BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-245A23
Chromosome13 (Build37)
Map Location 29,997,241 - 30,217,558
singlet/doubletdoublet
Overlap geneE2f3
Upstream geneSox4, LOC100041135, Cdkal1
Downstream geneMboat1, Agtr1a, Uqcrfs1, Dusp22, LOC666443, Irf4, Exoc2, Hus1b, EG432743, LOC100041257
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-245A23.bB6Ng01-245A23.g
ACCGA054043GA054044
length8771,124
definitionB6Ng01-245A23.b B6Ng01-245A23.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(30,216,699 - 30,217,558)(29,997,241 - 29,998,375)
sequence
gaattcttctgtgaaggtttctttctcacgtggtctcctgccttcccccc
tttcagctgacaagattgcctaacactctgtcgcagtttgatttctgggg
tcgggataaaattctgatccatagcaacttatgggataaaaggattttct
tcatccaacctgttacagtctgccaatgaaggaaggcaaggcaggaatct
gagcaggaatgtaaaggcagactgctcagtgttccacacagaattactct
gtagtgcaccacagagctcacttcatagctaaagaactaccttgggaacc
atagacgctgcttgctaactgaatcatggactggcttacacctaacttcc
tggcatagtccaaggccacccacactgggctggatcctcctacatgaatt
aacaaccaagacactccctatctgccccacaagccaagctggcgtagaca
gtttcctcttagatgactctagactgtcaagttggcagtcaagctaacca
ggacattcaagaatcagacttgctctgtcttcccagatgaaatcccagga
tagattctcattggccctgggagggtcatgtgctgacctctgaaccaagg
gatggatgtagcactgtaaattgaaccatatacccttctgtggggctgaa
gagggaactgaatccttttggattgcaggtaggaaaagggcagtaagtgg
ggcttctgcaatcaatacacagggaatcaacagcaagcttccaataaaag
caggcgtctacttcagctctggatgttctatgcgttaattcctctctgat
tttgtgatagctttcaaaagctcccttctcagttttggctaaattagtta
gtctctttgaataattttactcactgg
gaattccaggatgactaaggctatacaatatccttgtctgccccccccca
aaaaaaaaagaaacaaacaaaaaaagctttcatttaagtctttacaaggg
gtttagtacatgcaggtaccagtctaggggctgaggtcatgtatatagag
tgaaccagagagaaaacattatagaacttatgttctacggcagaagaggc
agcatgagctaacacatagatgatttgagaatactcagaacattcatcag
agcactcaaagatagtgtctagaattctaatagtttacacttggaaacaa
cccaaatatgcatcagtttatggataaatacattgaggcatatccataat
gaataatggactattattatttcaggcataaaaagaaatgaaatattggc
catgctactaaatggacgagccttgaaattggactataaagccaaacata
agagactatatatttcttattctataatagaaaatattcagaaaggcaac
ttcagcagcggaatggactagcagttgccacccgtgttaagtaggaagtg
gctgcttagttcacacaggtttccttctggggtgattagctacttaggaa
ccagatagacattgctgtgtactgtgaacaaactaaagtcactaatgata
agctttgttgtatattttactacataaaaaatagttcctggcacaacaac
tgtgccccaaccactccatcccatttctgaaaataagtaatctcctgggt
aacaagtaatatcttaatcactagaatggtatatagccattacaaacatg
aatctggtctgtaagtgctaacatagaaaaatattcaaggcatatataac
gaaggactaaatacactgtagcttgggccacatagtaagaccctatctat
aaaggggaacgtgctatgaatgtagctcattcggtacagtgcttgcctag
catgcacaagggcctgagttcaatccccagccacacacaaaacaaaccag
gtggtggtgcaccccatgggcctataatctcagcactcagagtaaggtgc
agaagattctgattcagtcagctacatagcagtttgagccacctagagta
cagaatagcctgccttaaatatac
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr13_30216699_30217558
seq2: B6Ng01-245A23.b_46_907 (reverse)

seq1  ATTCAAAGAGACTAACTAATTTAGCCAAAACCTGAG-AGGGAGCTTTTG-  48
      |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| 
seq2  ATTCAAAGAGACTAACTAATTTAGCCAAAA-CTGAGAAGGGAGCTTTTGA  49

seq1  AAGCTATCAACAAAATCAGAAGAGGAATTAACGCATAGAACATCCAGAGC  98
      |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCTATC-ACAAAATCAG-AGAGGAATTAACGCATAGAACATCCAGAGC  97

