC328277, 3830402I07Rik, EG666137, Zfp85-rs1
Upstream geneMzf6d, Vmn2r-ps106, LOC666027, LOC100042492, LOC100041947, EG382769, LOC666052, EG432768, LOC666061, Uqcrb, Mterfd1, Ptdss1, Zfp712, Zfp708, Zfp759, Rsl1, LOC674699, Zfp455, Zfp458, Zfp457, A230042K10Rik, E130120F12Rik, Zfp456, 2810487A22Rik, Zfp459, C330011K17Rik, LOC666098, 9630025I21Rik, Zfp817, Zfp87, Zfp748
Downstream geneLOC674597, Zfp273, BC048507, LOC666185, LOC100042687, LOC100042692, LOC674779, LOC677603, LOC100042124, LOC666222, AA414992, LOC666238, EG666245, EG666272, LOC100042223, Mtrr, LOC100042233, Fastkd3, 1700001L19Rik, Adcy2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-134B05.bB6Ng01-134B05.g
ACCDH934463DH934464
length990973
definitionDH934463|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-134B05, 5' end.DH934464|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-134B05, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(67,883,565 - 67,884,561)(67,721,449 - 67,722,390)
sequence
gaattcatcctctttaaagaaagagaatgacataagttccaaaacttaaa
taaaggtaattttatgaaaataaattgtaaaatttaggaattcacaaaaa
tatgtatttagtgtggaatgcttgcatagtacaccacacattgcatgcat
tctcacaggaagaagctatggtgaggagtaccacagtagaatactgtagc
cacagtggagtcggggccatacactggagccctgatttcagtaatgcaca
gagacccagagacagtactagctagttccaaccaccccacctcatttact
gatcctcagtcctgcaaatgcctcaatttcaacttctttttaagtatctt
ctctctctagtttcaccacaaacaggacttgtcctctgaaagtgagccaa
gatgccatagagtttgcaagtgtaccattgctttccagttgtgtagctga
tggctttgggcataggttcatgtcctgaccacacaggctttagagatgga
aggctaactctgattatcagttcttttaggaatatgggggtatatggtgg
attaataagttaaaacttcatagggtcttcttgtctgattgtttctctta
gcctgtttatgaagctgtcattccactgacttagagataaactcctgtca
tggttcatacaagtccttaactacggaactaaaactacacattcttggct
tggtcaggattggcaatggcaccctggcaggaggtgcacctaacactgat
aatgccagagatatgatttgtggtaaacaggcaaggtcgccatttgttac
attctgtttgctttttaaaatcttcatctaattggtcttttatgtgcagt
aacattactttgaatgtacaaatgaaattacacacttggtctataaagtg
ttaaaataaatgagcattggactcatcttgttatccatataagagatacc
ctctataatataaagattcaatatagtctaaatacttacc
gaattctcttgtgtttagaaagtgaggacagagagcggaaggcctttcca
cactctttacatttgtatggtttctctcctgtgtgaattctcttgtgttt
agatagtgatgaaggaaaacagaaggccttcccacatacttcacactgga
atggtttctctcctgtatgaattttcttatggttggaaagtcttgatgga
taataaaaggccttcccacatacttcacacttatagagtttttctcctgt
atgaattgtcctgtgtttagaaagcagtgatgaaacatggaaggccttgc
cacatacttcacacttgtagggcttctctcctgcacaaattctcttatgt
ttagagagtcttgaaggataaatgaaggccttgccacataattcattgtt
ataataattatcttctgtatgaattctcttgtgtttagaaagtgatgaca
gagaacgaaaagccttttgacatacttcacacttgtatggtttctctcct
gtatgcatttttgcatgggtagaaagtcttgagggataatcgaaagcctt
gccacatacttcacacttgtaaggattctcttctgtatgaattatcttgt
gcttagaaaggagtgataaaatgcggaaggccttcccacatacttcacac
ttgaatggtttctctcctgaatggattttcttatggttggaaagtcttga
tggataatggaaggccttgccacatacctcacactttgtagggtttttct
cctctatgaattattttgtgtttagaaagaaatgatgaaatgtggaaggc
cttgccacattcttcacatttgtatggtttctcttcctgaagaattccgc
ttgtgtttagagagtatttgatggtaatggaaggctttgtcacatatttc
actttgaatggtttcttctcctgatgaacctctcttgtgtaaccaaagta
atgatggaaagtggaggccattc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr13_67883565_67884561
seq2: B6Ng01-134B05.b_46_1035 (reverse)

