BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-206G14
Chromosome13 (Build37)
Map Location 104,812,194 - 104,952,841
singlet/doubletdoublet
Overlap geneNln, Sgtb, 2410002O22Rik
Upstream geneMast4, EG621312, EG432800, LOC432801, LOC100040045, Ppia-ps13_1282.1, Sfrs12, Erbb2ip, LOC100040086, D130037M23Rik
Downstream geneLOC100040518, Trim23, Ppwd1, Cenpk, Adamts6, LOC667518, Sdccag10, 3110031B13Rik, A930021C24Rik, EG238836, Rgs7bp, 4933425L06Rik, LOC100040646, LOC100040656, Rnf180
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-206G14.bB6Ng01-206G14.g
ACCGA025833GA025834
length1,1491,075
definitionB6Ng01-206G14.b B6Ng01-206G14.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(104,812,194 - 104,813,352)(104,951,869 - 104,952,841)
sequence
gaattcactctccagacgaactttcctcttgagggctatttccaaagtca
tcaccatattgttggtttctcaaacacttgtgatgctaattaatacaagc
ctgctgaaaatgtagttcttaggatgggtcatagtagcccattccttatg
ggagctaaccatattgggatccagagggactttcgatctggatacaaaca
tcttccagttccctcttcaaaggctttgtgcttcccacaggcccctccct
atatgtgctaaacagtgaactgctactgatatttggctagaaggtcacca
agacttttggttgccaagtcacatcatcacagtgaggttttgcctctacc
tgacaatgggacttgattaattttgttttatgtttgtcttagtagaggaa
tctttcaattttaataacatgttcatatataactattccagctgttattt
atatgttagtattttttagtggattttcttgcttttagccaaaggacttg
ctattccccctctttattcaatagctaggaatccacttagccaaagttat
ccagtcctatctctcaagcacaaaggtatgtcaacagagacaccaagtac
cttgatgggcacagtgagcactttctataaaactttcttaggtatccagc
ttctctgatgacaaacgctgcagacattgtaccttgggaagaacacttta
gagctgcctctgggtatctgaaaatcgccggtggaaagcttgagaacaga
ggacgagcacagcggaacaggggtaccaaacctgttccttatgaggaaat
ggaacatgcaggaatatccaaccaaatagaagcccaagcagagggtggtg
gcatccacctataaacacaacacgaggggtggttgcgcggctgattcgct
gtgcctttaacattaaaagacaaaagtactgtgagcctcattctcacgga
acaatgatgtcactttattgtgtgcagtcagtctttttacacactggcta
tagcttttccagtaaagtaggattattgatgaagttatttttggacgaga
caaccgggcaataatagaaaaagctgagagagtttttttttctttctttt
tcctcttttttgtctgaagtagaacaaaattgggtggggacggatgtga
gaattccagtcagtacacatggtcataatttttgtttggaaagagcaatg
gctagatatgtgattgttcattgattcatgagctatgtcagtggattagc
tggatgctcagggacttggaaagagcgtgatttttaagttgctgaaaaag
acatctggagaagtagtatgtagatagatctctccaaataggcaaaggat
gtgaagacacttgtgtcttatgtaaatacttatcaaaaggtgacttcagc
tgaggagttcaataataaagtaggtaggatgacctacctgttctgtagac
agtcaacctctttccccagccatccctgtcattgttcatgggcccatgaa
caaagtggccatggcagcatagaagggaattaattatgcatgggcttgac
agcatgggcttccactcacccaggctcacctggctgcagttgctgctgag
tgctaggtctgccagcaagtatattgtctggttttgtgtgtgtcagcttg
gcacaagctagagccatcagagaggaaggagcctcagctgaggaaatgtt
tcaatgagatccgggcaaaacacgcatacacatgaaattaaaacaaagtc
ttaaggggaaaaaccacccatgttgtagctgagcactttgacttgtgact
gcagctccagtactggagaggtggggacaggaaggccaaaagttcaaagt
catagttagctacacacaaagttgaaggctagcctgagctatatgagact
atgtctcaaaggagaaaaaaaactctcagatattcatactgcagtgtaga
cttacttccctgctttcttgtttgtaacttttttactccagggatgaaaa
cttgagttcttttgttacccataaccatatgtacatatatgccttatttt
acatcaatgctaaaataacattcatgcataactatacaacatatgtatta
caatatggtacaatactttgttctaatccacggcatatatacacaaaatg
aaattaaaaattgaattttcatagccccaatgaaaaggaatgcatgaact
tcaatatagctttgtttttgtcttt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr13_104812194_104813352
seq2: B6Ng01-206G14.b_49_1197

