BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-291G21
Chromosome13 (Build37)
Map Location 30,233,710 - 30,376,869
singlet/doubletdoublet
Overlap geneMboat1
Upstream geneLOC100041135, Cdkal1, E2f3
Downstream geneAgtr1a, Uqcrfs1, Dusp22, LOC666443, Irf4, Exoc2, Hus1b, EG432743, LOC100041257, LOC100041266
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-291G21.bB6Ng01-291G21.g
ACCGA088315GA088316
length1,147431
definitionB6Ng01-291G21.b B6Ng01-291G21.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(30,375,713 - 30,376,869)(30,233,710 - 30,234,146)
sequence
gaattcaacatagtgacacactattggcttattcaaacatcagcaaaaga
atacgtgcaggtcaggatgtcagagttctgtgagttgttgactcagttca
gatagccctgttatgtcctcacgttcctctttatctttatgatcaagctg
ttcccaggaatgttttaactacagggcatacccaggtttctttttctttg
ttctcagccccaggcagcctctaggctcacaaacaaccagcaatttctga
gtactttatatgacttacaggtcttgaaatttcatcttgaaatttcatct
ttttatatgacttacaggtcttgaaatttcattaagtgatctttcagtat
cacttaacttccttgttttcttttgtaatataagtctgatgctcactttg
agaaattacactcagatccaacactctctatggtgttcatgtctgtttgt
caccctgccaactccttgcccacctgagtaccagaaccctgattctcccg
agggttgagggactgactaagtccagtccatggcagcccaccttagatat
tgtcactatgtgacaagatgtttgatggttcctttcttaatgagagccat
ccaagtgtgtcattgtatcccatgtctctagacaatattttgtatggttc
acctttcaacaagcattgagaaagtatgttttaagcaagtattccctact
gcttatatgtgccacacatatttttaaaatctgtaaaaatattcttagag
actttttatagagcaatgtgaatgtgccatacattcattttgtaagaaga
ttctgggcatactgtacattttatacccataagaagaagattatgttttt
aatatattcaccatgtgacaaagaaccttgttagagaattgtaaagggtt
tctataggacattgaaatgtgccacctgtttccactgcattcaggggatc
gtgtgtgctgcatctttcacttatcacatgcaccgtcctgccttatgaat
atagatgccagagttcatagtgcaaagagctttgtccacagaaatttcag
aagtgataatagtaagagtaagattcattctttcttgtaatcaatgagaa
agtgtatgtgtgaccatttcactcagcatgacaaagtttataagagc
tgagactcctaagtccatctggtctatagagagaatccgagggaagacgt
tgaagggttcaaagtatgaaaagattgtcatatcaacgatacaggagatc
attgctgaaggaggcaaggatgcagggtggagcaagggctttgaggatgg
gcaatggtttggagagatcactaaggggctactgtgactgaatacctgaa
aagaagcaacttgtgtgaggaaggacatgtgaaggtgtggtccattatgg
taggaaggggaggtaatgggggagactcaacggaaacatgaggtccagcc
tatcaaggcagagaaggcagatggtgggagagatttagaagcattaggat
tagcagaaggattagcccatcatggtggggaaggcgggtgatggaagagg
ctgcccttaagccttgggtgcggtcatagca
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr13_30375713_30376869
seq2: B6Ng01-291G21.b_47_1193 (reverse)

seq1  GCTCTTATAAAAACTTTGTCATGCTGAGTGGAAAATGGGTCACACATTAC  50
      ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||
seq2  GCTCTTAT--AAACTTTGTCATGCTGAGTG--AAAT-GGTCACACA-TAC  44

seq1  ACTTTCTCATAGATTAC-AGAA--GATGAATTCCTACTCTTACCTAATTA  97
      |||||||||| |||||| ||||   ||||| || |||||||||   ||||
seq2  ACTTTCTCATTGATTACAAGAAAGAATGAA-TCTTACTCTTAC--TATTA  91

seq1  TCACTTCTGAAATTTCTTGTGACAGAGCTCCTTTGCCACTTATGAACTCT  147
      |||||||||||||||||   |||| |||| ||||| ||| ||||||||||
seq2  TCACTTCTGAAATTTCTGTGGACAAAGCT-CTTTG-CAC-TATGAACTCT  138

seq1  GGCATCTATATTCATAAGGCAGGAC-GTGCATGTGATAAGTGAAAGATGC  196
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCATCTATATTCATAAGGCAGGACGGTGCATGTGATAAGTGAAAGATGC  188

seq1  AGCACACACGATCCCCCTGAATGCAGTGGAAACAGGTGGCACATTTCAAT  246
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCACACACGAT-CCCCTGAATGCAGTGGAAACAGGTGGCACATTTCAAT  237

seq1  GTCCTATAGAAACCCCTTTACAATTCTCTAACAAGGTTCTTTGTCACATG  296
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCTATAGAAA-CCCTTTACAATTCTCTAACAAGGTTCTTTGTCACATG  286

seq1  GTGAATATATTAAAAACATAATCTTCTTCTTATGGGTATAAAATGTACAG  346
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAATATATTAAAAACATAATCTTCTTCTTATGGGTATAAAATGTACAG  336

seq1  TATGCCCAGAATCTTCTTACAAAATGAATGTATGGCACATTCACATTGCT  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGCCCAGAATCTTCTTACAAAATGAATGTATGGCACATTCACATTGCT  386

seq1  CTATAAAAAGTCTCTAAGAATATTTTTACAGATTTTAAAAATATGTGTGG  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATAAAAAGTCTCTAAGAATATTTTTACAGATTTTAAAAATATGTGTGG  436

