BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-134G19
Chromosome13 (Build37)
Map Location 107,998,807 - 108,118,854
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100040350
Upstream geneLOC631097, EG620949, Ipo11, Dimt1, Kif2a, LOC100040322
Downstream geneLOC100040366, Apoo, AI197445, LOC100040820, Zswim6, 3021401N23Rik, 2810008M24Rik, Ndufa12l, Ercc8, LOC668123, LOC621498, Elovl7, LOC668129, LOC100040524, Depdc1b
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-134G19.bB6Ng01-134G19.g
ACCDH934724DH934725
length8601,138
definitionDH934724|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-134G19, 5' end.DH934725|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-134G19, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(108,117,986 - 108,118,854)(107,998,807 - 107,999,941)
sequence
gaattctgagagcaaagtttcaagtctaactctgctaagcctcagactcc
acagttggtttaatgagaggttaggatgctatgactggccagttctggga
tggtatggtctcttgaatcaaagcttgctaacttggcagaaaaaaaaaag
gagtgttcctgggcctcctccaccctggcagctctgcttaaagacacagg
gcatgtaaggtagttttgctcttgataaaatgagcccgagatctataagc
tggcctcagccttttggcgaaaactctgaatatatggtaacctatatcta
tatttttcttcagatacagtgagtcttagaatgtctaccttcttagaaaa
gagtctctctctagagttcacgtaccagcaactacctcttttttcttttc
ctatttttgtttttggttctgtggcgggggctttttgccttttcttaaaa
caataattctcataagagatgtaaatactcttttccctcaataatcttga
ggcatgggttccaggaagctcatgaataccaaaactcatggatgcacatg
tcccttaagacatatctgcatataatctacaaacatcatcctatgttctt
aaaactatctctagattgctgctaatatagatagttggcatatgattttc
tttaggaaataatgacaatgatgaaaagggcttggacacggttcatctag
acctttttctctcaatatctttagtctgtgcttaatggactacgcaggta
caaaacctgtaaatactgaggcccacatctgcatgctgctaccatttcct
catctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctagagt
gtgtgggggg
gaattctccgtggttattaatacccaagttatcatttttgaaggtctcct
ttatcctgcatgaaatcagaacccatttgggacatcagcatccacttaac
acagacgttcttttcccttcaggtctattgatcaggtctatacatatatc
acacaggaagtgtggggattatctggtgataacttgtaggtggctaatta
ctgagagtctattgtagcaaacacatatgtgtacatatttcattaagaat
ggttattgccagaagaatttgatgttattgtgtgtgcatgaatagggaag
tcagataatagtggtccagcccagtttctagtttggttgcctgttatacc
caggaggctatggaaccaatatattcctttggcaagtgaagactcttgtc
tgtgtcttagaaaaatgcaaagtctgtgtgttaaggctcacccaacatct
atgtcgaagcattctttcagaaagtgtctatgtagaactccaataagcaa
cagaagacactgagctgtggccattaaaacagccagcattattgggccat
gcccaacatcctgcctgtagcagattgatccataagtggatgtccttggg
cttggctagtcaaagtcattgtccaggattttggaatctgggattccatg
agtggacctggtaagtcagctgactgaagctgcaaactgtaaagctttga
agttattagtggctatgattattggctcaaggataaaccttccagagaaa
agaataaagtcacagaaaaaagcagagacaggagctgaaggccttatata
gaggatgctgagtcccctgttcccgaagctccaggaatctgcatgtcccg
tggcttgagcaagtccttccaggaagctttcctccacaacctttgcttgc
ttattcgtcagtggctcgagctcaagctcatgggttataactaatgtcgc
agctattttttcacagctcttaaaaatagttgaccggagaagaaagtaca
gcaatggctgcaaaatgggcccgggaaggggcaagccatggtcaaccaat
cattgaatgtgccacttcctggcgatccaaggtgggtggaaaagaatgtg
gggtgaaagccatgcagctggagctttcgagagtcatc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr13_108117986_108118854
seq2: B6Ng01-134G19.b_42_901 (reverse)

seq1  CCCCCCACACACACACACACACAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG  50
      |||||||||||| |          ||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCCCACACACTC---------TAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG  41

seq1  AGAGAGAGAGAGAGAGATGAGGAAATGGTAGCAGCATGCAGATGTGGGCC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAGAGAGAGAGAGATGAGGAAATGGTAGCAGCATGCAGATGTGGGCC  91

seq1  TCAGTATTTACAGGTTTTGTACCTGCGTAGTCCATTAAGCACAGACTAAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGTATTTACAGGTTTTGTACCTGCGTAGTCCATTAAGCACAGACTAAA  141

