BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-248F02
Chromosome13 (Build37)
Map Location 66,924,064 - 67,050,691
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100042492, EG382769, LOC666052, EG432768, LOC666061, Uqcrb, Mterfd1, Ptdss1
Upstream geneLOC665851, Vmn2r-ps99, LOC628794, EG665897, LOC100041855, EG628746, LOC100042434, LOC100041892, EG665974, LOC100041915, 2410141K09Rik, C330014B19Rik, Mzf6d, Vmn2r-ps106, LOC666027, LOC100041947
Downstream geneZfp712, Zfp708, Zfp759, Rsl1, LOC674699, Zfp455, Zfp458, Zfp457, A230042K10Rik, E130120F12Rik, Zfp456, 2810487A22Rik, Zfp459, C330011K17Rik, LOC666098, 9630025I21Rik, Zfp817, Zfp87, Zfp748, A530054K11Rik, LOC328277, 3830402I07Rik, EG666137, Zfp85-rs1, LOC674597, Zfp273, BC048507, LOC666185
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-248F02.bB6Ng01-248F02.g
ACCGA056426GA056427
length1,0821,113
definitionB6Ng01-248F02.b B6Ng01-248F02.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(67,049,610 - 67,050,691)(66,924,064 - 66,925,176)
sequence
gaattcttccacacagaaaaatgagttttatgactttacatgaagtatga
gcaagtggcctttggaaaacaaattatgtaaacatgtgtgccgggcatgg
ttgcaagagaggcttggtgcctgctttcctgatatggtttgtccccgaaa
gctctggaaatgcctgttgaaatctgattgcttccttagctgactgctgc
tgtgctggtgctgggaagaggggcttttaagaggtgtttgaaagattcat
gaagctctgtagttaattaggttaatgttaattctcgcgggtttgatgaa
actctggctctcaaggggttggattacttatctggagtctgacttactat
aaagatgtctgtagttcctatttttatctcctcagaaggctcagatcgat
attctagcttcttctaatcacatactatctgagggtagcagaatagcacc
atacctaaccttgacttgccttttgcaataaatagccaaagcattctatg
gacaggccaaccaagtccacagtatgggaagagaaaacctgacagaaagg
aaaagaaacagaaggaaggggaagcgttatcgcaaggccatgtgaaagcc
ctacagagtggatctagtagcttgtatctagctagagaaaggctgaggta
ggaagacacagacccaagcctgaaagccaggcaaactgggacaggtagtt
gacttcagatgatgactggtggtcacaggtttcagctttctcacctataa
actgagtgggctgaactaggtaagctctacatgggtccttctctcctcat
ctggactacagcgcctgcacggcttggctaaagatacagtgataggtagg
gaacaagagcatgggtttatcatcccaaatcaaaagaaaatcacagtccc
atgatgggagaatgattaaaaggctttactaaagaatggaggaaaaccca
gatgttaaacccaaacgttacttcaaatagatttaattccctacctctat
gccttggtatccctgaaaaaagtatgtgtgaaagaacatccaatgctcag
tctgaaaaagcaccagggaaaacacacttgca
gaattctgagggccaggtgcttatctaagtcagcagaacatctggttaac
ttttaaccaaggtagacagggtgggagatagggaggcgcctggccaatct
gtacattcttgtatatcttctctatctttatggctagccagttcctagga
tgactttacagcctttgttctttgctctaggcccaaaaagccttcctaac
tagcaagctgcttgagtcatagatcttgaattttaattttctttcactta
gaagtagagataaggatttgtttaattccctaacaaaagcgccttcctct
ttctacacaggtaacctagcaacgatttacatgacaaagccttgcctgcc
tacctgcccaaagatcagcctggaaatcaacccctgaggagcctttgtca
gatttaaacacacaaataccactcctggtgtcctctcttttggaatgtca
gccttgattcccgtgggcaggcttcatgctcactgtgatttatgcctcag
cctgacctgggagaactttcacagatgggatgctgtgtttctctcatgag
tttagaacacccagggcttgaaatcagacaatgccctggcttagatttaa
aaagccttttaaaaaaatggagtctgactctcagttccccctgttccaca
gaaatgccctgtcattcacacagacagctgtggtggactgtgcttctcag
acccttggtgggtgaaaaacagtcgatgttgcctgctgctgtaagacccc
aagtcattgtgtttcttaggcccctagaaacaaagcccaggatggagttc
tttgttcttttgccatcagccctaaagaaaggtgagatgggtgactacct
aggcatctgacccattgtgtaagggaccaagaacatttacacaacttccc
cagtctttgtgatctatccttcccctcactttcggggagagatgagctgt
aattcaccatccccatatttatgatgcttatcctatccttccctcacttt
atgggttcattcttaaaaacctccactgcactgctggaggtctatctcct
ctgccccttgtgggctacgagctcagtctcagcatgctggaatactattt
gattgacgtcatg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr13_67049610_67050691
seq2: B6Ng01-248F02.b_47_1128 (reverse)