seq1  TGAAGTAGACGCCTGCTTTTATTGGAAGCTTGCTGTTGATTCCCTGTGTA  148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAGTAGACGCCTGCTTTTATTGGAAGCTTGCTGTTGATTCCCTGTGTA  147

seq1  TTGATTGCAG-AGCCCCACTTACTGCCCTTTTCCTACCTGCAATCCAAAA  197
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGATTGCAGAAGCCCCACTTACTGCCCTTTTCCTACCTGCAATCCAAAA  197

seq1  GGATTCAGTTCCCTCTTCAGCCCCACAGAAGGGTATATGGTTCAA-TTAC  246
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  GGATTCAGTTCCCTCTTCAGCCCCACAGAAGGGTATATGGTTCAATTTAC  247

seq1  AGTGCTACATCCATCCCTTGGTTCAGAGGTCAGCACATGACCCTCCCAGG  296
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGCTACATCCATCCCTTGGTTCAGAGGTCAGCACATGACCCTCCCAGG  297

seq1  GCCAATGAGAATCTATCCTGGGATTTCATCTGGGAAGACAGAGCAAGTCT  346
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAATGAGAATCTATCCTGGGATTTCATCTGGGAAGACAGAGCAAGTCT  347

seq1  GATTCTTGAATGTCCTGGTTAGCTTGACTGCCAACTTGACAGTCTAGAGT  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTCTTGAATGTCCTGGTTAGCTTGACTGCCAACTTGACAGTCTAGAGT  397

seq1  CATCTAAGAGG-AACTGTCTACGCCAGCTTGGCTTGTGGGGCAGATAGGG  445
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTAAGAGGAAACTGTCTACGCCAGCTTGGCTTGTGGGGCAGATAGGG  447

seq1  AGTGTCTTGGTTGTTAATTCATGTAGGAGGATCCAGCCCAGTGTGGGTGG  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGTCTTGGTTGTTAATTCATGTAGGAGGATCCAGCCCAGTGTGGGTGG  497

seq1  CCTTGGACTATGCCAGGAAGTTAGGTGTAAGCCAGTCCATGATTCAGTTA  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTGGACTATGCCAGGAAGTTAGGTGTAAGCCAGTCCATGATTCAGTTA  547

seq1  GCAAGCAGCGTCTATGGTTCCCAAGGTAGTTCTTTAGCTATGAAGTGAGC  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAGCAGCGTCTATGGTTCCCAAGGTAGTTCTTTAGCTATGAAGTGAGC  597

seq1  TCTGTGGTGCACTACAGAGTAATTCTGTGTGGAACACTGAGCAGTCTGCC  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTGGTGCACTACAGAGTAATTCTGTGTGGAACACTGAGCAGTCTGCC  647

seq1  TTTACATTCCTGCTCAGATTCCTGCCTTGCCTTCCTTCATTGGCAGACTG  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTACATTCCTGCTCAGATTCCTGCCTTGCCTTCCTTCATTGGCAGACTG  697

seq1  TAACAGGTTGGATGAAGAAAATCCTTTTATCCCATAAGTTGCTATGGATC  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACAGGTTGGATGAAGAAAATCCTTTTATCCCATAAGTTGCTATGGATC  747

seq1  AGAATTTTATCCCGACCCCAGAAATCAAACTGCGACAGAGTGTTAGGCAA  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAATTTTATCCCGACCCCAGAAATCAAACTGCGACAGAGTGTTAGGCAA  797

seq1  TCTTGTCAGCTGAAAGGGGGGAAGGCAGGAGACCACGTGAGAAAGAAACC  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTGTCAGCTGAAAGGGGGGAAGGCAGGAGACCACGTGAGAAAGAAACC  847

seq1  TTCACAGAAGAATTC  860
      |||||||||||||||
seq2  TTCACAGAAGAATTC  862

seq1: chr13_29997241_29998375
seq2: B6Ng01-245A23.g_68_1191

seq1  GAATTCCAGGATGACTAAGGCTATACAATATCCTTGTCTGCCCCCCCCCA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAGGATGACTAAGGCTATACAATATCCTTGTCTGCCCCCCCCCA  50

seq1  AAAAAAAAAGAAACAAACAAAAAAAGCTTTCATTTAAGTCTTTACAAGGG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAAAAAGAAACAAACAAAAAAAGCTTTCATTTAAGTCTTTACAAGGG  100

seq1  GTTTAGTACATGCAGGTACCAGTCTAGGGGCTGAGGTCATGTATATAGAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTAGTACATGCAGGTACCAGTCTAGGGGCTGAGGTCATGTATATAGAG  150

