BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-210B05
Chromosome13 (Build37)
Map Location 12,755,497 - 12,896,058
singlet/doubletdoublet
Overlap geneEG238507, LOC100039744, EG630757, Prl2c3
Upstream geneRyr2, LOC100039678, Mtr, LOC100039826, Actn2, EG432725, Heatr1, LOC546246, Lgals8, LOC100039900, Edaradd, Ero1lb, LOC664862
Downstream geneLOC100039999, LOC100039754, Prl2c2, LOC434483, LOC674723, Prl2c5, LOC630611, LOC100039786, LOC385049, LOC630663, LOC100040108, Gpr137b, LOC664960, Nid1, Lyst, LOC100039831, Gng4
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-210B05.bB6Ng01-210B05.g
ACCGA028514GA028515
length1,143437
definitionB6Ng01-210B05.b B6Ng01-210B05.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(12,755,497 - 12,756,638)(12,895,616 - 12,896,058)
sequence
gaattcttaagtagttaataggtaagaggaagacaggctaaagaaagaca
ttcctgtttgcctgatagcttattattattattattattttggacagggt
ctatctgtacagtcctggttctctatgtggaccagactggccttgaactc
acattgatccacctgcctctgtcttctgacttctaggattaatgacatgt
gccaccatgccaagctgttgacattaattttctagtgacaagaagcagca
ttttaaaaaaaaaattattttggctcctagttagcagggatacactccat
cacagcaggaaagtgtaaaggtagggagacttctctaagatggcagctta
cgtcactcagagagcagagactagactcgaagcacagagaaccttcaaaa
cctcccttcccatcatgacctaccacctccaacaaagctctacctcccca
aagtctcacactgtccccagatagtggtcccctatggggaccaaatgatt
aaacatgtgagccagtggggggacatttacattcaaaccataacacacgg
ggaactttcccagtgcccttccctgtctgagcatccacaggaatctacag
gaagaatctgccccaggctaactgttaacagtaaaaggtcccagaccaat
ctctacctatgctccctgtccagtgacaaacatctgcctaagctccatct
cagagcacacgacatcccaaagcactcaggggctcctttaaataaaagtc
tgcacaaaacctcccctggtcgggtgcaagacactgctgtgtgggtctgc
tgattctggatgtagacacgcatcatggtgaggccgcatgtagccaatga
caacctgtactatctggaatactaatacaactgtgtagaagaaggcagtc
accagaagaaatagcagtctactgaggtaggcaggcccttgtcctaagag
ccagcagtctgatcatatcacgattgacttgtgtttatggacatgccttg
acaaaaataacagacacagcaactattgattactttcatgtatttaaagt
atcagcttttttggcatgtatacaccgctttgacctcagcatccaggagg
ccagtgccaggttaggtttgaagcctagcctggattctatata
ttccttttaattgtctctcaccatctcttttgatatctatttttgccaga
tattaaggaagctacacctgcttgcttctatggttcatttacttggaata
tctttttcaatcctttactctgctgagataatgtctatcactgatgttga
ggtataattcttttttttttccatagaattgtcatgtatggacatatcaa
tttcaattttatttattttttcatttttttagatattttcttcatttaca
tttcaaatgctatcctaaagtcccccccagaactcccagtgactaagcca
ccaacacttggctccacttgcatatgtagcagagaatggccttgtcatgc
attaatccttggtcctataaaggctccatagatgtccgagtgtaggggaa
tcaagggcagggaggtgggagtgggtggatggttgga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr13_12755497_12756638
seq2: B6Ng01-210B05.b_44_1186

seq1  GAATTCTTAAGTAGTTAATAGGTAAGAGGAAGACAGGCTAAAGAAAGACA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTAAGTAGTTAATAGGTAAGAGGAAGACAGGCTAAAGAAAGACA  50

seq1  TTCCTGTTTGCCTGATAGCTTATTATTATTATTATTATTTTGGACAGGGT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCTGTTTGCCTGATAGCTTATTATTATTATTATTATTTTGGACAGGGT  100

seq1  CTATCTGTACAGTCCTGGTTCTCTATGTGGACCAGACTGGCCTTGAACTC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATCTGTACAGTCCTGGTTCTCTATGTGGACCAGACTGGCCTTGAACTC  150

seq1  ACATTGATCCACCTGCCTCTGTCTTCTGACTTCTAGGATTAATGACATGT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATTGATCCACCTGCCTCTGTCTTCTGACTTCTAGGATTAATGACATGT  200

seq1  GCCACCATGCCAAGCTGTTGACATTAATTTTCTAGTGACAAGAAGCAGCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCACCATGCCAAGCTGTTGACATTAATTTTCTAGTGACAAGAAGCAGCA  250

seq1  TTTTAAAAAAAAAATTATTTTGGCTCCTAGTTAGCAGGGATACACTCCAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTAAAAAAAAAATTATTTTGGCTCCTAGTTAGCAGGGATACACTCCAT  300

seq1  CACAGCAGGAAAGTGTAAAGGTAGGGAGACTTCTCTAAGATGGCAGCTTA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGCAGGAAAGTGTAAAGGTAGGGAGACTTCTCTAAGATGGCAGCTTA  350

seq1  CGTCACTCAGAGAGCAGAGACTAGACTCGAAGCACAGAGAACCTTCAAAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTCACTCAGAGAGCAGAGACTAGACTCGAAGCACAGAGAACCTTCAAAA  400

seq1  CCTCCCTTCCCATCATGACCTACCACCTCCAACAAAGCTCTACCTCCCCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCCCTTCCCATCATGACCTACCACCTCCAACAAAGCTCTACCTCCCCA  450