seq1  TGCAAGTGTGTTTTCCCTGGTGCTTTTTCAGGAACTGAGCATTGGATG-T  49
      |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |
seq2  TGCAAGTGTGTTTTCCCTGGTGCTTTTTCAG--ACTGAGCATTGGATGTT  48

seq1  CTTTCACACATACTTTTTTCA-GGATACCAAAGGCATAGAGGTAGGGAAT  98
      ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  CTTTCACACATACTTTTTTCAGGGATACC-AAGGCATAGAGGTAGGGAAT  97

seq1  TAAATCTATTTGAAGTAACGTTT-GGTTTAACATCTGGGTTTTCCTCCAT  147
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAATCTATTTGAAGTAACGTTTGGGTTTAACATCTGGGTTTTCCTCCAT  147

seq1  TCTTTAGTAAAGCCTTTTAATCATTCTCCCATCATGGGACTGTGATTTTC  197
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTAGTAAAGCCTTTTAATCATTCTCCCATCATGGGACTGTGATTTTC  197

seq1  TTTTGATTTGGGATGATAAACCCATGCTCTTGTTCCCTACCTATCACTGT  247
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTGATTTGGGATGATAAACCCATGCTCTTGTTCCCTACCTATCACTGT  247

seq1  ATCCTTAGCCAAGCCGTGCAGGCGCTGTAGTCCAGATGAGGAGAGAAGGA  297
      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTTTAGCCAAGCCGTGCAGGCGCTGTAGTCCAGATGAGGAGAGAAGGA  297

seq1  CCCATGTAGAGCTTACCTAGTTCAGCCCACTCAGTTTATAGGTGAGAAAG  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCATGTAGAGCTTACCTAGTTCAGCCCACTCAGTTTATAGGTGAGAAAG  347

seq1  CTGAAACCTGTGACCACCAGTCATCATCTGAAGTCAACTACCTGTCCCAG  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAAACCTGTGACCACCAGTCATCATCTGAAGTCAACTACCTGTCCCAG  397

seq1  TTTGCCTGGCTTTCAGGCTTGGGTCTGTGTCTTCCTACCTCAGCCTTTCT  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGCCTGGCTTTCAGGCTTGGGTCTGTGTCTTCCTACCTCAGCCTTTCT  447

seq1  CTAGCTAGATACAAGCTACTAGATCCACTCTGTAGGGCTTTCACATGGCC  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGCTAGATACAAGCTACTAGATCCACTCTGTAGGGCTTTCACATGGCC  497

seq1  TTGCGATAACGCTTCCCCTTCCTTCTGTTTCTTTTCCTTTCTGTCAGGTT  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCGATAACGCTTCCCCTTCCTTCTGTTTCTTTTCCTTTCTGTCAGGTT  547

seq1  TTCTCTTCCCATACTGTGGACTTGGTTGGCCTGTCCATAGAATGCTTTGG  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTCTTCCCATACTGTGGACTTGGTTGGCCTGTCCATAGAATGCTTTGG  597