seq1  TGAACCAGAGAGAAAACATTATAGAACTTATGTTCTACGGCAGAAGAGGC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAACCAGAGAGAAAACATTATAGAACTTATGTTCTACGGCAGAAGAGGC  200

seq1  AGCATGAGCTAACACATAGATGATTTGAGAATACTCAGAACATTCATCAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCATGAGCTAACACATAGATGATTTGAGAATACTCAGAACATTCATCAG  250

seq1  AGCACTCAAAGATAGTGTCTAGAATTCTAATAGTTTACACTTGGAAACAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCACTCAAAGATAGTGTCTAGAATTCTAATAGTTTACACTTGGAAACAA  300

seq1  CCCAAATATGCATCAGTTTATGGATAAATACATTGAGGCATATCCATAAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAAATATGCATCAGTTTATGGATAAATACATTGAGGCATATCCATAAT  350

seq1  GAATAATGGACTATTATTATTTCAGGCATAAAAAGAAATGAAATATTGGC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATAATGGACTATTATTATTTCAGGCATAAAAAGAAATGAAATATTGGC  400

seq1  CATGCTACTAAATGGACGAGCCTTGAAATTGGACTATAAAGCCAAACATA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGCTACTAAATGGACGAGCCTTGAAATTGGACTATAAAGCCAAACATA  450

seq1  AGAGACTATATATTTCTTATTCTATAATAGAAAATATTCAGAAAGGCAAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGACTATATATTTCTTATTCTATAATAGAAAATATTCAGAAAGGCAAC  500

seq1  TTCAGCAGCGGAATGGACTAGCAGTTGCCACCCGTGTTAAGTAGGAAGTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAGCAGCGGAATGGACTAGCAGTTGCCACCCGTGTTAAGTAGGAAGTG  550

seq1  GCTGCTTAGTTCACACAGGTTTCCTTCTGGGGTGATTAGCTACTTAGGAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGCTTAGTTCACACAGGTTTCCTTCTGGGGTGATTAGCTACTTAGGAA  600

seq1  CCAGATAGACATTGCTGTGTACTGTGAACAAACTAAAGTCACTAATGATA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGATAGACATTGCTGTGTACTGTGAACAAACTAAAGTCACTAATGATA  650

seq1  AGCTTTGTTGTATATTTTACTACATAAAAAATAGTTCCTGGCACAACAAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTTTGTTGTATATTTTACTACATAAAAAATAGTTCCTGGCACAACAAC  700

seq1  TGTGCCCCAACCACTCCATCCCATTTCTGAAAATAAGTAATCTCCTGGGT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGCCCCAACCACTCCATCCCATTTCTGAAAATAAGTAATCTCCTGGGT  750

seq1  AACAAGTAATATCTTAATCACTAGAATGGTATATAGCCATTACAAACATG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAAGTAATATCTTAATCACTAGAATGGTATATAGCCATTACAAACATG  800

seq1  AATCTGGTCTGTAAGTGCTAACATAGAAAAATATTCAAGGCATATATAAC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCTGGTCTGTAAGTGCTAACATAGAAAAATATTCAAGGCATATATAAC  850

seq1  GAAGGACTAAATACACTGTAGGCTTGGGCCACATAGTAAGACCCTATCTA  900
      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGGACTAAATACACTGTA-GCTTGGGCCACATAGTAAGACCCTATCTA  899

seq1  TAAAGGGGAACGTGCTATGAATGTAGCTCATTCGGTACAGTGCTTGCCTA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAGGGGAACGTGCTATGAATGTAGCTCATTCGGTACAGTGCTTGCCTA  949

seq1  GCATGCACAAGGGCCTGAGTTCAATCCCCAGCCACACACAAAACAAACCA  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATGCACAAGGGCCTGAGTTCAATCCCCAGCCACACACAAAACAAACCA  999

seq1  GGT-GTGGTGGCACCCCATGGGCCTATAATCTCAGCACTCAGGAGGTAGG  1049
      ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||
seq2  GGTGGTGGT-GCACCCCATGGGCCTATAATCTCAGCACTCA-GAGTAAGG  1047

seq1  TGCAGAAGATTCTGGAATTCAAGGTTCAGCTACATAGCAAGTTTGAGGCC  1099
      ||||||||||||||  |||||    ||||||||||||| ||||||||  |
seq2  TGCAGAAGATTCTG--ATTCA---GTCAGCTACATAGC-AGTTTGAG--C  1089

seq1  AACCTAGAGTACAGAATAGCCTGCCTAAAAATATAC  1135
       |||||||||||||||||||||||||  ||||||||
seq2  CACCTAGAGTACAGAATAGCCTGCCT-TAAATATAC  1124