seq1: chr4_27631352_27632181
seq2: B6Ng01-175L03.b_45_876 (reverse)
seq1 AACTTTATATGCCCCAGTACAGGGGAACA-CCAGGGCC-AAAAAGGGGGA 48
||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||
seq2 AACTTTATATG-CCCAGTACAGGGGAACACCCAGGGCCAAAAAAGGGGGA 49
seq1 GTGGGTGGGCAGGGGAGTGGGGGTGGGTGGATATGGGGGACTTTT-GGTA 97
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2 GTGGGTGGGCAGGGGAGTGGGGGTGGGTGGATATGGGGGACTTTTGGGTA 99
seq1 TAGCATTGGAAATGTAAATGAGCTAAATACCTAATAAAAATGGAAAAAAA 147
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TAGCATTGGAAATGTAAATGAGCTAAATACCTAATAAAAATGGAAAAAAA 149
seq1 AGAAAAGAAAAAAAATAAACTATTCATATTATCTAAAAAAAAAAGAAATT 197
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AGAAAAGAAAAAAAATAAACTATTCATATTATCTAAAAAAAAAAGAAATT 199
seq1 GTATGCTGATAGTCTATTAGTAATTATTAACACAAAAATTGTTATGAGAT 247
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GTATGCTGATAGTCTATTAGTAATTATTAACACAAAAATTGTTATGAGAT 249
seq1 ATAGTTATGTATAATATTTAGAAAACAATAATAGTAGAAATCAATTTCAG 297
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ATAGTTATGTATAATATTTAGAAAACAATAATAGTAGAAATCAATTTCAG 299
seq1 GTTTGTTTGTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTGGGAGTCCTCCTTGAATCCAT 347
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GTTTGTTTGTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTGGGAGTCCTCCTTGAATCCAT 349
seq1 GGCTTGATGCTGCTTTTACTCTTTGAAGAAGGAGCCCTAAAAATACTATG 397
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GGCTTGATGCTGCTTTTACTCTTTGAAGAAGGAGCCCTAAAAATACTATG 399
seq1 TAATAAGGGCTAGACAATGATCTGCTCCTGGACTTTAGAGGTAGCTCAGA 447
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TAATAAGGGCTAGACAATGATCTGCTCCTGGACTTTAGAGGTAGCTCAGA 449
seq1 TACGGATATCACAGGATTATAGGTCTCTGCTTCCACTCAGAGCATCACTC 497
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TACGGATATCACAGGATTATAGGTCTCTGCTTCCACTCAGAGCATCACTC 499
seq1 AGAGTAGGCAGGAGATGGCTGAGCCCAGGACTTGGATTAAATAATTTTGA 547
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AGAGTAGGCAGGAGATGGCTGAGCCCAGGACTTGGATTAAATAATTTTGA 549
seq1 TTCCAAGTGGGTGCCAGAGGCTGGGAGAGACAAAGCCTTCTCTGGGAGAT 597
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTCCAAGTGGGTGCCAGAGGCTGGGAGAGACAAAGCCTTCTCTGGGAGAT 599
seq1 TTATGCGATGCTAACTTGTATGAAGCCCCCCCCCCCCATTCTTACAGCAA 647
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTATGCGATGCTAACTTGTATGAAGCCCCCCCCCCCCATTCTTACAGCAA 649
seq1 TCTTTGATGAAGTGACAGTCCTTGCTTGTCCAAATGCTTTAATTAAGGGC 697
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TCTTTGATGAAGTGACAGTCCTTGCTTGTCCAAATGCTTTAATTAAGGGC 699
seq1 AAAGGTAAATGAATACACCTTACTCAGGATGAACCAGGGACTATACCTCT 747
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AAAGGTAAATGAATACACCTTACTCAGGATGAACCAGGGACTATACCTCT 749
seq1 TTTGGAAAGGAATGCCCAGGAAGAGAAGCTCATTGGCTTTATACATGTGA 797
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTTGGAAAGGAATGCCCAGGAAGAGAAGCTCATTGGCTTTATACATGTGA 799
seq1 CCTATCTAGATACCTCATTAGCATGGAGAATTC 830
|||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CCTATCTAGATACCTCATTAGCATGGAGAATTC 832
| seq1: chr13_3745496_3745613
seq2: B6Ng01-175L03.g_85_225 (reverse)
seq1 ATATATATATATATATCGTCAGTGAGGTATATATATCCATCAGTGGTGTG 50
|||||||||||||||| | ||||||||| || | || ||
seq2 ATATATATATATATAT--------ATATATATATATATAT-ATATGTATG 41
seq1 TGTGTATATATATATATGTATATGT----GTGTATATA---TATATAT-- 91
| |||||||||| |||| | ||| | ||| ||| | || |
seq2 TATGTATATATA-ATATCCAATTGTTAAAGAGTACATACCGTGCATGTCC 90
seq1 -----AAAATCAGTGA-------------------GGTATATATATATTC 117
|| | ||| | | ||||||||||||
seq2 TTTTGCAACTGAGTTACCTCACTAAGCATGATATTGCGATATATATATTC 140
seq1 A 118
|
seq2 A 141
|
