BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-196E15
Chromosome13 (Build37)
Map Location 32,784,051 - 32,920,203
singlet/doubletdoublet
Overlap geneWrnip1
Upstream geneFoxc1, 4930548F15Rik, Gmds, LOC666212
Downstream geneSerpinb1a, Serpinb1-ps1, Serpinb1c, Serpinb6b, Serpinb9, Serpinb9b, Serpinb1b, LOC628301, Serpinb9c, Serpinb9d, Serpinb9e, Serpinb9f, OTTMUSG00000000724, Serpinb9g, LOC100041370, EG619715, LOC382743, OTTMUSG00000000712, LOC193403, Vmn2r-ps94
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-196E15.bB6Ng01-196E15.g
ACCGA018469GA018470
length1,1291,153
definitionB6Ng01-196E15.b B6Ng01-196E15.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(32,784,051 - 32,785,190)(32,919,048 - 32,920,203)
sequence
gaattctagaaattaataaatgcttatgacgacccatctgtgacattttt
acttagcctcctgaactcctctttagctctcggtggcggtaatggttaat
attgattctatatgacagggtcaagaacaccaaagagacaagcctccagg
gatgccggaaattatccaaatttggtgaagtgggaagatgcaccttaact
gtgggtggcaccattctatggactgggaacctgagctaaattcagtggaa
agggtggccgagcacaggcttcatgctctctgcttcctgattgcaggtac
agtatgtgcagtggccttgagctcctgatactgtgacatccaccccctcc
cccatggtaaacagcgcctctagtgtgagctaagaataacccctccctct
ccaggttttcttcatgtccagagcctataacagcaatgaaagaaggaagt
aatatagtgctctttgaatccagaagcctagcaggctccaggcagggtgc
atgggtgtgatagtccttcaactttcatcctgagggcactgtcaccatca
tatctaacaggtagtttcttggggaaattccccaagagtttttgtggtgt
gagccaacctgagagctcactggaggaagaggcagtgagcagagtcttgt
gcctcagtcctttacccataacaaccagtggtaatcgtttgcctgaggtg
gagttgccaattggagctgaataagaggccatccaaaaaccatgaagaaa
aatttacaagactagatgtttataagggatttttaaaagtactgacatat
actatgcccatgtgcaggctggaactccttagaaattgcctaagaaagac
aataccttacctctggctttgagctttatgaaatgtgtactaagactaag
caggattctgaattactgttgtattcaagttgtagcccaacccagagtaa
ctcttacaaggagtagacttgcctaaaaaatattctctatctacagatca
ctattttttaaatattttaattattcttttaaaagtcctcatgttttaaa
tgaacacataagctgagccagagactaaattgtacatgtgaatgggagat
ttgagcctatcacacacaggtcacatctg
gaattccagcagactcactctgggtccatgttcctcagtgtgcatggatg
gctgggctattgatagaaccctggcgatgggggcagagggcaaaggttgg
caggcggagtgtgcaaagggattcatttctctcataaagtacagttccta
ggctgtccattctttcactgcctgtgtggatggcacagatggagaggtgc
aggacatgaactgtgcgccccctggtggttcagattgtagctgctaaaca
ggtggcataagtttccaattttcatatgcacacatacgtttaaaaaaatg
tccagtgttgggggctggtctggtgctgctatgtattcaaatgctaaata
ctggcccccaagacctggctgctcttgacaaacatatcctcatgtacacc
aagtgagtctatgtaaacttggctccccaatttaaagctattggctaaat
aaaagtggctacagccaatcactggggagaacagaggtaggtggagtttc
agttactgggctgggggattgcaaatagggaccacaagggacagagaaaa
gtagagtcaaggagggagatggagagagcaggagatgtgatgggccagga
gaacatgcccatcccacccccaaaatagactgctggagaagtaacttggg
taagactcaaacagcaagcaccactggcaagagcagctaggaagtagcca
gtttggctttagaaaaatatattagcaattgtgcaagagctgattaagta
aatccatacaactctgcctgggttactagggggctgtccaggttgtatca
ataactaacagagtatattaaactctatttaccgtattgtaaccaagagg
acatatattgaaccattcacagtagttaccactgaggaaaaatggtttat
ttccactactttttgcataattttgtagtgttcaaaacactgcttttgca
accagacaatcaactcttgaaaggtcactttatcttgtcctgttgatcac
aaacagtaagacaccttgggcctgcaatggtcactaggaacttttgctca
gcctcaggcttgacccctgctggagagaagctttgaggactagccctgat
ttcagacattacatagactcagggaaacgttatcagtcgttattatttag
caa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr13_32784051_32785190
seq2: B6Ng01-196E15.b_44_1172

