BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-262L14
Chromosome13 (Build37)
Map Location 37,056,933 - 37,087,916
singlet/doubletdoublet
Overlap geneF13a1
Upstream geneLOC100041568, Ppp1r3g, Lyrm4, LOC100042773, Fars2, LOC100041590, LOC666758, Nrn1
Downstream geneLy86, LOC100042794, LOC100042800, LOC100042802, LOC100041624, Rreb1, Ssr1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-262L14.bB6Ng01-262L14.g
ACCGA067064GA067065
length1,1891,148
definitionB6Ng01-262L14.b B6Ng01-262L14.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(37,086,714 - 37,087,916)(37,056,933 - 37,058,083)
sequence
gaattccaggatgagtgagtaaggatcagaaagggacatctttaatgcag
atcctaagcacaggaattaacagagagaaggatgcttagagaaagaagaa
ggaagcaaagttaagggtggctgtgggttccgcatcttatttaagagctt
atgatgttccaagtgctcacaggtacgaggcacagagccatagagaaggc
tatcaggccctgtaaccctgggactggcgagtgagcatgccacgagcatt
gcgagggaggggtccaggtttcattttgtgaacatttctctcttttgtaa
ataatgctgtaaggagtatttacagagggacttgtccagacttaggaatg
agggggagcgctgagaactccaggttgcagatcccatgcaagcacatttt
atttactatgtttgacatccttgtttgagatgtctgcagaaaagcagact
acctcagttggcaatattttgtttcatcactagtgccagaaattcctggc
cttttttccagaggaaaaaagacccatgtcgttacaattctcccaacttc
ctatccaggctcaattagaccgtagaaggcatttcaatgctttgatggtc
cccatttccagtccctccaaaggataccgaccaatcaccttgcctatggt
caaaggtccccacagttctcacctttctaggtcagcctcctcctttgcca
cagaatcttcatttctttttcctcccccatatgtaccatattttcatttg
gtacatatgggacatatgcaccatattttcatttggtacatatgggacat
atgtaccatattttcatttgccatgggctaggaatacttctccttacttt
gtccactgtgtgagtttgctttcttggcccaatatctgacataaccagct
ggaaaggagaaggatatgtgggcctagtggtttcagaggtttccgcccat
cacaatggagagggcattgttggagggcacaaaacacatgtgtgcacctg
cagaggaggcccagaggacactgtgtctgtacccacacacaatacagctg
tagctggtgctgcatcttagaactagtactccactataacatctacttta
ttattatgcccagcattctctggatttttcttggatgtcaatgactcata
gcaccattccttctggtttatccctgtcttcctctatgg
gaattcatatatagtttgtgtggtcctctggaagagtttgcaggccatat
gcatcccctggaatctatgcatagaatctgtggtcctctggaagggtttg
cagatcatatgcatcttctggaatccatgcacagtctgtgtggccctcct
gaaatgtttacccatctcatgcacctctgttctagcgcatctgttcagtg
gcagggatgagatgcattggaaatggacacgaagctatcagaggttgggg
gccagctcaggagaacaacatggccatctaactgtgaagtctgattttgg
ctggattcgtccagcttcaaatatgtccttgttgtagcttccaaatgcat
cttttcatatcttaagaaaaatctttaactgggaaataagaagatctgct
ccctttacatatacctttgttctttacttaactttatgctgaaatcccac
tgtgtgtttccagtgatcatgtagggtctgtctatatgatcagaaaattg
tttttctatgcatcaccatcttagccagttctggaggctccttgttttag
ctttataaatcactacagctgaacagattttggaaagactcacaaaagct
attttgaggattaaaggggataacaggggtgaagaggttttctcaactat
cgaactttctatactgtgaagagtggcatggggaactaaggggaagtgga
gctaccacttcaaattgctcagagcagtacctatctcctttaacacccaa
ggtcatcccttccagaaaacaaaccaaacctcaaccacattattctctat
gcagattttatctccctggtaccaggctgtgtaaccgtgatgatcatttt
ccaattagaactttagagagagaggctctttagagctaatgccattttga
ggcaatttaaattggtgttatgcctggtcagaggcagccacagacagtgt
gggttagattgtctccttttgctttcctctgtgctgctttggattggctt
gtgaatttctgcatttggtggaagttatgcacaggtgagtgtgtacgcag
tttgaagaactgtgttattttagaatgattaggagggagaacagttcata
ttcttatcatcttctcctgcttccttcactgcaacatgtcatgtgctt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr13_37086714_37087916
seq2: B6Ng01-262L14.b_46_1234 (reverse)

