BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-152E15
Chromosome13 (Build37)
Map Location 69,935,503 - 69,965,800
singlet/doubletdoublet
Overlap geneMed10
Upstream geneAdcy2, LOC666205, LOC218332, Pols, A530095I07Rik, Srd5a1, Nsun2, LOC100042260, 3110006E14Rik, 4930547H16Rik
Downstream geneEG620143, LOC100042291, 4930520P13Rik, EG633042, BC018507, EG620473, Adamts16
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-152E15.bB6Ng01-152E15.g
ACCDH947899DH947900
length9711,133
definitionDH947899|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-152E15, 5' end.DH947900|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-152E15, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(69,935,503 - 69,936,477)(69,964,665 - 69,965,800)
sequence
gaattctcttcacaatgattcatagatgccatggagacagggagaggcag
gggtaccaaccagattgttcaagtcttctaatggagactggaacctctgc
tcatcacttgcacaacctgggaaatcctatctgcccctttccccagccct
gcttgtacagagaaaactcctgagtttgctcagagaaaactcctagctaa
catgccatcacttctagtctccatgtttgcggcaacccagccaagagtgc
ctacccaggggcttggtttttgacagtgtatggagacgtcccagctccta
gctggcagatccatctttccttgcctaagctcgtaaaatctccttggtaa
atatcctggatgtgtgacttcacagaccttcacctggatcagtgaaccca
cccaagagcaacctcctaataaacttgctttgatctacgttaaatctggt
ctaatctggtctatatctgtgtcaccaagggagataaaatgtctgtcaga
ggcctctaagttttagagttcagtgtgaaggtcctacagatgcatatgca
gaaagtggccactgggaactaagtgcttgaaattcagggaagcctcagac
tttaacagacctcagctgcttcttctatcttactggatttgaggccgcag
caacaggggcaaatgagctagggagctgcccaggcccccagactggctcc
ttccaatgctacatcagcagtaggaagcccactgggtgcctcccctggag
tcaatatcaaaccagtgtctatttcagccttgtgggtggggcagtctaca
cacactcatctacacagttgctacaggaactctggggactggaacttgaa
cttctggcctctgcatggtagaagagacatgatggtttggatatctgctt
caaggtatcatcttgggtctgtttcttcatttctttatggggtggaatgg
ttacataaaagcgggttcatc
gaattcctttgcttttgaacactcactcatgagatttatccaaaacaaca
gattcaccagataggcagccagagaaaggggactgggcaagtggacccct
tccctggtagctggcattgtgggaatcttcagagctcatctcctggaggt
gaaggacactggtgaatttgaatcccaagtgttacatacaaagggcaggt
ctcagtagccaccccacagtgaaggagtgaaaggccagaaaacagtcgca
ggacctcaaaggtacagtctgctttatgccaagggataactcagactttc
agtggcttatgtagcccagaccctatagatagctcgtgaaccttcatctg
tctggcatgcatactttatatgactgtattattaattagttatcaatgca
caaaatgatgtgagaaacaggaagcagaaaatatatatgtgaaaacattg
gacagagttaaacacagcaacactgtaggaaagtatgaaggagagcctgt
cacgctaacattcatctctaatctgtaagtcacggtcttaacctttctgc
tttaagtagtaggagaaagaaaatatatttttcttacacatgtcacagct
acgtgtgggatactggccatacacgcagcttcaaactcattatacacacc
aaatccatgaaccaacgaatgtggaaaccaactctctgctgtaaaatact
cttgcaaactatttaataataaacgacatttttatggtcacaaaatgtat
tctaacaataatatcccccactgtgagaagcagccaccacgcttcagaaa
caatgctctccatgtttgagatttggttgcccagaacgaagtattttccc
ttttgtggctggaattctgatacagcagccagggtggacagggagcatgt
gagatcagaagtaaacactggtccaaagggaactgagagcgggctcccct
ctgtgctgcctcagccaggtttcatttcaccaggattaatgagaaggcat
tcctcgttaatatcaagggcttccttccctaagtcgcacgaactcagcac
acctcagcactggtgctcattacgtctgccatacacttgaagtgggtggg
ctcaggtaagcatggcctcccagagagtcttga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr13_69935503_69936477
seq2: B6Ng01-152E15.b_47_1017

seq1  GAATTCTCTTCACAATGATTCATAGATGCCATGGAGACAGGGAGAGGCAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCTTCACAATGATTCATAGATGCCATGGAGACAGGGAGAGGCAG  50

seq1  GGGTACCAACCAGATTGTTCAAGTCTTCTAATGGAGACTGGAACCTCTGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTACCAACCAGATTGTTCAAGTCTTCTAATGGAGACTGGAACCTCTGC  100

seq1  TCATCACTTGCACAACCTGGGAAATCCTATCTGCCCCTTTCCCCAGCCCT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATCACTTGCACAACCTGGGAAATCCTATCTGCCCCTTTCCCCAGCCCT  150

