BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-240G07
Chromosome13 (Build37)
Map Location 62,912,472 - 63,080,889
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC630951, Fbp2, Fbp1, LOC100042090, EG665524
Upstream geneEG638502, LOC100041382, EG633250, EG624180, LOC100041420, LOC665444, EG630579, EG630594, LOC665455, LOC100041430, LOC100041962, LOC100041437, LOC100041979, LOC100041986, 8430426H19Rik, LOC100041455, 6720457D02Rik, EG665503, LOC100041493, LOC630857, EG630978, EG435366, LOC380850
Downstream gene2010111I01Rik, Fancc, Ptch1, C030010C08Rik, 0610007P08Rik, 9330134C04Rik, EG665575
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-240G07.bB6Ng01-240G07.g
ACCGA050576GA050577
length1,1701,143
definitionB6Ng01-240G07.b B6Ng01-240G07.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(62,912,472 - 62,913,652)(63,079,738 - 63,080,889)
sequence
gaattcagtgcaggagaaattaagggcttggggggttactatataaacct
agtacattggtgacttcctggaatcaattagagtatctcataataataga
ggatattgggtctaaactggccttctttgtaaccaagcatggcttcaggg
atggaactgggtcacattcagttgacttgctggcctgtagggaacaacca
tgctgatgctaggacaaaaatttgctctctgaaaacttccaacagggatc
cactggtgaggacaacttcaacacagctcactgaatccagagaggtccac
cgggtgcaggcatggattcttcacccctatgctcaagcctctttgggacc
aaaaattactctactagctacagaaaaaccttgacaccaaactaactaca
aaaccctccatctaccatctgtccttcctgtaagatatgtagaggcatgg
tggcaccaactactttgaggtgaacatatgccttacactgccgagatgtt
caggagtctcacaactgaaatagcaagcagggaccctgcatggatttaca
cagggttctctaattatatgttacagctgttaacttggagtttttgtggg
attcctcacagtggtaatgggtgtagctctgacatttttgcctgctctta
aagagtctttccttcctgttgggttgccttgtgcagcttcattatgagct
cttttgctttgttttatcttcccccccccccccaccttgttttgccctgt
ttgactgtcctctcttggagaccagctcttttctgaagaagaaaccaaag
agagggagtgagtctgggtaagaggacgataggagaggcgggagctagct
gggagaagtagagagagcagaaacagtggccactataagttgtgtgagag
aagaggctctttttcagttaaaaacgtcaatgaactaaatgacattgcaa
agacaggggaaacccacgatgacaatgagaagcagaatacggagcaggaa
cgcacatttgacgatacaggtacactggagtcatgatgaactggaggctc
gcaccaatgtctagagctgtgaaatccgaaattctggctctcagcatgtg
aggtatcacggagaaaatgtgactcagccattcccttgggttcctcttcc
aagtgcatatggaatccaca
gaattccccagggcaaaatgataattaaacaatcagctccccgcttggaa
ctggatcatcatatttctccaagctgctgtgcggaccgcatgcactacac
acggcctgggggaggcaggggctgctggggatgcaggctctcagatgaat
gactccagggctaggaaaggacagcctccaggagcagccaacaacccaca
ctggaaacaggacattcagagaattcttatagactgaacagctgagctac
ctgaaccaacccttgccctcaaagccatgcaatcaggattctcttaagcc
actgcatacataaaattaaagaaaatctaggaataactggttaaagagat
ggcacagttggtaaagtacttgtcgtgaaagcatgaggacctgagctcag
cccccagaacccagctgaggtagccaggagtggtgggtacacttgtgacc
tcagcacccaccaggagggtagggaacagtccatctcccagagcagccta
actgccaaactccaggacagtggaagcctgctgcggaaacaccaacacag
acagccagtacagggcacccaaggctgccccgggcctcacattaaaggaa
gcaaagagcaaggctcctctccactgcattatacagtgtataggttccag
gttaaagtgcagccacgaacagtgcatgactgcatagtggtcactcagaa
agggagtggccctacataaaggctgaaagatcctctacaacacaatgaaa
attttacttgctctttatcattgccatgtttttgtttttgtttcctggtc
tcagcaatgcagttgacctacatgggctactaatcccaaatttacacatg
ttctacaaactcacgggagttcttgttaaaacaaagtactgaactttcag
atcggtatgcctaacagaaaacatgagatgccagaactaatcaaagactg
atctactccccaattactgcaatttgacatttaatttcaatgatgcttaa
aaaatccttgcatcttggcaaaagtttccagccacctgcaaggggcttcc
tagcagagcttgcttgctagcacagtgagggattggtcatccaaattggc
agatatgtaaataacttttttttccgtagcttcccaatcctgg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr13_62912472_62913652
seq2: B6Ng01-240G07.b_42_1211