seq1  CTATTTATTGCAAAAGGCAAGTCAAGGTTAGGTATGGTGCTATTCTGCTA  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATTTATTGCAAAAGGCAAGTCAAGGTTAGGTATGGTGCTATTCTGCTA  647

seq1  CCCTCAGATAGTATGTGATTAGAAGAAGCTAGAATATCGATCTGAGCCTT  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTCAGATAGTATGTGATTAGAAGAAGCTAGAATATCGATCTGAGCCTT  697

seq1  CTGAGGAGATAAAAATAGGAACTACAGACATCTTTATAGTAAGTCAGACT  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAGGAGATAAAAATAGGAACTACAGACATCTTTATAGTAAGTCAGACT  747

seq1  CCAGATAAGTAATCCAACCCCTTGAGAGCCAGAGTTTCATCAAACCCGCG  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGATAAGTAATCCAACCCCTTGAGAGCCAGAGTTTCATCAAACCCGCG  797

seq1  AGAATTAACATTAACCTAATTAACTACAGAGCTTCATGAATCTTTCAAAC  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAATTAACATTAACCTAATTAACTACAGAGCTTCATGAATCTTTCAAAC  847

seq1  ACCTCTTAAAAGCCCCTCTTCCCAGCACCAGCACAGCAGCAGTCAGCTAA  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTCTTAAAAGCCCCTCTTCCCAGCACCAGCACAGCAGCAGTCAGCTAA  897

seq1  GGAAGCAATCAGATTTCAACAGGCATTTCCAGAGCTTTCGGGGACAAACC  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAGCAATCAGATTTCAACAGGCATTTCCAGAGCTTTCGGGGACAAACC  947

seq1  ATATCAGGAAAGCAGGCACCAAGCCTCTCTTGCAACCATGCCCGGCACAC  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATCAGGAAAGCAGGCACCAAGCCTCTCTTGCAACCATGCCCGGCACAC  997

seq1  ATGTTTACATAATTTGTTTTCCAAAGGCCACTTGCTCATACTTCATGTAA  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTTTACATAATTTGTTTTCCAAAGGCCACTTGCTCATACTTCATGTAA  1047

seq1  AGTCATAAAACTCATTTTTCTGTGTGGAAGAATTC  1082
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCATAAAACTCATTTTTCTGTGTGGAAGAATTC  1082

seq1: chr13_66924064_66925176
seq2: B6Ng01-248F02.g_65_1177

seq1  GAATTCTGAGGGCCAGGTGCTTATCTAAGTCAGCAGAACATCTGGTTAAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTGAGGGCCAGGTGCTTATCTAAGTCAGCAGAACATCTGGTTAAC  50

seq1  TTTTAACCAAGGTAGACAGGGTGGGAGATAGGGAGGCGCCTGGCCAATCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTAACCAAGGTAGACAGGGTGGGAGATAGGGAGGCGCCTGGCCAATCT  100

seq1  GTACATTCTTGTATATCTTCTCTATCTTTATGGCTAGCCAGTTCCTAGGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACATTCTTGTATATCTTCTCTATCTTTATGGCTAGCCAGTTCCTAGGA  150

seq1  TGACTTTACAGCCTTTGTTCTTTGCTCTAGGCCCAAAAAGCCTTCCTAAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACTTTACAGCCTTTGTTCTTTGCTCTAGGCCCAAAAAGCCTTCCTAAC  200

seq1  TAGCAAGCTGCTTGAGTCATAGATCTTGAATTTTAATTTTCTTTCACTTA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCAAGCTGCTTGAGTCATAGATCTTGAATTTTAATTTTCTTTCACTTA  250

seq1  GAAGTAGAGATAAGGATTTGTTTAATTCCCTAACAAAAGCGCCTTCCTCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGTAGAGATAAGGATTTGTTTAATTCCCTAACAAAAGCGCCTTCCTCT  300

