BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-141I19
Chromosome13 (Build37)
Map Location 32,455,662 - 32,599,580
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneG630018N14Rik, LOC100042491, Foxq1, LOC100041312, Foxf2, Foxc1, 4930548F15Rik, Gmds, LOC666212
Downstream geneWrnip1, Serpinb1a, Serpinb1-ps1, Serpinb1c, Serpinb6b, Serpinb9, Serpinb9b, Serpinb1b, LOC628301, Serpinb9c, Serpinb9d, Serpinb9e, Serpinb9f, OTTMUSG00000000724, Serpinb9g
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-141I19.bB6Ng01-141I19.g
ACCDH939980DH939981
length9491,065
definitionDH939980|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-141I19, 5' end.DH939981|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-141I19, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(32,455,662 - 32,456,526)(32,598,504 - 32,599,580)
sequence
gaattcatagatataaaaggtgaaatgccaggcagtggtggtacaggact
ttaatcccagcacttgggaggcagaggcaaatggatctctgtgagttcaa
ggtcagcctggtctacagagtgagttctaggacaactggggctacacaga
aaaactctgtcttgaaaatataacaaacaaacaaataaatgtatgtgatg
aaaatattcaaagaagagaagttacaaagcattatttgcaacagtataca
ctatacttgccttccctgggcacctgtaaaaagtttatatgaacatctct
aggatccagtataaaccctaaagtgtttaagggaaaaaggaaaaaatgaa
aataggaaattagggagggcagaactgggcagctttggccatgtgtctct
ggctttatagtcaagaggagaaggagattactggaataattaagaagaga
ccagcatcactgagttgaaatcttctgggaagtgttttctcagagcacaa
agaaattgtgttccagagatagtcaaagttgtgccttgtgctgcagctgt
atttggtaatgtataagagtcacccaggtggtactggttttgaaggcatg
aaagggatcatgaagagcagctggggcttggcactttgagaggccatgga
agaccattgggaaatgtgcagcttcaattgtagttgatggtccaggactg
agggggtcatacaaaggagttgaggcttgacatcatgaagagagcctatg
agaggctattggttaagcctagttgcaacagaagaccccagcatattgga
gatgtcactggataaccaccaagaagagcagtggcagtggagtggatcaa
cttgagctacagaggacagagctgaagaagtgacacagccctttggagga
gccagatgatcatgtgtggatcccaggcactgaaacaagaagctgtaac
gaattcacttctcaggaaaagcaagtatactttccaacaaactgacgaga
ggaaagagagaaagagagaacaatagggcatcttcaaagaatatagagag
ctattttatatatataaaatatcatcctcaactctgaatgttttatgtta
aatttgtatacacacacacacatatataacttgttctagataaaggggct
gttcctagatctctgtgagaatattagtaaggctgtcaggcaaaagtatg
gtgtgtatatgtgtgtacacatgttactacagtttgtaacggataaagtg
agaggtgagatcaccaagttagcacagtaaataacagaaaactcagaaag
caatggcaaggtagaatatggggtgctgctataatgtgttaatggagata
gtcatttgggacaaaagtttagttaaaaaagcaactacagagcggccttc
atagactggtgggatgacaggcctgtgggcctgggaagatggttcttcag
ctaaaacactcactgtgcaatggcgaagacagaagtttttatttccagga
accacatgaaggttggacggccacattggccttctactaatcccagcaga
tccatgggaaacaggagaattctctgagcaaactggttagccagaccagc
cagtgtgagcacgagtcactgagagactctgcatcagtgtgtaagataga
gtatgtaacgaaagaagacattcaccatgaacccctgcctccccaggcag
tgtacatacatgtacccacacacttgtagccacatacatgtacccacaca
cttgtagccacatacatgaaaacacatacacatatatgtgctgtgcacta
catgtatgcaaaaataaataaattaagataaaaggatcatgtgtaacaca
gagaatcccaaataaagaggtaaaaacttgtcactgggatgcgagatggc
tccatgggtaaagcacaaactgctcttctgaaagtcctgaattcaacccg
caccacctggtgctcacaacaccctggaatgagatctatgcctcctttcg
gggtgttgagtcagc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr13_32455662_32456526
seq2: B6Ng01-141I19.b_49_913

seq1  GAATTCATAGATATAAAAGGTGAAATGCCAGGCAGTGGTGGTACAGGACT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATAGATATAAAAGGTGAAATGCCAGGCAGTGGTGGTACAGGACT  50

seq1  TTAATCCCAGCACTTGGGAGGCAGAGGCAAATGGATCTCTGTGAGTTCAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATCCCAGCACTTGGGAGGCAGAGGCAAATGGATCTCTGTGAGTTCAA  100

