BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-183L02
Chromosome13 (Build37)
Map Location 71,323,062 - 71,440,812
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream gene4930520P13Rik, EG633042, BC018507, EG620473, Adamts16, 8030423J24Rik
Downstream geneLOC627230, LOC100042360, Irx1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-183L02.bB6Ng01-183L02.g
ACCGA009253GA009254
length7951,112
definitionB6Ng01-183L02.b B6Ng01-183L02.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(71,323,062 - 71,323,850)(71,439,716 - 71,440,812)
sequence
gaattcaaatgagcagacatagggaaaaaagcaaaacaggtcatgcaagc
ttctaatcccagcaccaggggagggtgatatcggatgattgttaaagttg
tcctctgacctccaatacacagtcacacatagggatgtgcatgcatacac
acacacacacacacacacgactaacacacatacacacatgtatatccata
tcatctgcatgctacatacacatataaacacacatatgcacacacatgcc
tctaacatacccacatacatgtacatccatatcatccacatacacatatg
catatatacatatatatatatgtatatatgggtttatatatacatatgta
cacacacattcagggagagagagagagagagggagagagagagagagaga
gagagagagagagctgaagtttcaacatgactggataacatgactggatg
acagcatcccatgcgtttatgtcatcatagaagaggggaaagtactgtca
ctgaaatgtttctctcaatatcaccttaaaaaacccaaaccacgaagcat
tcagaggttcctaagcagtagaataatgagtcttgtggtaaatgtgctca
ccaggggccaccacagagaagaagtctttacagtcagagcagaggaatcc
ccggctggttggtgaacaaagacaataaatacaactaaatttgaggaaac
cgctgtgctcatagaaaccttctccattttgccctgagtcctgtatctgt
gggtcccaccatagtttttccctaccatggtacctttgtggacaa
gaattccacagggagtttcagatgtgagtgacccactgggcccatggtag
gttttttttttttttttttttgacatcaaactgatgttcctaaacccaca
gtgtgataatctggcacttagtttcaaaatgcagcctaaatcacagaagc
cataatatgtcaaatgatcccaccctcgcagggggaaaacagtaagtaat
gaaaaagctatgattgcttttctgtcctccaaatgacagctatcacctca
atgacctgctccgggcggaccagtctagacccgacacactaaggataacg
tcatctaacagggtagttacaaaaatcaatacaaaacccatttcagagat
actctgtgtaagaatcctggcgtaatgctcatttattgaataggcctggg
gaaaaacacaacaacttctctgatatatatgccttaccttccaagcaaag
gaattctgtaggtaagcaataattgtatttttcaatctattacttagact
tggcagggctcaggctggaatctaatatatggatgatggctataactcaa
ttatggcgtttcggcagaatcctagtgtattcagagtaaaggtacagaac
tcgacagctcccccgctgggctttcgggaacaactgtgtctatgaacgct
tctttacaagcttgatccctgtcctattgaatatatatatatatacatac
atacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacat
atatatatatattaacccatgtaattcctgggcacttctgctactgtctt
ttcctctcatgttaggtctgcatttggaagtcagagcgttctgtttgaat
aaacagatgcattagttactgtaactgagaatgactggctgggattgccg
gctgaaatcccttggggcctgagagaacagcagaactttctgcatgccaa
acagctgagacccgtccctaagctcactgccttcttttactcagccctgg
agcagcagttggcaagtcaaaaagcttaattgattagggcagggagtgag
atgccttgtacaacaactggaaaagaaaatctggaaagcctgcttacaag
gatttggagctc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr13_71323062_71323850
seq2: B6Ng01-183L02.b_48_842

seq1  GAATTCAAATGAGCAGACATAGGGAAAAAAGCAAAACAGGTCATGCAAGC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAATGAGCAGACATAGGGAAAAAAGCAAAACAGGTCATGCAAGC  50

seq1  TTCTAATCCCAGCACCAGGGGAGGGTGATATCGGATGATTGTTAAAGTTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTAATCCCAGCACCAGGGGAGGGTGATATCGGATGATTGTTAAAGTTG  100

seq1  TCCTCTGACCTCCAATACACAGTCACACATAGGGATGTGCATGCATACAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTCTGACCTCCAATACACAGTCACACATAGGGATGTGCATGCATACAC  150