seq1  GAATTCACTCTCCAGACGAACTTTCCTCTTGAGGGCTATTTCCAAAGTCA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACTCTCCAGACGAACTTTCCTCTTGAGGGCTATTTCCAAAGTCA  50

seq1  TCACCATATTGTTGGTTTCTCAAACACTTGTGATGCTAATTAATACAAGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACCATATTGTTGGTTTCTCAAACACTTGTGATGCTAATTAATACAAGC  100

seq1  CTGCTGAAAATGTAGTTCTTAGGATGGGTCATAGTAGCCCATTCCTTATG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTGAAAATGTAGTTCTTAGGATGGGTCATAGTAGCCCATTCCTTATG  150

seq1  GGAGCTAACCATATTGGGATCCAGAGGGACTTTCGATCTGGATACAAACA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGCTAACCATATTGGGATCCAGAGGGACTTTCGATCTGGATACAAACA  200

seq1  TCTTCCAGTTCCCTCTTCAAAGGCTTTGTGCTTCCCACAGGCCCCTCCCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTCCAGTTCCCTCTTCAAAGGCTTTGTGCTTCCCACAGGCCCCTCCCT  250

seq1  ATATGTGCTAAACAGTGAACTGCTACTGATATTTGGCTAGAAGGTCACCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATGTGCTAAACAGTGAACTGCTACTGATATTTGGCTAGAAGGTCACCA  300

seq1  AGACTTTTGGTTGCCAAGTCACATCATCACAGTGAGGTTTTGCCTCTACC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACTTTTGGTTGCCAAGTCACATCATCACAGTGAGGTTTTGCCTCTACC  350

seq1  TGACAATGGGACTTGATTAATTTTGTTTTATGTTTGTCTTAGTAGAGGAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACAATGGGACTTGATTAATTTTGTTTTATGTTTGTCTTAGTAGAGGAA  400

seq1  TCTTTCAATTTTAATAACATGTTCATATATAACTATTCCAGCTGTTATTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTCAATTTTAATAACATGTTCATATATAACTATTCCAGCTGTTATTT  450

seq1  ATATGTTAGTATTTTTTAGTGGATTTTCTTGCTTTTAGCCAAAGGACTTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATGTTAGTATTTTTTAGTGGATTTTCTTGCTTTTAGCCAAAGGACTTG  500

seq1  CTATTCCCCCTCTTTATTCAATAGCTAGGAATCCACTTAGCCAAAGTTAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATTCCCCCTCTTTATTCAATAGCTAGGAATCCACTTAGCCAAAGTTAT  550

seq1  CCAGTCCTATCTCTCAAGCACAAAGGTATGTCAACAGAGACACCAAGTAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGTCCTATCTCTCAAGCACAAAGGTATGTCAACAGAGACACCAAGTAC  600

seq1  CTTGATGGGCACAGTGAGCACTTTCTATAAAACTTTCTTAGGTATCCAGC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGATGGGCACAGTGAGCACTTTCTATAAAACTTTCTTAGGTATCCAGC  650

seq1  TTCTCTGATGACAAACGCTGCAGACATTGTACCTTGGGAAGAACACTTTA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTCTGATGACAAACGCTGCAGACATTGTACCTTGGGAAGAACACTTTA  700