seq1  GCTTGTACAGAGAAAACTCCTGAGTTTGCTCAGAGAAAACTCCTAGCTAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTGTACAGAGAAAACTCCTGAGTTTGCTCAGAGAAAACTCCTAGCTAA  200

seq1  CATGCCATCACTTCTAGTCTCCATGTTTGCGGCAACCCAGCCAAGAGTGC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGCCATCACTTCTAGTCTCCATGTTTGCGGCAACCCAGCCAAGAGTGC  250

seq1  CTACCCAGGGGCTTGGTTTTTGACAGTGTATGGAGACGTCCCAGCTCCTA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACCCAGGGGCTTGGTTTTTGACAGTGTATGGAGACGTCCCAGCTCCTA  300

seq1  GCTGGCAGATCCATCTTTCCTTGCCTAAGCTCGTAAAATCTCCTTGGTAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGGCAGATCCATCTTTCCTTGCCTAAGCTCGTAAAATCTCCTTGGTAA  350

seq1  ATATCCTGGATGTGTGACTTCACAGACCTTCACCTGGATCAGTGAACCCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATCCTGGATGTGTGACTTCACAGACCTTCACCTGGATCAGTGAACCCA  400

seq1  CCCAAGAGCAACCTCCTAATAAACTTGCTTTGATCTACGTTAAATCTGGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAAGAGCAACCTCCTAATAAACTTGCTTTGATCTACGTTAAATCTGGT  450

seq1  CTAATCTGGTCTATATCTGTGTCACCAAGGGAGATAAAATGTCTGTCAGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAATCTGGTCTATATCTGTGTCACCAAGGGAGATAAAATGTCTGTCAGA  500

seq1  GGCCTCTAAGTTTTAGAGTTCAGTGTGAAGGTCCTACAGATGCATATGCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCTCTAAGTTTTAGAGTTCAGTGTGAAGGTCCTACAGATGCATATGCA  550

seq1  GAAAGTGGCCACTGGGAACTAAGTGCTTGAAATTCAGGGAAGCCTCAGAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAGTGGCCACTGGGAACTAAGTGCTTGAAATTCAGGGAAGCCTCAGAC  600

seq1  TTTAACAGACCTCAGCTGCTTCTTCTATCTTACTGGATTTGAGGCCGCAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAACAGACCTCAGCTGCTTCTTCTATCTTACTGGATTTGAGGCCGCAG  650

seq1  CAACAGGGGCAAATGAGCTAGGGAGCTGCCCAGGCCCCCAGACTGGCTCC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACAGGGGCAAATGAGCTAGGGAGCTGCCCAGGCCCCCAGACTGGCTCC  700

seq1  TTCCAATGCTACATCAGCAGTAGGAAGCCCACTGGGTGCCTCCCCTGGAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCAATGCTACATCAGCAGTAGGAAGCCCACTGGGTGCCTCCCCTGGAG  750

seq1  TCAATATCAAACCAGTGTCTATTTCAGCCTTGTGGGTGGGGCAGTCTACA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAATATCAAACCAGTGTCTATTTCAGCCTTGTGGGTGGGGCAGTCTACA  800

seq1  CACACTCATCTACACAGTTGCTACAGGAACTCTGGGGACTGGAACTTGAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACTCATCTACACAGTTGCTACAGGAACTCTGGGGACTGGAACTTGAA  850

seq1  CTTCTGGCCTCTGCATGGTAGAAGAGACAATGATGGTTTGGATTATCTGC  900
      |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||
seq2  CTTCTGGCCTCTGCATGGTAGAAGAGAC-ATGATGGTTTGGA-TATCTGC  898

seq1  TTCAAGGTATCCATCTTGGTTCTGTTTCTTCATTTCTTTATGGTGTGCAT  950
      |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | 
seq2  TTCAAGGTAT-CATCTTGGGTCTGTTTCTTCATTTCTTTATGGGGTGGAA  947

seq1  TGGTTACATAAAAGCGGGTTTCATC  975
      |||||||||||||||||| ||||||
seq2  TGGTTACATAAAAGCGGG-TTCATC  971

seq1: chr13_69964665_69965800
seq2: B6Ng01-152E15.g_69_1201 (reverse)

seq1  TCAAGACTCTCTGGGAGGGCATGGCATAACCCTGAGCCCACCAAC-TCAA  49
      |||||||||||||||||| ||| || ||  |||||||||||| || ||||
seq2  TCAAGACTCTCTGGGAGGCCAT-GCTTA--CCTGAGCCCACCCACTTCAA  47

seq1  GTGATTGACAGACGTTAATGAGCA-CAGTGCTGAGTGTTTGCTGAGTCTG  98
      |||  || |||||| ||||||||| |||||||||| || ||||||||  |
seq2  GTGTATGGCAGACG-TAATGAGCACCAGTGCTGAG-GTGTGCTGAGTTCG  95

