BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-270M15
Chromosome13 (Build37)
Map Location 119,820,105 - 119,821,208
singlet/doubletsinglet
Overlap genenone
Upstream geneLOC674926, Mrps30, LOC668309, LOC100041278, Fgf10
Downstream geneLOC100041298, LOC100041757, Nnt, Paip1, LOC100041802, 4833420G17Rik, 3110070M22Rik, EG633640
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-270M15.b
ACCGA073040
length1,100
definitionB6Ng01-270M15.b
singlet/doubletsinglet---
BLAST hituniqueno hit data
sequence
gaattctttgtattgaagaaggattacacatggaaatagagaaaatatta
aagagtcatcagagatacataaatgcatgaaataataactactataatta
ctactactatagttactcatcaaatttacagttaggtgcctctaaaatag
ctataaaattggtctgacaaccctgaaaactaccagagatgctgctgaca
gttgatggagatacaattgaagcaaacagacacggtagggacagtgcaaa
ataatgcagatatttgtgaaaacagctgcttctcacaaattctgtataca
cttgccatatggctgaacaattccatcactatttacttatttattgaaaa
gaaagagaaaatggtgtactaacaagttacatgagaatgtttgtaatgct
ctttttcataatagtccaatgctttattggaaagaatgattccaaatgtt
ctttaaccagtcaaataaccaaattatgatctatccattattggcgcaca
cacaaaaaatgaatacttcccaagagcatcagtgctaaggaaactgtaat
cccgaagatggcattggagttaatgggggtttactagtctttgttctccc
ctttgctttgactgcagtataattcaattttgttgaaatattatgcacag
aaataagttcctagaatacagccaagtaccaaaattgcacacatagatgt
aaaccctaaatgctatagagattcaagaatgttgaactaggaagattttg
gattattcatttgtccatacctatttgcaaatacccttaaacctttgcag
actgtagtcagaagatacagccagagaaaggttggtcagagggacttgac
acagtagctttgaagaggatatatagaaccatttgcctcatagtttgatt
ggcctgtagaagctagcctatggaagaaaatagaatcgttcctacaacct
ccagaagggaaaggatcccatgagattgagttagcccacaagtcaatgtc
ggactcccataagtgtacatgaagtattgcataagacactgatgatggtt
atcggcttaatgaagaatagaaaactatatgcatgctctagcaccaaatg

quality valuesOpen.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr13_119820105_119821208
seq2: B6Ng01-270M15.b_41_1140

seq1  GAATTCTTTGTATTGAAGAAGGATTACACATGGAAATAGAGAAAATATTA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTGTATTGAAGAAGGATTACACATGGAAATAGAGAAAATATTA  50

seq1  AAGAGTCATCAGAGATACATAAATGCATGAAATAATAACTACTATAATTA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGTCATCAGAGATACATAAATGCATGAAATAATAACTACTATAATTA  100

seq1  CTACTACTATAGTTACTCATCAAATTTACAGTTAGGTGCCTCTAAAATAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACTACTATAGTTACTCATCAAATTTACAGTTAGGTGCCTCTAAAATAG  150

seq1  CTATAAAATTGGTCTGACAACCCTGAAAACTACCAGAGATGCTGCTGACA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATAAAATTGGTCTGACAACCCTGAAAACTACCAGAGATGCTGCTGACA  200

seq1  GTTGATGGAGATACAATTGAAGCAAACAGACACGGTAGGGACAGTGCAAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGATGGAGATACAATTGAAGCAAACAGACACGGTAGGGACAGTGCAAA  250

seq1  ATAATGCAGATATTTGTGAAAACAGCTGCTTCTCACAAATTCTGTATACA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAATGCAGATATTTGTGAAAACAGCTGCTTCTCACAAATTCTGTATACA  300

seq1  CTTGCCATATGGCTGAACAATTCCATCACTATTTACTTATTTATTGAAAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGCCATATGGCTGAACAATTCCATCACTATTTACTTATTTATTGAAAA  350

seq1  GAAAGAGAAAATGGTGTACTAACAAGTTACATGAGAATGTTTGTAATGCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAGAGAAAATGGTGTACTAACAAGTTACATGAGAATGTTTGTAATGCT  400

seq1  CTTTTTCATAATAGTCCAATGCTTTATTGGAAAGAATGATTCCAAATGTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTTCATAATAGTCCAATGCTTTATTGGAAAGAATGATTCCAAATGTT  450

seq1  CTTTAACCAGTCAAATAACCAAATTATGATCTATCCATTATTGGCGCACA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTAACCAGTCAAATAACCAAATTATGATCTATCCATTATTGGCGCACA  500

seq1  CACAAAAAATGAATACTTCCCAAGAGCATCAGTGCTAAGGAAACTGTAAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAAAAAATGAATACTTCCCAAGAGCATCAGTGCTAAGGAAACTGTAAT  550

seq1  CCCGAAGATGGCATTGGAGTTAATGGGGGTTTACTAGTCTTTGTTCTCCC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCGAAGATGGCATTGGAGTTAATGGGGGTTTACTAGTCTTTGTTCTCCC  600

seq1  CTTTGCTTTGACTGCAGTATAATTCAATTTTGTTGAAATATTATGCACAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTGCTTTGACTGCAGTATAATTCAATTTTGTTGAAATATTATGCACAG  650

seq1  AAATAAGTTCCTAGAATACAGCCAAGTACCAAAATTGCACACATAGATGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATAAGTTCCTAGAATACAGCCAAGTACCAAAATTGCACACATAGATGT  700

seq1  AAACCCTAAATGCTATAGAGATTCAAGAATGTTGAACTAGGAAGATTTTG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACCCTAAATGCTATAGAGATTCAAGAATGTTGAACTAGGAAGATTTTG  750

seq1  GATTATTCATTTGTCCATACCTATTTGCAAATACCCTTAAACCTTTGCAG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTATTCATTTGTCCATACCTATTTGCAAATACCCTTAAACCTTTGCAG  800

seq1  ACTGTAGTCAGAAGATACAGCCAGAG-AAGGTTGGTCAGAGGGACTTGAC  849
      |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGTAGTCAGAAGATACAGCCAGAGAAAGGTTGGTCAGAGGGACTTGAC  850

seq1  ACAGTAGCTTTGAAGAGGATATATAGAACCATTTGCCTCATAGTTTGATT  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGTAGCTTTGAAGAGGATATATAGAACCATTTGCCTCATAGTTTGATT  900

seq1  GGCCTGTAGAAGCTAGCCAATGGAAGAAAATAGAATCGTTCCTACAACCT  949
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCTGTAGAAGCTAGCCTATGGAAGAAAATAGAATCGTTCCTACAACCT  950

seq1  CCAGAAGGGAAAGGATCCCATGAGATTGAGGTTAGCCCACCAAGCCAATG  999
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||
seq2  CCAGAAGGGAAAGGATCCCATGAGATTGA-GTTAGCCCA-CAAGTCAATG  998

seq1  TCAGACTCCCATAAGTGGTACATGAA-TATTGCATAAGACACTGATTGAT  1048
      || ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||
seq2  TCGGACTCCCATAAGT-GTACATGAAGTATTGCATAAGACACTGA-TGAT  1046

seq1  GGTTATTGGCTAAAGGAGGAATAGAAAACTAATATGCATGCTCTAGCAAC  1098
      |||||| |||| || || |||||||||||| |||||||||||||||| ||
seq2  GGTTATCGGCTTAATGAAGAATAGAAAACT-ATATGCATGCTCTAGC-AC  1094

seq1  CAAATG  1104
      ||||||
seq2  CAAATG  1100