BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-268K16
Chromosome13 (Build37)
Map Location 12,558,491 - 12,735,526
singlet/doubletdoublet
Overlap geneEdaradd, Ero1lb, LOC664862
Upstream geneZp4, Ryr2, LOC100039678, Mtr, LOC100039826, Actn2, EG432725, Heatr1, LOC546246, Lgals8, LOC100039900
Downstream geneEG238507, LOC100039744, EG630757, Prl2c3, LOC100039999, LOC100039754, Prl2c2, LOC434483, LOC674723, Prl2c5, LOC630611, LOC100039786, LOC385049, LOC630663, LOC100040108, Gpr137b, LOC664960, Nid1, Lyst
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-268K16.bB6Ng01-268K16.g
ACCGA071465GA071466
length9771,092
definitionB6Ng01-268K16.b B6Ng01-268K16.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(12,558,491 - 12,559,458)(12,734,448 - 12,735,526)
sequence
gaattcttccacgaggaaacattgtcacttccatcgactttgtaaagttt
attagggggttatggtactggattttgcctctttcattagcggttttcag
gagaagttgcctccccctcagtttccattatcataacaaaaacctgaaac
aattaacttggaaagatttatctgagtttactgatttgcagggttgggac
cccagtaagttgcccccgtcatgttttgggggtttgtgtcaaggcagcac
atcctggtgtgagagggaggagaggacaggccacttttgcaaattcactt
aaagaccagcagatggccaagtgggtaaagacactttagctgccaagcct
ggtgacctgagtccaactcctgggacccatgtgggggagagagactctac
ttctgcatgttgttgacctatgattgccaggagtacacatgccatacaca
ctaaatcattagataacaaagaaataaatgactggagagagggctcagca
gctaactgctcttctagaagaccagagttcaattcccagcacccacatgg
cagctcacaactgtctgtaactccatttctaggattttgaccccctcttc
tgctccacagggtcctgtactcacatggagaaacaacatgctgtggtggt
ttgaatatggttgtcccagggaatggcactattaggaggtgtagccttgt
tggagtaggtgtggccttgtcagaggaagtgtgtcactgtgggtgtgggc
tataagacccctcatcctagttgccttggaagccactcttctcctgtctg
cccttcggaacaagatgcagaactctcagcccctcctgcaccatgcctgc
ccaagctccctgccttgatgataatggactgaatcctctgaacctggaag
ccagccccaattaaatgctggtcctttataagagttgccttcgtcatggt
gtctaacttagaacacatgcatacaaa
gaattcactctgtagtccagacaggctaagtcctgattcttgtgtctcat
ctttccaagtagccaggatggtgggcttataccactacgcaaagctgcct
ttttacttggaaccagccatccttactttagtgcctctccttgtttctct
gttgtgatttgggcttgtcccttccctcctgatggctgttctttagagtc
ctactcagtagctgggcctgctggcacaggcctgttaaccctgccatatg
ccagagactgaggcagaaggacgaacgtgggctgcagaatgagttcaggg
ctagcttgggcagcttggtaggacattgtcttcaattaaaaatgtaaaga
ggaggttcgggatattgtagctcagtggaagaacactttatttagcactt
tgaggtcctaagttccatccccagtatgggggtggggaggcctcagccag
gtcacttctccttcagggtttcccatagctattattcattgtaggacacg
aggaacaccatccagcaccgcgtgacccacaggtcatgggttcctgggaa
agtctgaaaatctccatgtttgcttctgaggcagaaagtgactctaccag
aggaaacctgggcattttgggcactgaccttgtgttgtgttttttttttt
tttgttttttttttttttttataaattttgctttccaagaaggaatccta
tggtaagatgtggaggggttctggctgcatgctggccaactgaccctctt
ttgtgaagcccttgggcttgactcactagttcctagttgactcactgtgg
gagaaaacacatcctctctgtcacctggttaatctccctagggcttgttg
tgggcagacgagcagccttgttctaccaaactgaagctgtgattggtggc
tcctcagtgagaagatgattatagccaccctgtcagatacagcgctgcca
ctcctgggactgagaagagctactgcgacagagctgtcctcggttgttag
tttccatgccaacacagacgtacagggccttttcctagttagtcagcttg
ggatgggcaagggcagagacctcagactggaagctgttcctt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr13_12558491_12559458
seq2: B6Ng01-268K16.b_47_1022

seq1  GAATTCTTCCACGAGGAAACATTGTCACTTCCATCGACTTTGTAAAGTTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTCCACGAGGAAACATTGTCACTTCCATCGACTTTGTAAAGTTT  50

seq1  ATTAGGGGGTTATGGTACTGGATTTTGCCTCTTTCATTAGCGGTTTTCAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAGGGGGTTATGGTACTGGATTTTGCCTCTTTCATTAGCGGTTTTCAG  100

