BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-225B06
Chromosome13 (Build37)
Map Location 12,561,800 - 12,717,126
singlet/doubletdoublet
Overlap geneEdaradd, Ero1lb, LOC664862
Upstream geneZp4, Ryr2, LOC100039678, Mtr, LOC100039826, Actn2, EG432725, Heatr1, LOC546246, Lgals8, LOC100039900
Downstream geneEG238507, LOC100039744, EG630757, Prl2c3, LOC100039999, LOC100039754, Prl2c2, LOC434483, LOC674723, Prl2c5, LOC630611, LOC100039786, LOC385049, LOC630663, LOC100040108, Gpr137b, LOC664960, Nid1, Lyst
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-225B06.bB6Ng01-225B06.g
ACCGA039363GA039364
length5841,167
definitionB6Ng01-225B06.b B6Ng01-225B06.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(12,561,800 - 12,562,387)(12,715,947 - 12,717,126)
sequence
cttagccactgactgtggaccttctggaagttgaggcaatggtgaaggta
gcagaagctgcactgtttctgaaaacagggccatttgttggagtgggatt
tagggtaaagttctagcctaagctgactcttggcacttccggcagttggt
atgggtagcaatcttagcagttcctagtaatggccggatgagtcaggatc
tattgactgtgtctattgacggatccagactcatctctcctgtgagttct
ttcaggatgagagaaggtttgagagaggggattactgcacacggctggct
ggctccagcatctagaactagactccttaatgggctgaggagatggctcc
tttggtaaagtgcctgtcactccaagcttgagggcctgagtcacccacat
gaaagccaagatcagtgggaaagtcatgcatctttaaaagctctctctct
ctctctctctctctctctctctctctctctctctctccctccctccctcc
ctccttctccctcccctcccctaagctttaaatatgtgtgcatctgggca
gggtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgcgtga
gaattctacatcttgatccgaaggcagcaggaggatgctgtgtgctaaat
tggatatatcttaagcatagcagaccccaaagcccaccaagtgctttgga
ggccacacttcttccaacaaggccacacctcttaataagtgccactccct
atgggccaagcattgaaacacaagaatctgtgggaaccgtaacttttcaa
accaccacagatgtcaagagaagtctgtaggtgttcagcacagatgcaat
tcagttgcttggtttcttggctggttgagtctgggatatggatacagtga
atatgggggactgagcaatctgtcttcagcgacaaccttgtaaggcaggc
atcacagttttagttttcgaagatgaggctcaacaaagattgtgttgtgg
cccttttacccatgctgagggtgatggggtagacatttgtgctcccctgg
agttctctgagcccaagcctgttctcgtcctcgtgtacaggcaatttgga
gaggatgctcaggcaatgcagccaataggcacagacctaaaacagtcctt
gccacctcttagaaatgagaccctgtgaaggaaggatcctcaggcaaggg
ggccagaaagtagccattttgtaatttggagctgagaatgtctattgcca
agagccatgctcctgcctcagcagtgagcccaacatcccagctactttct
agactgacccaggatgtatagctaatatgaagtgacaggtcctgaagcat
gtctctcatctcctccaggttacccctctacctggcctcacttttcatca
gcctcgttttcctgttggtgaatctgacctgtgctgtgctggtgaagacg
ggagactgggacaggaaaggttatcgtctctgtgagagtggccatcaatg
acacactctttgtgctgtgtgctatctctctctccatctgcctctacaaa
atctccaagatgtccctggcgaacatctacttggagtcaaaggtaaaggt
gggaatgtgatcaagttgtcttagtctgaaatggctttctggctgacaca
tagacaacagatctgctccctctggtcactgacttgtatcagtgatttag
ctaggcggtatgttagcatgtaggtctctggaaacttagtctggatacac
tacaactgtttagcact
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr13_12561800_12562387
seq2: B6Ng01-225B06.b_48_637

seq1  GAATTCCTTAGCCACTGACTGTGGACCTTCTGGAAGTTGAGGCAATGGTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTTAGCCACTGACTGTGGACCTTCTGGAAGTTGAGGCAATGGTG  50

