BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-264L15
Chromosome13 (Build37)
Map Location 108,381,612 - 108,522,539
singlet/doubletdoublet
Overlap geneZswim6
Upstream geneIpo11, Dimt1, Kif2a, LOC100040322, LOC100040350, LOC100040366, Apoo, AI197445, LOC100040820
Downstream gene3021401N23Rik, 2810008M24Rik, Ndufa12l, Ercc8, LOC668123, LOC621498, Elovl7, LOC668129, LOC100040524, Depdc1b, Pde4d, EG668144
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-264L15.bB6Ng01-264L15.g
ACCGA068556GA068557
length1,1781,159
definitionB6Ng01-264L15.b B6Ng01-264L15.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(108,381,612 - 108,382,796)(108,521,364 - 108,522,539)
sequence
gaattctgcttgggtaggagaaacgtggccaagcagtcaaaatcaatttg
ttcatgtgattgacactagggactgtgtgtcagccgagctctttcatacc
atctgggctctgattatgatcaataggtatttgtgatatgcccaggaaat
gtgctgtttgattacttttacatgggagaggagacacaaatgtctcaacc
cagagtcccctgatgtggctacagaagccagataatgaattattagaata
tggagtttgcactgataaacttttgaactttcattgaacttgtagattaa
gaataggcagtttttccaagaggagaattcaccagacaaccaacaatttt
tctttcacatatttaagagagatgttcgatctggtaaggaaataatagta
atttatgtctttgataattgagaaggattatagttctatacacagaaaaa
gcaaccatcacccaggctgtgtgagtcacaaacccattaaagaagaagct
tctagcttaaaagcagatgaaacccctgggtctggagggtggtattttcc
aagagggagttaagagaaggaaaagaaatccctcagagacttgtaaaatt
agggctccatgtctgacttcttccaaacaagagtaatgacaattatcaga
ttcatcatgacacctcacgcggaaagaaaagcatgtatgctcagacccat
ttcttaatatgcacatttctctcttggagagaccttctggtccacacaca
cagagacctctgcagacccttgttgagaggcagcctttccaacagcagcc
tccttcaatctgtagagatccatcattctatgaacatcatttgcccttta
atatttaaaggcagcctagagaagattaaataggaagattgctgacacct
gaaaacatgtgtggtacaatcaactcactacaagaagtcattttactgat
aaaacagagttgactgagatcaggctcttgagagaaaagaattactaatt
ttaatgctgtggcattgataggctgcatgaaaaataatatgctagcttgt
ggtgcatgcactggtcacttctactagatgctgggccatgctacagctca
gtaccttattaaagtcttccttcagatctcctcactgggatactggcctt
ccttggattcaatatactcactccacca
gaattccacgcggaagaaacttaatattatgaaatattatgatgcctcca
gatactgctgctactaccaggctaaagttgaagtgaaatgggggcttggc
cctgtgttctggcttagggcaaggaatctgctgccctgatgaatgcctgg
ggtacagcagggcacagggaacagtgtcccctctgccctctcttacctgc
ccctcgtaccctatagaaggcagagcaccagatcattgcaggatgccagg
aaccttgcaagggaaggggagatagagctgcacccatgctccctacatct
gagagagaggggtcaagaaaggacagctcctgtgcactttctcatcttcc
cagaactgttgactactttgtagcaactccagcgaggatctggctaggga
gaccagcattcttgaattcttttaaaagctgaataacaaccctgctgaaa
ttctcacttcttgatcctctactttgcccaccgcattttccaaagtaaca
tctcgttgtccctagataaaaaccgaatgagtgagtcatttggcttctct
gaaccttgcgggctacgttctctgactctgcaaactttcaggggtcccta
gctcttatttcatagttcctgaactagtaggctggatgaagccagtgtgt
tgataattcttaaggcattattctagttagaactaagctgctgatctctt
tggtactttctattagaagaagtcactaatgtgatttgttttcaagaatt
gtttattgtcaacataattgaagttagaaatcatattaaattcatgttca
gttccgttcagcctctggttgatgaaatacaagttaactttagattcctg
aggtcacaggaataaatcctgttagaactttaaaatgtaggaagaggagc
ccattttagttttaacaagttaaagactttttatctactgctctctattg
cagactccatcctaaatacccatttttatctgtttatttttgatggcgat
agattaaaactagtcgtggagataagctcatctttcatatctgtgtctgg
ttctgggtgtcctgatgtcatgtgtcatgtgtcattttctcagtgatgct
gcctaaggatgtagaggaagcctgtacaggtcccgactcatgccaaaaca
ggcacccat
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr13_108381612_108382796
seq2: B6Ng01-264L15.b_47_1224