seq1  GAGAAGTTGCCTCCCCCTCAGTTTCCATTATCATAACAAAAACCTGAAAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAAGTTGCCTCCCCCTCAGTTTCCATTATCATAACAAAAACCTGAAAC  150

seq1  AATTAACTTGGAAAGATTTATCTGAGTTTACTGATTTGCAGGGTTGGGAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTAACTTGGAAAGATTTATCTGAGTTTACTGATTTGCAGGGTTGGGAC  200

seq1  CCCAGTAAGTTGCCCCCGTCATGTTTTGGGGGTTTGTGTCAAGGCAGCAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAGTAAGTTGCCCCCGTCATGTTTTGGGGGTTTGTGTCAAGGCAGCAC  250

seq1  ATCCTGGTGTGAGAGGGAGGAGAGGACAGGCCACTTTTGCAAATTCACTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCTGGTGTGAGAGGGAGGAGAGGACAGGCCACTTTTGCAAATTCACTT  300

seq1  AAAGACCAGCAGATGGCCAAGTGGGTAAAGACACTTTAGCTGCCAAGCCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGACCAGCAGATGGCCAAGTGGGTAAAGACACTTTAGCTGCCAAGCCT  350

seq1  GGTGACCTGAGTCCAACTCCTGGGACCCATGTGGGGGAGAGAGACTCTAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGACCTGAGTCCAACTCCTGGGACCCATGTGGGGGAGAGAGACTCTAC  400

seq1  TTCTGCATGTTGTTGACCTATGATTGCCAGGAGTACACATGCCATACACA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGCATGTTGTTGACCTATGATTGCCAGGAGTACACATGCCATACACA  450

seq1  CTAAATCATTAGATAACAAAGAAATAAATGACTGGAGAGAGGGCTCAGCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAATCATTAGATAACAAAGAAATAAATGACTGGAGAGAGGGCTCAGCA  500

seq1  GCTAACTGCTCTTCTAGAAGACCAGAGTTCAATTCCCAGCACCCACATGG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTAACTGCTCTTCTAGAAGACCAGAGTTCAATTCCCAGCACCCACATGG  550

seq1  CAGCTCACAACTGTCTGTAACTCCATTTCTAGGATTTTGACCCCCTCTTC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCTCACAACTGTCTGTAACTCCATTTCTAGGATTTTGACCCCCTCTTC  600

seq1  TGCTCCACAGGGTCCTGTACTCACATGGAGAAACAACATGCTGTGGTGGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTCCACAGGGTCCTGTACTCACATGGAGAAACAACATGCTGTGGTGGT  650

seq1  TTGAATATGGTTGTCCCAGGGAATGGCACTATTAGGAGGTGTAGCCTTGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAATATGGTTGTCCCAGGGAATGGCACTATTAGGAGGTGTAGCCTTGT  700

seq1  TGGAGTAGGTGTGGCCTTGTCAGAGGAAGTGTGTCACTGTGGGTGTGGGC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAGTAGGTGTGGCCTTGTCAGAGGAAGTGTGTCACTGTGGGTGTGGGC  750

seq1  TATAAGA-CCCTCATCCTAGTTGCC-TGGAAGCCACTCTTCTCCTGTCTG  798
      ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAAGACCCCTCATCCTAGTTGCCTTGGAAGCCACTCTTCTCCTGTCTG  800

seq1  -CCTTCGGAACAAGATGCAGAACTCTCAGCCCCTCCTGCACCATGCCTG-  846
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  CCCTTCGGAACAAGATGCAGAACTCTCAGCCCCTCCTGCACCATGCCTGC  850

seq1  CCAAGCT-CCTGCCTTGATGATAATGGACTGAA-CCTCTGAACCTGGAAG  894
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  CCAAGCTCCCTGCCTTGATGATAATGGACTGAATCCTCTGAACCTGGAAG  900

seq1  CCAGCCCCAATTAAATGCT-GTCCTTTATAAGAGTTGCCTTCGTCATGGT  943
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGCCCCAATTAAATGCTGGTCCTTTATAAGAGTTGCCTTCGTCATGGT  950

seq1  GTCTAACTAAG-ACACATGCATACAA  968
      |||||||| || ||||||||||||||
seq2  GTCTAACTTAGAACACATGCATACAA  976

seq1: chr13_12734448_12735526
seq2: B6Ng01-268K16.g_65_1156 (reverse)

seq1  AAGG-ACAGCTT-CAGTCTGAG--CTCTGCCC-TGCCCATCCCAAGCTGA  45
      |||| ||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||
seq2  AAGGAACAGCTTCCAGTCTGAGGTCTCTGCCCTTGCCCATCCCAAGCTGA  50

seq1  CTAACTAGGGAA--GCCCTGTCCGTCTGTGTTGGCATGGAAACTAACAAC  93
      ||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAACTAGGAAAAGGCCCTGTACGTCTGTGTTGGCATGGAAACTAACAAC  100

