BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-151P10
Chromosome13 (Build37)
Map Location 116,039,713 - 116,185,975
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneNdufs4, LOC100040958, Fst, 4930467J12Rik, Mocs2, Itga2, LOC100040975, Itga1, Pelo
Downstream geneLOC100041023, LOC547402, LOC100041045, EG623174, Isl1, EG668276, Gm280
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-151P10.bB6Ng01-151P10.g
ACCDH947655DH947656
length1,2121,143
definitionDH947655|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-151P10, 5' end.DH947656|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-151P10, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(116,039,713 - 116,040,953)(116,184,826 - 116,185,975)
sequence
gaattctagagctggaaacaatgccaatataaaatgttttaagtaagcat
ttggatactaataaaattttaagataagtaaatgaatatcaaccaatgaa
attagtacaatatgtgggccctatatagtatagataatactttctggaac
aatgcttaatttcccttgagttttgttggttaaattggtgtgggaatgtc
aagtgtaagcatcttccagaacgcgagtggatgatgtaataacaacagca
atgtattgttgtgcacttctatcagtcaataccattggactatggagtgt
agtagggtggggaccttgtccacttactcatactcatgctcagctaatca
aagaaggccttcggcttaggctcagaagatctattagtaaattatgttac
acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacatatct
taatataaaagttcaaaggataaactaatatatcccactggagtactgaa
cagttgatcacttaaaattgtaaaattaatttaatatattttataagaag
ttattgttcctttaaaattatgtttgttttcaataggtacatgtgtgtgt
tttcatgagcaatgtacataaaccatgtacatatgagagcccatggaggc
cagaagagggcatcagcactctgacatgggagtaacagagaattgtgagc
cactgtgtgggtgctaagaactgaacagagttcctgtctaagagcagtaa
gggctcctaactgctgggtcatctctccagctccaaggcattattgtttt
ttaagaatggatggtttgctgccaataaatcgtataggagtcaactgtcc
tactatgattttgacagtttgtgattgcaagtcctgtctgtccttagtta
ccaatcattactttgggaaagctccatttgctcacatgttattctgtttt
ctatatttttcacacaggaaatctactagaatcacaggaatagtctcatt
agctacacatcagtatattttatttaaatttatatttttatttaaatttg
gggggcactctgagtatacatgattctgtctcaaaaggaaaacaaaccag
cattttattttatgaaattgactcttagtttaaaagccttaggctctggc
ttaatagatgtaagttccaattcgactccatgtaagtctgtagtacaaaa
tgaagaaatttg
gaattcaaggtgaatttctcatttcaaacaagatactgggatttttttta
acatggacttaaataataaataaaggtcaaagcctgggaggcaaaaaaga
gaagaataattaatgaaaaggtagtcatggcaatacacatatggaaggat
agagaaaataagaggaaagaaaaggagtattagggacacatctgtgggga
attatagtgtattagaatttggagagcatggaaaatatttaaaaattgga
aagaggaaaaagtacgaaagagaaagaatgtgccattatttattagagtt
ccaagatttgttatacagagtaaaacttctttattaaactcagagatggt
gaccataagagtcccttgacatgtaattcttaaatgtaacatgcctagtt
tatggtcgtatggatacataacatcaagatgtatatacacaaagtatcac
atacacactgaagcatgcccttccttctactgtaattccagagttgctat
aataagaaataaaaataaaagacttgagagtcgatttcagtcaaaggcag
ctaagacacgatttagatcaaactctcaaagcgcgaggatgcacaaccac
agaatgctttgctatgaatgtaaaatgccgtccttgtctttctccaatac
agacaccctaaggtcctgagttttttgttcttctcagtgccaacaatcta
ttgggtactggaaaaacaggctgaataatagaaagtgtttggacataagt
atagacatttttaaaccacattaacgacagagtctatcttttatgactaa
acacattaaatgttagacattggtaagttttaatcttaataatgcttgac
aagctataaaatttgaagtttgaatacttcattctggtgatgagatagtc
gagactaaagcggagagtttccatgtggttttgtattctctgtcttcttg
tcatagatgaacatagatggcttgacagtgatgtcattatcatctccaca
gacaggccttaacataagggagatgctgagcacacttagattaaactctg
tagcttctccaccatttataatcgagtcttctaacgtagcagcaggtgca
tcttattccagacatatgaattcaatggtagaccagcttctga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr13_116039713_116040953
seq2: B6Ng01-151P10.b_46_1257