seq1  AAGGTAGCAGAAGCTGCACTGTTTCTGAAAACAGGGCCATTTGTTGGAGT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGTAGCAGAAGCTGCACTGTTTCTGAAAACAGGGCCATTTGTTGGAGT  100

seq1  GGGATTTAGGGTAAAGTTCTAGCCTAAGCTGACTCTTGGCACTTCCGGCA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGATTTAGGGTAAAGTTCTAGCCTAAGCTGACTCTTGGCACTTCCGGCA  150

seq1  GTTGGTATGGGTAGCAATCTTAGCAGTTCCTAGTAATGGCCGGATGAGTC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGGTATGGGTAGCAATCTTAGCAGTTCCTAGTAATGGCCGGATGAGTC  200

seq1  AGGATCTATTGACTGTGTCTATTGACGGATCCAGACTCATCTCTCCTGTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGATCTATTGACTGTGTCTATTGACGGATCCAGACTCATCTCTCCTGTG  250

seq1  AGTTCTTTCAGGATGAGAGAAGGTTTGAGAGAGGGGATTACTGCACACGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTCTTTCAGGATGAGAGAAGGTTTGAGAGAGGGGATTACTGCACACGG  300

seq1  CTGGCTGGCTCCAGCATCTAGAACTAGACTCCTTAATGGGCTGAGGAGAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGCTGGCTCCAGCATCTAGAACTAGACTCCTTAATGGGCTGAGGAGAT  350

seq1  GGCTCCTTTGGTAAAGTGCCTGTCACTCCAAGCTTGAGGGCCTGAGTCAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTCCTTTGGTAAAGTGCCTGTCACTCCAAGCTTGAGGGCCTGAGTCAC  400

seq1  CCACATGAAAGCCAAGATCAGTGGGAAAGTCATGCATCTTTAAAAG--CT  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||
seq2  CCACATGAAAGCCAAGATCAGTGGGAAAGTCATGCATCTTTAAAAGCTCT  450

seq1  CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCCTCCCT  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCCTCCCT  500

seq1  CCCTCCCTCCTTCTCCCTCCCCTCCCCCAAGCTTTAAATATGTGTGCCTC  548
      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||
seq2  CCCTCCCTCCTTCTCCCTCCCCTCCCCTAAGCTTTAAATATGTGTGCATC  550

seq1  TGGGCAGGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGA  588
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  TGGGCAGGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGTGA  590

seq1: chr13_12715947_12717126
seq2: B6Ng01-225B06.g_64_1230 (reverse)

seq1  AGTGCTAAACAGTTGTAGTTGTAAACCAGACTAAGTTTTCCCAGAGACTC  50
      |||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||  |||||||| |
seq2  AGTGCTAAACAGTTGTAG-TGT-ATCCAGACTAAGTTT--CCAGAGAC-C  45

seq1  TACATGCCCTACACTAC--GCTAGCTAAACCACTTGGATACAAAGTTCAG  98
      ||||||  |||   |||   ||||||||| ||||  |||||||   ||||
seq2  TACATG--CTAACATACCGCCTAGCTAAATCACT--GATACAA--GTCAG  89

seq1  TGAACCAGAGTGAGCAAGATCTGTTTGTCCTATGTGTCAGCCAGGAAGCC  148
      || ||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||
seq2  TG-ACCAGAGGGAGC-AGATCTG-TTGT-CTATGTGTCAGCCAGAAAGCC  135

seq1  ATTTTCAGACTAAGACACCTTGATCACATTCCCACCTTTACCTTTGACTC  198
      | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  A-TTTCAGACTAAGACAACTTGATCACATTCCCACCTTTACCTTTGACTC  184

seq1  CAAGTAGATGTTCGCCAGGGACATCTTGGAGATTTTGTAGAGGCAGATGG  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGTAGATGTTCGCCAGGGACATCTTGGAGATTTTGTAGAGGCAGATGG  234

seq1  AGAGAGAGATAGCACACAGCACAAAGAGTGTGTCATTGATGGCCACTCTC  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAGAGATAGCACACAGCACAAAGAGTGTGTCATTGATGGCCACTCTC  284