seq1  GAATTCAGTGCAGGAGAAATTAAGGGCTTGGGGGGTTACTATATAAACCT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGTGCAGGAGAAATTAAGGGCTTGGGGGGTTACTATATAAACCT  50

seq1  AGTACATTGGTGACTTCCTGGAATCAATTAGAGTATCTCATAATAATAGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTACATTGGTGACTTCCTGGAATCAATTAGAGTATCTCATAATAATAGA  100

seq1  GGATATTGGGTCTAAACTGGCCTTCTTTGTAACCAAGCATGGCTTCAGGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATATTGGGTCTAAACTGGCCTTCTTTGTAACCAAGCATGGCTTCAGGG  150

seq1  ATGGAACTGGGTCACATTCAGTTGACTTGCTGGCCTGTAGGGAACAACCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGAACTGGGTCACATTCAGTTGACTTGCTGGCCTGTAGGGAACAACCA  200

seq1  TGCTGATGCTAGGACAAAAATTTGCTCTCTGAAAACTTCCAACAGGGATC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGATGCTAGGACAAAAATTTGCTCTCTGAAAACTTCCAACAGGGATC  250

seq1  CACTGGTGAGGACAACTTCAACACAGCTCACTGAATCCAGAGAGGTCCAC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTGGTGAGGACAACTTCAACACAGCTCACTGAATCCAGAGAGGTCCAC  300

seq1  CGGGTGCAGGCATGGATTCTTCACCCCTATGCTCAAGCCTCTTTGGGACC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGGTGCAGGCATGGATTCTTCACCCCTATGCTCAAGCCTCTTTGGGACC  350

seq1  AAAAATTACTCTACTAGCTACAGAAAAACCTTGACACCAAACTAACTACA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAATTACTCTACTAGCTACAGAAAAACCTTGACACCAAACTAACTACA  400

seq1  AAACCCTCCATCTACCATCTGTCCTTCCTGTAAGATATGTAGAGGCATGG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACCCTCCATCTACCATCTGTCCTTCCTGTAAGATATGTAGAGGCATGG  450

seq1  TGGCACCAACTACTTTGAGGTGAACATATGCCTTACACTGCCGAGATGTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCACCAACTACTTTGAGGTGAACATATGCCTTACACTGCCGAGATGTT  500

seq1  CAGGAGTCTCACAACTGAAATAGCAAGCAGGGACCCTGCATGGATTTACA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGAGTCTCACAACTGAAATAGCAAGCAGGGACCCTGCATGGATTTACA  550

seq1  CAGGGTTCTCTAATTATATGTTACAGCTGTTAACTTGGAGTTTTTGTGGG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGGTTCTCTAATTATATGTTACAGCTGTTAACTTGGAGTTTTTGTGGG  600

seq1  ATTCCTCACAGTGGTAATGGGTGTAGCTCTGACATTTTTGCCTGCTCTTA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCCTCACAGTGGTAATGGGTGTAGCTCTGACATTTTTGCCTGCTCTTA  650

seq1  AAGAGTCTTTCCTTCCTGTTGGGTTGCCTTGTGCAGCTTCATTATGAGCT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGTCTTTCCTTCCTGTTGGGTTGCCTTGTGCAGCTTCATTATGAGCT  700

seq1  CTTTTGCTTTGTTTTATCTTCCCCCCCCCCCCCACCTTGTTTTGCCCTGT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTGCTTTGTTTTATCTTCCCCCCCCCCCCCACCTTGTTTTGCCCTGT  750

