BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-151N06
Chromosome13 (Build37)
Map Location 112,995,707 - 113,124,503
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100041161, LOC100041175, Ankrd55
Upstream gene4732495G21Rik, LOC100040640, EG621953, Gpbp1, LOC100040666, Mier3, Map3k1, LOC668181, LOC100040716
Downstream geneLOC100040725, Il6st, Il31ra, LOC100041240, Ddx4, 9130023D20Rik, Ppap2a, LOC100041282, Skiv2l2, Dhx29, LOC667756, Ccnu, EG622408, EG622422, 2310016C16Rik, Cdc20b, Gzma, 1700084D21Rik, Gzmk, Esm1, BC067074
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-151N06.bB6Ng01-151N06.g
ACCDH947551DH947552
length1,157849
definitionDH947551|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-151N06, 5' end.DH947552|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-151N06, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(112,995,707 - 112,996,870)(113,123,647 - 113,124,503)
sequence
gaattcacccagcagagtctagttgcagaggctagaccttcaactgctct
gcaccatctcttctacctatcctgggctctgattgcacaaacaacaccag
tgacccacaggcccagggcctgggtgaggagacagaaagtccccaggcca
gtagatctgagttacatatccatctcatgggaatgcaagagccccaaacg
agccttcctctgctcagttaacaaaacttctccaagttgaatgaacagca
aggaaggaaatggatgtctgagagctgagcccttgtctcaagatcctgat
agcttagctgggtccaggaccttggctttgtcaggagacctctctgagcc
tccttccttcctaaagaggaaggtagcctgggcaagcatgtcaggtgacc
tctctgagcctccttctttcctaaagaggagggtagcctgggcaagcttg
tcaggagacctctctgagcctccttccatcctaaagaggagggtagcctg
ggctagcttgtcaggagacctctctgagcctccttccatcctaaagagga
gggtagcctgggcaagcttgtcaggagacctctctgagcctccttccttc
ctaaagaggagggtatcctgggctagcttgtcaggagacctctctgagcc
tccttccttcctaaagaggagggtagcctgggcaagcatctctctttctc
ggctgtacatcagaaactcttgaggagctttgacaaaaagccagtagcaa
agccttccccattcctgcttaggaccatggaaggtcatggaaggtcagga
tttattgtaggaaacaaagcatcttttaccctcttgcacagagataacaa
tttcatgggacaggagaaaaaatgacaagagaaactctaaccaatacata
tttttaaaaaactacactcccttatatgtgtatggcttctatacatgtgg
ggcttaaggaaccaagagctaaaaatagcaggagaagaaatgaggctatt
ttgacacccacaaacattcttttctacatgttctccaagcagtataagac
ctatttacatagcattacatggtataggtagtaaaatatattataagtac
tatggaatctagagaatgaatatgtataccggagttatgggtgggctatt
aaaaata
gaattccagattcattcctttgtctgataggtagtcattataaaaataat
tgaattggggtgacgctttccgtttctgtaattgtctcgcctctgggtct
atttccgttctggctgctttatggatgggagtgagactgttgcctctctg
tgtccctctctagtggtcgcttgtaatctctagcgtccatttggtttgca
gtgggtgtcgacatgggagtcaagagatgagctaaggcagtggttctcaa
ctttcctcacgctgtgaccctcctgttgtgctgacccccaaccgtaaact
tgtttttgttgccacttcataactgtatatctgctactattatgaatggt
aatgtaaatattggatatggaggatatctgatatgcgatccccaaggggt
cacggcccacaggttgagaagctgcttagctggagccagtgttgctctct
cagctagccccaaggtaaatgtctcctctgcactcagacaggttttccct
tgtggatgcattggaatggctcccaggaaagtgaggcgcagggaagactg
gaataagggtaaacagagaaagagcccatgtcacagcctgggtggcccca
agattgtgagatgaatccctgtcaccatgggcttctcacattctttctcg
atgcaatccctggctctggggttgaccttcgaagatgacattaaccaagt
gtccacacgtaggatttggtggtcagtgggaggaacaatcagattagctt
ctggcaatgaatgattccttgacccctttagatgaagggtgggaaaattt
ctgtttttttttttgagaatgaagttttgttttgtttgtttgtttgttt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr13_112995707_112996870
seq2: B6Ng01-151N06.b_42_1198

seq1  GAATTCACCCAGCAGAGTCTAGTTGCAGAGGCTAGACCTTCAACTGCTCT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACCCAGCAGAGTCTAGTTGCAGAGGCTAGACCTTCAACTGCTCT  50

seq1  GCACCATCTCTTCTACCTATCCTGGGCTCTGATTGCACAAACAACACCAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACCATCTCTTCTACCTATCCTGGGCTCTGATTGCACAAACAACACCAG  100

