BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-163C23
Chromosome13 (Build37)
Map Location 63,134,231 - 63,256,158
singlet/doubletdoublet
Overlap gene2010111I01Rik
Upstream geneEG624180, LOC100041420, LOC665444, EG630579, EG630594, LOC665455, LOC100041430, LOC100041962, LOC100041437, LOC100041979, LOC100041986, 8430426H19Rik, LOC100041455, 6720457D02Rik, EG665503, LOC100041493, LOC630857, EG630978, EG435366, LOC380850, LOC630951, Fbp2, Fbp1, LOC100042090, EG665524
Downstream geneFancc, Ptch1, C030010C08Rik, 0610007P08Rik, 9330134C04Rik, EG665575, Hsd17b3, Slc35d2, Zfp367
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-163C23.bB6Ng01-163C23.g
ACCDH955835DH955836
length9461,130
definitionDH955835|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-163C23, 5' end.DH955836|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-163C23, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(63,255,212 - 63,256,158)(63,134,231 - 63,135,356)
sequence
gaattcacatgagtggctggtggggagtgagcttcattttccatcttcca
gtttgtttcccatgaacagtcatctccaccagacttctctcctcaccttc
ctgaactgggggtgcctctgggatgtactaaggacagatctatagagatc
tgtctaaagttcccatttcctaccctcagccctttcttcccagtcaacag
taaccaatttcctactgttctgtggggaagaaggaagtgtgaagataggt
tgtcacacatgatacaataactctgttatcactcagagctctcccggtag
ccaatgtccatgtgggaccgaccctgctttcaagctttcagtgactaccc
tcaagggtgttaagcaaacttgggacataagggataacgacaactttcct
tccctctttctgactctgaatgtcagaatcacttactcaaggtacataga
cgttttaaagcatcgttttcctcagtagctagtaaagaaaacaacacacc
tcagtccactttgaggatcaacagtcaatgtccctttgctagtaggtccc
ttagcatagacagcaccccacaacagagagcttttagaatgtctaggcta
ccatgaccttggtttggtatgcaaggcccactcacaggtgcacagtccaa
tcctgtattctcagacccaagcaatcggctcaggcttcccttctgtcaaa
acccctggaattcttatgccctggaagagggatcacctacctcaaggaag
ataatcacattgctaacatcttcacactaagagcaaagattttgttgtta
ttgttttgctttcttaaaccataagtcattgaatgtattgtttttccaga
tgagagttatgcaggattgccattttaaatctcaaagtacagcccctctc
ttgaattctctgccacatgctctgtgctataggtgtgtgtgtgtgt
gaattcagttcagtatgtgaaatgaaagagtcagctataaagcctcaaat
gtttctacttggaaagctcaagataacctccctgccttggtagagagata
aatggcaggcaactcattttaaagtcttcccttctctgtctttcttctgc
aggccatgtgtttatactatgggatcccccatcaacaacagggccctttt
tccatgccaggaaccacccgttgccatgtcaacatggcaggctacagttc
gagcagctgcatcttttgttgttttaatgagtggagaaaattctgccaag
cccacaccacttcgagaaggtacagtacacgtgttctttcttatttgggt
gtgacgcacacagcgggatccaaggagccatcggctgagctacagtctct
taaggagctgcttttctggtggggttggatgaaaaaccctaccagagaac
gcacaggggttgggaggagcactggggaacttggacatgggggctccaga
ttccccaagccaaagttatcaattcacagatgactccacttttacatgat
ggtttgtggagcaaaagtgggtggtcttggttgaagacttcctggacagg
caagtgtgtcatggaaacacatagctgagctgtgtgtggtttggacatgg
catctgtatgtggttgtgtttttataagaggtagtgcgtaggctagccaa
cttgctgggcttggaagtctgaatccagggtgtgtcagaagaacggtggc
aagagccagcacaccacccagatctgttgtgaggtgcttgcctgttcatt
caccacagtccatttgatgtcttcagcatgctgatgccagacaacaacac
ttattcttaatgtattgcatggggtactctcctacatgcttatcagaaca
acttgacatatacaaaaagtcaaaaaccaaaatgaaataattttggaaag
gatgagtgctcacgtgttgcattatccccagtacttagagccatgtgtat
cagaggtactaatgtcttaggttggtgcaacagtataatctacttttctt
gctgtatgtgtaacatttaaaaaattacaattgttttattgttctgaagt
atattcaagtaaaccgaacagacctctcac
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr13_63255212_63256158
seq2: B6Ng01-163C23.b_46_991 (reverse)

seq1  ACACACACACACACCTATAGCACAGAGCATGTGGCAGAGAATTCAAGAGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACACACACACCTATAGCACAGAGCATGTGGCAGAGAATTCAAGAGA  50

seq1  GGGGCTGTTACTTTGAGATTTAAAATGGCAATCCTGCATAACTCTCATCT  100
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGCTG-TACTTTGAGATTTAAAATGGCAATCCTGCATAACTCTCATCT  99