seq1  GATATTGAGAGAAAAAGGTCTAGATGAACCGTGTCCAAGCCCTTTTCATC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATATTGAGAGAAAAAGGTCTAGATGAACCGTGTCCAAGCCCTTTTCATC  191

seq1  ATTGTCATTATTTCCTAAAGAAAATCATATGCCAACTATCTATATTAGCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGTCATTATTTCCTAAAGAAAATCATATGCCAACTATCTATATTAGCA  241

seq1  GCAATCTAGAGATAGTTTTAAGAACATAGGATGATGTTTGTAGATTATAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAATCTAGAGATAGTTTTAAGAACATAGGATGATGTTTGTAGATTATAT  291

seq1  GCAGATATGTCTTAAGGGACATGTGCATCCATGAGTTTTGGTATTCATGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGATATGTCTTAAGGGACATGTGCATCCATGAGTTTTGGTATTCATGA  341

seq1  GCTTCCTGGAACCCATGCCTCAAGATTATTGAGGGAAAAGAGTATTTACA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTCCTGGAACCCATGCCTCAAGATTATTGAGGGAAAAGAGTATTTACA  391

seq1  TCTCTTATGAGAATTATTGTTTTAAGAAAAGGCAAAAAGCCCCCGCCACA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTTATGAGAATTATTGTTTTAAGAAAAGGCAAAAAGCCCCCGCCACA  441

seq1  GAACCAAAAACAAAAATAGGAAAAGAAAAAAGAGGTAGTTGCTGGTACGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACCAAAAACAAAAATAGGAAAAGAAAAAAGAGGTAGTTGCTGGTACGT  491

seq1  GAACTCTAGAGAGAGACTCTTTTCTAAGAAGGTAGACATTCTAAGACTCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACTCTAGAGAGAGACTCTTTTCTAAGAAGGTAGACATTCTAAGACTCA  541

seq1  CTGTATCTGAAGAAAAATATAGATATAGGTTACCATATATTCAGAGTTTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTATCTGAAGAAAAATATAGATATAGGTTACCATATATTCAGAGTTTT  591

seq1  CGCCAAAAGGCTGAGGCCAGCTTATAGATCTCGGGCTCATTTTATCAAGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGCCAAAAGGCTGAGGCCAGCTTATAGATCTCGGGCTCATTTTATCAAGA  641

seq1  GCAAAACTACCTTACATGCCCTGTGTCTTTAAGCAGAGCTGCCAGGGTGG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAAACTACCTTACATGCCCTGTGTCTTTAAGCAGAGCTGCCAGGGTGG  691

seq1  AGGAGGCCCAGGAACACTCCTTTTTTTTTTCTGCCAAGTTAGCAAGCTTT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAGGCCCAGGAACACTCCTTTTTTTTTTCTGCCAAGTTAGCAAGCTTT  741

seq1  GATTCAAGAGACCATACCATCCCAGAACTGGCCAGTCATAGCATCCTAAC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTCAAGAGACCATACCATCCCAGAACTGGCCAGTCATAGCATCCTAAC  791

seq1  CTCTCATTAAACCAACTGTGGAGTCTGAGGCTTAGCAGAGTTAGACTTGA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTCATTAAACCAACTGTGGAGTCTGAGGCTTAGCAGAGTTAGACTTGA  841

seq1  AACTTTGCTCTCAGAATTC  869
      |||||||||||||||||||
seq2  AACTTTGCTCTCAGAATTC  860

seq1: chr13_107998807_107999941
seq2: B6Ng01-134G19.g_67_1204

seq1  GAATTCTCCGTGGTTATTAATACCCAAGTTATCATTTTTGAAGGTCTCCT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCCGTGGTTATTAATACCCAAGTTATCATTTTTGAAGGTCTCCT  50

seq1  TTATCCTGCATGAAATCAGAACCCATTTGGGACATCAGCATCCACTTAAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATCCTGCATGAAATCAGAACCCATTTGGGACATCAGCATCCACTTAAC  100

seq1  ACAGACGTTCTTTTCCCTTCAGGTCTATTGATCAGGTCTATACATATATC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGACGTTCTTTTCCCTTCAGGTCTATTGATCAGGTCTATACATATATC  150

seq1  ACACAGGAAGTGTGGGGATTATCTGGTGATAACTTGTAGGTGGCTAATTA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACAGGAAGTGTGGGGATTATCTGGTGATAACTTGTAGGTGGCTAATTA  200

seq1  CTGAGAGTCTATTGTAGCAAACACATATGTGTACATATTTCATTAAGAAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAGAGTCTATTGTAGCAAACACATATGTGTACATATTTCATTAAGAAT  250