seq1  CCAT-GAGGAAGACAGGGGGATAACCCAGAAGAGATGGTGGCTAATGATG  49
      |||| ||||||||||  ||||||| |||||||  ||||| ||| |||| |
seq2  CCATAGAGGAAGACA--GGGATAAACCAGAAGGAATGGT-GCT-ATGA-G  45

seq1  TCATGGACATCTAAGAAAAATCCCCAGAGGAAATGGCTTGGGGCATAATA  99
      |||| |||||| |||||||||  ||||||  ||| |||  ||||||||||
seq2  TCATTGACATCCAAGAAAAAT--CCAGAG--AAT-GCT--GGGCATAATA  88

seq1  ATAAAGGTAGATGTTATAGTGGAGTACTTAGTTTCTAAGATGCAGCACCA  149
      ||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||
seq2  ATAAA-GTAGATGTTATAGTGGAGTAC-TAG-TTCTAAGATGCAGCACCA  135

seq1  GCCTACAGCTGTA-TGTGTGTGGGTACAGACACAGTTGTCCTCTGGGCCT  198
      | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  G-CTACAGCTGTATTGTGTGTGGGTACAGACACAG-TGTCCTCTGGGCCT  183

seq1  CCTCTTGCAGGTGCACACATGTG-TTTGTGCCCTCCAACAATGCCCTCTC  247
      |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTC-TGCAGGTGCACACATGTGTTTTGTGCCCTCCAACAATGCCCTCTC  232

seq1  CATTGTGATGGGCGGAAACCTCTGAAACCACTAGG-CCACATATCCTTCT  296
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  CATTGTGATGGGCGGAAACCTCTGAAACCACTAGGCCCACATATCCTTCT  282

seq1  CCTTTCCAGCTGGTTATGTCAGATATTGGGCCAAGAAAGCAAACTCACAC  346
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTTCCAGCTGGTTATGTCAGATATTGGGCCAAGAAAGCAAACTCACAC  332

seq1  AGTGGACAAAGTAAGGAGAAGTATTCCTAGCCCATGGCAAATGAAAATAT  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGGACAAAGTAAGGAGAAGTATTCCTAGCCCATGGCAAATGAAAATAT  382

seq1  GGTACATATGTCCCATATGTACCAAATGAAAATATGGTGCATATGTCCCA  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTACATATGTCCCATATGTACCAAATGAAAATATGGTGCATATGTCCCA  432

seq1  TATGTACCAAATGAAAATATGGTACATATGGGGGAGGAAAAAGAAATGAA  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTACCAAATGAAAATATGGTACATATGGGGGAGGAAAAAGAAATGAA  482

seq1  GATTCTGTGGCAAAGGAGGAGGCTGACCTAGAAAGGTGAGAACTGTGGGG  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTCTGTGGCAAAGGAGGAGGCTGACCTAGAAAGGTGAGAACTGTGGGG  532

seq1  ACCTTTGACCATAGGCAAGGTGATTGGTCGGTATCCTTTGGAGGGACTGG  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTTTGACCATAGGCAAGGTGATTGGTCGGTATCCTTTGGAGGGACTGG  582

seq1  AAATGGGGACCATCAAAGCATTGAAATGCCTTCTACGGTCTAATTGAGCC  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGGGGACCATCAAAGCATTGAAATGCCTTCTACGGTCTAATTGAGCC  632

seq1  TGGATAGGAAGTTGGGAGAATTGTAACGACATGGGTCTTTTTTCCTCTGG  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGATAGGAAGTTGGGAGAATTGTAACGACATGGGTCTTTTTTCCTCTGG  682