seq1  GGAAAAACAATACATTCAATGACTTATGGTTTAAGAAAGCAAAACAATAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAAAACAATACATTCAATGACTTATGGTTTAAGAAAGCAAAACAATAA  149

seq1  CAACAAAATCTTTGCTCTTAGTGTGAAGATGTTAGCAATGTGATTATCTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACAAAATCTTTGCTCTTAGTGTGAAGATGTTAGCAATGTGATTATCTT  199

seq1  CCTTGAGGTAGGTGATCCCTCTTCCAGGGCATAAGAATTCCAGGGGTTTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTGAGGTAGGTGATCCCTCTTCCAGGGCATAAGAATTCCAGGGGTTTT  249

seq1  GACAGAAGGGAAGCCTGAGCCGATTGCTTGGGTCTGAGAATACAGGATTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAGAAGGGAAGCCTGAGCCGATTGCTTGGGTCTGAGAATACAGGATTG  299

seq1  GACTGTGCACCTGTGAGTGGGCCTTGCATACCAAACCAAGGTCATGGTAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTGTGCACCTGTGAGTGGGCCTTGCATACCAAACCAAGGTCATGGTAG  349

seq1  CCTAGACATTCTAAAAGCTCTCTGTTGTGGGGTGCTGTCTATGCTAAGGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAGACATTCTAAAAGCTCTCTGTTGTGGGGTGCTGTCTATGCTAAGGG  399

seq1  ACCTACTAGCAAAGGGACATTGACTGTTGATCCTCAAAGTGGACTGAGGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTACTAGCAAAGGGACATTGACTGTTGATCCTCAAAGTGGACTGAGGT  449

seq1  GTGTTGTTTTCTTTACTAGCTACTGAGGAAAACGATGCTTTAAAACGTCT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTTGTTTTCTTTACTAGCTACTGAGGAAAACGATGCTTTAAAACGTCT  499

seq1  ATGTACCTTGAGTAAGTGATTCTGACATTCAGAGTCAGAAAGAGGGAAGG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTACCTTGAGTAAGTGATTCTGACATTCAGAGTCAGAAAGAGGGAAGG  549

seq1  AAAGTTGTCGTTATCCCTTATGTCCCAAGTTTGCTTAACACCCTTGAGGG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTTGTCGTTATCCCTTATGTCCCAAGTTTGCTTAACACCCTTGAGGG  599

seq1  TAGTCACTGAAAGCTTGAAAGCAGGGTCGGTCCCACATGGACATTGGCTA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTCACTGAAAGCTTGAAAGCAGGGTCGGTCCCACATGGACATTGGCTA  649

seq1  CCGGGAGAGCTCTGAGTGATAACAGAGTTATTGTATCATGTGTGACAACC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCGGGAGAGCTCTGAGTGATAACAGAGTTATTGTATCATGTGTGACAACC  699

seq1  TATCTTCACACTTCCTTCTTCCCCACAGAACAGTAGGAAATTGGTTACTG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCTTCACACTTCCTTCTTCCCCACAGAACAGTAGGAAATTGGTTACTG  749

seq1  TTGACTGGGAAGAAAGGGCTGAGGGTAGGAAATGGGAACTTTAGACAGAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGACTGGGAAGAAAGGGCTGAGGGTAGGAAATGGGAACTTTAGACAGAT  799

seq1  CTCTATAGATCTGTCCTTAGTACATCCCAGAGGCACCCCCAGTTCAGGAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTATAGATCTGTCCTTAGTACATCCCAGAGGCACCCCCAGTTCAGGAA  849

seq1  GGTGAGGAGAGAAGTCTGGTGGAGATGACTGTTCATGGGAAACAAACTGG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGAGGAGAGAAGTCTGGTGGAGATGACTGTTCATGGGAAACAAACTGG  899

seq1  AAGATGGAAAATGAAGCTCACTCCCCACCAGCCACTCATGTGAATTC  947
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGATGGAAAATGAAGCTCACTCCCCACCAGCCACTCATGTGAATTC  946

seq1: chr13_63134231_63135356
seq2: B6Ng01-163C23.g_65_1194

seq1  GAATTCAGTTCAGTATGTGAAATGAAAGAGTCAGCTATAAAGCCTCAAAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGTTCAGTATGTGAAATGAAAGAGTCAGCTATAAAGCCTCAAAT  50

seq1  GTTTCTACTTGGAAAGCTCAAGATAACCTCCCTGCCTTGGTAGAGAGATA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTCTACTTGGAAAGCTCAAGATAACCTCCCTGCCTTGGTAGAGAGATA  100

seq1  AATGGCAGGCAACTCATTTTAAAGTCTTCCCTTCTCTGTCTTTCTTCTGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGGCAGGCAACTCATTTTAAAGTCTTCCCTTCTCTGTCTTTCTTCTGC  150