seq1  ACAGAGACGATAACC-TTCCTGTCCCAGTCTCCCGTCTTCACCAGCACAG  347
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGAGACGATAACCTTTCCTGTCCCAGTCTCCCGTCTTCACCAGCACAG  334

seq1  CACAGGTCAGATTCACCAACAGGAAAACGAGGCTGATGAAAAGTGAGGCC  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGGTCAGATTCACCAACAGGAAAACGAGGCTGATGAAAAGTGAGGCC  384

seq1  AGGTAGAGGGGTAACCTGGAGGAGATGAGAGACATGCTTCAGGACCTGTC  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTAGAGGGGTAACCTGGAGGAGATGAGAGACATGCTTCAGGACCTGTC  434

seq1  ACTTCATATTAGCTATACATCCTGGGTCAGTCTAGAAAGTAGCTGGGATG  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTCATATTAGCTATACATCCTGGGTCAGTCTAGAAAGTAGCTGGGATG  484

seq1  TTGGGCTCACTGCTGAGGCAGGAGCATGGCTCTTGGCAATAGACATTCTC  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGGCTCACTGCTGAGGCAGGAGCATGGCTCTTGGCAATAGACATTCTC  534

seq1  AGCTCCAAATTACAAAATGGCTACTTTCTGGCCCCCTTGCCTGAGGATCC  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTCCAAATTACAAAATGGCTACTTTCTGGCCCCCTTGCCTGAGGATCC  584

seq1  TTCCTTCACAGGGTCTCATTTCTAAGAGGTGGCAAGGACTGTTTTAGGTC  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCTTCACAGGGTCTCATTTCTAAGAGGTGGCAAGGACTGTTTTAGGTC  634

seq1  TGTGCCTATTGGCTGCATTGCCTGAGCATCCTCTCCAAATTGCCTGTACA  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGCCTATTGGCTGCATTGCCTGAGCATCCTCTCCAAATTGCCTGTACA  684

seq1  CGAGGACGAGAACAGGCTTGGGCTCAGAGAACTCCAGGGGAGCACAAATG  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGAGGACGAGAACAGGCTTGGGCTCAGAGAACTCCAGGGGAGCACAAATG  734

seq1  TCTACCCCATCACCCTCAGCATGGGTAAAAGGGCCACAACACAATCTTTG  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTACCCCATCACCCTCAGCATGGGTAAAAGGGCCACAACACAATCTTTG  784

seq1  TTGAGCCTCATCTTCGAAAACTAAAACTGTGATGCCTGCCTTACAAGGTT  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAGCCTCATCTTCGAAAACTAAAACTGTGATGCCTGCCTTACAAGGTT  834

seq1  GTCGCTGAAGACAGATTGCTCAGTCCCCCATATTCACTGTATCCATATCC  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCGCTGAAGACAGATTGCTCAGTCCCCCATATTCACTGTATCCATATCC  884

seq1  CAGACTCAACCAGCCAAGAAACCAAGCAACTGAATTGCATCTGTGCTGAA  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGACTCAACCAGCCAAGAAACCAAGCAACTGAATTGCATCTGTGCTGAA  934

seq1  CACCTACAGACTTCTCTTGACATCTGTGGTGGTTTGAAAAGTTACGGTTC  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCTACAGACTTCTCTTGACATCTGTGGTGGTTTGAAAAGTTACGGTTC  984

seq1  CCACAGATTCTTGTGTTTCAATGCTTGGCCCATAGGGAGTGGCACTTATT  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACAGATTCTTGTGTTTCAATGCTTGGCCCATAGGGAGTGGCACTTATT  1034

seq1  AAGAGGTGTGGCCTTGTTGGAAGAAGTGTGGCCTCCAAAGCACTTGGTGG  1097
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGGTGTGGCCTTGTTGGAAGAAGTGTGGCCTCCAAAGCACTTGGTGG  1084

seq1  GCTTTGGGGTCTGCTATGCTTAAGATATATCCAATTTAGCACACAGCATC  1147
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTTGGGGTCTGCTATGCTTAAGATATATCCAATTTAGCACACAGCATC  1134

seq1  CTCCTGCTGCCTTCGGATCAAGATGTAGAATTC  1180
      |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCTGCTGCCTTCGGATCAAGATGTAGAATTC  1167