seq1  AAAAAAGGCCAGGAATTTCTGGCACTAGTGATGAAACAAAATATTGCCAA  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAAGGCCAGGAATTTCTGGCACTAGTGATGAAACAAAATATTGCCAA  732

seq1  CTGAGGTAGTCTGCTTTTCTGCAGACATCTCAAACAAGGATGTCAAACAT  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAGGTAGTCTGCTTTTCTGCAGACATCTCAAACAAGGATGTCAAACAT  782

seq1  AGTAAATAAAATGTGCTTGCATGGGATCTGCAACCTGGAGTTCTCAGCGC  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTAAATAAAATGTGCTTGCATGGGATCTGCAACCTGGAGTTCTCAGCGC  832

seq1  TCCCCCTCATTCCTAAGTCTGGACAAGTCCCTCTGTAAATACTCCTTACA  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCCCTCATTCCTAAGTCTGGACAAGTCCCTCTGTAAATACTCCTTACA  882

seq1  GCATTATTTACAAAAGAGAGAAATGTTCACAAAATGAAACCTGGACCCCT  946
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATTATTTACAAAAGAGAGAAATGTTCACAAAATGAAACCTGGACCCCT  932

seq1  CCCTCGCAATGCTCGTGGCATGCTCACTCGCCAGTCCCAGGGTTACAGGG  996
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTCGCAATGCTCGTGGCATGCTCACTCGCCAGTCCCAGGGTTACAGGG  982

seq1  CCTGATAGCCTTCTCTATGGCTCTGTGCCTCGTACCTGTGAGCACTTGGA  1046
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGATAGCCTTCTCTATGGCTCTGTGCCTCGTACCTGTGAGCACTTGGA  1032

seq1  ACATCATAAGCTCTTAAATAAGATGCGGAACCCACAGCCACCCTTAACTT  1096
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATCATAAGCTCTTAAATAAGATGCGGAACCCACAGCCACCCTTAACTT  1082

seq1  TGCTTCCTTCTTCTTTCTCTAAGCATCCTTCTCTCTGTTAATTCCTGTGC  1146
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTCCTTCTTCTTTCTCTAAGCATCCTTCTCTCTGTTAATTCCTGTGC  1132

seq1  TTAGGATCTGCATTAAAGATGTCCCTTTCTGATCCTTACTCACTCATCCT  1196
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGGATCTGCATTAAAGATGTCCCTTTCTGATCCTTACTCACTCATCCT  1182

seq1  GGAATTC  1203
      |||||||
seq2  GGAATTC  1189

seq1: chr13_37056933_37058083
seq2: B6Ng01-262L14.g_63_1210

seq1  GAATTCATATATAGTTTGTGTGGTCCTCTGGAAGAGTTTGCAGGCCATAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATATATAGTTTGTGTGGTCCTCTGGAAGAGTTTGCAGGCCATAT  50

seq1  GCATCCCCTGGAATCTATGCATAGAATCTGTGGTCCTCTGGAAGGGTTTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATCCCCTGGAATCTATGCATAGAATCTGTGGTCCTCTGGAAGGGTTTG  100

seq1  CAGATCATATGCATCTTCTGGAATCCATGCACAGTCTGTGTGGCCCTCCT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGATCATATGCATCTTCTGGAATCCATGCACAGTCTGTGTGGCCCTCCT  150

seq1  GAAATGTTTACCCATCTCATGCACCTCTGTTCTAGCGCATCTGTTCAGTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAATGTTTACCCATCTCATGCACCTCTGTTCTAGCGCATCTGTTCAGTG  200

seq1  GCAGGGATGAGATGCATTGGAAATGGACACGAAGCTATCAGAGGTTGGGG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGGGATGAGATGCATTGGAAATGGACACGAAGCTATCAGAGGTTGGGG  250

seq1  GCCAGCTCAGGAGAACAACATGGCCATCTAACTGTGAAGTCTGATTTTGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAGCTCAGGAGAACAACATGGCCATCTAACTGTGAAGTCTGATTTTGG  300

seq1  CTGGATTCGTCCAGCTTCAAATATGTCCTTGTTGTAGCTTCCAAATGCAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGATTCGTCCAGCTTCAAATATGTCCTTGTTGTAGCTTCCAAATGCAT  350