seq1  GAATTCTGCTTGGGTAGGAGAAACGTGGCCAAGCAGTCAAAATCAATTTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTGCTTGGGTAGGAGAAACGTGGCCAAGCAGTCAAAATCAATTTG  50

seq1  TTCATGTGATTGACACTAGGGACTGTGTGTCAGCCGAGCTCTTTCATACC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCATGTGATTGACACTAGGGACTGTGTGTCAGCCGAGCTCTTTCATACC  100

seq1  ATCTGGGCTCTGATTATGATCAATAGGTATTTGTGATATGCCCAGGAAAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTGGGCTCTGATTATGATCAATAGGTATTTGTGATATGCCCAGGAAAT  150

seq1  GTGCTGTTTGATTACTTTTACATGGGAGAGGAGACACAAATGTCTCAACC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCTGTTTGATTACTTTTACATGGGAGAGGAGACACAAATGTCTCAACC  200

seq1  CAGAGTCCCCTGATGTGGCTACAGAAGCCAGATAATGAATTATTAGAATA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGTCCCCTGATGTGGCTACAGAAGCCAGATAATGAATTATTAGAATA  250

seq1  TGGAGTTTGCACTGATAAACTTTTGAACTTTCATTGAACTTGTAGATTAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAGTTTGCACTGATAAACTTTTGAACTTTCATTGAACTTGTAGATTAA  300

seq1  GAATAGGCAGTTTTTCCAAGAGGAGAATTCACCAGACAACCAACAATTTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATAGGCAGTTTTTCCAAGAGGAGAATTCACCAGACAACCAACAATTTT  350

seq1  TCTTTCACATATTTAAGAGAGATGTTCGATCTGGTAAGGAAATAATAGTA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTCACATATTTAAGAGAGATGTTCGATCTGGTAAGGAAATAATAGTA  400

seq1  ATTTATGTCTTTGATAATTGAGAAGGATTATAGTTCTATACACAGAAAAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTATGTCTTTGATAATTGAGAAGGATTATAGTTCTATACACAGAAAAA  450

seq1  GCAACCATCACCCAGGCTGTGTGAGTCACAAACCCATTAAAGAAGAAGCT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAACCATCACCCAGGCTGTGTGAGTCACAAACCCATTAAAGAAGAAGCT  500

seq1  TCTAGCTTAAAAGCAGATGAAACCCCTGGGTCTGGAGGGTGGTATTTTCC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAGCTTAAAAGCAGATGAAACCCCTGGGTCTGGAGGGTGGTATTTTCC  550

seq1  AAGAGGGAGTTAAGAGAAGGAAAAGAAATCCCTCAGAGACTTGTAAAATT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGGGAGTTAAGAGAAGGAAAAGAAATCCCTCAGAGACTTGTAAAATT  600

seq1  AGGGCTCCATGTCTGACTTCTTCCAAACAAGAGTAATGACAATTATCAGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGCTCCATGTCTGACTTCTTCCAAACAAGAGTAATGACAATTATCAGA  650

seq1  TTCATCATGACACCTCACGCGGAAAGAAAAGCATGTATGCTCAGACCCAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCATCATGACACCTCACGCGGAAAGAAAAGCATGTATGCTCAGACCCAT  700

seq1  TTCTTAATATGCACATTTCTCTCTTGGAGAGACCTTCTGGTCCACACACA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTAATATGCACATTTCTCTCTTGGAGAGACCTTCTGGTCCACACACA  750