seq1  GAATTCTAGAAATTAATAAATGCTTATGACGACCCATCTGTGACATTTTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTAGAAATTAATAAATGCTTATGACGACCCATCTGTGACATTTTT  50

seq1  ACTTAGCCTCCTGAACTCCTCTTTAGCTCTCGGTGGCGGTAATGGTTAAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTAGCCTCCTGAACTCCTCTTTAGCTCTCGGTGGCGGTAATGGTTAAT  100

seq1  ATTGATTCTATATGACAGGGTCAAGAACACCAAAGAGACAAGCCTCCAGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGATTCTATATGACAGGGTCAAGAACACCAAAGAGACAAGCCTCCAGG  150

seq1  GATGCCGGAAATTATCCAAATTTGGTGAAGTGGGAAGATGCACCTTAACT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGCCGGAAATTATCCAAATTTGGTGAAGTGGGAAGATGCACCTTAACT  200

seq1  GTGGGTGGCACCATTCTATGGACTGGGAACCTGAGCTAAATTCAGTGGAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGGTGGCACCATTCTATGGACTGGGAACCTGAGCTAAATTCAGTGGAA  250

seq1  AGGGTGGCCGAGCACAGGCTTCATGCTCTCTGCTTCCTGATTGCAGGTAC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGTGGCCGAGCACAGGCTTCATGCTCTCTGCTTCCTGATTGCAGGTAC  300

seq1  AGTATGTGCAGTGGCCTTGAGCTCCTGATACTGTGACATCCACCCCCTCC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTATGTGCAGTGGCCTTGAGCTCCTGATACTGTGACATCCACCCCCTCC  350

seq1  CCCATGGTAAACAGCGCCTCTAGTGTGAGCTAAGAATAACCCCTCCCTCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCATGGTAAACAGCGCCTCTAGTGTGAGCTAAGAATAACCCCTCCCTCT  400

seq1  CCAGGTTTTCTTCATGTCCAGAGCCTATAACAGCAATGAAAGAAGGAAGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGTTTTCTTCATGTCCAGAGCCTATAACAGCAATGAAAGAAGGAAGT  450

seq1  AATATAGTGCTCTTTGAATCCAGAAGCCTAGCAGGCTCCAGGCAGGGTGC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATATAGTGCTCTTTGAATCCAGAAGCCTAGCAGGCTCCAGGCAGGGTGC  500

seq1  ATGGGTGTGATAGTCCTTCAACTTTCATCCTGAGGGCACTGTCACCATCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGGTGTGATAGTCCTTCAACTTTCATCCTGAGGGCACTGTCACCATCA  550

seq1  TATCTAACAGGTAGTTTCTTGGGGAAATTCCCCAAGAGTTTTTGTGGTGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCTAACAGGTAGTTTCTTGGGGAAATTCCCCAAGAGTTTTTGTGGTGT  600

seq1  GAGCCAACCTGAGAGCTCACTGGAGGAAGAGGCAGTGAGCAGAGTCTTGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCCAACCTGAGAGCTCACTGGAGGAAGAGGCAGTGAGCAGAGTCTTGT  650

seq1  GCCTCAGTCCTTTACCCATAACAACCAGTGGTAATCGTTTGCCTGAGGTG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTCAGTCCTTTACCCATAACAACCAGTGGTAATCGTTTGCCTGAGGTG  700