seq1  TTCTACACAGGTAACCTAGCAACGATTTACATGACAAAGCCTTGCCTGCC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTACACAGGTAACCTAGCAACGATTTACATGACAAAGCCTTGCCTGCC  350

seq1  TACCTGCCCAAAGATCAGCCTGGAAATCAACCCCTGAGGAGCCTTTGTCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCTGCCCAAAGATCAGCCTGGAAATCAACCCCTGAGGAGCCTTTGTCA  400

seq1  GATTTAAACACACAAATACCACTCCTGGTGTCCTCTCTTTTGGAATGTCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTTAAACACACAAATACCACTCCTGGTGTCCTCTCTTTTGGAATGTCA  450

seq1  GCCTTGATTCCCGTGGGCAGGCTTCATGCTCACTGTGATTTATGCCTCAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTTGATTCCCGTGGGCAGGCTTCATGCTCACTGTGATTTATGCCTCAG  500

seq1  CCTGACCTGGGAGAACTTTCACAGATGGGATGCTGTGTTTCTCTCATGAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGACCTGGGAGAACTTTCACAGATGGGATGCTGTGTTTCTCTCATGAG  550

seq1  TTTAGAACACCCAGGGCTTGAAATCAGACAATGCCCTGGCTTAGATTTAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAGAACACCCAGGGCTTGAAATCAGACAATGCCCTGGCTTAGATTTAA  600

seq1  AAAGCCTTTTAAAAAAATGGAGTCTGACTCTCAGTTCCCCCTGTTCCACA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGCCTTTTAAAAAAATGGAGTCTGACTCTCAGTTCCCCCTGTTCCACA  650

seq1  GAAATGCCCTGTCATTCACACAGACAGCTGTGGTGGACTGTGCTTCTCAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAATGCCCTGTCATTCACACAGACAGCTGTGGTGGACTGTGCTTCTCAG  700

seq1  ACCCTTGGTGGGTGAAAAACAGTCGATGTTGCCTGCTGCTGTAAGACCCC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCTTGGTGGGTGAAAAACAGTCGATGTTGCCTGCTGCTGTAAGACCCC  750

seq1  AAGTCATTGTGTTTCTTAGGCCCCTAGAAACAAAGCCCAGGATGGAGTTC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTCATTGTGTTTCTTAGGCCCCTAGAAACAAAGCCCAGGATGGAGTTC  800

seq1  TTTGTTCTTTTGCCATCAGCCCTAAAGAAAGGTGAGATGGGTGACTACCT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTTCTTTTGCCATCAGCCCTAAAGAAAGGTGAGATGGGTGACTACCT  850

seq1  AGGCATCTGACCCATTGTGTAAGGGACCAAGAACATTTACACAACTTCCC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCATCTGACCCATTGTGTAAGGGACCAAGAACATTTACACAACTTCCC  900

seq1  CAGTCTTTGTGATCTATCCTTCCCCTCACTTTCGGGGAGAGATGAGCTGT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTCTTTGTGATCTATCCTTCCCCTCACTTTCGGGGAGAGATGAGCTGT  950

seq1  AATTCACCATCCCCATATTTATGATGCTTATCCTATCCTTCCCTCACTTT  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTCACCATCCCCATATTTATGATGCTTATCCTATCCTTCCCTCACTTT  1000

seq1  AT-GGTTCATTCTTTAAAAACCTCCACTGCAACTGCTGGAGGTCTATCTC  1049
      || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  ATGGGTTCATTC-TTAAAAACCTCCACTGC-ACTGCTGGAGGTCTATCTC  1048

seq1  CTCTGCCCCTTGTGGGTTACGAGCTCAGTCTCAGCATGCTG--ATACTAT  1097
      |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||
seq2  CTCTGCCCCTTGTGGGCTACGAGCTCAGTCTCAGCATGCTGGAATACTAT  1098

seq1  TTGAATAAACGTCATG  1113
      ||| ||  ||||||||
seq2  TTG-ATTGACGTCATG  1113