seq1  AAGTCTCACACTGTCCCCAGATAGTGGTCCCCTATGGGGACCAAATGATT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTCTCACACTGTCCCCAGATAGTGGTCCCCTATGGGGACCAAATGATT  500

seq1  AAACATGTGAGCCAGTGGGGGGACATTTACATTCAAACCATAACACACGG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACATGTGAGCCAGTGGGGGGACATTTACATTCAAACCATAACACACGG  550

seq1  GGAACTTTCCCAGTGCCCTTCCCTGTCTGAGCATCCACAGGAATCTACAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAACTTTCCCAGTGCCCTTCCCTGTCTGAGCATCCACAGGAATCTACAG  600

seq1  GAAGAATCTGCCCCAGGCTAACTGTTAACAGTAAAAGGTCCCAGACCAAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGAATCTGCCCCAGGCTAACTGTTAACAGTAAAAGGTCCCAGACCAAT  650

seq1  CTCTACCTATGCTCCCTGTCCAGTGACAAACATCTGCCTAAGCTCCATCT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTACCTATGCTCCCTGTCCAGTGACAAACATCTGCCTAAGCTCCATCT  700

seq1  CAGAGCACACGACATCCCAAAGCACTCAGGGGCTCCTTTAAATAAAAGTC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGCACACGACATCCCAAAGCACTCAGGGGCTCCTTTAAATAAAAGTC  750

seq1  TGCACAAAACCTCCCCTGGTCGGGTGCAAGACACTGCTGTGTGGGTCTGC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCACAAAACCTCCCCTGGTCGGGTGCAAGACACTGCTGTGTGGGTCTGC  800

seq1  TGATTCTGGATGTAGACACGCATCATGGTGAGGCCGCATGTAGCCAATGA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATTCTGGATGTAGACACGCATCATGGTGAGGCCGCATGTAGCCAATGA  850

seq1  CAACCTGTACTATCTGGAATACTAATACAACTGTGTAGAAGAAGGCAGTC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACCTGTACTATCTGGAATACTAATACAACTGTGTAGAAGAAGGCAGTC  900

seq1  ACCAGAAGAAATAGCAGTCTACTGAGGTAGGCAGGCCCTTGTCCTAAGAG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAGAAGAAATAGCAGTCTACTGAGGTAGGCAGGCCCTTGTCCTAAGAG  950

seq1  CCAGCAGTCTGATCATATCACGATTGACTTGTGTTTATGGACATGCCTTG  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGCAGTCTGATCATATCACGATTGACTTGTGTTTATGGACATGCCTTG  1000

seq1  ACAAAAATAACAGACACAGCAACTATTGAATTACTTTCATGTATTTAAAG  1050
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  ACAAAAATAACAGACACAGCAACTATTG-ATTACTTTCATGTATTTAAAG  1049

seq1  TATTCAGCCTTTTTTGGCATGGTGGTACA-CGCTTTGAACCCCAGCATCC  1099
      || |||| |||||||||||||    |||| ||||||| ||| ||||||||
seq2  TA-TCAG-CTTTTTTGGCATG--TATACACCGCTTTG-ACCTCAGCATCC  1094

seq1  AGGAGG-CAGTGCCAGGT--AGTTTG-AGGCTAGCCTG--ATCTATATA  1142
      |||||| |||||||||||   ||||| || ||||||||   ||||||||
seq2  AGGAGGCCAGTGCCAGGTTAGGTTTGAAGCCTAGCCTGGATTCTATATA  1143

seq1: chr13_12895616_12896058
seq2: B6Ng01-210B05.g_67_509 (reverse)

seq1  TCCAACCATCCACCCACTCCCACCTCCCTGCCCTTGATTCCCCTACACTC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAACCATCCACCCACTCCCACCTCCCTGCCCTTGATTCCCCTACACTC  50

seq1  GGACATCTATGGAGCCTTTATAGGACCAAGGATTAATGCATGACAAGGCC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACATCTATGGAGCCTTTATAGGACCAAGGATTAATGCATGACAAGGCC  100

seq1  ATTCTCTGCTACATATGCAAGTGGAGCCAAGTGTTGGTGGCTTAGTCACT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCTCTGCTACATATGCAAGTGGAGCCAAGTGTTGGTGGCTTAGTCACT  150

seq1  GGGAGTTCTGGGGGGGACTTTAGGATAGCATTTGAAATGTAAATGAAGAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAGTTCTGGGGGGGACTTTAGGATAGCATTTGAAATGTAAATGAAGAA  200

seq1  AATATCTAAAAAAATGAAAAAATAAATAAAATTGAAATTGATATGTCCAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATATCTAAAAAAATGAAAAAATAAATAAAATTGAAATTGATATGTCCAT  250

seq1  ACATGACAATTCTATGGAAAAAAAAAAGAATTATACCTCAACATCAGTGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGACAATTCTATGGAAAAAAAAAAGAATTATACCTCAACATCAGTGA  300

seq1  TAGACATTATCTCAGCAGAGTAAAGGATTGAAAAAGATATTCCAAGTAAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGACATTATCTCAGCAGAGTAAAGGATTGAAAAAGATATTCCAAGTAAA  350

seq1  TGAACCATAGAAGCAAGCAGGTGTAGCTTCCTTAATATCTGGCAAAAATA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAACCATAGAAGCAAGCAGGTGTAGCTTCCTTAATATCTGGCAAAAATA  400

seq1  GATATCAAAAGAGATGGTGAGAGACAATTAAAAGGAAGAATTC  443
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATATCAAAAGAGATGGTGAGAGACAATTAAAAGGAAGAATTC  443