seq1  TGCGACTTTGGGAAGGAAGCCCTTGATATTTACCGGGGAATGCCCTCTCA  148
      |||||||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||||| |||||
seq2  TGCGACTTAGGGAAGGAAGCCCTTGATA-TTAACGAGGAATGCCTTCTCA  144

seq1  TTAATCCT-GTGAAATGAAACCTGGCTGAGGCAGCACAGA-GGGAGCCCG  196
      |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  TTAATCCTGGTGAAATGAAACCTGGCTGAGGCAGCACAGAGGGGAGCCCG  194

seq1  CTCTCAGTTCCCTTTGGACCAGTGTTTACTTCTGATCTCACATGCTCCCT  246
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTCAGTTCCCTTTGGACCAGTGTTTACTTCTGATCTCACATGCTCCCT  244

seq1  GTCCACCCTGGCTGCTGTTATCAGAATTCCAGCCACAAAAGGGAAAATAC  296
      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCACCCTGGCTGCTG-TATCAGAATTCCAGCCACAAAAGGGAAAATAC  293

seq1  TTCGTTCTGGGCAACCAAATCTCAAACATGGAGAGCATTGTTTCTGAAGC  346
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCGTTCTGGGCAACCAAATCTCAAACATGGAGAGCATTGTTTCTGAAGC  343

seq1  GTGGTGGCTGCTTCTCACAGTGGGGGATATTATTGTTAGAATACATTTTG  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGTGGCTGCTTCTCACAGTGGGGGATATTATTGTTAGAATACATTTTG  393

seq1  TGACCATAAAAATGTCGTTTATTATTAAATAGTTTGCAAGAGTATTTTAC  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACCATAAAAATGTCGTTTATTATTAAATAGTTTGCAAGAGTATTTTAC  443

seq1  AGCAGAGAGTTGGTTTCCACATTCGTTGGTTCATGGATTTGGTGTGTATA  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAGAGAGTTGGTTTCCACATTCGTTGGTTCATGGATTTGGTGTGTATA  493

seq1  ATGAGTTTGAAGCTGCGTGTATGGCCAGTATCCCACACGTAGCTGTGACA  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAGTTTGAAGCTGCGTGTATGGCCAGTATCCCACACGTAGCTGTGACA  543

seq1  TGTGTAAGAAAAATATATTTTCTTTCTCCTACTACTTAAAGCAGAAAGGT  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTAAGAAAAATATATTTTCTTTCTCCTACTACTTAAAGCAGAAAGGT  593

seq1  TAAGACCGTGACTTACAGATTAGAGATGAATGTTAGCGTGACAGGCTCTC  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGACCGTGACTTACAGATTAGAGATGAATGTTAGCGTGACAGGCTCTC  643

seq1  CTTCATACTTTCCTACAGTGTTGCTGTGTTTAACTCTGTCCAATGTTTTC  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCATACTTTCCTACAGTGTTGCTGTGTTTAACTCTGTCCAATGTTTTC  693

seq1  ACATATATATTTTCTGCTTCCTGTTTCTCACATCATTTTGTGCATTGATA  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATATATATTTTCTGCTTCCTGTTTCTCACATCATTTTGTGCATTGATA  743

seq1  ACTAATTAATAATACAGTCATATAAAGTATGCATGCCAGACAGATGAAGG  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTAATTAATAATACAGTCATATAAAGTATGCATGCCAGACAGATGAAGG  793

seq1  TTCACGAGCTATCTATAGGGTCTGGGCTACATAAGCCACTGAAAGTCTGA  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCACGAGCTATCTATAGGGTCTGGGCTACATAAGCCACTGAAAGTCTGA  843

seq1  GTTATCCCTTGGCATAAAGCAGACTGTACCTTTGAGGTCCTGCGACTGTT  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTATCCCTTGGCATAAAGCAGACTGTACCTTTGAGGTCCTGCGACTGTT  893

seq1  TTCTGGCCTTTCACTCCTTCACTGTGGGGTGGCTACTGAGACCTGCCCTT  946
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGGCCTTTCACTCCTTCACTGTGGGGTGGCTACTGAGACCTGCCCTT  943

seq1  TGTATGTAACACTTGGGATTCAAATTCACCAGTGTCCTTCACCTCCAGGA  996
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTATGTAACACTTGGGATTCAAATTCACCAGTGTCCTTCACCTCCAGGA  993

seq1  GATGAGCTCTGAAGATTCCCACAATGCCAGCTACCAGGGAAGGGGTCCAC  1046
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGAGCTCTGAAGATTCCCACAATGCCAGCTACCAGGGAAGGGGTCCAC  1043

seq1  TTGCCCAGTCCCCTTTCTCTGGCTGCCTATCTGGTGAATCTGTTGTTTTG  1096
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCCCAGTCCCCTTTCTCTGGCTGCCTATCTGGTGAATCTGTTGTTTTG  1093

seq1  GATAAATCTCATGAGTGAGTGTTCAAAAGCAAAGGAATTC  1136
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAAATCTCATGAGTGAGTGTTCAAAAGCAAAGGAATTC  1133