seq1  GAGCTGCCTCTGGGTATCTGAAAATCGCCGGTGGAAAGCTTGAGAACAGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCTGCCTCTGGGTATCTGAAAATCGCCGGTGGAAAGCTTGAGAACAGA  750

seq1  GGACGAGCACAGCGGAACAGGGGTACCAAACCTGTTCCTTATGAGGAAAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACGAGCACAGCGGAACAGGGGTACCAAACCTGTTCCTTATGAGGAAAT  800

seq1  GGAACATGCAGGAATATCCAACCAAATAGAAGCCCAAGCAGAGGGTGGTG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAACATGCAGGAATATCCAACCAAATAGAAGCCCAAGCAGAGGGTGGTG  850

seq1  GCATCCACCTATAAACACAACACGAGGGGTGGTTGCGCGGCTGATTCGCT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATCCACCTATAAACACAACACGAGGGGTGGTTGCGCGGCTGATTCGCT  900

seq1  GTGCCTTTAACATTAAAAGACAAAAGTACTGTGAG-CTCATTCTCACGG-  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| 
seq2  GTGCCTTTAACATTAAAAGACAAAAGTACTGTGAGCCTCATTCTCACGGA  950

seq1  ACAATGATGTCACTTTATTGTGTGCAGTCAGTC-TTTTACACACTGGCTA  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  ACAATGATGTCACTTTATTGTGTGCAGTCAGTCTTTTTACACACTGGCTA  1000

seq1  TTAGCTTTTCCAAGTAAAGTAAGATTTATGATGAAGTTATTTTTGAAGGA  1047
       |||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||| | ||
seq2  -TAGCTTTTCC-AGTAAAGTAGGATTATTGATGAAGTTATTTTTGGACGA  1048

seq1  GACAAACCGGGCAATAATAGAAAAAGCTGAAGAGAGTTTTTTTTTTTCTT  1097
      ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||
seq2  GAC-AACCGGGCAATAATAGAAAAAGCTG-AGAGAG--TTTTTTTTTCTT  1094

seq1  TCTTTTTCTCCTTTTTTTTGTCTGAAAGTAGGAAACAAAAATGGGGGTGG  1147
      ||||||  |||| ||||||||||| ||||||  ||||||| |  ||||||
seq2  TCTTTT--TCCTCTTTTTTGTCTG-AAGTAG--AACAAAATT--GGGTGG  1137

seq1  GGACAGATGTGA  1159
      |||| |||||||
seq2  GGACGGATGTGA  1149

seq1: chr13_104951869_104952841
seq2: B6Ng01-206G14.g_142_1140 (reverse)

seq1  AAAGACAAAA--CAAGC--TATTG-AGTTCATGCATTCCTTTTCA-TGGG  44
      ||||||||||   ||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||
seq2  AAAGACAAAAACAAAGCTATATTGAAGTTCATGCATTCCTTTTCATTGGG  50

seq1  GCTATG-AAATTCA--TTTTAA-TTCATTTTGTG--TATATGCCGT-GAT  87
      |||||| |||||||  |||||| |||||||||||  |||||||||| |||
seq2  GCTATGAAAATTCAATTTTTAATTTCATTTTGTGTATATATGCCGTGGAT  100

seq1  TAGA--CAAGTA-TGTA-CATA-TGT-ATACATATG-TGTATAG-TATGC  129
      ||||   ||||| |||| |||| ||| ||||||||| ||||||| |||||
seq2  TAGAACAAAGTATTGTACCATATTGTAATACATATGTTGTATAGTTATGC  150

seq1  ATGAATG-TATTTAAGCATTGATGTAAA--TAGGCATATATGTACATATG  176
      ||||||| ||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||
seq2  ATGAATGTTATTTTAGCATTGATGTAAAATAAGGCATATATGTACATATG  200