seq1  AGGCCATGTGTTTATACTATGGGATCCCCCATCAACAACAGGGCCCTTTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCCATGTGTTTATACTATGGGATCCCCCATCAACAACAGGGCCCTTTT  200

seq1  TCCATGCCAGGAACCACCCGTTGCCATGTCAACATGGCAGGCTACAGTTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCATGCCAGGAACCACCCGTTGCCATGTCAACATGGCAGGCTACAGTTC  250

seq1  GAGCAGCTGCATCTTTTGTTGTTTTAATGAGTGGAGAAAATTCTGCCAAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCAGCTGCATCTTTTGTTGTTTTAATGAGTGGAGAAAATTCTGCCAAG  300

seq1  CCCACACCACTTCGAGAAGGTACAGTACACGTGTTCTTTCTTATTTGGGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCACACCACTTCGAGAAGGTACAGTACACGTGTTCTTTCTTATTTGGGT  350

seq1  GTGACGCACACAGCGGGATCCAAGGAGCCATCGGCTGAGCTACAGTCTCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGACGCACACAGCGGGATCCAAGGAGCCATCGGCTGAGCTACAGTCTCT  400

seq1  TAAGGAGCTGCTTTTCTGGTGGGGTTGGATGAAAAACCCTACCAGAGAAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGGAGCTGCTTTTCTGGTGGGGTTGGATGAAAAACCCTACCAGAGAAC  450

seq1  GCACAGGGGTTGGGAGGAGCACTGGGGAACTTGGACATGGGGGCTCCAGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACAGGGGTTGGGAGGAGCACTGGGGAACTTGGACATGGGGGCTCCAGA  500

seq1  TTCCCCAAGCCAAAGTTATCAATTCACAGATGACTCCACTTTTACATGAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCCCAAGCCAAAGTTATCAATTCACAGATGACTCCACTTTTACATGAT  550

seq1  GGTTTGTGGAGCAAAAGTGGGTGGTCTTGGTTGAAGACTTCCTGGACAGG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTTGTGGAGCAAAAGTGGGTGGTCTTGGTTGAAGACTTCCTGGACAGG  600

seq1  CAAGTGTGTCATGGAAACACATAGCTGAGCTGTGTGTGGTTTGGACATGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGTGTGTCATGGAAACACATAGCTGAGCTGTGTGTGGTTTGGACATGG  650

seq1  CATCTGTATGTGGTTGTGTTTTTATAAGAGGTAGTGCGTAGGCTAGCCAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTGTATGTGGTTGTGTTTTTATAAGAGGTAGTGCGTAGGCTAGCCAA  700

seq1  CTTGCTGGGCTTGGAAGTCTGAATCCAGGGTGTGTCAGAAGAACGGTGGC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGCTGGGCTTGGAAGTCTGAATCCAGGGTGTGTCAGAAGAACGGTGGC  750

seq1  AAGAGCCAGCACACCACCCAGATCTGTTGTGAGGTGCTTGCCTGTTCATT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGCCAGCACACCACCCAGATCTGTTGTGAGGTGCTTGCCTGTTCATT  800

seq1  CACCACAGTCCATTTGATGTCTTCAGCATGCTGATGCCAGACAACAACAC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCACAGTCCATTTGATGTCTTCAGCATGCTGATGCCAGACAACAACAC  850

seq1  TTATTCTTAATGTATTGCATGGGGTACTCTCCTACATGCTTATCAGAACA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTCTTAATGTATTGCATGGGGTACTCTCCTACATGCTTATCAGAACA  900

seq1  ACTTGAACATATACAAAAAGTCAAAAACCAAAATGAAATAATTTTGGAAA  950
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTG-ACATATACAAAAAGTCAAAAACCAAAATGAAATAATTTTGGAAA  949

seq1  GAATGAGTGCTCACGTGTTGCATTATCCCCAGTACTTAAGAGCCATGTGT  1000
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  GGATGAGTGCTCACGTGTTGCATTATCCCCAGTACTT-AGAGCCATGTGT  998

seq1  ATCAAGAGGTACTAAATGGTCTTTAAGGTT-GTGCAACAGTATAATCTAC  1049
      ||| |||||||||||   |||||  ||||| |||||||||||||||||||
seq2  ATC-AGAGGTACTAA--TGTCTT--AGGTTGGTGCAACAGTATAATCTAC  1043

seq1  TTTTCTTGCTCGTA-GTGT-ACATT--AAAAAATACAATTGTTTTATTG-  1094
      |||||||||| ||| |||| |||||  ||||| |||||||||||||||| 
seq2  TTTTCTTGCT-GTATGTGTAACATTTAAAAAATTACAATTGTTTTATTGT  1092

seq1  TCTG-AGTATAT--CAGT-AACCG-ACAGACCT-TCAC  1126
      |||| |||||||   ||| ||||| |||||||| ||||
seq2  TCTGAAGTATATTCAAGTAAACCGAACAGACCTCTCAC  1130