seq1  GAGTTGCCAATTGGAGCTGAATAAGAGGCCATCCAAAAACCATGAAGAAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTTGCCAATTGGAGCTGAATAAGAGGCCATCCAAAAACCATGAAGAAA  750

seq1  AATTTACAAGACTAGATGTTTATAAGGGATTTTTAAAAGTACTGACATAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTACAAGACTAGATGTTTATAAGGGATTTTTAAAAGTACTGACATAT  800

seq1  ACTATGCCCATGTGCAGGCTGGAACTCCTTAGAAATTGCCTAAGAAAGAC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTATGCCCATGTGCAGGCTGGAACTCCTTAGAAATTGCCTAAGAAAGAC  850

seq1  AATACCTTACCTCTGGCTTTGAGCTTTATGAAAATGTGTACTAAGACTAA  900
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  AATACCTTACCTCTGGCTTTGAGCTTTATG-AAATGTGTACTAAGACTAA  899

seq1  GCAGGATTCTGAATTACTGTTGTATTCAAGTTGTAGCCCAACCCAGAGTA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  GCAGGATTCTGAATTACTGTTGTATTCAAGTTGTAGCCCAACCCAGAGT-  948

seq1  AACTCTTAACAAGGAGTAGACTTGCCTAAAAAATTAATTCTCTATCTACA  1000
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||
seq2  AACTCTT-ACAAGGAGTAGACTTGCCTAAAAAAT--ATTCTCTATCTACA  995

seq1  GATCACTATTTTTAAAATATTTTAAATTATTCTTTTAAAAAGTCCTCATG  1050
      ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||
seq2  GATCACTATTTTTTAAATATTTT-AATTATTCTTTT-AAAAGTCCTCATG  1043

seq1  TTTTTAAATTGACCACCAATTAGCTGAG-CAGAGACTTAAAATGGTACAT  1099
      ||||  || ||| |||  || ||||||| ||||||||  |||| ||||||
seq2  TTTT--AAATGAACAC--ATAAGCTGAGCCAGAGACT--AAATTGTACAT  1087

seq1  GTG-ATGGGAGATTTGAGCTTATCACACACAGGGCACATCTG  1140
      ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||
seq2  GTGAATGGGAGATTTGAGCCTATCACACACAGGTCACATCTG  1129

seq1: chr13_32919048_32920203
seq2: B6Ng01-196E15.g_66_1218 (reverse)

seq1  TTGCTAAATAATAAAACGAATGGATAACGTTTCCCTGGGGTCTATGTAAT  50
      ||||||||||||  ||||| | |||||||||||||| | |||||||||||
seq2  TTGCTAAATAAT--AACGACT-GATAACGTTTCCCT-GAGTCTATGTAAT  46

seq1  GTCTGGAAATCA-GGCTAGTCCTCAAAGCTTCTCTCCAGCAGGGGTC-AG  98
      |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  GTCT-GAAATCAGGGCTAGTCCTCAAAGCTTCTCTCCAGCAGGGGTCAAG  95

seq1  GCTGAGGCTGGAGC-AAAGTTCCTAGTGACCATTGCAGGCCAAGGTTGTC  147
       |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||
seq2  CCTGAGGCT-GAGCAAAAGTTCCTAGTGACCATTGCAGGCCCAAGGTGTC  144

seq1  TTACTGTTTGTGATCAACAGGAC-AGATAAAGTGACCTTTCAAGAGTTGA  196
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACTGTTTGTGATCAACAGGACAAGATAAAGTGACCTTTCAAGAGTTGA  194

seq1  TTTGTCTGGTTGCAAAAGCAGTG-TTTGAACACTACAAAAATTATGCAAA  245
       |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||
seq2  -TTGTCTGGTTGCAAAAGCAGTGTTTTGAACACTAC-AAAATTATGCAAA  242

seq1  AAGTAGTGGAAATAAACCATTTTTCCTCAGTGGTAACTACTGTGAATGGT  295
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTAGTGGAAATAAACCATTTTTCCTCAGTGGTAACTACTGTGAATGGT  292

seq1  TCAATATATGTCCTCTTGGTTACAATACGGTAAATAGAGTTTAATATACT  345
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAATATATGTCCTCTTGGTTACAATACGGTAAATAGAGTTTAATATACT  342