seq1  GGTAAGTATTTTAGACTATATT-AATCTATTATATTTATAGATGGTATAC  49
      |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||| |
seq2  GGTAAGTA-TTTAGACTATATTGAATCT-TTATA-TTATAGAGGGTAT-C  46

seq1  TCTTAATATGTATAACAAGATGAGTCAAATGCTCATTAATTTTTAACAAC  99
      |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||
seq2  TCTT-ATATGGATAACAAGATGAGTCCAATGCTCATTTA-TTTTAAC-AC  93

seq1  TTTATAGACCAAGTGTGTAATTTCATTTGTACATTCAAAGTAATGTTAAC  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  TTTATAGACCAAGTGTGTAATTTCATTTGTACATTCAAAGTAATGTT-AC  142

seq1  TGCACATAAAAGACCAATTAGATGAAGATTTTAAAAAGCAAACAGAATGT  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCACATAAAAGACCAATTAGATGAAGATTTTAAAAAGCAAACAGAATGT  192

seq1  AACAAATGGCGACCTTGCCTGTTTACCACAAATCATATCTCTGGCATTAT  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAAATGGCGACCTTGCCTGTTTACCACAAATCATATCTCTGGCATTAT  242

seq1  CAGTGTTAGGTGCACCTCCTGCCAGGGTGCCATTGCCAATCCTGACCAAG  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGTTAGGTGCACCTCCTGCCAGGGTGCCATTGCCAATCCTGACCAAG  292

seq1  CCAAGAATGTGTAGTTTTAGTTCCGTAGTTAAGGACTTGTATGAACCATG  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAGAATGTGTAGTTTTAGTTCCGTAGTTAAGGACTTGTATGAACCATG  342

seq1  ACAGGAGTTTATCTCTAAGTCAGTGGAATGACAGCTTCATAAACAGGCTA  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGGAGTTTATCTCTAAGTCAGTGGAATGACAGCTTCATAAACAGGCTA  392

seq1  AGAGAAACAATCAGACAAGAAGACCCTATGAAGTTTTAACTTATTAATCC  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAAACAATCAGACAAGAAGACCCTATGAAGTTTTAACTTATTAATCC  442

seq1  ACCATATACCCCCATATTCCTAAAAGAACTGATAATCAGAGTTAGCCTTC  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCATATACCCCCATATTCCTAAAAGAACTGATAATCAGAGTTAGCCTTC  492

seq1  CATCTCTAAAGCCTGTGTGGTCAGGACATGAACCTATGCCCAAAGCCATC  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTCTAAAGCCTGTGTGGTCAGGACATGAACCTATGCCCAAAGCCATC  542

seq1  AGCTACACAACTGGAAAGCAATGGTACACTTGCAAACTCTATGGCATCTT  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTACACAACTGGAAAGCAATGGTACACTTGCAAACTCTATGGCATCTT  592

seq1  GGCTCACTTTCAGAGGACAAGTCCTGTTTGTGGTGAAACTAGAGAGAGAA  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTCACTTTCAGAGGACAAGTCCTGTTTGTGGTGAAACTAGAGAGAGAA  642

seq1  GATACTTAAAAAGAAGTTGAAATTGAGGCATTTGCAGGACTGAGGATCAG  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATACTTAAAAAGAAGTTGAAATTGAGGCATTTGCAGGACTGAGGATCAG  692

seq1  TAAATGAGGTGGGGTGGTTGGAACTAGCTAGTACTGTCTCTGGGTCTCTG  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAATGAGGTGGGGTGGTTGGAACTAGCTAGTACTGTCTCTGGGTCTCTG  742

seq1  TGCATTACTGAAATCAGGGCTCCAGTGTATGGCCCCGACTCCACTGTGGC  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCATTACTGAAATCAGGGCTCCAGTGTATGGCCCCGACTCCACTGTGGC  792

seq1  TACAGTATTCTACTGTGGTACTCCTCACCATAGCTTCTTCCTGTGAGAAT  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAGTATTCTACTGTGGTACTCCTCACCATAGCTTCTTCCTGTGAGAAT  842

seq1  GCATGCAATGTGTGGTGTACTATGCAAGCATTCCACACTAAATACATATT  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATGCAATGTGTGGTGTACTATGCAAGCATTCCACACTAAATACATATT  892

seq1  TTTGTGAATTCCTAAATTTTACAATTTATTTTCATAAAATTACCTTTATT  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTGAATTCCTAAATTTTACAATTTATTTTCATAAAATTACCTTTATT  942

seq1  TAAGTTTTGGAACTTATGTCATTCTCTTTCTTTAAAGAGGATGAATTC  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGTTTTGGAACTTATGTCATTCTCTTTCTTTAAAGAGGATGAATTC  990