seq1  GGTTATTGCCAGAAGAATTTGATGTTATTGTGTGTGCATGAATAGGGAAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTATTGCCAGAAGAATTTGATGTTATTGTGTGTGCATGAATAGGGAAG  300

seq1  TCAGATAATAGTGGTCCAGCCCAGTTTCTAGTTTGGTTGCCTGTTATACC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGATAATAGTGGTCCAGCCCAGTTTCTAGTTTGGTTGCCTGTTATACC  350

seq1  CAGGAGGCTATGGAACCAATATATTCCTTTGGCAAGTGAAGACTCTTGTC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGAGGCTATGGAACCAATATATTCCTTTGGCAAGTGAAGACTCTTGTC  400

seq1  TGTGTCTTAGAAAAATGCAAAGTCTGTGTGTTAAGGCTCACCCAACATCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTCTTAGAAAAATGCAAAGTCTGTGTGTTAAGGCTCACCCAACATCT  450

seq1  ATGTCGAAGCATTCTTTCAGAAAGTGTCTATGTAGAACTCCAATAAGCAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTCGAAGCATTCTTTCAGAAAGTGTCTATGTAGAACTCCAATAAGCAA  500

seq1  CAGAAGACACTGAGCTGTGGCCATTAAAACAGCCAGCATTATTGGGCCAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAAGACACTGAGCTGTGGCCATTAAAACAGCCAGCATTATTGGGCCAT  550

seq1  GCCCAACATCCTGCCTGTAGCAGATTGATCCATAAGTGGATGTCCTTGGG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCAACATCCTGCCTGTAGCAGATTGATCCATAAGTGGATGTCCTTGGG  600

seq1  CTTGGCTAGTCAAAGTCATTGTCCAGGATTTTGGAATCTGGGATTCCATG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGGCTAGTCAAAGTCATTGTCCAGGATTTTGGAATCTGGGATTCCATG  650

seq1  AGTGGACCTGGTAAGTCAGCTGACTGAAGCTGCAAACTGTAAAGCTTTGA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGGACCTGGTAAGTCAGCTGACTGAAGCTGCAAACTGTAAAGCTTTGA  700

seq1  AGTTATTAGTGGCTATGATTATTGGCTCAAGGATAAACCTTCCAGAGAAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTATTAGTGGCTATGATTATTGGCTCAAGGATAAACCTTCCAGAGAAA  750

seq1  AGAATAAAGTCACAGAAAAAAGCAGAGACAGGAGCTGAAGGCCTTATATA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAATAAAGTCACAGAAAAAAGCAGAGACAGGAGCTGAAGGCCTTATATA  800

seq1  GAGGATGCTGAGTCCCCTGTTCCCGAAGCTCCAGGAATCTGCATGTCCCG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGATGCTGAGTCCCCTGTTCCCGAAGCTCCAGGAATCTGCATGTCCCG  850

seq1  TGGCTTGAGCAAGTCCTTCCAGGAAGCTTTCCTCCACAACCTTTGCTTGC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCTTGAGCAAGTCCTTCCAGGAAGCTTTCCTCCACAACCTTTGCTTGC  900

seq1  TTATTCGTTCAGTGGCTCGAGCTCAAGCTCAGGGGTTATAACTAATGTCG  950
      ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  TTATTCG-TCAGTGGCTCGAGCTCAAGCTCATGGGTTATAACTAATGTCG  949

seq1  CAGCTA-TTTCTCACAGCCTCTAAAAATAG-TGACGGAAGGAAGAAAGTA  998
      |||||| ||| |||||||   ||||||||| |||| | | ||||||||||
seq2  CAGCTATTTTTTCACAGCTCTTAAAAATAGTTGACCGGA-GAAGAAAGTA  998

seq1  CAGCAATGGCTGCAAAAATGGCCCGGGAAGGGGGCAAGCCATGGCACAGC  1048
      |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||   | |
seq2  CAGCAATGGCTGCAAAATGGGCCCGGGAA-GGGGCAAGCCATGGTCAACC  1047

seq1  AATCATTGAA-GTGCCACTTCCCTGGCGATCAAAGGTTGGTGAGAAAAGG  1097
      |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||| |||||| 
seq2  AATCATTGAATGTGCCACTT-CCTGGCGATCCAAGGTGGGTG-GAAAAGA  1095

seq1  AAGTGGGGGTGAAGAGCCACTGCAGCCTGGA---------AGTCATC  1135
      | || |||||||| ||||| ||||| |||||         |||||||
seq2  ATGT-GGGGTGAA-AGCCA-TGCAG-CTGGAGCTTTCGAGAGTCATC  1138