seq1  TGACCCACAGGCCCAGGGCCTGGGTGAGGAGACAGAAAGTCCCCAGGCCA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACCCACAGGCCCAGGGCCTGGGTGAGGAGACAGAAAGTCCCCAGGCCA  150

seq1  GTAGATCTGAGTTACATATCCATCTCATGGGAATGCAAGAGCCCCAAACG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGATCTGAGTTACATATCCATCTCATGGGAATGCAAGAGCCCCAAACG  200

seq1  AGCCTTCCTCTGCTCAGTTAACAAAACTTCTCCAAGTTGAATGAACAGCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCTTCCTCTGCTCAGTTAACAAAACTTCTCCAAGTTGAATGAACAGCA  250

seq1  AGGAAGGAAATGGATGTCTGAGAGCTGAGCCCTTGTCTCAAGATCCTGAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAAGGAAATGGATGTCTGAGAGCTGAGCCCTTGTCTCAAGATCCTGAT  300

seq1  AGCTTAGCTGGGTCCAGGACCTTGGCTTTGTCAGGAGACCTCTCTGAGCC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTTAGCTGGGTCCAGGACCTTGGCTTTGTCAGGAGACCTCTCTGAGCC  350

seq1  TCCTTCCTTCCTAAAGAGGAAGGTAGCCTGGGCAAGCATGTCAGGTGACC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTTCCTTCCTAAAGAGGAAGGTAGCCTGGGCAAGCATGTCAGGTGACC  400

seq1  TCTCTGAGCCTCCTTCTTTCCTAAAGAGGAGGGTAGCCTGGGCAAGCTTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTGAGCCTCCTTCTTTCCTAAAGAGGAGGGTAGCCTGGGCAAGCTTG  450

seq1  TCAGGAGACCTCTCTGAGCCTCCTTCCATCCTAAAGAGGAGGGTAGCCTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGGAGACCTCTCTGAGCCTCCTTCCATCCTAAAGAGGAGGGTAGCCTG  500

seq1  GGCTAGCTTGTCAGGAGACCTCTCTGAGCCTCCTTCCATCCTAAAGAGGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTAGCTTGTCAGGAGACCTCTCTGAGCCTCCTTCCATCCTAAAGAGGA  550

seq1  GGGTAGCCTGGGCAAGCTTGTCAGGAGACCTCTCTGAGCCTCCTTCCTTC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTAGCCTGGGCAAGCTTGTCAGGAGACCTCTCTGAGCCTCCTTCCTTC  600

seq1  CTAAAGAGGAGGGTATCCTGGGCTAGCTTGTCAGGAGACCTCTCTGAGCC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAAGAGGAGGGTATCCTGGGCTAGCTTGTCAGGAGACCTCTCTGAGCC  650

seq1  TCCTTCCTTCCTAAAGAGGAGGGTAGCCTGGGCAAGCATCTCTCTTTCTC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTTCCTTCCTAAAGAGGAGGGTAGCCTGGGCAAGCATCTCTCTTTCTC  700

seq1  GGCTGTACATCAGAAACTCTTGAGGAGCTTTGACAAAAAGCCAGTAGCAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTGTACATCAGAAACTCTTGAGGAGCTTTGACAAAAAGCCAGTAGCAA  750

seq1  AGCCTTCCCCATTCCTGCTTAGGACCATGGAAGGTCATGGAAGGTCAGGA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCTTCCCCATTCCTGCTTAGGACCATGGAAGGTCATGGAAGGTCAGGA  800

seq1  TTTATTGTAGGAAACAAAGCATCTTTTACCCTCTTGCACAGAGATAACAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATTGTAGGAAACAAAGCATCTTTTACCCTCTTGCACAGAGATAACAA  850

seq1  TTTCATGGGACAGGAGAAAAAATGACAAGAGAAACTCTAACCAATACATA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCATGGGACAGGAGAAAAAATGACAAGAGAAACTCTAACCAATACATA  900

seq1  TTTTTAAAAAAACTACACTCCCTTATATGTGTATGGCTTCTATACATGT-  949
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  TTTTT-AAAAAACTACACTCCCTTATATGTGTATGGCTTCTATACATGTG  949

seq1  GGGCTTAAGGAACCAAGAGCTAAAAATAGCAGGAGAGAAAATGAGGCTAT  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||
seq2  GGGCTTAAGGAACCAAGAGCTAAAAATAGCAGGAGAAGAAATGAGGCTAT  999

seq1  ATTGAACACCCACAAACATTCTTTCTTACCATTGTTCTCCAAGCAGTATA  1049
       ||| |||||||||||||||||||  |||   ||||||||||||||||||
seq2  TTTG-ACACCCACAAACATTCTTTTCTAC--ATGTTCTCCAAGCAGTATA  1046