seq1  GAATTCTAGAGCTGGAAACAATGCCAATATAAAATGTTTTAAGTAAGCAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTAGAGCTGGAAACAATGCCAATATAAAATGTTTTAAGTAAGCAT  50

seq1  TTGGATACTAATAAAATTTTAAGATAAGTAAATGAATATCAACCAATGAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGATACTAATAAAATTTTAAGATAAGTAAATGAATATCAACCAATGAA  100

seq1  ATTAGTACAATATGTGGGCCCTATATAGTATAGATAATACTTTCTGGAAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAGTACAATATGTGGGCCCTATATAGTATAGATAATACTTTCTGGAAC  150

seq1  AATGCTTAATTTCCCTTGAGTTTTGTTGGTTAAATTGGTGTGGGAATGTC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGCTTAATTTCCCTTGAGTTTTGTTGGTTAAATTGGTGTGGGAATGTC  200

seq1  AAGTGTAAGCATCTTCCAGAACGCGAGTGGATGATGTAATAACAACAGCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTGTAAGCATCTTCCAGAACGCGAGTGGATGATGTAATAACAACAGCA  250

seq1  ATGTATTGTTGTGCACTTCTATCAGTCAATACCATTGGACTATGGAGTGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTATTGTTGTGCACTTCTATCAGTCAATACCATTGGACTATGGAGTGT  300

seq1  AGTAGGGTGGGGACCTTGTCCACTTACTCATACTCATGCTCAGCTAATCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTAGGGTGGGGACCTTGTCCACTTACTCATACTCATGCTCAGCTAATCA  350

seq1  AAGAAGGCCTTCGGCTTAGGCTCAGAAGATCTATTAGTAAATTATGTTAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAAGGCCTTCGGCTTAGGCTCAGAAGATCTATTAGTAAATTATGTTAC  400

seq1  ACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACATATCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACATATCT  450

seq1  TAATATAAAAGTTCAAAGGATAAACTAATATATCCCACTGGAGTACTGAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATATAAAAGTTCAAAGGATAAACTAATATATCCCACTGGAGTACTGAA  500

seq1  CAGTTGATCACTTAAAATTGTAAAATTAATTTAATATATTTTATAAGAAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTTGATCACTTAAAATTGTAAAATTAATTTAATATATTTTATAAGAAG  550

seq1  TTATTGTTCCTTTAAAATTATGTTTGTTTTCAATAGGTACATGTGTGTGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTGTTCCTTTAAAATTATGTTTGTTTTCAATAGGTACATGTGTGTGT  600

seq1  TTTCATGAGCAATGTACATAAACCATGTACATATGAGAGCCCATGGAGGC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCATGAGCAATGTACATAAACCATGTACATATGAGAGCCCATGGAGGC  650

seq1  CAGAAGAGGGCATCAGCACTCTGACATGGGAGTAACAGAGAATTGTGAGC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAAGAGGGCATCAGCACTCTGACATGGGAGTAACAGAGAATTGTGAGC  700

seq1  CACTGTGTGGGTGCTAAGAACTGAACAGAGTTCCTGTCTAAGAGCAGTAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTGTGTGGGTGCTAAGAACTGAACAGAGTTCCTGTCTAAGAGCAGTAA  750

seq1  GGGCTCCTAACTGCTGGGTCATCTCTCCAGCTCCAAGGCATTATTGTTTT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCTCCTAACTGCTGGGTCATCTCTCCAGCTCCAAGGCATTATTGTTTT  800

seq1  TTAAGAATGGATGGTTTGCTGCCAATAAATCGTATAGGAGTCAACTGTCC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAGAATGGATGGTTTGCTGCCAATAAATCGTATAGGAGTCAACTGTCC  850