seq1  CAGAGACCTCTGCAGACCCTTGTTGAGAGGCAGCCTTTCCAACAGCAGCC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGACCTCTGCAGACCCTTGTTGAGAGGCAGCCTTTCCAACAGCAGCC  800

seq1  TCCTTCAATCTGTAGAGATCCATCATTCTATGAACATCATTTGCCCTTTA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTTCAATCTGTAGAGATCCATCATTCTATGAACATCATTTGCCCTTTA  850

seq1  ATATTTAAAGGCAGCCTAGAGAAGATTAAATAGGAAGATTGCTGACACCT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATTTAAAGGCAGCCTAGAGAAGATTAAATAGGAAGATTGCTGACACCT  900

seq1  GAAAACATGTGTGGTACAATCAACTCACTACAAGAAGTCATTTTACTGAT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAACATGTGTGGTACAATCAACTCACTACAAGAAGTCATTTTACTGAT  950

seq1  AAAACAGAGTTGACTGAGATCAGGCTCTTGAGAGAAAAGAATTACTAATT  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAACAGAGTTGACTGAGATCAGGCTCTTGAGAGAAAAGAATTACTAATT  1000

seq1  TTAATGCTGTGGCATTGAATAGGCTGCATGAAAAAT-ATATGCTAGCTTG  1049
      ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  TTAATGCTGTGGCATTG-ATAGGCTGCATGAAAAATAATATGCTAGCTTG  1049

seq1  TTGGTGCAATGCACTGGTCACTTCTACTAGATGCTGGG-CATGCTACAGC  1098
       |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  -TGGTGC-ATGCACTGGTCACTTCTACTAGATGCTGGGCCATGCTACAGC  1097

seq1  TCAGTTAACCTTATTAAAGTCTTCTTTCAAGATCTCCTCACTGGAATACT  1148
      |||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||
seq2  TCAGT--ACCTTATTAAAGTCTTCCTTC-AGATCTCCTCACTGGGATACT  1144

seq1  TTGCTTCCTTGGAATTCAATTATACTCAACTCCACCA  1185
         ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||
seq2  GGCCTTCCTTGG-ATTCAA-TATACTC-ACTCCACCA  1178

seq1: chr13_108521364_108522539
seq2: B6Ng01-264L15.g_67_1225 (reverse)

seq1  ATGGGTG-CTGTTTGGGGCATGAGTTCGGGGAACTGTACAGCTCTCCTCC  49
      ||||||| ||||||  |||||||||   |||| ||||||||   ||||| 
seq2  ATGGGTGCCTGTTT-TGGCATGAGT--CGGGACCTGTACAGGCTTCCTC-  46

seq1  TTACATCC-TAAGCAGCATCACTGAGAAAATGACACATGACACATGACAT  98
       ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  -TACATCCTTAGGCAGCATCACTGAGAAAATGACACATGACACATGACA-  94

seq1  TCAGGGACACCCAGAACCCAGACACAGAATTATGAAAGATGAGCTTTAAT  148
      ||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||  ||
seq2  TCA-GGACACCCAGAA-CCAGACACAGA--TATGAAAGATGAGCTT--AT  138

seq1  CTCCACGAACTAGTTTTTAATCTTATCGCCCATCAAAAAATAAAACAAGA  198
      ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||   |||
seq2  CTCCACG-ACTAG-TTTTAATC-TATCG-CCATC-AAAAATAAA--CAGA  181

seq1  TAAAAATGGGTATTTAGGATGGAGTCTGCAATAGAGAGCAGTAGATAAAA  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAAATGGGTATTTAGGATGGAGTCTGCAATAGAGAGCAGTAGATAAAA  231

seq1  AGTCTTTAACTTGTTAAAACTAAAATGGGCTCCTCTTCCTACATTTTAAA  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCTTTAACTTGTTAAAACTAAAATGGGCTCCTCTTCCTACATTTTAAA  281

seq1  GTTCTAACAGGATTTATTCCTGTGACCTCAGGAATCTAAAGTTAACTTGT  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCTAACAGGATTTATTCCTGTGACCTCAGGAATCTAAAGTTAACTTGT  331