seq1  GTTATGGGTAACAAAAG-ACTCAAGTTTTCATCCCTGGAGT-AAAAAGTT  224
      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  GTTATGGGTAACAAAAGAACTCAAGTTTTCATCCCTGGAGTAAAAAAGTT  250

seq1  ACAAACAAGAAAGCAGGGAAGTAAGTCTACACTGCAGTATGAATATCTGA  274
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAACAAGAAAGCAGGGAAGTAAGTCTACACTGCAGTATGAATATCTGA  300

seq1  GAGTTTTTTTTCTCCTTTGAGACATAGTCTCATATAGCTCAGGCTAGCCT  324
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTTTTTTTTCTCCTTTGAGACATAGTCTCATATAGCTCAGGCTAGCCT  350

seq1  TCAACTTTGTGTGTAGCTAACTATGACTTTGAACTTTTGGCCTTCCTGTC  374
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAACTTTGTGTGTAGCTAACTATGACTTTGAACTTTTGGCCTTCCTGTC  400

seq1  CCCACCTCTCCAGTACTGGAGCTGCAGTCACAAGTCAAAGTGCTCAGCTA  424
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCACCTCTCCAGTACTGGAGCTGCAGTCACAAGTCAAAGTGCTCAGCTA  450

seq1  CAACATGGGTGGTTTTTCCCCTTAAGACTTTGTTTTAATTTCATGTGTAT  474
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACATGGGTGGTTTTTCCCCTTAAGACTTTGTTTTAATTTCATGTGTAT  500

seq1  GCGTGTTTTGCCCGGATCTCATTGAAACATTTCCTCAGCTGAGGCTCCTT  524
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCGTGTTTTGCCCGGATCTCATTGAAACATTTCCTCAGCTGAGGCTCCTT  550

seq1  CCTCTCTGATGGCTCTAGCTTGTGCCAAGCTGACACACACAAAACCAGAC  574
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCTCTGATGGCTCTAGCTTGTGCCAAGCTGACACACACAAAACCAGAC  600

seq1  AATATACTTGCTGGCAGACCTAGCACTCAGCAGCAACTGCAGCCAGGTGA  624
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATATACTTGCTGGCAGACCTAGCACTCAGCAGCAACTGCAGCCAGGTGA  650

seq1  GCCTGGGTGAGTGGAAGCCCATGCTGTCAAGCCCATGCATAATTAATTCC  674
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTGGGTGAGTGGAAGCCCATGCTGTCAAGCCCATGCATAATTAATTCC  700

seq1  CTTCTATGCTGCCATGGCCACTTTGTTCATGGGCCCATGAACAATGACAG  724
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTATGCTGCCATGGCCACTTTGTTCATGGGCCCATGAACAATGACAG  750

seq1  GGATGGCTGGGGAAAGAGGTTGACTGTCTACAGAACAGGTAGGTCATCCT  774
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATGGCTGGGGAAAGAGGTTGACTGTCTACAGAACAGGTAGGTCATCCT  800

seq1  ACCTACTTTATTATTGAACTCCTCAGCTGAAGTCACCTTTTGATAAGTAT  824
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTACTTTATTATTGAACTCCTCAGCTGAAGTCACCTTTTGATAAGTAT  850

seq1  TTACATAAGACACAAGTGTCTTCACATCCTTTGCCTATTTGGAGAGATCT  874
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACATAAGACACAAGTGTCTTCACATCCTTTGCCTATTTGGAGAGATCT  900

seq1  ATCTACATACTACTTCTCCAGATGTCTTTTTCAGCAACTTAAAAATCACG  924
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTACATACTACTTCTCCAGATGTCTTTTTCAGCAACTTAAAAATCACG  950

seq1  CTCTTTCCAAGTCCCTGAGCATCCAGCTAATCCACTGACATAGCTCATG  973
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTTTCCAAGTCCCTGAGCATCCAGCTAATCCACTGACATAGCTCATG  999