seq1  GGTCAGCCTGGTCTACAGAGTGAGTTCTAGGACAACTGGGGCTACACAGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCAGCCTGGTCTACAGAGTGAGTTCTAGGACAACTGGGGCTACACAGA  150

seq1  AAAACTCTGTCTTGAAAATATAACAAACAAACAAATAAATGTATGTGATG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAACTCTGTCTTGAAAATATAACAAACAAACAAATAAATGTATGTGATG  200

seq1  AAAATATTCAAAGAAGAGAAGTTACAAAGCATTATTTGCAACAGTATACA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATATTCAAAGAAGAGAAGTTACAAAGCATTATTTGCAACAGTATACA  250

seq1  CTATACTTGCCTTCCCTGGGCACCTGTAAAAAGTTTATATGAACATCTCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATACTTGCCTTCCCTGGGCACCTGTAAAAAGTTTATATGAACATCTCT  300

seq1  AGGATCCAGTATAAACCCTAAAGTGTTTAAGGGAAAAAGGAAAAAATGAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGATCCAGTATAAACCCTAAAGTGTTTAAGGGAAAAAGGAAAAAATGAA  350

seq1  AATAGGAAATTAGGGAGGGCAGAACTGGGCAGCTTTGGCCATGTGTCTCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAGGAAATTAGGGAGGGCAGAACTGGGCAGCTTTGGCCATGTGTCTCT  400

seq1  GGCTTTATAGTCAAGAGGAGAAGGAGATTACTGGAATAATTAAGAAGAGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTTTATAGTCAAGAGGAGAAGGAGATTACTGGAATAATTAAGAAGAGA  450

seq1  CCAGCATCACTGAGTTGAAATCTTCTGGGAAGTGTTTTCTCAGAGCACAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGCATCACTGAGTTGAAATCTTCTGGGAAGTGTTTTCTCAGAGCACAA  500

seq1  AGAAATTGTGTTCCAGAGATAGTCAAAGTTGTGCCTTGTGCTGCAGCTGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAATTGTGTTCCAGAGATAGTCAAAGTTGTGCCTTGTGCTGCAGCTGT  550

seq1  ATTTGGTAATGTATAAGAGTCACCCAGGTGGTACTGGTTTTGAAGGCATG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTGGTAATGTATAAGAGTCACCCAGGTGGTACTGGTTTTGAAGGCATG  600

seq1  AAAGGGATCATGAAGAGCAGCTGGGGCTTGGCACTTTGAGAGGCCATGGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGGGATCATGAAGAGCAGCTGGGGCTTGGCACTTTGAGAGGCCATGGA  650

seq1  AGACCATTGGGAAATGTGCAGCTTCAATTGTAGTTGATGGTCCAGGACTG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACCATTGGGAAATGTGCAGCTTCAATTGTAGTTGATGGTCCAGGACTG  700

seq1  AGGGGGTCATACAAAGGAGTTGAGGCTTGACATCATGAAGAGAGCCTATG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGGGTCATACAAAGGAGTTGAGGCTTGACATCATGAAGAGAGCCTATG  750

seq1  AGAGGCTATTGGTTAAGCCTAGTTGCAACAGAAGACCCCAGCATATTGGA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGGCTATTGGTTAAGCCTAGTTGCAACAGAAGACCCCAGCATATTGGA  800

seq1  GATGTCACTGGATAACCACCAAGAAGAGCAGTGGCAGTGGAGTGGATCAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGTCACTGGATAACCACCAAGAAGAGCAGTGGCAGTGGAGTGGATCAA  850

seq1  CTTGAGCTACAGAGG  865
      |||||||||||||||
seq2  CTTGAGCTACAGAGG  865

seq1: chr13_32598504_32599580
seq2: B6Ng01-141I19.g_67_1131 (reverse)

seq1  GCTGACTTCAAACACCCCAGAAGAAGGCATTAGATCTCATTACAGGTGGT  50
      |||||||   ||||||||  ||| ||||| ||||||||||| ||||  ||
seq2  GCTGACT--CAACACCCCGAAAGGAGGCA-TAGATCTCATTCCAGGGTGT  47

seq1  TGTGAGCCACCATGTGGTTGCTGAGATTTGAATTCAGGACCTTCAGGAGA  100
      |||||| ||||| ||||    || |  ||||||||||||| ||||| |||
seq2  TGTGAG-CACCAGGTGG----TGCGGGTTGAATTCAGGACTTTCAGAAGA  92