seq1  CGAGGACAGCCTCTGTCGCAGTAGCTCTCCTCAGTCCCAGGAGTGGCAGC  143
      ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  CGAGGACAG-CTCTGTCGCAGTAGCTCTTCTCAGTCCCAGGAGTGGCAGC  149

seq1  GCTGTATCTGACAGGGT-GCTATAATCATCTTCTCACTGA-GAGCCA-CA  190
      ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||
seq2  GCTGTATCTGACAGGGTGGCTATAATCATCTTCTCACTGAGGAGCCACCA  199

seq1  ATCACAGCTTCAGTTTGGTAG-ACAAGGCTGCTCGTCTG-CCACAAC-AG  237
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||
seq2  ATCACAGCTTCAGTTTGGTAGAACAAGGCTGCTCGTCTGCCCACAACAAG  249

seq1  CCCTAGGGAGATTAACCAGGTGACAGAGAGGATGTG-TTTCTCCCACAGT  286
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  CCCTAGGGAGATTAACCAGGTGACAGAGAGGATGTGTTTTCTCCCACAGT  299

seq1  GAGTCAACTAGGAACTAGTGAGTCAAGCCCAAGGGCTTCACAAAAGAGGG  336
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTCAACTAGGAACTAGTGAGTCAAGCCCAAGGGCTTCACAAAAGAGGG  349

seq1  TCAGTTGGCCAGCATGCAGCCAGAACCCCTCCACATCTTACCATAGGATT  386
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGTTGGCCAGCATGCAGCCAGAACCCCTCCACATCTTACCATAGGATT  399

seq1  CCTTCTTGGAAAGCAAAATTTATAAAAAAAAAAAAAAAACAAAAAAAAAA  436
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTCTTGGAAAGCAAAATTTATAAAAAAAAAAAAAAAACAAAAAAAAAA  449

seq1  AAAACACAACACAAGGTCAGTGCCCAAAATGCCCAGGTTTCCTCTGGTAG  486
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAACACAACACAAGGTCAGTGCCCAAAATGCCCAGGTTTCCTCTGGTAG  499

seq1  AGTCACTTTCTGCCTCAGAAGCAAACATGGAGATTTTCAGACTTTCCCAG  536
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCACTTTCTGCCTCAGAAGCAAACATGGAGATTTTCAGACTTTCCCAG  549

seq1  GAACCCATGACCTGTGGGTCACGCGGTGCTGGATGGTGTTCCTCGTGTCC  586
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACCCATGACCTGTGGGTCACGCGGTGCTGGATGGTGTTCCTCGTGTCC  599

seq1  TACAATGAATAATAGCTATGGGAAACCCTGAAGGAGAAGTGACCTGGCTG  636
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAATGAATAATAGCTATGGGAAACCCTGAAGGAGAAGTGACCTGGCTG  649

seq1  AGGCCTCCCCACCCCCATACTGGGGATGGAACTTAGGACCTCAAAGTGCT  686
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCCTCCCCACCCCCATACTGGGGATGGAACTTAGGACCTCAAAGTGCT  699

seq1  AAATAAAGTGTTCTTCCACTGAGCTACAATATCCCGAACCTCCTCTTTAC  736
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATAAAGTGTTCTTCCACTGAGCTACAATATCCCGAACCTCCTCTTTAC  749

seq1  ATTTTTAATTGAAGACAATGTCCTACCAAGCTGCCCAAGCTAGCCCTGAA  786
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTTAATTGAAGACAATGTCCTACCAAGCTGCCCAAGCTAGCCCTGAA  799

seq1  CTCATTCTGCAGCCCACGTTCGTCCTTCTGCCTCAGTCTCTGGCATATGG  836
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCATTCTGCAGCCCACGTTCGTCCTTCTGCCTCAGTCTCTGGCATATGG  849

seq1  CAGGGTTAACAGGCCTGTGCCAGCAGGCCCAGCTACTGAGTAGGACTCTA  886
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGGTTAACAGGCCTGTGCCAGCAGGCCCAGCTACTGAGTAGGACTCTA  899

seq1  AAGAACAGCCATCAGGAGGGAAGGGACAAGCCCAAATCACAACAGAGAAA  936
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAACAGCCATCAGGAGGGAAGGGACAAGCCCAAATCACAACAGAGAAA  949

seq1  CAAGGAGAGGCACTAAAGTAAGGATGGCTGGTTCCAAGTAAAAAGGCAGC  986
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGGAGAGGCACTAAAGTAAGGATGGCTGGTTCCAAGTAAAAAGGCAGC  999

seq1  TTTGCGTAGTGGTATAAGCCCACCATCCTGGCTACTTGGAAAGATGAGAC  1036
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGCGTAGTGGTATAAGCCCACCATCCTGGCTACTTGGAAAGATGAGAC  1049

seq1  ACAAGAATCAGGACTTAGCCTGTCTGGACTACAGAGTGAATTC  1079
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAGAATCAGGACTTAGCCTGTCTGGACTACAGAGTGAATTC  1092