seq1  TTGACTGTCCTCTCTTGGAGACCAGCTCTTTTCTGAAGAAGAAACCAAAG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGACTGTCCTCTCTTGGAGACCAGCTCTTTTCTGAAGAAGAAACCAAAG  800

seq1  AGAGGGAGTGAGTCTGGGTAAGAGGACGATAGGAGAGGCGGGAGCTAGCT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGGGAGTGAGTCTGGGTAAGAGGACGATAGGAGAGGCGGGAGCTAGCT  850

seq1  GGGAGAAGTAGAGAGAGCAGAAACAGTGGCCACTATAAGTTGTGTGAGAG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAGAAGTAGAGAGAGCAGAAACAGTGGCCACTATAAGTTGTGTGAGAG  900

seq1  AAGAGGCTCTTTTTCAGTTAAAAACGTCAATGAACTAAATGACATTGCAA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGGCTCTTTTTCAGTTAAAAACGTCAATGAACTAAATGACATTGCAA  950

seq1  AGACAAGGGGAAACCAAGGATGAACAATGAGAAGCAGAATACGGAAGGCA  1000
      |||| |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||  |||
seq2  AGAC-AGGGGAAACCCACGATG-ACAATGAGAAGCAGAATACGGA--GCA  996

seq1  GGAAACGCACAATTTTGACAGATACAGTTACACTGGAGTTCATGATGAAC  1050
      || ||||||||  |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||
seq2  GG-AACGCACA--TTTGAC-GATACAGGTACACTGGAG-TCATGATGAAC  1041

seq1  T-GAGGCTCGCACC-ATGTCTAGAGCTGTGAAATCAGAAATTCT-GCTCT  1097
      | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||
seq2  TGGAGGCTCGCACCAATGTCTAGAGCTGTGAAATCCGAAATTCTGGCTCT  1091

seq1  CAGCATGTGAAGTATCACGGAGAAAATG-AACTCAGGCCATTCTCTTGTG  1146
      |||||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||| |
seq2  CAGCATGTGAGGTATCACGGAGAAAATGTGACTCA-GCCATTCCCTTGGG  1140

seq1  TT-CTCTTTCACTAGTTTGCATTATGGAATCACACA  1181
      || ||||| ||  ||  |||| ||||||||| ||||
seq2  TTCCTCTTCCA--AG--TGCA-TATGGAATC-CACA  1170

seq1: chr13_63079738_63080889
seq2: B6Ng01-240G07.g_64_1206 (reverse)

seq1  CCAGGATTGGGGGAGGTATGGAAAAAAAAAGTTA-TTACATATCCTGCAA  49
      |||||||| ||| || || || |||||||||||| |||||||| |||| |
seq2  CCAGGATT-GGGAAGCTACGG-AAAAAAAAGTTATTTACATAT-CTGCCA  47

seq1  ATTTTGAATGACCAAAATCCCTCACTGTGCTAAGCAGCAAGCTTCCTGCT  99
      | |||| ||||||  |||||||||||||||||   ||||||||  |||| 
seq2  A-TTTGGATGACC--AATCCCTCACTGTGCTAGCAAGCAAGCT--CTGC-  91

seq1  TAGGAAGCCCCTTTGCAGGTGGCTGGAACTTTTTGCC-AGATGCAAGGAT  148
      ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||
seq2  TAGGAAGCCCC-TTGCAGGTGGCTGGAAACTTTTGCCAAGATGCAAGGAT  140

seq1  TTTTTTAAAGCATCATTGAAATTAAATGTCAAATTGCAGTAATT-GGGAG  197
      |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  TTTTT--AAGCATCATTGAAATTAAATGTCAAATTGCAGTAATTGGGGAG  188

seq1  TAGATCAGTCTTTGATTAGTTCTGGCATCTCATG-TTTCTGTTAGGCATA  246
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  TAGATCAGTCTTTGATTAGTTCTGGCATCTCATGTTTTCTGTTAGGCATA  238

seq1  CCGATCCTGAAAGTTCAGTACTTTGTTTTAACAAGAACTCCCGTGAGTTT  296
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCGAT-CTGAAAGTTCAGTACTTTGTTTTAACAAGAACTCCCGTGAGTTT  287