seq1  CACATATAAGCAGTAGGGAATACTTGCTTAAAACATACTTTCTCAATGCT  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATATAAGCAGTAGGGAATACTTGCTTAAAACATACTTTCTCAATGCT  486

seq1  TGTTGAAAGGTGAACCATACAAAATATTGTCTAGAGACATGGGATACAAT  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTGAAAGGTGAACCATACAAAATATTGTCTAGAGACATGGGATACAAT  536

seq1  GACACACTTGGATGGCTCTCATTAAGAAAGGAACCATCAAACATCTTGTC  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACACACTTGGATGGCTCTCATTAAGAAAGGAACCATCAAACATCTTGTC  586

seq1  ACATAGTGACAATATCTAAGGTGGGCTGCCATGGACTGGACTTAGTCAGT  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATAGTGACAATATCTAAGGTGGGCTGCCATGGACTGGACTTAGTCAGT  636

seq1  CCCTCAACCCTCGGGAGAATCAGGGTTCTGGTACTCAGGTGGGCAAGGAG  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTCAACCCTCGGGAGAATCAGGGTTCTGGTACTCAGGTGGGCAAGGAG  686

seq1  TTGGCAGGGTGACAAACAGACATGAACACCATAGAGAGTGTTGGATCTGA  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGCAGGGTGACAAACAGACATGAACACCATAGAGAGTGTTGGATCTGA  736

seq1  GTGTAATTTCTCAAAGTGAGCATCAGACTTATATTACAAAAGAAAACAAG  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTAATTTCTCAAAGTGAGCATCAGACTTATATTACAAAAGAAAACAAG  786

seq1  GAAGTTAAGTGATACTGAAAGATCACTTAATGAAATTTCAAGACCTGTAA  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGTTAAGTGATACTGAAAGATCACTTAATGAAATTTCAAGACCTGTAA  836

seq1  GTCATATAAAAAGATGAAATTTCAAGATGAAATTTCAAGACCTGTAAGTC  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCATATAAAAAGATGAAATTTCAAGATGAAATTTCAAGACCTGTAAGTC  886

seq1  ATATAAAGTACTCAGAAATTGCTGGTTGTTTGTGAGCCTAGAGGCTGCCT  946
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATAAAGTACTCAGAAATTGCTGGTTGTTTGTGAGCCTAGAGGCTGCCT  936

seq1  GGGGCTGAGAACAAAGAAAAAGAAACCTGGGTATGCCCTGTAGTTAAAAC  996
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGCTGAGAACAAAGAAAAAGAAACCTGGGTATGCCCTGTAGTTAAAAC  986

seq1  ATTCCTGGGAACAGCTTGATCATAAAGATAAAGAGGAACGTGAGGACATA  1046
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCCTGGGAACAGCTTGATCATAAAGATAAAGAGGAACGTGAGGACATA  1036

seq1  ACAGGGCTATCTGAACTGAGTCAACAACTCACAGAACTCTGACATCCTGA  1096
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGGGCTATCTGAACTGAGTCAACAACTCACAGAACTCTGACATCCTGA  1086

seq1  CCTGCACGTATTCTTTTGCTGATGTTTGAATAAGCCAATAGTGTGTCACT  1146
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGCACGTATTCTTTTGCTGATGTTTGAATAAGCCAATAGTGTGTCACT  1136

seq1  ATGTTGAATTC  1157
      |||||||||||
seq2  ATGTTGAATTC  1147

seq1: chr13_30233710_30234146
seq2: B6Ng01-291G21.g_69_505

seq1  GAATTCTGAGACTCCTAAGTCCATCTGGTCTATAGAGAGAATCCGAGGGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTGAGACTCCTAAGTCCATCTGGTCTATAGAGAGAATCCGAGGGA  50

seq1  AGACGTTGAAGGGTTCAAAGTATGAAAAGATTGTCATATCAACGATACAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACGTTGAAGGGTTCAAAGTATGAAAAGATTGTCATATCAACGATACAG  100

seq1  GAGATCATTGCTGAAGGAGGCAAGGATGCAGGGTGGAGCAAGGGCTTTGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGATCATTGCTGAAGGAGGCAAGGATGCAGGGTGGAGCAAGGGCTTTGA  150

seq1  GGATGGGCAATGGTTTGGAGAGATCACTAAGGGGCTACTGTGACTGAATA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATGGGCAATGGTTTGGAGAGATCACTAAGGGGCTACTGTGACTGAATA  200

seq1  CCTGAAAAGAAGCAACTTGTGTGAGGAAGGACATGTGAAGGTGTGGTCCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGAAAAGAAGCAACTTGTGTGAGGAAGGACATGTGAAGGTGTGGTCCA  250

seq1  TTATGGTAGGAAGGGGAGGTAATGGGGGAGACTCAACGGAAACATGAGGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATGGTAGGAAGGGGAGGTAATGGGGGAGACTCAACGGAAACATGAGGT  300

seq1  CCAGCCTATCAAGGCAGAGAAGGCAGATGGTGGGAGAGATTTAGAAGCAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGCCTATCAAGGCAGAGAAGGCAGATGGTGGGAGAGATTTAGAAGCAT  350

seq1  TAGGATTAGCAGAAGGATTAGCCCATCATGGTGGGGAAGGCGGGTGATGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGATTAGCAGAAGGATTAGCCCATCATGGTGGGGAAGGCGGGTGATGG  400

seq1  AAGAGGCTGCGCAGAAGCCTTGGGTGCAGTCAAAGCA  437
      |||||||||| |  ||||||||||||| |||| ||||
seq2  AAGAGGCTGCCCTTAAGCCTTGGGTGCGGTCATAGCA  437