seq1  ACACACACACACACACACGACTAACACACATACACACATGTATATCCATA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACACACACACACACGACTAACACACATACACACATGTATATCCATA  200

seq1  TCATCTGCATGCTACATACACATATAAACACACATATGCACACACATGCC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATCTGCATGCTACATACACATATAAACACACATATGCACACACATGCC  250

seq1  TCTAACATACCCACATACATGTACATCCATATCATCCACATACACATATG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAACATACCCACATACATGTACATCCATATCATCCACATACACATATG  300

seq1  CATATATACATATATATATATGTATATATGGGTTTATATATACATATGTA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATATATACATATATATATATGTATATATGGGTTTATATATACATATGTA  350

seq1  CACACACATTCAGGGAGAGAGAGAGAGAGAGGGAGAGAGAGAGAGAGAGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACACATTCAGGGAGAGAGAGAGAGAGAGGGAGAGAGAGAGAGAGAGA  400

seq1  GAGAGAGAGAGAGCTGAAGTTTCAACATGACTGGATAACATGACTGGATG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAGAGAGAGAGCTGAAGTTTCAACATGACTGGATAACATGACTGGATG  450

seq1  ACAGCATCCCATGCGTTTATGTCATCATAGAAGAGGGGAAAGTACTGTCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGCATCCCATGCGTTTATGTCATCATAGAAGAGGGGAAAGTACTGTCA  500

seq1  CTGAAATGTTTCTCTCAATATCACCTTAAAAAACCCAAACCACGAAGCAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAAATGTTTCTCTCAATATCACCTTAAAAAACCCAAACCACGAAGCAT  550

seq1  TCAGAGGTTCCTAAGCAGTAGAATAATGAGTCTTGTGGTAAATGTGCTCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGAGGTTCCTAAGCAGTAGAATAATGAGTCTTGTGGTAAATGTGCTCA  600

seq1  CCAGGGGCCACCACAGAGAAGAAG-CCTTACAGTCAGAGCAGAGGAATCC  649
      |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGGGCCACCACAGAGAAGAAGTCTTTACAGTCAGAGCAGAGGAATCC  650

seq1  CCGGCTGGTTGGTGAACAAAGACAATAAATACAACTAAATTTGAGGAAAC  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCGGCTGGTTGGTGAACAAAGACAATAAATACAACTAAATTTGAGGAAAC  700

seq1  CGCTGTGCTCATAGAAACCTTCTCCATTTTG-CCTGAG-CCTGTATCTGT  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||
seq2  CGCTGTGCTCATAGAAACCTTCTCCATTTTGCCCTGAGTCCTGTATCTGT  750

seq1  GGGTCCCACCATAG-TTTTCCCTACCATGGTA-CTTTG-GGACAA  789
      |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||
seq2  GGGTCCCACCATAGTTTTTCCCTACCATGGTACCTTTGTGGACAA  795

seq1: chr13_71439716_71440812
seq2: B6Ng01-183L02.g_67_1178 (reverse)

seq1  GAGCT-CAAATCCTTTTA--CCAGCTGTCCAGATATTTCTTTTCAAGTTG  47
      ||||| ||||||||| ||  |  ||| ||||||| ||||||||| |||||
seq2  GAGCTCCAAATCCTTGTAAGCAGGCTTTCCAGAT-TTTCTTTTCCAGTTG  49

seq1  TTGTACAGGGCATCCTCACTCCCTG-CCTTATCA--TTAGCTTTTTGCCT  94
      ||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||  | ||||||||| ||
seq2  TTGTACAAGGCAT-CTCACTCCCTGCCCTAATCAATTAAGCTTTTTGACT  98

seq1  TG-CAACTGCTGCTC--AGGCTGAGTAAA--GAGGCAGTGAGCTTAGGGA  139
      || ||||||||||||   |||||||||||   ||||||||||||||||||
seq2  TGCCAACTGCTGCTCCAGGGCTGAGTAAAAGAAGGCAGTGAGCTTAGGGA  148

seq1  CGGGTCTCAGCTG-TTGGCATGCAGAA--GTCTGCTTGTCTCTCA-GCCC  185
      ||||||||||||| |||||||||||||   ||||||  ||||||| ||||
seq2  CGGGTCTCAGCTGTTTGGCATGCAGAAAGTTCTGCTGTTCTCTCAGGCCC  198