seq1  TACTATGATTTTGACAGTTTGTGATTGCAAGTCCTGTCTGTCCTTAGTTA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTATGATTTTGACAGTTTGTGATTGCAAGTCCTGTCTGTCCTTAGTTA  900

seq1  CCAATCATTACTTTGGGAAAGCTCCATTTGCTCACATGTTATTCTGTTTT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAATCATTACTTTGGGAAAGCTCCATTTGCTCACATGTTATTCTGTTTT  950

seq1  CTATTATTTTTCACACAGGAAATCTTAACTAGAATCAACAGGGAATAGTC  1000
      ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||
seq2  CTA-TATTTTTCACACAGGAAATCT--ACTAGAATC-ACA-GGAATAGTC  995

seq1  TCATTAAGCTACCACATCAGTATAATTTTTATTTAAATTTATAATTTTTA  1050
      ||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||
seq2  TCATT-AGCTA-CACATCAGTATA--TTTTATTTAAATTTAT-ATTTTTA  1040

seq1  TTTAAATTTGGGGGGCACTCTGAGGTATACATGATTCTGTCTCAAAAGGA  1100
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAAATTTGGGGGGCACTCTGA-GTATACATGATTCTGTCTCAAAAGGA  1089

seq1  AAACAAAACAAGGCATTTTTATTTTTAATGAAAATGACTCTTCATGTTAT  1150
      ||||||| ||  ||| |||||||||  |||||| ||||||||   ||| |
seq2  AAACAAACCA--GCA-TTTTATTTT--ATGAAATTGACTCTT--AGTT-T  1131

seq1  AAAAGCTTTA-GCTCTTGGGCTATATTAAGTATGTTAGTTCCACTATTCG  1199
      |||||| ||| |||||  |||| || ||   |||| |||||||  |||||
seq2  AAAAGCCTTAGGCTCT--GGCT-TAATA--GATGTAAGTTCCA--ATTCG  1174

seq1  ACTCCATGTGAAAAGTCTGGAATACAAAATGAAGTAAATTTG  1241
      |||||||||   ||||||| | |||||||||||| |||||||
seq2  ACTCCATGT---AAGTCTGTAGTACAAAATGAAG-AAATTTG  1212

seq1: chr13_116184826_116185975
seq2: B6Ng01-151P10.g_68_1210 (reverse)

seq1  TCAG-AGCTGGTCTACCCACTGGATTCTATATGTCTTGAAATAAGATGCA  49
      |||| |||||||||| ||| || |||| ||||||| || |||||||||||
seq2  TCAGAAGCTGGTCTA-CCATTGAATTC-ATATGTC-TGGAATAAGATGCA  47

seq1  CCTGCTGCTAAGGTTAGAGGACTTCGATTTATAATGGTGGGAGAAAGCCT  99
      ||||||||| | |||||| ||| ||||||   |||||| ||||||   ||
seq2  CCTGCTGCT-ACGTTAGAAGAC-TCGATTATAAATGGT-GGAGAA--GCT  92

seq1  ACAGAGTTTAATCTAAGTGGTGGCTCAGCATCTCCCCTATGTTTAAGGCC  149
      |||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||| ||||||||
seq2  ACAGAGTTTAATCTAAGTG--TGCTCAGCATCTCCCTTATG-TTAAGGCC  139

seq1  TGTCTGT-GAGATGATATTGACATCACTGTC-AGCCATCTATGTTCATCT  197
      ||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  TGTCTGTGGAGATGATAATGACATCACTGTCAAGCCATCTATGTTCATCT  189

seq1  ATGACAAGAAGACAGAGAATACAAAACCACATGGAAACTCTCCGC-TTAG  246
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  ATGACAAGAAGACAGAGAATACAAAACCACATGGAAACTCTCCGCTTTAG  239

seq1  TCTCGACTATCTCATCACCAGAATGAAGTATTCAAACTTC-AATTTTATA  295
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  TCTCGACTATCTCATCACCAGAATGAAGTATTCAAACTTCAAATTTTATA  289