seq1  CTGTTAGTTATTGATACAACCTGGACAGCCCCCTAGTAACCCAGGCAGAG  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTTAGTTATTGATACAACCTGGACAGCCCCCTAGTAACCCAGGCAGAG  392

seq1  TTGTATGGATTTACTTAATCAGCTCTTGCACAATTGCTAATATATTTTTC  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTATGGATTTACTTAATCAGCTCTTGCACAATTGCTAATATATTTTTC  442

seq1  TAAAGCCAAACTGGCTACTTCCTAGCTGCTCTTGCCAGTGGTGCTTGCTG  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAGCCAAACTGGCTACTTCCTAGCTGCTCTTGCCAGTGGTGCTTGCTG  492

seq1  TTTGAGTCTTACCCAAGTTACTTCTCCAGCAGTCTATTTTGGGGGTGGGA  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGAGTCTTACCCAAGTTACTTCTCCAGCAGTCTATTTTGGGGGTGGGA  542

seq1  TGGGCATGTTCTCCTGGCCCATCACATCTCCTGCTCTCTCCATCTCCCTC  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGCATGTTCTCCTGGCCCATCACATCTCCTGCTCTCTCCATCTCCCTC  592

seq1  CTTGACTCTACTTTTCTCTGTCCCTTGTGGTCCCTATTTGCAATCCCCCA  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGACTCTACTTTTCTCTGTCCCTTGTGGTCCCTATTTGCAATCCCCCA  642

seq1  GCCCAGTAACTGAAACTCCACCTACCTCTGTTCTCCCCAGTGATTGGCTG  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCAGTAACTGAAACTCCACCTACCTCTGTTCTCCCCAGTGATTGGCTG  692

seq1  TAGCCACTTTTATTTAGCCAATAGCTTTAAATTGGGGAGCCAAGTTTACA  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCCACTTTTATTTAGCCAATAGCTTTAAATTGGGGAGCCAAGTTTACA  742

seq1  TAGACTCACTTGGTGTACATGAGGATATGTTTGTCAAGAGCAGCCAGGTC  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGACTCACTTGGTGTACATGAGGATATGTTTGTCAAGAGCAGCCAGGTC  792

seq1  TTGGGGGCCAGTATTTAGCATTTGAATACATAGCAGCACCAGACCAGCCC  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGGGGCCAGTATTTAGCATTTGAATACATAGCAGCACCAGACCAGCCC  842

seq1  CCAACACTGGACATTTTTTTAAACGTATGTGTGCATATGAAAATTGGAAA  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAACACTGGACATTTTTTTAAACGTATGTGTGCATATGAAAATTGGAAA  892

seq1  CTTATGCCACCTGTTTAGCAGCTACAATCTGAACCACCAGGGGGCGCACA  945
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTATGCCACCTGTTTAGCAGCTACAATCTGAACCACCAGGGGGCGCACA  942

seq1  GTTCATGTCCTGCACCTCTCCATCTGTGCCATCCACACAGGCAGTGAAAG  995
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCATGTCCTGCACCTCTCCATCTGTGCCATCCACACAGGCAGTGAAAG  992

seq1  AATGGACAGCCTAGGAACTGTACTTTATGAGAGAAATGAATCCCTTTGCA  1045
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGGACAGCCTAGGAACTGTACTTTATGAGAGAAATGAATCCCTTTGCA  1042

seq1  CACTCCGCCTGCCAACCTTTGCCCTCTGCCCCCATCGCCAGGGTTCTATC  1095
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTCCGCCTGCCAACCTTTGCCCTCTGCCCCCATCGCCAGGGTTCTATC  1092

seq1  AATAGCCCAGCCATCCATGCACACTGAGGAACATGGACCCAGAGTGAGTC  1145
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAGCCCAGCCATCCATGCACACTGAGGAACATGGACCCAGAGTGAGTC  1142

seq1  TGCTGGAATTC  1156
      |||||||||||
seq2  TGCTGGAATTC  1153