seq1  CAA-GGATTTCAGCCGGCAATCCCAGCCAGTCATTCTCAGTTACAGTAAC  234
      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGGGATTTCAGCCGGCAATCCCAGCCAGTCATTCTCAGTTACAGTAAC  248

seq1  T-ATGCATCTGTTTATTCAAACAGAACGCTCTGACTTCCAAATGCAGACC  283
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATGCATCTGTTTATTCAAACAGAACGCTCTGACTTCCAAATGCAGACC  298

seq1  TAACATGAGAGGAAAAGACAGTAGCAGAAGTGCCCAGGAATTACATGGGT  333
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACATGAGAGGAAAAGACAGTAGCAGAAGTGCCCAGGAATTACATGGGT  348

seq1  TAATATATATATATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT  383
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATATATATATATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT  398

seq1  GTGTGTGTGTGTATGTATGTATATATATATATATTCAATAGGACAGGGAT  433
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTGTGTGTATGTATGTATATATATATATATTCAATAGGACAGGGAT  448

seq1  CAAGCTTGTAAAGAAGCGTTCATAGACACAGTTGTTCCCGAAAGCCCAGC  483
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGCTTGTAAAGAAGCGTTCATAGACACAGTTGTTCCCGAAAGCCCAGC  498

seq1  GGGGGAGCTGTCGAGTTCTGTACCTTTACTCTGAATACACTAGGATTCTG  533
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGGAGCTGTCGAGTTCTGTACCTTTACTCTGAATACACTAGGATTCTG  548

seq1  CCGAAACGCCATAATTGAGTTATAGCCATCATCCATATATTAGATTCCAG  583
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCGAAACGCCATAATTGAGTTATAGCCATCATCCATATATTAGATTCCAG  598

seq1  CCTGAGCCCTGCCAAGTCTAAGTAATAGATTGAAAAATACAATTATTGCT  633
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGAGCCCTGCCAAGTCTAAGTAATAGATTGAAAAATACAATTATTGCT  648

seq1  TACCTACAGAATTCCTTTGCTTGGAAGGTAAGGCATATATATCAGAGAAG  683
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCTACAGAATTCCTTTGCTTGGAAGGTAAGGCATATATATCAGAGAAG  698

seq1  TTGTTGTGTTTTTCCCCAGGCCTATTCAATAAATGAGCATTACGCCAGGA  733
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTGTGTTTTTCCCCAGGCCTATTCAATAAATGAGCATTACGCCAGGA  748

seq1  TTCTTACACAGAGTATCTCTGAAATGGGTTTTGTATTGATTTTTGTAACT  783
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTACACAGAGTATCTCTGAAATGGGTTTTGTATTGATTTTTGTAACT  798

seq1  ACCCTGTTAGATGACGTTATCCTTAGTGTGTCGGGTCTAGACTGGTCCGC  833
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCTGTTAGATGACGTTATCCTTAGTGTGTCGGGTCTAGACTGGTCCGC  848

seq1  CCGGAGCAGGTCATTGAGGTGATAGCTGTCATTTGGAGGACAGAAAAGCA  883
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCGGAGCAGGTCATTGAGGTGATAGCTGTCATTTGGAGGACAGAAAAGCA  898

seq1  ATCATAGCTTTTTCATTACTTACTGTTTTCCCCCTGCGAGGGTGGGATCA  933
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCATAGCTTTTTCATTACTTACTGTTTTCCCCCTGCGAGGGTGGGATCA  948

seq1  TTTGACATATTATGGCTTCTGTGATTTAGGCTGCATTTTGAAACTAAGTG  983
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGACATATTATGGCTTCTGTGATTTAGGCTGCATTTTGAAACTAAGTG  998

seq1  CCAGATTATCACACTGTGGGTTTAGGAACATCAGTTTGATGTCAAAAAAA  1033
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGATTATCACACTGTGGGTTTAGGAACATCAGTTTGATGTCAAAAAAA  1048

seq1  AAAAAAAAAAAAACCTACCATGGGCCCAGTGGGTCACTCACATCTGAAAC  1083
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAAAAAAAAACCTACCATGGGCCCAGTGGGTCACTCACATCTGAAAC  1098

seq1  TCCCTGTGGAATTC  1097
      ||||||||||||||
seq2  TCCCTGTGGAATTC  1112