seq1  ATTTCATCAACCAGAGGCTGAACGGAACTGAACATGAATTTAATATGATT  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTCATCAACCAGAGGCTGAACGGAACTGAACATGAATTTAATATGATT  381

seq1  TCTAACTTCAATTATGTTGACAATAAACAATTCTTGAAAACAAATCACAT  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAACTTCAATTATGTTGACAATAAACAATTCTTGAAAACAAATCACAT  431

seq1  TAGTGACTTCTTCTAATAGAAAGTACCAAAGAGATCAGCAGCTTAGTTCT  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTGACTTCTTCTAATAGAAAGTACCAAAGAGATCAGCAGCTTAGTTCT  481

seq1  AACTAGAATAATGCCTTAAGAATTATCAACACACTGGCTTCATCCAGCCT  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTAGAATAATGCCTTAAGAATTATCAACACACTGGCTTCATCCAGCCT  531

seq1  ACTAGTTCAGGAACTATGAAATAAGAGCTAGGGACCCCTGAAAGTTTGCA  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTAGTTCAGGAACTATGAAATAAGAGCTAGGGACCCCTGAAAGTTTGCA  581

seq1  GAGTCAGAGAACGTAGCCCGCAAGGTTCAGAGAAGCCAAATGACTCACTC  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTCAGAGAACGTAGCCCGCAAGGTTCAGAGAAGCCAAATGACTCACTC  631

seq1  ATTCGGTTTTTATCTAGGGACAACGAGATGTTACTTTGGAAAATGCGGTG  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCGGTTTTTATCTAGGGACAACGAGATGTTACTTTGGAAAATGCGGTG  681

seq1  GGCAAAGTAGAGGATCAAGAAGTGAGAATTTCAGCAGGGTTGTTATTCAG  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAAAGTAGAGGATCAAGAAGTGAGAATTTCAGCAGGGTTGTTATTCAG  731

seq1  CTTTTAAAAGAATTCAAGAATGCTGGTCTCCCTAGCCAGATCCTCGCTGG  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTAAAAGAATTCAAGAATGCTGGTCTCCCTAGCCAGATCCTCGCTGG  781

seq1  AGTTGCTACAAAGTAGTCAACAGTTCTGGGAAGATGAGAAAGTGCACAGG  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTGCTACAAAGTAGTCAACAGTTCTGGGAAGATGAGAAAGTGCACAGG  831

seq1  AGCTGTCCTTTCTTGACCCCTCTCTCTCAGATGTAGGGAGCATGGGTGCA  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTGTCCTTTCTTGACCCCTCTCTCTCAGATGTAGGGAGCATGGGTGCA  881

seq1  GCTCTATCTCCCCTTCCCTTGCAAGGTTCCTGGCATCCTGCAATGATCTG  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCTATCTCCCCTTCCCTTGCAAGGTTCCTGGCATCCTGCAATGATCTG  931

seq1  GTGCTCTGCCTTCTATAGGGTACGAGGGGCAGGTAAGAGAGGGCAGAGGG  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCTCTGCCTTCTATAGGGTACGAGGGGCAGGTAAGAGAGGGCAGAGGG  981

seq1  GACACTGTTCCCTGTGCCCTGCTGTACCCCAGGCATTCATCAGGGCAGCA  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACACTGTTCCCTGTGCCCTGCTGTACCCCAGGCATTCATCAGGGCAGCA  1031

seq1  GATTCCTTGCCCTAAGCCAGAACACAGGGCCAAGCCCCCATTTCACTTCA  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTCCTTGCCCTAAGCCAGAACACAGGGCCAAGCCCCCATTTCACTTCA  1081

seq1  ACTTTAGCCTGGTAGTAGCAGCAGTATCTGGAGGCATCATAATATTTCAT  1148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTTAGCCTGGTAGTAGCAGCAGTATCTGGAGGCATCATAATATTTCAT  1131

seq1  AATATTAAGTTTCTTCCGCGTGGAATTC  1176
      ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATATTAAGTTTCTTCCGCGTGGAATTC  1159