seq1  GGCTTGTCAGGCATTATTAAGATTAAAACTTACCAATGTCTAACATTTAA  345
       |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  -GCTTGTCAAGCATTATTAAGATTAAAACTTACCAATGTCTAACATTTAA  338

seq1  TGTGTTTAGTCATAAAAGATAGACTCTGTCGTTAATGTGGTTTAAAAATG  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTTTAGTCATAAAAGATAGACTCTGTCGTTAATGTGGTTTAAAAATG  388

seq1  TCTATACTTATGTCCAAACACTTTCTATTATTCAGCCTGTTTTTCCAGTA  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTATACTTATGTCCAAACACTTTCTATTATTCAGCCTGTTTTTCCAGTA  438

seq1  CCCAATAGATTGTTGGCACTGAGAAGAACAAAAAACTCAGGACCTTAGGG  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAATAGATTGTTGGCACTGAGAAGAACAAAAAACTCAGGACCTTAGGG  488

seq1  TGTCTGTATTGGAGAAAGACAAGGACGGCATTTTACATTCATAGCAAAGC  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTGTATTGGAGAAAGACAAGGACGGCATTTTACATTCATAGCAAAGC  538

seq1  ATTCTGTGGTTGTGCATCCTCGCGCTTTGAGAGTTTGATCTAAATCGTGT  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCTGTGGTTGTGCATCCTCGCGCTTTGAGAGTTTGATCTAAATCGTGT  588

seq1  CTTAGCTGCCTTTGACTGAAATCGACTCTCAAGTCTTTTATTTTTATTTC  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAGCTGCCTTTGACTGAAATCGACTCTCAAGTCTTTTATTTTTATTTC  638

seq1  TTATTATAGCAACTCTGGAATTACAGTAGAAGGAAGGGCATGCTTCAGTG  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTATAGCAACTCTGGAATTACAGTAGAAGGAAGGGCATGCTTCAGTG  688

seq1  TGTATGTGATACTTTGTGTATATACATCTTGATGTTATGTATCCATACGA  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTATGTGATACTTTGTGTATATACATCTTGATGTTATGTATCCATACGA  738

seq1  CCATAAACTAGGCATGTTACATTTAAGAATTACATGTCAAGGGACTCTTA  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATAAACTAGGCATGTTACATTTAAGAATTACATGTCAAGGGACTCTTA  788

seq1  TGGTCACCATCTCTGAGTTTAATAAAGAAGTTTTACTCTGTATAACAAAT  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTCACCATCTCTGAGTTTAATAAAGAAGTTTTACTCTGTATAACAAAT  838

seq1  CTTGGAACTCTAATAAATAATGGCACATTCTTTCTCTTTCGTACTTTTTC  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGGAACTCTAATAAATAATGGCACATTCTTTCTCTTTCGTACTTTTTC  888

seq1  CTCTTTCCAATTTTTAAATATTTTCCATGCTCTCCAAATTCTAATACACT  945
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTTTCCAATTTTTAAATATTTTCCATGCTCTCCAAATTCTAATACACT  938

seq1  ATAATTCCCCACAGATGTGTCCCTAATACTCCTTTTCTTTCCTCTTATTT  995
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAATTCCCCACAGATGTGTCCCTAATACTCCTTTTCTTTCCTCTTATTT  988

seq1  TCTCTATCCTTCCATATGTGTATTGCCATGACTACCTTTTCATTAATTAT  1045
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTATCCTTCCATATGTGTATTGCCATGACTACCTTTTCATTAATTAT  1038

seq1  TCTTCTCTTTTTTGCCTCCCAGGCTTTGACCTTTATTTATTATTTAAGTC  1095
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTCTCTTTTTTGCCTCCCAGGCTTTGACCTTTATTTATTATTTAAGTC  1088

seq1  CATGTTAAAAAAAATCCCAGTATCTTGTTTGAAATGAGAAATTCACCTTG  1145
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGTTAAAAAAAATCCCAGTATCTTGTTTGAAATGAGAAATTCACCTTG  1138

seq1  AATTC  1150
      |||||
seq2  AATTC  1143