seq1: chr13_67721449_67722390
seq2: B6Ng01-134B05.g_68_1011

seq1  GAATTCTCTTGTGTTTAGAAAGTGAGGACAGAGAGCGGAAGGCCTTTCCA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCTTGTGTTTAGAAAGTGAGGACAGAGAGCGGAAGGCCTTTCCA  50

seq1  CACTCTTTACATTTGTATGGTTTCTCTCCTGTGTGAATTCTCTTGTGTTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTCTTTACATTTGTATGGTTTCTCTCCTGTGTGAATTCTCTTGTGTTT  100

seq1  AGATAGTGATGAAGGAAAACAGAAGGCCTTCCCACATACTTCACACTGGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATAGTGATGAAGGAAAACAGAAGGCCTTCCCACATACTTCACACTGGA  150

seq1  ATGGTTTCTCTCCTGTATGAATTTTCTTATGGTTGGAAAGTCTTGATGGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGTTTCTCTCCTGTATGAATTTTCTTATGGTTGGAAAGTCTTGATGGA  200

seq1  TAATAAAAGGCCTTCCCACATACTTCACACTTATAGAGTTTTTCTCCTGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATAAAAGGCCTTCCCACATACTTCACACTTATAGAGTTTTTCTCCTGT  250

seq1  ATGAATTGTCCTGTGTTTAGAAAGCAGTGATGAAACATGGAAGGCCTTGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAATTGTCCTGTGTTTAGAAAGCAGTGATGAAACATGGAAGGCCTTGC  300

seq1  CACATACTTCACACTTGTAGGGCTTCTCTCCTGCACAAATTCTCTTATGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATACTTCACACTTGTAGGGCTTCTCTCCTGCACAAATTCTCTTATGT  350

seq1  TTAGAGAGTCTTGAAGGATAAATGAAGGCCTTGCCACATAATTCATTGTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGAGAGTCTTGAAGGATAAATGAAGGCCTTGCCACATAATTCATTGTT  400

seq1  ATAATAATTATCTTCTGTATGAATTCTCTTGTGTTTAGAAAGTGATGACA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAATAATTATCTTCTGTATGAATTCTCTTGTGTTTAGAAAGTGATGACA  450

seq1  GAGAACGAAAAGCCTTTTGACATACTTCACACTTGTATGGTTTCTCTCCT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAACGAAAAGCCTTTTGACATACTTCACACTTGTATGGTTTCTCTCCT  500

seq1  GTATGCATTTTTGCATGGGTAGAAAGTCTTGAGGGATAATCGAAAGCCTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATGCATTTTTGCATGGGTAGAAAGTCTTGAGGGATAATCGAAAGCCTT  550

seq1  GCCACATACTTCACACTTGTAAGGATTCTCTTCTGTATGAATTATCTTGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCACATACTTCACACTTGTAAGGATTCTCTTCTGTATGAATTATCTTGT  600

seq1  GCTTAGAAAGGAGTGATAAAATGCGGAAGGCCTTCCCACATACTTCACAC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTAGAAAGGAGTGATAAAATGCGGAAGGCCTTCCCACATACTTCACAC  650

seq1  TTGAATGGTTTCTCTCCTGAATGGATTTTCTTATGGTTGGAAAGTCTTGA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAATGGTTTCTCTCCTGAATGGATTTTCTTATGGTTGGAAAGTCTTGA  700

seq1  TGGATAATGGAAGGCCTTGCCACATACCTCACAC-TTGTAGGGTTTTTCT  749
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  TGGATAATGGAAGGCCTTGCCACATACCTCACACTTTGTAGGGTTTTTCT  750

seq1  CCTCTATGAATTATTTTGTGTTTAGAAAGAAATGATGAAATGTGGAAGGC  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCTATGAATTATTTTGTGTTTAGAAAGAAATGATGAAATGTGGAAGGC  800

seq1  CTTGCCACATTCTTCACATTTGTATGGTTTCTC-TCCTGTATGAATT-CG  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||
seq2  CTTGCCACATTCTTCACATTTGTATGGTTTCTCTTCCTG-AAGAATTCCG  849

seq1  CTTGTGTTTAGAGAGTA-TTGATGGATAATGGAAGGCTTTGTCACATATT  896
      ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGTGTTTAGAGAGTATTTGATGG-TAATGGAAGGCTTTGTCACATATT  898

seq1  TCACATTTGTATGGTTTC-TCTCCTGTATGAA-CTCTCTTGTGTACCA  942
      |||| |||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| | 
seq2  TCAC-TTTGAATGGTTTCTTCTCCTG-ATGAACCTCTCTTGTGTAACC  944