seq1  GTAGAACATGTGTAAATTTGGGATTAGTAGCCCATGTAGGTCAACTGCAT  346
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGAACATGTGTAAATTTGGGATTAGTAGCCCATGTAGGTCAACTGCAT  337

seq1  TGCTGAGACCAGGAAACAAAAACAAAAACATGGCAATGATAAAGAGCAAG  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGAGACCAGGAAACAAAAACAAAAACATGGCAATGATAAAGAGCAAG  387

seq1  TAAAATTTTCATTGTGTTGTAGAGGATCTTTCAGCCTTTATGTAGGGCCA  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAATTTTCATTGTGTTGTAGAGGATCTTTCAGCCTTTATGTAGGGCCA  437

seq1  CTCCCTTTCTGAGTGACCACTATGCAGTCATGCACTGTTCGTGGCTGCAC  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCCTTTCTGAGTGACCACTATGCAGTCATGCACTGTTCGTGGCTGCAC  487

seq1  TTTAACCTGGAACCTATACACTGTATAATGCAGTGGAGAGGAGCCTTGCT  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAACCTGGAACCTATACACTGTATAATGCAGTGGAGAGGAGCCTTGCT  537

seq1  CTTTGCTTCCTTTAATGTGAGGCCCGGGGCAGCCTTGGGTGCCCTGTACT  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTGCTTCCTTTAATGTGAGGCCCGGGGCAGCCTTGGGTGCCCTGTACT  587

seq1  GGCTGTCTGTGTTGGTGTTTCCGCAGCAGGCTTCCACTGTCCTGGAGTTT  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTGTCTGTGTTGGTGTTTCCGCAGCAGGCTTCCACTGTCCTGGAGTTT  637

seq1  GGCAGTTAGGCTGCTCTGGGAGATGGACTGTTCCCTACCCTCCTGGTGGG  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAGTTAGGCTGCTCTGGGAGATGGACTGTTCCCTACCCTCCTGGTGGG  687

seq1  TGCTGAGGTCACAAGTGTACCCACCACTCCTGGCTACCTCAGCTGGGTTC  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGAGGTCACAAGTGTACCCACCACTCCTGGCTACCTCAGCTGGGTTC  737

seq1  TGGGGGCTGAGCTCAGGTCCTCATGCTTTCACGACAAGTACTTTACCAAC  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGGGCTGAGCTCAGGTCCTCATGCTTTCACGACAAGTACTTTACCAAC  787

seq1  TGTGCCATCTCTTTAACCAGTTATTCCTAGATTTTCTTTAATTTTATGTA  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGCCATCTCTTTAACCAGTTATTCCTAGATTTTCTTTAATTTTATGTA  837

seq1  TGCAGTGGCTTAAGAGAATCCTGATTGCATGGCTTTGAGGGCAAGGGTTG  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAGTGGCTTAAGAGAATCCTGATTGCATGGCTTTGAGGGCAAGGGTTG  887

seq1  GTTCAGGTAGCTCAGCTGTTCAGTCTATAAGAATTCTCTGAATGTCCTGT  946
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCAGGTAGCTCAGCTGTTCAGTCTATAAGAATTCTCTGAATGTCCTGT  937

seq1  TTCCAGTGTGGGTTGTTGGCTGCTCCTGGAGGCTGTCCTTTCCTAGCCCT  996
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCAGTGTGGGTTGTTGGCTGCTCCTGGAGGCTGTCCTTTCCTAGCCCT  987

seq1  GGAGTCATTCATCTGAGAGCCTGCATCCCCAGCAGCCCCTGCCTCCCCCA  1046
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGTCATTCATCTGAGAGCCTGCATCCCCAGCAGCCCCTGCCTCCCCCA  1037

seq1  GGCCGTGTGTAGTGCATGCGGTCCGCACAGCAGCTTGGAGAAATATGATG  1096
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCGTGTGTAGTGCATGCGGTCCGCACAGCAGCTTGGAGAAATATGATG  1087

seq1  ATCCAGTTCCAAGCGGGGAGCTGATTGTTTAATTATCATTTTGCCCTGGG  1146
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCAGTTCCAAGCGGGGAGCTGATTGTTTAATTATCATTTTGCCCTGGG  1137

seq1  GAATTC  1152
      ||||||
seq2  GAATTC  1143