seq1  CTTTTCATATCTTAAGAAAAATCTTTAACTGGGAAATAAGAAGATCTGCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTCATATCTTAAGAAAAATCTTTAACTGGGAAATAAGAAGATCTGCT  400

seq1  CCCTTTACATATACCTTTGTTCTTTACTTAACTTTATGCTGAAATCCCAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTTTACATATACCTTTGTTCTTTACTTAACTTTATGCTGAAATCCCAC  450

seq1  TGTGTGTTTCCAGTGATCATGTAGGGTCTGTCTATATGATCAGAAAATTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTGTTTCCAGTGATCATGTAGGGTCTGTCTATATGATCAGAAAATTG  500

seq1  TTTTTCTATGCATCACCATCTTAGCCAGTTCTGGAGGCTCCTTGTTTTAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTCTATGCATCACCATCTTAGCCAGTTCTGGAGGCTCCTTGTTTTAG  550

seq1  CTTTATAAATCACTACAGCTGAACAGATTTTGGAAAGACTCACAAAAGCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTATAAATCACTACAGCTGAACAGATTTTGGAAAGACTCACAAAAGCT  600

seq1  ATTTTGAGGATTAAAGGGGATAACAGGGGTGAAGAGGTTTTCTCAACTAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTGAGGATTAAAGGGGATAACAGGGGTGAAGAGGTTTTCTCAACTAT  650

seq1  CGAACTTTCTATACTGTGAAGAGTGGCATGGGGAACTAAGGGGAAGTGGA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGAACTTTCTATACTGTGAAGAGTGGCATGGGGAACTAAGGGGAAGTGGA  700

seq1  GCTACCACTTCAAATTGCTCAGAGCAGTACCTATCTCCTTTAACACCCAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTACCACTTCAAATTGCTCAGAGCAGTACCTATCTCCTTTAACACCCAA  750

seq1  GGTCATCCCTTCCAGAAAACAAACCAAACCTCAACCACATTATTCTCTAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCATCCCTTCCAGAAAACAAACCAAACCTCAACCACATTATTCTCTAT  800

seq1  GCAGATTTTATCTCCCTGGTACCAGGCTGTGTAACCGTGATGATCATTTT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGATTTTATCTCCCTGGTACCAGGCTGTGTAACCGTGATGATCATTTT  850

seq1  CCAAATTAGAACTTTAGAGAGAGAGGCTCTTTAGAGCTAATGCCATTTTG  900
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CC-AATTAGAACTTTAGAGAGAGAGGCTCTTTAGAGCTAATGCCATTTTG  899

seq1  AGGCAATTTAAATTGGTGTTATGCCTGGTCAGAGGCAGCCACAGACAGTG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCAATTTAAATTGGTGTTATGCCTGGTCAGAGGCAGCCACAGACAGTG  949

seq1  TGGGTTAGATTGTCTCCTTTTGCTTTCCTCTGTGCTGCTTTGGATTGGCT  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGTTAGATTGTCTCCTTTTGCTTTCCTCTGTGCTGCTTTGGATTGGCT  999

seq1  TGTG-ATTTCTGCATTTGGTGGAAG-TATGCACA-GTGAGTGTGTAAGGC  1047
      |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |  
seq2  TGTGAATTTCTGCATTTGGTGGAAGTTATGCACAGGTGAGTGTGTACG--  1047

seq1  CAGGTTGAAG-ACTGTGTTATTTTAGAATGAATAAGAGGGAG-ACAGTTC  1095
      ||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||
seq2  CAGTTTGAAGAACTGTGTTATTTTAGAATGATTAGGAGGGAGAACAGTTC  1097

seq1  ATA-TCTTATCACTCCTTCTTCTTGCTTCTCTTCACTGCAACATGTCATG  1144
      ||| ||||||||   |||| || |||||| ||||||||||||||||||||
seq2  ATATTCTTATCA--TCTTC-TCCTGCTTC-CTTCACTGCAACATGTCATG  1143

seq1  GTTGCTT  1151
        |||||
seq2  --TGCTT  1148