seq1  AGACCTATTTACATAGCATTTACATGGTATAGGTAGTAAAAATATATTAT  1099
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  AGACCTATTTACATAGCA-TTACATGGTATAGGTAGT-AAAATATATTAT  1094

seq1  AAAGGTAACTAT-GAATCTAGAG-ATGATTATGTATACAGGAAGTTAT-G  1146
      ||  || ||||| |||||||||| |||| ||||||||| || |||||| |
seq2  AA--GT-ACTATGGAATCTAGAGAATGAATATGTATACCGG-AGTTATGG  1140

seq1  GTTGGCTATATAAAAATA  1164
      || |||||| ||||||||
seq2  GTGGGCTAT-TAAAAATA  1157

seq1: chr13_113123647_113124503
seq2: B6Ng01-151N06.g_69_917 (reverse)

seq1  AAACAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACTTACATTCTCAAAAAAAAAAA  50
      |||| |||||||   |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||
seq2  AAAC-AAACAAA--CAAACAAAACAAAACTT-CATTCTC-AAAAAAAAAA  45

seq1  ACAGAAAAATTTTCCCACCCCTTCATCTAAAGGGGTCAAGGAATCATTCA  100
      ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAG--AAATTTTCCCA-CCCTTCATCTAAAGGGGTCAAGGAATCATTCA  92

seq1  TTGCCAGAAGCTAATCTGATTTGTTCCTCCCACTGACCACCAAATCCTAC  150
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCCAGAAGCTAATCTGA-TTGTTCCTCCCACTGACCACCAAATCCTAC  141

seq1  GTGTGGACACTTGGTTAATGTCATCTTCGAAGGTCAACCCCAGAGCCAGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGGACACTTGGTTAATGTCATCTTCGAAGGTCAACCCCAGAGCCAGG  191

seq1  GATTGCATCGAGAAAGAATGTGAGAAGCCCATGGTGACAGGGATTCATCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTGCATCGAGAAAGAATGTGAGAAGCCCATGGTGACAGGGATTCATCT  241

seq1  CACAATCTTGGGGCCACCCAGGCTGTGACATGGGCTCTTTCTCTGTTTAC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAATCTTGGGGCCACCCAGGCTGTGACATGGGCTCTTTCTCTGTTTAC  291

seq1  CCTTATTCCAGTCTTCCCTGCGCCTCACTTTCCTGGGAGCCATTCCAATG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTATTCCAGTCTTCCCTGCGCCTCACTTTCCTGGGAGCCATTCCAATG  341

seq1  CATCCACAAGGGAAAACCTGTCTGAGTGCAGAGGAGACATTTACCTTGGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCCACAAGGGAAAACCTGTCTGAGTGCAGAGGAGACATTTACCTTGGG  391

seq1  GCTAGCTGAGAGAGCAACACTGGCTCCAGCTAAGCAGC-TCTCAACCTGT  449
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  GCTAGCTGAGAGAGCAACACTGGCTCCAGCTAAGCAGCTTCTCAACCTGT  441

seq1  GGGCCGTGACCCCTTGGGGATCGCATATCAGATATCCTCCATATCCAATA  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCCGTGACCCCTTGGGGATCGCATATCAGATATCCTCCATATCCAATA  491

seq1  TTTACATTACCATTCATAATAGTAGCAGATATACAGTTATGAAGTGGCAA  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTACATTACCATTCATAATAGTAGCAGATATACAGTTATGAAGTGGCAA  541

seq1  CAAAAACAAGTTTACGGTTGGGGGTCAGCACAACAGGAGGGTCACAGCGT  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAAACAAGTTTACGGTTGGGGGTCAGCACAACAGGAGGGTCACAGCGT  591

seq1  GAGGAAAGTTGAGAACCACTGCCTTAGCTCATCTCTTGACTCCCATGTCG  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGAAAGTTGAGAACCACTGCCTTAGCTCATCTCTTGACTCCCATGTCG  641

seq1  ACACCCACTGCAAACCAAATGGACGCTAGAGATTACAAGCGACCACTAGA  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACCCACTGCAAACCAAATGGACGCTAGAGATTACAAGCGACCACTAGA  691

seq1  GAGGGACACAGAGAGGCAACAGTCTCACTCCCATCCATAAAGCAGCCAGA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGGACACAGAGAGGCAACAGTCTCACTCCCATCCATAAAGCAGCCAGA  741

seq1  ACGGAAATAGACCCAGAGGCGAGACAATTACAGAAACGGAAAGCGTCACC  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGGAAATAGACCCAGAGGCGAGACAATTACAGAAACGGAAAGCGTCACC  791

seq1  CCAATTCAATTATTTTTATAATGACTACCTATCAGACAAAGGAATGAATC  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAATTCAATTATTTTTATAATGACTACCTATCAGACAAAGGAATGAATC  841

seq1  TGGAATTC  857
      ||||||||
seq2  TGGAATTC  849