seq1  GCAGTCTGTGCTCTTACCCACTGAGCCATCTCGCCATCCCAGTGACAAGT  150
      ||||| |||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| 
seq2  GCAGTTTGTGCT-TTACCCATGGAGCCATCTCG-CATCCCAGTGACAAG-  139

seq1  TTTTTACCTCTTTATTTGGGATTCTCTGTGTTACACATGATCCTTTTATC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTACCTCTTTATTTGGGATTCTCTGTGTTACACATGATCCTTTTATC  189

seq1  TTTATTTATTTATTTTTTGCATACATGTAGTGCACAGCACATATATGTGT  250
      || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATTTATTTA-TTTTTGCATACATGTAGTGCACAGCACATATATGTGT  238

seq1  ATGTGTTTTCATGTATGTGGCTACAAGTGTGTGGGTACATGTATGTGGCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTGTTTTCATGTATGTGGCTACAAGTGTGTGGGTACATGTATGTGGCT  288

seq1  ACAAGTGTGTGGGTACATGTATGTACACTGCCTGGGGAGGCAGGGGTTCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAGTGTGTGGGTACATGTATGTACACTGCCTGGGGAGGCAGGGGTTCA  338

seq1  TGGTGAATGTCTTCTTTCGTTACATACTCTATCTTACACACTGATGCAGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTGAATGTCTTCTTTCGTTACATACTCTATCTTACACACTGATGCAGA  388

seq1  GTCTCTCAGTGACTCGTGCTCACACTGGCTGGTCTGGCTAACCAGTTTGC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTCTCAGTGACTCGTGCTCACACTGGCTGGTCTGGCTAACCAGTTTGC  438

seq1  TCAGAGAATTCTCCTGTTTCCCATGGATCTGCTGGGATTAGTAGAAGGCC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGAGAATTCTCCTGTTTCCCATGGATCTGCTGGGATTAGTAGAAGGCC  488

seq1  AATGTGGCCGTCCAACCTTCATGTGGTTCCTGGAAATAAAAACTTCTGTC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGTGGCCGTCCAACCTTCATGTGGTTCCTGGAAATAAAAACTTCTGTC  538

seq1  TTCGCCATTGCACAGTGAGTGTTTTAGCTGAAGAACCATCTTCCCAGGCC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCGCCATTGCACAGTGAGTGTTTTAGCTGAAGAACCATCTTCCCAGGCC  588

seq1  CACAGGCCTGTCATCCCACCAGTCTATGAAGGCCGCTCTGTAGTTGCTTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGGCCTGTCATCCCACCAGTCTATGAAGGCCGCTCTGTAGTTGCTTT  638

seq1  TTTAACTAAACTTTTGTCCCAAATGACTATCTCCATTAACACATTATAGC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAACTAAACTTTTGTCCCAAATGACTATCTCCATTAACACATTATAGC  688

seq1  AGCACCCCATATTCTACCTTGCCATTGCTTTCTGAGTTTTCTGTTATTTA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCACCCCATATTCTACCTTGCCATTGCTTTCTGAGTTTTCTGTTATTTA  738

seq1  CTGTGCTAACTTGGTGATCTCACCTCTCACTTTATCCGTTACAAACTGTA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGCTAACTTGGTGATCTCACCTCTCACTTTATCCGTTACAAACTGTA  788

seq1  GTAACATGTGTACACACATATACACACCATACTTTTGCCTGACAGCCTTA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAACATGTGTACACACATATACACACCATACTTTTGCCTGACAGCCTTA  838

seq1  CTAATATTCTCACAGAGATCTAGGAACAGCCCCTTTATCTAGAACAAGTT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAATATTCTCACAGAGATCTAGGAACAGCCCCTTTATCTAGAACAAGTT  888

seq1  ATATATGTGTGTGTGTGTATACAAATTTAACATAAAACATTCAGAGTTGA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATATGTGTGTGTGTGTATACAAATTTAACATAAAACATTCAGAGTTGA  938

seq1  GGATGATATTTTATATATATAAAATAGCTCTCTATATTCTTTGAAGATGC  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATGATATTTTATATATATAAAATAGCTCTCTATATTCTTTGAAGATGC  988

seq1  CCTATTGTTCTCTCTTTCTCTCTTTCCTCTCGTCAGTTTGTTGGAAAGTA  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTATTGTTCTCTCTTTCTCTCTTTCCTCTCGTCAGTTTGTTGGAAAGTA  1038

seq1  TACTTGCTTTTCCTGAGAAGTGAATTC  1077
      |||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTTGCTTTTCCTGAGAAGTGAATTC  1065